胃肠道褪黑素的合成及其对消化道微生物群体影响的研究进展

胃肠道褪黑素主要是由肠嗜铬细胞分泌,具有一定昼夜节律性。褪黑素通过调控细胞因子或NF-κB等调控肠道微生物及其代谢,进而影响动物肠道微生物群体结构以及某些细菌的昼夜节律。本文主要对近几年胃肠道褪黑素的合成分泌及其生理功能、肠道微生物节律性以及褪黑素对肠道微生物的调控作用等研究进行综述,以期为胃肠道褪黑素与菌群之间调控关系的研究提供一定参考。     

反刍动物瘤胃噬菌体的宏基因组学研究方法及进展

病毒(virus)存在于各种动物胃肠道中,反刍动物瘤胃也不例外.瘤胃是一个复杂且多样的微生态系统,包括细菌、真菌、原虫、古生菌和病毒等多种微生物.目前,多组学技术和生物信息学分析手段被广泛用于瘤胃细菌群落的研究.有研究表明,饲粮、环境及宿主基因型会对瘤胃细菌多样性和菌群结构产生影响;瘤胃细菌也会反过来影响宿主机体代谢、...     

如何维持家畜胃肠道微生态平衡

一、家畜胃肠道的微生物菌群微生物是微生态系统中的主要成员。家畜胃肠道微生物区系指在胃肠道内的微生物群落数量、种类及其相互作用。家畜胃肠道的微生态区系受家畜种类、年龄、生理变化、饲料、正常微生物群的菌群关系等的影响。仅就种属不同来说，微生物区系就有明显的差异。反刍动物的瘤胃缺乏胃腺，主要靠微生物的发酵作用消化饲料。瘤胃内有一个庞大的正常微生物区系，在每毫升瘤胃内容物中含细菌数约１０７～１０１２，含纤毛虫６０～８０万个，还有各种酵母菌、螺旋体和放线菌等。反刍家畜肠道内的微生物区系与杂食性家畜相似，肠…     

西部旱区紫花苜蓿地土壤微生物群落结构和多样性分析

为探究紫花苜蓿种植地土壤微生物与区域环境因素及土壤特征关系,本研究以西部旱区苜蓿种植地为研究对象,基于高通量测序技术,结合试验区环境因素,分析了土壤细菌和古菌的群落结构和多样性。结果表明:3个试验区苜蓿种植地土壤微生物优势菌门主要是变形菌门、放线菌门和酸杆菌门,微生物群落结构差异较大;位于乌兰县试验区土壤的微生物多样性显著低于其他两个试验区; 3个试验区海拔、土壤全氮含量与微生物多样性显著相关;冗余分析发现,本文选取的环境因素能解释70%以上的土壤微生物群落变化,其中水分(降水量)和海拔解释度最高。综上所述,苜蓿地土壤微生物群落结构和多样性与环境因素(气候、海拔)、土壤质地密切相关。     

2007~2008年国际反刍动物营养研究进展 Ⅰ.瘤胃微生物多样性和功能

随着试验生物学和生物信息学的快速发展,对瘤胃微生物的多样性和功能开展了系统的研究。笔者综述了2007～2008年在CNKI、ADSA ASAS大会和PubMed等数据库中与瘤胃微生物分子多态性和元基因组学相关的32篇文献。瘤胃微生物群落在“属”分类水平上多样性水平较低,在亚种或菌株水平上表现出极大的多样性,多样性指数估计表明,瘤胃内细菌种类约为900多种,而菌株类型（独特序列型）约为97000种。瘤胃微生物群落结构受到宿主遗传背景、生长发育阶段、日粮、环境条件等多种因素的影响。瘤胃微生物组中蕴藏了大量具有应用潜力的遗传资源,这些结果为准确了解瘤胃微生物群落结构、功能及其调控方式提供了重要的基础。     

宏基因组学在动物胃肠道微生物研究中的应用

实验室条件下可培养的微生物约占自然界中微生物总数的1%,这限制了人们对环境微生物的了解和利用.宏基因组学绕开传统纯培养方法,提供了一种探知微生物多样性和功能基因组的新方法.作者简述了宏基因组学的概念、基本方法,着重介绍了宏基因组学在动物胃肠道微生物研究中的应用和取得的成果,并对宏基因组学的发展做了简要分析.     

关于动物微生态学的几点思考

1 加强动物微生态区系中微生物种类的研究 在动物微生态区系中微生物种类很多,各种不同种类的微生物及其相互之间的互作对动物正常微生态区系有着不同的作用.然而,目前限于研究技术手段的缺陷,对微生物种类的研究主要注重于细菌,而对区系中的病毒、真菌、寄生虫等却缺乏研究.     

微生态制剂对肠道菌群紊乱的调节作用

微生态制剂是根据微生态学基本原理研制 ,用于调节机体的微生态环境。动物微生态学是研究动物机体正常微生物群与宿主相互关系。其研究内容主要包括口腔、胃肠道、泌尿生殖道和皮肤 4个生态学领域。其中胃肠道微生态学在动物生产上的作用研究最多 ,也最深入。1　动物肠道的正常菌群　　细菌、真菌广泛寄居于健康动物的体内和体表 ,动物出生时肠道内是无菌的 ,经 2～ 4h后有大量细菌进入并繁殖 ,称为细菌的定植 ( colonization) ,细菌种类和数量随动物年龄、食物、宿主对细菌、细菌与细菌之间相互作用而发生变化 ,这种变化存在整个生命过程中…     

不同利用方式下呼伦贝尔草甸草原土壤细菌群落特征与理化性质的关系分析

为了研究4种不同利用方式下呼伦贝尔草甸草原土壤细菌群落结构及多样性与土壤理化性质的关系,揭示不同利用方式对草原土壤微生物多样性及土壤理化性质的影响情况,试验采用高通量测序技术,比较贝加尔针茅群落放牧+刈割(S1)、羊草群落放牧(S2)、羊草群落刈割(S3)以及贝加尔针茅群落刈割(S4)4种不同利用方式下的呼伦贝尔草甸草原土壤细菌群落结构及多样性,分析土壤理化性质与物种相对丰度、细菌多样性的相关关系。结果表明:S1、S2、S3、S4四个样本土壤细菌分别有31,27,26,28个门,酸杆菌门、变形菌门、疣微菌门、放线菌门是土壤中的优势群落;四个样本中S1的细菌多样性最高,S3的物种数最低;草甸草原土壤细菌群落相对丰度的排序为S1S4S2S3,多样性排序为S1S2S3S4;土壤全氮、全磷、速效氮和有机质对细菌群落多样性和物种相对丰度的影响较大,呈显著正相关。说明呼伦贝尔草甸草原土壤细菌物种组成丰富,四个样本土壤细菌群落结构相似,植被类型、利用方式和理化性质等都是影响细菌群落结构和多样性的因素。     

过表达TLR4基因绵羊瘤胃与肠道宏基因组分析

胃肠道微生物生态系统参与机体物质代谢、生物屏障、免疫调控等生理过程,对维持宿主健康具有重要作用。Toll样受体4(Toll-like Receptor 4,TLR4)除在机体天然免疫过程中扮演关键角色之外,胃肠道中TLR4基因的表达可能参与微生物区系结构的塑造。本研究利用前期获得的过表达TLR4基因绵羊,基于宏基因组测序技术探讨TLR4基因高水平表达对绵羊胃肠道微生物群体多样性、丰度及生物学功能的影响。结果表明：TLR4基因过表达后对绵羊瘤胃(P=0.35)和肠道(P=0.56)中微生物Alpha多样性无显著影响;胃肠道中微生物优势菌群(相对丰度>1%)在门、属、种不同分类水平上的区系结构无显著变化。进一步分析TLR4基因过表达对胃肠道中革兰氏阴性菌群(相对丰度<1%)组成的影响,在瘤胃和肠道中分别鉴定出8个和13个差异菌属(P<0.05),33个和32个差异菌种(P<0.05);其中,Helicobactersp.MIT05-5293(P=0.03)和Yersinia pseudotuberculosis(P=0.048)在瘤胃中存在显著差异,Campylob...