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山东栒子是中国山东省的特有种,现已处于极度濒危状态。目前,山东栒子的分子生物学研究较少,基因数据库资源极度缺乏,急需探究其生物学遗传信息,以加快对山东栒子的保护遗传学工作。本研究以山东栒子叶片、花、成熟果实为实验材料,利用PacBio Sequel测序平台对其转录组进行全长转录组测序。共得到高质量去冗余的转录本53932个,作为最终转录本序列。预测到的CDS区共52490个;对其SSR位点进行分析,对测序得到Unigenes进行单核苷酸至六核苷酸重复的SSR位点搜索,共搜索到26796个SSR位点。对非冗余转录本利用BLAST软件与NR、Swissprot、GO、COG、KOG、KEGG 6个数据库进行比对,一共成功注释了53319个Unigenes,其中与NR数据库进行比对中注释为苹果的的相关基因数量最多,其次是白梨和桃;在GO数据库中有33305条山东栒子Unigenes被注释分类,由生物学过程、细胞成分和分子功能三部分组成;在与COG数据库比对中,共有23910条比对到了同源序列,且一共被分为25类;在与KEGG数据库的一系列比对中,可将Unigenes映射到126条代谢通路中。本研究在高通量全长转录组水平对山东栒子进行了系统研究,这为进一步开展山东栒子的分子标记开发和挖掘优良基因提供了科学依据,从而推动山东栒子的保护与利用。 相似文献
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以黄瓜、萝卜和白菜种子为试材,采用西洋参水提液处理的方法,研究了不同浓度的健康和患根腐病西洋参水提液对3种受试植物种子萌发率、幼苗下胚轴长、根长和鲜质量的影响,分析健康和患根腐病西洋参的差异性化感作用,以期为进一步筛选和鉴定差异化感物质提供参考依据.结果 表明:患根腐病西洋参水提液分别在25000 mg·L-1和2500 mg·L-1显著抑制黄瓜和白菜种子萌发,抑制率最高分别为37.25%和24.00%,而健康西洋参水提液则无明显抑制作用.此外,患根腐病西洋参水提液也明显降低了黄瓜、白菜、萝卜幼苗的根长和下胚轴长,抑制了幼苗的生长,而健康西洋参水提液不明显.总体上表明健康和根腐病西洋参水提液对黄瓜、萝卜和白菜种子的化感作用存在显著差异性. 相似文献
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【目的】氮肥减施条件下,筛选出适合辣椒生长的氨基酸液体肥料比例,提高辣椒的产量及品质。【方法】以辉腾8号为材料,共设6个处理,以常规施肥为对照,减施氮肥10%、20%、30%、40%、50%,配施氨基酸液体肥料,测定辣椒的生长指标、产量及品质指标,分析氨基酸液体肥料替代化肥对辣椒生长、产量及品质的影响。【结果】各处理对辣椒的生长、产量及品质都有影响。T4处理可以提高辣椒的产量,其中,单果重、单株果实数、单株产量、小区产量分别比CK提高0.17%、28.98%、10.11%、24.64%。同时,T4处理可以改善辣椒的品质,果形指数、可溶性蛋白、可溶性糖、VC比CK提高12.62%、10.92%、3.63%、30.44%,硝酸盐含量比CK降低22.61%。【结论】氨基酸液体肥料可以替代部分氮肥且T4处理(减施氮肥40%,配施28 kg/667m2的氨基酸液体肥料)进行基施和追施,可使辣椒的产量和品质达到最好。 相似文献
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对杭州市桐庐县茶园、果园和桑园土壤肥力的调查表明,该县园地土壤酸化明显、土壤有机质和全氮偏低、土壤有效钾不足;土壤有效磷高低相差较大,茶园、果园土壤磷素缺乏明显,桑园土壤有效磷平均较丰富,但仍有一定面积的土壤存在磷素不足。建议重视园地土壤酸化的防治,增加有机肥料的投入,增强配方施肥的推广力度。 相似文献
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陆地棉ZF-HD蛋白的全基因组分析 总被引:1,自引:0,他引:1
ZF-HD(Zinc finger-homeodomain)蛋白属于同源异型盒蛋白家族,在动植物发育过程中起重要的作用。利用生物信息学的手段,研究陆地棉标准系TM-1基因组中ZF-HD蛋白的数目、亚细胞定位、染色体分布、基序、进化关系和组织表达情况。TM-1中共有35个Gh ZHD蛋白成员,且大部分成员定位到细胞核内;分布在20条染色体和2条Scaffold上,且具有11对直系同源基因;进化树分析表明,TM-1基因组中的ZF-HD蛋白大致分为6个小组,每个小组成员间具有类似的基序类型和排列顺序;大部分Gh ZHD基因在胚珠和纤维组织中表达,还有部分基因在根、茎、花、蕾和分生区中表达,在叶和愈伤组织中表达的基因最少。 相似文献