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基于随机森林算法和SRAP分子标记的桂花品种鉴定方法 总被引:1,自引:0,他引:1
【目的】为了解决桂花品种难以鉴定以及苗木生产和园林应用中品种混杂、以次充好和常规DNA指纹图谱无法很好地应用于品种鉴定的问题,提出一种基于随机森林算法和SRAP分子标记的桂花品种鉴定方法,以实现桂花品种简便、快速和准确的鉴定。【方法】以45个桂花品种或变异类型为材料,提取DNA,使用90对SRAP引物进行PCR扩增,以毛细管电泳技术采集扩增信息,筛选出多态性强、扩增结果稳定的引物,计算单对引物的多态信息含量(PIC)、带型数、有效带型数、分辨能力(D)、带型分布的卡方值(χ2)和无法区分的样品对数(x)。筛选出能够完全区分所有品种的引物对组合位点数据作为训练集,用于构建基于随机森林算法的分类模型,并根据模型的泛化能力和分类效果选择最优的分类模型。【结果】筛选出10对SRAP引物,平均PIC为0.26,平均带型数为33.9,平均有效带型数为26.6,平均D为0.97,平均χ2为21.07,平均x为28.2。构建了8个分类模型rf1-rf8,每个分类模型均含有2对SRAP引物。所有分类模型都能完全区分所有桂花品种,模型的袋外数据(OOB)误差估计在0.004 4~0.013 9之间,rf5和rf3泛化能力最强,rf8最弱。rf1分类效果最优,rf3、rf4、rf5和rf7其次,rf2、rf6和rf8最差。【结论】分类模型rf1、rf3、rf4、rf5和rf7的分类能力最佳,所用SRAP引物对分别为me1/em3+me9/em6、me4/em5+me9/em6、me4/em8+me9/em6、me6/em9+me9/em6和me5/em5+me9/em6。除引物对的分辨能力外,所选引物对之间的相关性也显著影响模型的分类能力,相关性越弱,模型的分类能力越强。本研究提出的基于随机森林算法和SRAP分子标记的桂花品种鉴定方法,能够实现桂花品种简便、快速、准确的鉴定,满足桂花苗木生产、推广应用和种质资源保护对于品种鉴定的要求。 相似文献
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在园林植物造景设计过程中,设计人员根据自身水平,利用乔木、灌木以及草本植物等,运用艺术性的设计方法,合理搭配植物色彩,丰富植物层次,最大限度表现园林景观的美,进一步丰富造景的内涵。因此,本文首先分析植物配置与园林造景的原则,接着提出相应的解决对策和建议。 相似文献
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湿地公园是指拥有一定的规模和范围,以湿地景观为主题,以湿地生态系统保护为核心,兼顾湿地生态系统服务功能展示、科普宣教和湿地合理利用示范,蕴含一定文化或美学价值,具有一定的基础设施,可供人们进行科学研究和生态旅游,并予以特殊保护和管理的湿地区域。从社河湿地公园规划建设的必要性,概况,规划总体布局,湿地保护与恢复规划,主要建设内容及存在的问题对抚顺社河湿地公园的规划设计进行探讨。 相似文献
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为了健全非农建设项目占用耕地的补偿机制,保障国家粮食战略后备基地储粮充足。本研究运用空间分析、实证研究等方法,对黑龙江垦区各管理局2000-2014年耕地增减变动情况进行分析。发现其在耕地占补平衡政策实施过程中存在制度缺失、“占优补劣”、农民不合理利用土地以及自然条件的局限等问题。通过借鉴建三江管理局耕地占补平衡的创新经验,完善垦区专门性制度规范,不单纯以数量作为耕地占补平衡衡量标准、借助现代技术手段实现对表土的充分利用,形成体系化改革。助力垦区乃至全国其他地区全面实现耕地占补平衡,从而实现耕地的可持续发展,保障国家粮食安全。 相似文献
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基于农户调查基础上研究黑龙江省农村宅基地流转问题并提出相应对策,以盘活存量农村宅基地,提高农村宅基地集约节约利用度。通过对帽儿山镇农村宅基地流转现状进行实地调研,在收集整理农户对宅基地流转意愿数据的基础上,从农户视角出发对农村宅基地流转进行了初步探讨,分析帽儿山镇农村宅基地流转现状,揭示出帽儿山镇农村宅基地流转存在的问题,借鉴文献中的成功经验与方式方法,提出相应的建议与对策,为帽儿山镇农村宅基地流转的制度化、规范化、法制化提供依据。 相似文献
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杀虫剂的亚致死效应研究是害虫可持续治理和杀虫剂科学应用中一项较复杂、重要的课题,其研究的最终目的在于更好地推进化学杀虫剂在害虫综合治理(IPM)中的合理应用,同时实现“农药减量控害”的目的。鉴于此,本文根据近年文献资料,分类整理了杀虫剂对害虫生长发育、繁殖力、生态行为和抗药性等方面的亚致死效应,主要阐述了有关解毒酶及性信息素通讯系统的亚致死效应作用机制,并对杀虫剂亚致死效应的研究前景进行了展望,旨在为更全面深入了解杀虫剂的亚致死效应及科学应用提供参考和理论依据。 相似文献
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不同苹果品种对桃小食心虫生长发育和繁殖的影响 总被引:4,自引:1,他引:3
为探索苹果不同品种对桃小食心虫Carposina sasakii生长发育和繁殖的影响,在温度25±1 ℃、相对湿度(70±5)%、光周期L:D=16 h:8 h的室内条件下,测定了桃小食心虫在红富士、国光、新红星、金冠4个品种上的发育历期、存活率和产卵量,并组建了其生命周期表.结果显示,4个品种之间,除雌成虫外,桃小食心虫的卵、幼虫、蛹和雄成虫的发育历期差异均不显著;单雌总产卵量以金冠种群最高,为285.07粒,新红星种群最低,为145.25粒;总成活率以金冠种群最高,为17.23%,而红富士种群仅为6.55%;内禀增长率最高的是金冠种群,之后依次为国光、新红星、红富士种群.表明4个试验品种中金冠是桃小食心虫最适宜的寄主品种. 相似文献