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应用荧光RT-PCR技术检测口蹄疫病毒 总被引:4,自引:0,他引:4
1 材料与方法1.1 试剂 裂解液 ,DEPC水、carrier RNA、RT-PCR反应液 ,RT- PCR酶颗粒 (Beads)、Taq酶。均由深圳匹基生物工程股份有限公司提供。1. 2 引物设计 上游引物 :5′- TCCACTAGC-GAGTGTTAGTAGC- 3′;下游引物 :5′- GCCTGT-CACCAGTGTTTGAGTA- 3′。1.3 试验材料 进口冻肉、冻猪脚、冻猪耳等。1.4 仪器 荧光 PCR仪 ,L ight cycler(Roche公司生产 )。1.5 操作方法1.5 .1 样本处理 (1)取 n个 1.5 ml灭菌离心管 (n=样本数 + 1管阴性对照 + 1管阳性对照 ) ,作好标记。 (2 )在各离心管中加入 6 0… 相似文献
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用RT-PCR方法检测口蹄疫病毒 总被引:3,自引:0,他引:3
口蹄疫(FMD)是致偶蹄兽的一种急性、热性、高度接触性传染病,主要特点是流行广、传播快、发病率高,被国际兽疫局列为A类传染病之首。该病对畜牧业生产危害性极大,是世界各国检测和防疫的重点对象。由于FMDV传代速度快且有多种传播途径,特别是康复和亚临床感染动物及其畜产品(主要为肉、奶类)带毒,给FMD的防疫工作带来诸多困难。目前,检测FMDV常用的技术有动物接种、 相似文献
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一步法RT-PCR检测禽呼肠孤病毒的研究 总被引:6,自引:0,他引:6
根据已发表的禽呼肠孤病毒(ARV)S1133株S1基因序列,设计合成了一对扩增跨幅为532bp的引物。这对引物对ARV标准株,分离株以及人工感染SPF鸡跗关节组织抽提的核酸进行一步法RT-PCR扩增,即将反转录和PCR反应在一个PCR反应管中一次性完成。结果该方法对ARV4个标准株和5个分离株的扩增均获得了与预期大小一致的RT-PCR产物,而对照样品的扩增全为阴性;该方法最低可检测到0.16ng的ARV RNA,还可以直接从感染鸡关节组织抽提的核酸中检测到ARV RNA,表明该一步法RT-PCR对于ARV的检测是可行的。 相似文献
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RT-PCR检测猪传染性胃肠炎病毒方法的建立 总被引:3,自引:0,他引:3
猪传染性胃肠炎 ( TGE)是一种以严重腹泻、呕吐和脱水为临床特征的高度接触性传染病 ,属于国际兽疫局 ( OIE)法典中 B类疫病必检的猪传染病。TGEV是一种有囊膜的正链 RNA冠状病毒。目前检测 TGEV的方法主要有中和试验、免疫荧光抗体试验、酶联免疫吸附试验和电镜技术 ,这些方法对于检测 TGEV和防制 TGE起到了重要作用 ,但也存在特异性不强、灵敏性差、耗时长等缺点。c DNA探针、RT- PCR近年来已成为国际上用于检测病原微生物的主要方法。由于 c DNA探针与临床样品中非相关核酸有一定的非特异性结合 ,尤其是检测粪便、尿液等… 相似文献
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为了能快速准确地对禽流感进行病原学诊断,根据流感病毒的M基因序列,在保守区内用Olig04.0软件设计了1对引物,建立了一步法RT—PCR诊断方法,其目的片段大小为229bp。通过对不同稀释倍数的H5亚型禽流感病毒尿囊液和棉拭子浸出液进行检测,结果显示,病毒尿囊液的最低检出稀释度为1:10^4;阳性棉拭子的最低检出稀释度为1:2^3。用病毒分离法和一步法RT—PCR同时检测人工感染鸡不同脏器、口咽及泄殖腔棉拭子样品,二者符合率为100%,但前者的检测灵敏度比后者高10~100倍。用该方法检测H1~H15亚型禽流感病毒和鸡新城疫病毒等其他14种禽病病原,所有禽流感病毒均有229bp的目的条带出现,而其他14种禽病病原均无目的条带出现,表明该方法的特异性好。 相似文献
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应用实时荧光定量TaqMan RT-PCR检测口蹄疫病毒 总被引:11,自引:0,他引:11
按照口蹄疫病毒(FMDV)聚合酶3D基因序列,设计合成了引物和探针,经各反应务件的优化,建立了实时荧光定量RT-PcR技术,对细胞培养物、水泡液、水泡皮及分泌物、血液中的FMDV进行了特异性检测和敏感性试验。结果,用300nmol/L的引物浓度和200nmol/L探针浓度,获得的CT值较小,而△Rn最大;可检测到相当于9.1TCID50的病毒RNA;与VSV和其他水泡性病毒不发生交叉反应;制作的标准曲线中各浓度范围内有极好的线性关系,且线性范围宽,相关系数为0.984;组内和组间试验重复性的变异系数(CV)分别为5.4%和6.7%;与常规RT-PCR相比较,该方法具有快速、特异、敏感、可定量,并可同时检测大量样品等优点。 相似文献
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应用荧光RT-PCR检测亚欧型口蹄疫病毒 总被引:1,自引:0,他引:1
根据口蹄疫病毒基因组的5’非翻译区序列比较保守的特点,采用软件设计亚欧型(A、O、C及Asia-1型)FMDV通用的引物和探针,经对反应条件和反应体系进行优化,建立了亚欧型FMDV的实时荧光RT-PCR检测方法。研究表明,该方法检测阳性质粒模板的线性范围为1.9×107-1.9×10拷贝,最低可检测19个拷贝。通过对FMDV各血清型(A、O、C、Asia-1及SAT-1,2,3型)的检测,证实该方法对亚欧型FMDV具有良好的特异性,能有效区分亚欧型和南非型FMDV感染。本研究为亚欧型口蹄疫的快速诊断和流行病学调查提供了新的方法。 相似文献
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参考GenBank中各个血清型口蹄疫病毒3D、vp1、2A基因的标准序列,设计引物P1/P2和S1/S2。建立用于检测口蹄疫病毒及其利用引物S1/S2克隆片段同源性比较而确定血清型的RT-PCR方法。通过敏感性试验检测,2对引物均可以检测到10TCID50的病毒量;特异性试验的检测,2对引物对正常细胞、牛黏膜病病毒、猪瘟病毒、水疱性口炎病毒、牛传染性鼻气管炎病毒的检测结果均为阴性。利用该方法对病牛的流涎液体、水疱液体、舌皮组织、感染犊牛心脏等组织进行检测初步结果显示:该方法可以对O型和AsiaⅠ型口蹄疫病毒进行特异性检测,能够用于口蹄疫急性及亚临床感染的诊断及流行病学调查。 相似文献
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根据已发表的口蹄疫病毒(FMDV)基因序列设计了一对引物,扩增FMDV 3D后1/3区段,应用反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)技术,从组织培养液中扩增出大小为489 bp的基因片段,建立了FMDV RT-PCR检测方法.该方法灵敏度高,可检测出0.01个TCID50的病毒含量;特异性好,不与其他病毒如PRV、PRRSV、JEV等发生交叉反应.阳性样品的检测结果与反向间接血凝(IHA)检测结果的符合率为100%.应用所建立的RT-PCR方法,对采自3个奶牛场的55份鲜奶样品及40份牛鼻拭子样品进行检测.结果表明,所建立的检测方法可用于奶牛隐性感染FMDV的检测. 相似文献
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试验通过对口蹄疫病毒核苷酸序列的比对分析,在O型口蹄疫病毒的P1基因保守区,设计1对特异性引物,应用均匀设计法优化反应参数,建立口蹄疫O型病毒二温式RT-PCR检测方法。对该法进行特异性试验、敏感性试验检测。结果表明,该二温式RT-PCR方法只对口蹄疫O型病毒敏感,对其他血清型的口蹄疫病毒及常见的猪病病毒均不敏感;扩增条带与预期目的片段大小相符,扩增片段经克隆、测序发现与引物所在基因序列的同源性为100%;检测病毒RNA的敏感性为1.665 pg/μL,其敏感性与三步法PCR敏感性检测结果没有差异。运用该法对54头攻毒试验的动物进行检测,阳性鉴定结果与三步法PCR鉴定结果一致,与三步法PCR相比该法节省了20 min,表明所建立的口蹄疫O型病毒二温式RT-PCR方法是一种准确、快速、特异、敏感的检测方法。 相似文献
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According to the gene sequences analysis of foot and mouth disease virus (FMDV) in GenBank,a pair of specific primers was designed in the conserved sequence of type O FMDV P1 gene. The reaction parameters were optimized using the uniform design method to develop a two-temperature RT-PCR method for detection of type O FMDV.The results of sensitivity and specificity showed that the two-temperature RT-PCR method was only specific for type O FMDV without amplification of the other viruses. The amplified fragment was same with the expected length.The cloning and sequencing results revealed that the sequence of amplified fragment had 100% simililarity to the target sequence,and the minimum detection quantity was 1.665 pg/μL,the effective detection rate was consistent with the three step RT-PCR sensitivity test results. 54 taper toxicity test pigs were detected,and positive identification results and three-step PCR results was consistent.Compared with the three-step PCR,it could save 20 min.These results indicated that the developed two-temperature RT-PCR for detection of type O FMDV was a kind of accurate,rapid,specific and sensitive detection method. 相似文献
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利用单克隆抗体技术制备抗口蹄疫病毒的单克隆抗体,特异性试验表明其只与O、A、Asia 1型3种血清型FMDV抗原结合.进而采用胶体金标记技术,以胶体金标记的抗口蹄疫病毒单克隆抗体、多克隆血清抗体和葡萄球菌A蛋白为主要材料,研制口蹄疫快速检测试纸条.该试纸条检测O、A、Asia 1型3种血清型灭活口蹄疫病毒均为阳性,检测水疱性口炎病毒、猪水疱病病毒、蓝舌病病毒、猪蓝耳病病毒4种灭活抗原及小反刍兽疫病毒疫苗株均为阴性,试验结果与口蹄疫实时荧光定量RT-PCR方法的完全一致,表明其具有良好的特异性.敏感性试验结果是,试纸条的检测极限为1∶160稀释的样品,其敏感性相当于实时荧光定量RT-PCR方法的1/64.由于试纸条具有操作方便、检测快速等优点,因此该试纸条可以用于大量临床样品的快速检测和现场检测. 相似文献
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Zhang K Huang J Wang Q He Y Xu Z Xiang M Wu B Chen H 《Research in veterinary science》2011,91(1):90-94
One of the crucial factors for evaluation of an effective genetically engineered vaccine is whether susceptible animals are protected from virus challenge after vaccination. In this study, a recombinant pseudorabies virus (PRV-P12A3C) that expressed capsid precursor polypeptide P12A and nonstructural protein 3C of foot-and-mouth disease virus (FMDV) was used as a vaccine. The expression of P12A3C and its immunogenicity and protective efficacy against FMDV challenge were measured. Humoral and cellular immune responses were evaluated after each immunization. Subsequently, each piglet was challenged with 1000 ID50 (50% infection dose) FMDV serotype O, named OR/80, which is used to produce vaccine in China. PRV-P12A3C induced a high level of neutralizing antibody and FMDV-specific lymphocytes. Inactivated vaccine provided 100% protection, and the vector strain (TK−/gE−/gI−) showed no protection. PRV-P12A3C induced 60% protection, compared with piglets that were vaccinated with TK−/gE−/gI−. The severity of clinical signs for the remaining two piglets was lighter and the appearance of vesicles was delayed. 相似文献
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通过研究重组白细胞介素-2(IL-2)对口蹄疫病毒(FMDV)多表位疫苗免疫效果的增强作用,为IL-2作为 FMDV 表位疫苗佐剂应用提供实验依据。6周龄雌性 Balb/c 小鼠,分为4组,第1组联合免疫表达猪 IL-2的重组腺病毒(rAd5poIL-2)和串联表达 FMDV 多表位基因的重组腺病毒(rAd5EGS),第2、3和4组分别注射 rAd5EGS、灭活疫苗和 PBS,间隔2周免疫1次,共免疫3次。首免后每周采血分离小鼠血清,通过 ELISA 检测血清中特异性 IgG;首免后6周检测血清中抗体亚型 IgG1、IgG2a 及细胞因子 IL-4和 IFN-γ的表达水平,同时分离脾细胞,MTT 法检测淋巴细胞增殖指数。结果显示,联合免疫 rAd5poIL-2和rAd5EGS 既能增强 rAd5EGS 诱导小鼠特异性 IgG、IgG1和 IgG2a 的分泌,又能增强其诱导淋巴细胞增殖能力,且免疫效果强于灭活疫苗;细胞因子检测结果显示,联合免疫 rAd5poIL-2后能增强 rAd5EGS 诱导小鼠 IL-4和 IFN-γ的分泌,且其诱导 IL-4和 IFN-γ分泌能力也强于灭活疫苗。说明重组 IL-2能有效增强FMDV 多表位疫苗诱导抗体分泌能力和细胞免疫应答,rAd5poIL-2有望作为 FMDV 表位疫苗的候选佐剂。 相似文献