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猪流行性腹泻病毒(Porcine Epidemic Diarrhea Virus,PEDV)属于冠状病毒科(Coronaviridae),能引起猪吸收不良性水样腹泻、呕吐、脱水和血液电解质紊乱。自20世纪70年代以来,PED暴发已成为全世界各国养猪生产的主要问题,造成巨大的经济损失。虽然成年猪感染PED不会死亡,但新生哺乳仔猪感染的死亡率可达100%。本研究对PED暴发过后的商业猪场中死亡猪和存活猪的基因组进行了对比分析。采集三个国家(美国、加拿大和德国)五个不同猪场262头猪(商业品系)的样本(其中156头死亡猪样本,106头康复猪样本),以猪80 K SNP芯片进行基因分型。在死亡和康复猪基因组的1 Mb非重叠区内计算平均F_(st)值(F_(st)是表征亚群体间的遗传分化尺度。可以对不同人群之间遗传关系的远近进行量化),计算结果进行均一化(normalized)处理以发现其中的差异。在死亡和康复猪之间,检测到7个检测窗口表现出高度趋异化,其中5个位于2号染色体,1个位于4号染色体,1个位于15号染色体,共含152个基因。其中少数基因在很多病毒感染中过量或过低表达,包括冠状病毒(如非典型性肺炎冠状病毒)。隶属于一个或多个Gene Ontology语义中的32个基因都与PED的感染发展过程有关,如高尔基体,此外,还与恢复或腹泻病情发展(细胞增殖、离子转运、腺苷三磷酸酶活性)的机制相关。综上所述,本文首次从基因图谱分析揭示了哺乳仔猪从PEDV中快速恢复的原因和能力。 相似文献
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脊椎动物TYR基因的序列特征与正选择位点鉴定 总被引:1,自引:0,他引:1
酪氨酸酶是一种含铜金属酶,它广泛存在于各种生物中,是黑色素生物合成的关键酶.利用生物信息学手段详细剖析了脊椎动物TYR基因的序列和进化特性,并模拟了其蛋白的三位结构.系统发生研究显示,脊椎动物TYR基因与物种进化关系之间具有较高的一致性.基因结构分析表明,绝大多数脊椎动物TYR基因有5个外显子,但DrTYR和OlTYR有6个外显子,而Ss TYR有9个外显子.蛋白序列特征分析显示,脊椎动物TYR蛋白均具有典型的TYROSINASE结构域,但不同物种具有特异的保守基序组织模式,其中保守基序13是哺乳类动物TYR蛋白所特有的.位点模型没有检测出正选择位点,但分支位点模型已经检测出马与猪的祖先支(26个正选择位点)、猪进化分支(27个正选择位点)以及斑胸草雀与鸡的祖先支(1个正选择位点)均经历了适应性进化.这些正选择位点虽然被定位于不同二级结构内,但在三维结构中它们分布在相对集中的区域内,很可能与特定功能密切相关. 相似文献
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青蛤的移苗与养殖 总被引:4,自引:0,他引:4
青蛤Cyclinasinensis(Gmelin)俗称黑蛤、圆蛤、铁蛤、牛眼蛤、墨蛤、石头螺等 ,在我国沿海都有分布。有关青蛤繁殖和生长的研究 ,孙晋廷和关福田[1 ] ,曾志南和李复雪[2 ] ,于业绍等[3] ,于业绍和王慧[4] ,于业绍和周琳[5] 先后都有过报导。在浙江省玉环县沿海 ,进行海涂埕田养殖和池塘育肥 ,以及养殖环境和青蛤体内的细菌分析等研究还属首次 ,本文阐述该项试验的结果。1 材料与方法1 .1 试验区位于浙江省东南沿海的玉环县 ,北纬 2 8°1′~ 2 8°9′ ,东经 1 2 1°3′~ 1 2 1°3 2′ ,属亚热带季风气候区 ,具有明… 相似文献
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研究采用单因子试验设计,以丹系妊娠后期二元母猪为研究对象,探讨了在母猪饲粮中补充钾盐对母猪繁殖性能的影响。试验选取1~6胎、健康状况良好且预产期接近的妊娠后期母猪40头,按随机区组法分为两组。对照组20头,饲喂常规怀孕母猪料及哺乳母猪料;试验组20头,在常规怀孕母猪料和哺乳母猪料中补充索巴伦诗(硫酸钾镁盐)5 kg/t。试验期为51 d,记录母猪采食量、产仔情况数据及断奶生产数据。结果显示,与对照组相比,试验组母猪窝均产活仔数提高0.42%,仔猪断奶前窝均死亡数降低72.93%,窝均断奶仔猪数提高12.25%,断奶窝重提高14.45%,母猪头均日采食量提高2.00%,母猪断奶后下一情期受胎率提高4.76个百分点。这表明,在母猪饲粮中补充钾盐能够大幅提高母猪的繁殖性能。 相似文献