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相似文献
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1.
外源基因在甲醇酵母Pichia pastoris中的表达策略   总被引:1,自引:0,他引:1  
甲醇酵母Pichia pastoris表达系统是近几年发展起来的一个真核表达系统,在其乙醇氧化酶基因启动子的控制下,某些外源基因的表达量可达克/升以上。虽然该系统是一种优良的表达系统,但有许多因素影响外源基因在其中的表达,包括外源基因的拷贝数及其整合到酵母染色体的位置和方式、mRNA的5′和3′端非翻译区、转录起始密码子的上下文、外源基因A+T的组成与转录和翻译的阻断、密码子的偏爱性、信号肽序列的特性、产物的稳定性、宿主菌的生理特性、培养基成份和培养条件等。在应用该表达系统过程中,这些因素均需予以考虑。本文就这些因素作了概述和讨论,有利于提高外源基因在该系统中的表达水平。  相似文献   

2.
猪繁殖与呼吸综合征病毒ORF6基因在毕赤酵母中的表达   总被引:2,自引:0,他引:2  
根据酵母表达系统的密码子偏爱性、poly(A)信号以及外源基因mRNA5’端的二级结构等特性 ,对猪繁殖与呼吸综合征病毒 (PRRSV)ORF6基因进行简并改造和人工合成 ,然后以正确的读码框架插入到分泌型酵母高效表达载体pPICZαA的α因子信号肽编码序列 3’端 ,构建成酵母转移载体 ,用化学方法转化受体酵母菌GS115 ,经PCR和酶切鉴定证实 ,目的基因已整合到重组酵母菌染色体中。对重组酵母进行诱导表达 ,并通过SDS_PAGE和Westernblot分析进行筛选 ,获得了一株高效表达目的蛋白的重组酵母菌 ,该重组蛋白具有免疫学活性 ,其表达水平可达 2 .0g/L ,而未经改造的ORF6基因则不表达  相似文献   

3.
为了揭示猪α-(1,2)岩藻糖转移酶2(FUT2)基因密码子使用特性并提高其在外源宿主内的表达量,本研究综合运用EMBOSS Explorer网站和CodonW软件包分析了猪FUT2基因的密码子使用偏好性的相关参数,并与3种模式生物(大肠杆菌、酵母菌和果蝇)基因组密码子使用模式进行比较,最后参照与之最为相近的模式生物基因组密码子使用方式,利用JCat和OPTIMIZER两个密码子优化网站对猪FUT2基因密码子进行优化。结果显示,猪FUT2基因表达水平不高,存在24种偏好密码子,且这24种偏好密码子中有23种以G/C结尾;猪FUT2基因与果蝇基因组密码子使用模式的差异小于大肠杆菌和酵母基因组,表明果蝇更适合猪FUT2基因的外源表达;根据果蝇基因组密码子使用模式优化猪FUT2基因密码子,优化后其适应指数有了明显提高,而整体GC含量没有明显变化,说明在理论上猪FUT2基因优化成功。本研究从翻译水平上揭示了猪FUT2基因的密码子使用特性,为其在遗传改良中选择最佳外源表达系统及提高其在宿主细胞内的表达水平提供一定的理论依据。  相似文献   

4.
大肠杆菌表达系统的影响因素   总被引:4,自引:0,他引:4  
大肠杆菌已经被广泛地应用于表达各种外源基因,但并非每一种基因都能在其中有效表达。基因的表达受到多种因素的影响,表达效率也有很大差异。本文从外源基因本身特性和表达系统的特性及其他因素等方面阐明外源基因高效表达的影响因素,从而为大肠杆菌表达系统高效表达外源蛋白提供参考。  相似文献   

5.
猪繁殖与呼吸综合征病毒ORF6基因在比赤酵母中的表达   总被引:2,自引:0,他引:2  
根据酵母表达系统的密码子偏爱性、poly(A)信号以及外源基因mRNA5′端的二级结构等特性,对猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)ORF6基因进行简并改造和人工合成,然后以正确的读码框架插和到分泌型母高效表达载体pPICZαA的α因子信号肽编码序列3′端,构建成酵母转移载体,用化学方法转化酵母菌GS115,和酶切鉴定证实,目的基因已整合到重组酵母菌染色体中。对重组酵母进行诱导表达,并通过SDS-PAGE和Western blot分析筛选,获得了一株高效表达目的蛋白的重组酵母菌,该重蛋白有免疫学活性,其表达水平可达2.0g/L,而未经改造的ORF6基因则不表达。  相似文献   

6.
本研究以近期报道的高生物学活性、高代谢稳定性的牛生长激素释放因子类似(Ile^2,Ala^15,Leu^27)bGRF(1-29)-NH2的氨基酸序列为模板,选用大肠杆菌高效表达所偏爱的密码子设计出该基因的全序列。采用化学合成法合成两个3’末端有19碱基互补的80碱基的寡核苷酸片段。并互为模板和引物,通过酶促延伸合成完整的bGRF类似物基因,克隆于pT7 Blue T-Vector中,通过蓝/白筛  相似文献   

7.
为了揭示猪α-(1,2)岩藻糖转移酶2(FUT2)基因密码子使用特性并提高其在外源宿主内的表达量,本研究综合运用EMBOSS Explorer网站和CodonW软件包分析了猪FUT2基因的密码子使用偏好性的相关参数,并与3种模式生物(大肠杆菌、酵母菌和果蝇)基因组密码子使用模式进行比较,最后参照与之最为相近的模式生物基因组密码子使用方式,利用JCat和OPTIMIZER两个密码子优化网站对猪FUT2基因密码子进行优化。结果显示,猪FUT2基因表达水平不高,存在24种偏好密码子,且这24种偏好密码子中有23种以G/C结尾;猪FUT2基因与果蝇基因组密码子使用模式的差异小于大肠杆菌和酵母基因组,表明果蝇更适合猪FUT2基因的外源表达;根据果蝇基因组密码子使用模式优化猪FUT2基因密码子,优化后其适应指数有了明显提高,而整体GC含量没有明显变化,说明在理论上猪FUT2基因优化成功。本研究从翻译水平上揭示了猪FUT2基因的密码子使用特性,为其在遗传改良中选择最佳外源表达系统及提高其在宿主细胞内的表达水平提供一定的理论依据。  相似文献   

8.
VP1蛋白是口蹄疫病毒(FMDV)的主要结构蛋白,可诱导机体产生中和抗体以及激发保护性免疫应答。为探究VP1基因密码子偏好性,筛选出其最佳体外表达系统,使用Visual Gene Developer、CodonW、GraphPad Prism等软件,对VP1基因进行密码子偏好性分析,同时将VP1基因密码子使用频率与大肠杆菌、毕赤酵母、昆虫杆状病毒和哺乳动物细胞表达系统作了比较。结果显示,VP1基因的CAI为0.21,ENC为55.43,GC3S为65.26%,表明该基因密码子使用偏好较弱并且密码子偏好以G/C碱基结尾。结合VP1基因与各表达系统密码子使用频率比值,发现其与昆虫杆状病毒表达系统频率比值差异最小且CAI最大,因此推断昆虫杆状病毒表达系统是FMDV VP1基因最适体外表达系统。本研究为FMDV亚单位疫苗研制等提供了技术基础。  相似文献   

9.
 乙烯应答因子(ethyleneresponsefactor,ERF)是植物特有的一类转录因子,参与植物生长发育和胁迫应答等多个生理生化过程。本研究以拟南芥AP2结构域为探针搜索美国国立生物技术信息中心(NCBI)的苜蓿属蛋白质数据库,运用生物信息学软件分析苜蓿乙烯应答因子的系统进化、疏水轮廓、二级结构、信号肽以及亚细胞定位情况。运用半定量RT-PCR 技术研究5个紫花苜蓿乙烯应答因子基因(MsERF1,MsERF2,MsERF6,MsERF7,MsERF9)表达的组织差异性以及多种处理条件下的表达特性。结果表明,5个乙烯应答因子基因在叶中的表达量都明显高于其他组织,不同基因有不同的组织表达特性;NaCl和PEG6000 对MsERF2 的表达没有影响,但Al2(SO4)3能诱导其表达,其余基因的表达都受这3种处理的诱导;脱落酸对MsERF2的表达没有影响,能够诱导其他基因的表达;生长素只能诱导MsERF6的表达,对其他基因的表达没有影响;赤霉素、茉莉酸甲酯和乙烯利对5个基因的表达都起促进作用。本研究为进一步研究苜蓿乙烯应答因子的结构和功能奠定了基础,同时为研究不同信号传导途径之间的相互作用提供了依据。  相似文献   

10.
全鱼基因在鲫鱼体内的整合与转录   总被引:1,自引:0,他引:1  
以鲤鱼金属硫蛋白启动子与大麻哈鱼生长激素基因重组的融合全鱼基因(commoncarpmetaloth-ioneinpromoterandtroutsalmongrowthhormonegene,cMTsGH)为外源基因,通过显微注射法将其线性片段导入鲫鱼受精卵内,研究了其整合与转录效率。结果表明,全鱼基因在鲫鱼基因组中的整合率为36.4%(16/44),对转基因鱼阳性的RNA样本进行Northern印迹杂交检测,转录率为25%(1/4)。由此认为,该全鱼基因可以作为转基因鱼研究和应用的外源基因。  相似文献   

11.
12.
在毕赤酵母真核表达系统中表达柔嫩艾美耳球虫真核起始因子3d(Emeria tenella eukaryotic initiation factor 3d,EteIF3d)基因,并获得具有天然构象的活性蛋白。将EteIF3d基因克隆到毕赤酵母表达载体pPIC9k上,将构建正确的重组质粒通过电激转化入酵母细胞GS115,用组氨酸缺陷培养基和G418分别进行筛选,获得含重组质粒的酵母表达细胞。在含1%甲醇的BMMY培养基中诱导培养,收集1~3 d的表达上清。表达产物进行SDS-PAGE检测,并用Western blot进行免疫学分析。结果表明,本研究成功构建了重组质粒pPIC9k-EteIF3d,并成功表达该蛋白,且该蛋白能与兔抗EteIF3d血清特异性结合,具有良好的抗原性。EteIF3d基因可在真核表达系统毕赤酵母中表达,且获得蛋白具有抗原性,从而为进一步研究该蛋白的结构和功能奠定了基础。  相似文献   

13.
为给猪细小病毒(Porcineparvovirus,PPV)主要非结构蛋白(NS1)基因选择良好的宿主表达系统提供参考依据,本研究运用EMBOSS在线分析软件的CHIPS和CUSP程序对PPVNS1基因进行密码子偏爱性分析。结果显示PPVNS1基因的CAI值为0.642,ENC值为39.703,这表明NS1在密码子使用上存在较明显的偏爱性,且第三位核苷酸尤其偏爱A或T;从与PPVNS1基因密码子使用频率比值上看,使用频率差异较大的在大肠杆菌有33个、酵母有26个、人有27个;PPVNS1基因共有71个大肠杆菌稀有密码子,并且还有多个稀有密码子多次串联成簇出现的情况。结果表明酵母等真核生物与其密码子偏爱性较为接近,可作为该基因体外表达宿主的首选。  相似文献   

14.
15.
To stably maintain pregnancy, several genes are expressed in the uterus. In particular, the endometrial expression of genes encoding growth factors appears to play a key role in maternal–foetal communication. The previous studies characterized the endometrial expression kinetics of the genes encoding epidermal growth factor (EGF), its receptor (EGFR), transforming growth factor-alpha (TGF-α), amphiregulin (Areg), heparin-binding (Hb) EGF and calbindin-D9k (CaBP-9k) in pigs during implantation. Here, we further characterized the expression patterns of these molecules during the entire porcine pregnancy. Porcine uteri were collected at pregnancy days (PD) 12, 15, 30, 60, 90 and 110 and subjected to RT-PCR. EGF and EGFR showed similar expression patterns, being highly expressed around implantation and then disappearing. TGF-α and Areg expression levels rose steadily until they peaked at PD30, after which they gradually decreased to PD12 levels. This Areg mRNA expression pattern was confirmed by real-time PCR and similar Areg protein expression patterns were observed. Immunohistochemical analysis of PD60 uteri revealed Areg in the glandular and luminal epithelial cells. Hb EGF was steadily expressed throughout the entire pregnancy, while CaBP-9k was expressed strongly on PD12, and then declined sharply on PD15 before recovering slightly for the remainder of the pregnancy. Thus, the EGF family may play a key role during implantation in pigs. In addition, CaBP-9k may help to maintain uterine quiescence during pregnancy by sequestering cytoplasmic Ca2+.  相似文献   

16.
Epidermal growth factor (EGF) is a potent mitogen for a variety of cell types. The 53-amino acid mature EGF protein is encoded by sequences in exons 20 and 21 of a gene spanning over 110 kb. In this study, we report the cloning and characterization of 7.5 kb of bovine genomic sequence homologous to exon 19 through 21 from EGF genes from other mammalian species. The cloned gene fragment had an unusual sequence composition in the form of an in-frame TGA codon in the coding sequence. The sequence was expressed at low levels in kidney tissue and the corresponding cDNA contained the TGA codon. The level of similarity between the bovine exonic sequence and the human, porcine, murine, feline, and canine corresponding sequences varied from 64% to 73%; however, when only sequences encoding the mature EGF protein were compared, the level of similarity between the bovine sequence and the sequence from these species was 59% to 66%. The sequence similarity of the deduced mature protein was lower (34% to 39%) than the sequence similarity of the deduced propeptide. Although the cloned sequences could originate from a bovine EGF pseudogene, the possibility exists that they originate from the functional EGF gene. An as yet unidentified mechanism to by-pass the stop codon would allow the synthesis of a functional EGF protein. Alternatively, the cloned sequence could originate from an EGF-like gene.  相似文献   

17.
旨在探讨体外成熟(IVM)液中添加血小板活化因子(PAF)对牦牛卵母细胞发育能力及基因表达影响。本试验将牦牛1 025个卵丘-卵母细胞复合体(COCs)分为4组,分别在含不同浓度PAF(0、10-8、10-7和10-6mol·L-1)的IVM液中成熟后,与奶牛精子体外受精(IVF)和体外培养(IVC),比较分析各组卵母细胞成熟率、卵裂率和囊胚率以及COCs和胚胎中抗凋亡(BCL-2)、促凋亡(BAX)、表皮生长因子(EGF)及其受体(EGFR)、转录因子(OCT-4和NANOG)和c-fos等基因的表达量差异。结果表明,IVM液中PAF浓度为10-7mol·L-1组的卵母细胞成熟率((92.16±0.19)%)、卵裂率((77.20±0.85)%)和囊胚率((46.71±0.68)%)显著高于其他组(P<0.05)。qPCR结果显示,在该组成熟的COCs中BCL-2、EGFEGFRc-fos表达量显著上调(P<0.05),而促凋亡基因BAX表达量显著下调(P<0.05),囊胚中EGFEGFR、OCT-4基因表达量显著上调(P<0.05)。各组间2-、4-、8-细胞、桑椹胚和囊胚中BCL-2、BAXNANOG表达量差异不显著,但桑椹胚和囊胚中BCL-2表达量均明显下调,而BAX表达量均明显上调。综上所述,IVM液中适宜浓度PAF(10-7mol·L-1)可以促进牦牛卵母细胞成熟和胚胎发育,调控细胞凋亡和增殖相关基因的表达。  相似文献   

18.
Components of the insulin-like growth factor (IGF) system were investigated in chondrocytes isolated from the avian growth plate. The genes for IGF-I, IGF-II, type 1 IGF receptor (IGF-R), IGF binding protein-2 (IGFBP-2), IGFBP-3, IGFBP-5 and IGFBP-7 were found to be expressed in both proliferative and hypertrophic chondrocytes. The expression of IGF-II in proliferative chondrocytes was extremely high relative to IGF-I. Although IGF-I expression was significantly increased in hypertrophic chondrocytes, the level was still low relative to IGF-II. In cell culture, IGF-I stimulated proteoglycan synthesis and increased the expression of Indian hedgehog (Ihh) and type X collagen, markers of chondrocyte differentiation. IGF-II was found to be equally efficacious in stimulating proteoglycan biosynthesis. These observations suggest that IGF-II may play a significant role in avian growth plate physiology, which is consistent with several reports on mammalian endochondral bone growth.  相似文献   

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