隆林牛与郏县红牛线粒体DNA全基因组遗传多样性比较研究

摘　要：［目的］本研究旨在从基因组水平探究隆林牛和郏县红牛的线粒体DNA（mtDNA）全基因组遗传多样性与母系起源,并对2个黄牛品种的mtDNA全基因组遗传多样性进行比较分析。［方法］采用全基因组重测序及生物信息学方法。［结果］在15头隆林牛和28头郏县红牛mtDNA全基因组序列中,共检测到36种单倍型,其中郏县红牛有26种单倍型,隆林牛仅有8种单倍型,2个黄牛品种共享2种单倍型。郏县红牛和隆林牛的平均单倍型多样度（Hd）分别为1.000和0.943,平均核苷酸多样度（Pi）分别为0.0080和0.0053,表明其遗传多样性丰富。构建的系统发育树表明,隆林牛和郏县红牛具有瘤牛和普通牛两个母系支系。［结论］隆林牛以瘤牛起源为主,郏县红牛为普通牛与瘤牛的混合起源,这2个地方黄牛品种具有独特的母系遗传信息,表现出明显的母系遗传差异。     

郏县红牛体尺测定与改良选育

[目的]为了摸清纯种郏县红牛的现状。[方法]本研究在郏县红牛主产区对92头良种繁育场的纯种郏县红牛和197头农户散养的纯种郏县红牛进行了体尺测定。[结果]表明,纯种郏县红牛的体尺与历史记录差异不大,说明郏县红牛在核心主产区仍保持着较为纯正的血统。但是繁育场中的郏县红牛的体尺要大于农户散养的郏县红牛,说明在郏县红牛的选育中要进一步加强饲养管理。[结论]我们建议要控制合适的外血比例以保持郏县红牛自身的特色,同时随着现代生物技术在家畜育种中的应用,建议在今后的育种实践中应该将常规育种和分子育种相结合,以提高郏县红牛向肉用方向选育的进度。     

郏县红牛FGF13基因拷贝数变异及其与生长性状关联性分析

本研究旨在检测郏县红牛成纤维生长因子13（fibroblast growth factor 13, FGF13）基因的拷贝数变异（copy number variation, CNV）及其与生长性状之间的相关性分析。本研究利用实时定量PCR（real-time quantitative PCR, qPCR）技术,以57头郏县红牛为研究对象,检测FGF13基因CNV,并利用皮尔逊相关分析进行FGF13基因拷贝数与郏县红牛生长性状的关联分析。结果表明,郏县红牛FGF13基因的相对拷贝数高于对照组秦川牛（P<0.05）,在郏县红牛群体中,FGF13基因CNV位点存在拷贝数增加Gain,拷贝数正常Normal和拷贝数减少Loss三种类型;关联分析结果显示,FGF13基因的相对拷贝数与郏县红牛的体斜长呈显著的正相关（P<0.05）。该研究结果表明,FGF13基因的CNV位点与郏县红牛的生长性状显著相关,可作为分子标记应用于郏县红牛的分子标记辅助选择育种工作中。     

秦川牛和郏县红牛GBP2基因拷贝数变异检测及其对生长性状的效应分析

本研究旨在黄牛中检测GBP2基因的拷贝数变异及其遗传效应分析。运用实时定量荧光PCR(q PCR)技术,分别在80头秦川牛和30头郏县红牛个体中检测GBP2基因2个拷贝数变异CNV1和CNV2,并对GBP2基因这2个拷贝数变异与黄牛的生长性状进行关联分析。结果表明:GBP2基因拷贝数在秦川牛和郏县红牛中均存在Gain(拷贝数增加)、Median(拷贝数正常)和Loss(拷贝数缺失)3种类型;关联分析发现,GBP2基因拷贝数变异对秦川牛体长、体高和体重等几个重要性状的影响差异显著(P0.05),其中CNV1和CNV2均表现为Loss/Median型在生长性状上优于Gain型;在郏县红牛中CNV1为Loss型的个体在腰角宽和坐骨端宽性状上显著强于Gain/Median型,CNV2则在体高上表现为Loss型优于Median型(P0.05)。因此,GBP2基因的拷贝数变异CNV1和CNV2均与生长性状显著相关,可作为秦川牛和郏县红牛的生长性状辅助选择分子标记之一。     

郏县红牛TAFA1基因多态性及其与生长性状的关联分析

本研究旨在探讨TAFA趋化素样家族成员1（TAFA1）基因多态性与郏县红牛生长的关联性。试验共采集了79头郏县红牛成年母牛的血样并提取基因组DNA,利用直接测序法对TAFA1基因上的错义突变SNP rs137516577进行基因型分型,并与郏县红牛体高、体长、胸围、腰角宽、坐骨端宽、尻长、十字部高、荐高、胸深、胸宽、体重等11个生长和体尺性状进行关联分析。同时根据“Animal Omics Datebase”数据库对TAFA1基因的组织表达情况进行分析。结果发现该SNP与体长、腰角宽、坐骨端宽、尻长和体重等性状显著相关（P<0.05）,且GC型个体体长、腰角宽、坐骨端宽、尻长和体重均显著高于GG型（P<0.05）。TAFA1基因在牛大脑组织中表达量最高。结果表明,TAFA1基因上错义突变SNP rs137516577与郏县红牛生长性状相关,可作为郏县红牛生长性状的分子标记。     

郏县红牛mtDNA D-loop区遗传多样性与母系起源研究

［目的］探究郏县红牛的mtDNA D-loop遗传多样性与母系起源。［方法］采用生物信息学方法。［结果］在46头郏县红牛mtDNA D-loop区全序列共检测到60个变异位点,定义20种mtDNA D-loop单倍型,平均单倍型多样度(Hd)为0.8530,平均核苷酸多样度(Pi)为0.0254,表明郏县红牛有丰富的母系遗传多样性。构建的IQ系统发育树表明郏县红牛具有瘤牛和普通牛两个母系支系。［结论］郏县红牛具有丰富的母系遗传多样性,有普通牛和瘤牛两个母系起源。     

郏县红牛生长及肉用性能测定与分析

试验采用超声波活体测定和屠宰测定等手段对261头郏县红牛的生长发育指标、44头成年郏县红牛的活体背膘厚和眼肌面积以及6头育肥至30月龄的郏县红牛(公牛)屠宰后肉中氨基酸含量指标进行了测定与分析,旨在系统分析郏县红牛的生长性能及肉用性能。结果表明,郏县红牛公牛体斜长极显著高于阉牛(P0.01),但与产肉相关的生长发育指标在不同性别间差异不显著(P0.05);不同年龄段郏县红牛各项体尺指标均差异极显著(P0.01);超声波活体测定30月龄郏县红牛公(母)牛眼肌面积为(76.21±7.62) cm~2,显著高于秦川牛和延边牛(P0.01),与南阳牛相近;屠宰后郏县红牛背最长肌氨基酸总量为16.29 mg/100 mg,其中29.59%为必需氨基酸,必需氨基酸/非必需氨基酸(EAA/NEAA)约为42.86%。研究结果显示,郏县红牛具有良好的肉用遗传改良潜力。     

郏县红牛种质资源个性描述

通过查阅文献、现场调查、取样分析,对郏县红牛的基本情况、群体情况、生理生化指标、种质基本特征描述、体尺体重、繁殖性能、生产性能、遗传指标、饲养管理等方面对郏县红牛种质资源进行个性描述.在对郏县红牛种质资源进行评估的基础上,提出郏县红牛的研究开发及主要利用方向.     

郏县红牛选育研究小组对全县种公牛进行普查鉴定

郏县红牛是河南省地方良种黄牛品种之一。为了保持郏县红牛优良特性,切实搞好选育工作,郏县红牛选育研究小组于1984年8月26日对全县种公牛进行了外貌、体尺、体重等方面的普查鉴定。鉴定结果表明,在52头种公牛的各性状等级中,体重等级较好,一级以上者40     

河南省三种地方牛种超数排卵结果与分析

［目的］为了分析河南三种肉牛超数排卵效果。［方法］分别选择夏南牛、郏县红牛、南阳牛作为试验母牛,采用两次PG+促卵泡素(FSH)的方法对试验母牛进行超数排卵,观测试验母牛获得总胚胎数、可用胚数分析超数排卵效果。［结果］结果显示,夏南牛可用胚9.86枚/头,南阳牛可用胚7.71枚/头,郏县红牛为6.75枚/头,可用胚中夏南牛最高与郏县红牛和南阳牛有显著性差异。可用胚率郏县红牛最高79.41%,显著高于夏南牛和南阳牛。［结论］结果表明,PG+FSH法可以用于夏南牛、郏县红牛和南阳牛的超数排卵。     

郏县红牛的分子育种研究与高效选育

本文围绕郏县红牛肉用性状的高效选育,分析了郏县红牛种质资源特性与现状,综述了郏县红牛分子育种研究进展与成就,在此基础上,提出了郏县红牛高效选育的实施和措施。首先必须坚持进行郏县红牛的本品种选育,其次是利用已取得的在分子育种方面的研究成果,开展高效选育。在选育和扩群的基础上提出了郏县红牛遗传利用的原则和方法。     

郏县红牛肉用新品系培育和高档牛肉开发思路

郏县红牛是我国八大肉牛良种之一,具有良好的特征特性和稳定的遗传性能,搞好郏县红牛的保种选育与开发利用具有非常重要的意义。本文以郏县红牛的发展及现状为基础,提出了郏县红牛新品系培育的技术路线、方向和方法.并就郏县红牛高档牛肉的开发提出了思路。     

南德温肉牛改良郏县红牛试验效果

为了研究南德温肉牛对郏县红牛的改良效果,本试验测定了初生、6月龄和1岁南郏F_1公、母牛的体尺、体重,并与相应年龄和性别的郏县红牛进行了比较。结果发现,南郏F_1公、母牛各项体尺值(体高、体长、胸围、管围)均显著或极显著地高于郏县红牛,表明利用南德温肉牛对郏县红牛进行杂交改良是切实可行的。     

郏县红牛与不同品种肉牛杂交后代肉用性能比较研究

为了研究郏县红牛与不同品种肉牛杂交后代的肉用性能和肉品质情况,试验选取红安格斯牛、西门塔尔牛、夏洛莱牛与郏县红牛的杂交1代公牛各5头,纯种郏县红牛5头,分为试验A组（郏县红牛公牛）、B组（红郏F1代公牛（红安格斯牛×郏县红牛））、C组（西郏F1代公牛（西门塔尔牛×郏县红牛））和D组（夏郏F1代公牛（夏洛莱牛×郏县红牛））4个试验组,在同样的饲养管理条件下,持续育肥3个月后屠宰,利用屠宰测定和检验分析的方法对郏县红牛及其不同杂交品种的体尺发育、肉用性能和肉品质进行分析测定。结果表明：采用红安格斯牛、夏洛莱牛改良郏县红牛,在体高、体斜长、胸围和管围方面与郏县红牛纯种牛相比均无显著性差异（P>0.05）;屠宰测定方面,杂交后代组的头重、皮厚、皮重、前二蹄重和尾重,屠体器官食道、气管、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏的重量,以及胴体产肉率、眼肌面积、肉骨比与郏县红牛纯种牛相比均无显著性差异（P>0.05）,但其胴体后腿宽显著高于郏县红牛纯种牛（P<0.05）;红郏F1代公牛高档肉块重和优质肉块重最高,分别为70.22和105.22 kg,但高档牛肉率4组之间差异不显著（P>0.05）,红郏F1代公牛优质牛肉率达到34.43%,显著高于郏县红牛和西郏F1代公牛（P<0.05）,高于夏郏F1代公牛（P>0.05）。在肉品质方面,红郏F1代公牛与肉品风味有关的肌苷酸含量最高,而不饱和脂肪酸含量和与鲜味有关的氨基酸（天门冬氨酸、谷氨酸、甘氨酸和丙氨酸）含量均为夏郏F1代公牛含量最高,分别为53.85%和8.04%。结果提示,采用红安格斯牛、西门塔尔牛和夏洛莱牛改良郏县红牛,没有在体尺发育和肉用性能方面表现出显著优势,但采用红安格斯牛改良郏县红牛可提高郏县红牛肉用性能的潜力,可适度提高高档牛肉和优质牛肉肉块重量,而夏洛莱牛改良郏县红牛可适度提高牛肉品质。     

Comparative Study on the Beef Traits Between Jiaxian Red Cattle and Crossbred Beef Cattle

In order to study the beef traits and beef quality of Jiaxian Red bull with crossbred beef cattle, 5 purebred Jiaxian Red bull, 5 Red Angus cattle×Jiaxian Red bull F1 generation, 5 Simmental cattle×Jiaxian Red bull F1 generation and 5 Charolais cattle×Jiaxian Red bull F1 generation were chosen and assigned into groups A,B,C and D for continual finishing for 3 months of age under the same feeding and management conditions and slaughtered at the end of the trial. The results showed that there were no significant difference in body height, body length, chest girth and cannon circumference between Red Angus cattle×Jiaxian Red bull F1 generation and purebred Jiaxian Red bull, the same as in Charolais cattle×Jiaxian Red bull F1 generation (P>0.05). The weight of head, skin, fore hooves and tail, the skin thick, esophagus, trachea, liver, spleen, lung, kidney, and carcass meat percentage, loin eye area and the meat bone ratio in crossbred beef cattle groups were not significant differences compared with purebred Jiaxian Red bull (P>0.05), but its hind legs wide in carcass was significantly higher than that of purebred Jiaxian Red bull (P<0.05). The high-grade meat weight and high quality meat weight in Red Angus cattle×Jiaxian Red bull F1 generation were 70.22 and 105.22 kg, respectively, and was the highest in four groups,but the high-grade beef percentage among four groups did not show significant differences (P>0.05). The high quality meat percentage in Red Angus cattle×Jiaxian Red bull F1 reached 34.43%, was significantly higher than that of Jiaxian Red bull and Simmental cattle×Jiaxian Red bull F1 generation (P<0.05), and was higher than that of Charolais cattle×Jiaxian Red bull F1 generation (P>0.05). In terms of meat quality, the content of inosinic acid that related with the meat flavor in Red Angus cattle×Jiaxian Red bull F1 was the highest in four groups, while the content of unsaturated fatty acid and the flavor related amino acid, such as aspartic acid, glutamic acid, glycine and alanine, in Charolais cattle×Jiaxian Red bull F1 were the highest in four groups,and their values were 53.85% and 8.04%, respectively. To sum up, the results suggested that there was no significant difference in body development and beef traits using Red Angus cattle, Simmental cattle and Charolais cattle to improve Jiaxian Red bull, while Red Angus cattle crossbred with Jiaxian Red bull could moderately improve the weight of high-grade beef and high-quality beef, and Charolais cattle could moderately improve the beef quality of Jiaxian Red bull.     

对郏县红牛的主动保种问题讨论

为了促进郏县红牛的保种安全性.通过对郏县红牛主产区牛群的调查,认识到在现代肉牛生产体系中,郏县红牛属于一个良好的母本品种,具有很多优良特性.提出要依据保种理论建立保种群体,尽量提高保种群体的安全性;以发展促进保种,不断选育提高,合理利用导入杂交.作者认为,主动保种是郏县红牛长期保种的有效途径.