马铃薯糖转运蛋白系统进化关系分析和顺式调控元件鉴定

利用Clustal和MEGA 6程序进行序列分析,建立了54个马铃薯糖转运子之间以及它们与其他物种中的同源蛋白的进化关系。利用PLACE程序鉴定了42个糖转运子的顺式调控元件。此研究结果有利于对马铃薯糖转运子加深理解,从而挑选出提高马铃薯经济性的位点。     

马铃薯抗晚疫病种质资源中抗病基因的筛选

【目的】筛选晚疫病抗病种质资源的晚疫病抗病基因，为马铃薯晚疫病抗性种质创新与利用提供依据。【方法】利用转录组测序技术分析马铃薯抗感晚疫病材料(广谱晚疫病抗性材料野生种Solanum demissum品系cs47)和易感材料(卡它丁、大西洋、底西瑞)间差异表达基因，利用GO数据库预测差异表达基因的功能，Clustal Omega程序比对氨基酸序列，MEGA6绘制氨基酸序列进化树。【结果】利用马铃薯抗病种质资源cs47筛选得到PGSC0003DMP400045185、PGSC0003DMP400015105和PGSC0003DMP400015107共3个潜在的晚疫病抗性基因，与3个易感晚疫病品种比分别有6 084～6 547个和6 264～6 316个基因表达水平显著上升和显著下降。在显著差异表达水平的基因中，3个cc-NBS-LRR类基因和已克隆的晚疫病抗性基因拥有类似的蛋白结构域。【结论】广谱晚疫病抗性材料野生种S.demissum品系cs47含有PGSC0003DMP400045185、PGSC0003DMP400015105和PGSC0003DMP400015107共3个潜在的晚疫...