基因芯片在抗微生物药学研究中的应用

基因芯片技术是一种高通量、快速、平行、自动化的DNA测序及基因表达研究工具。病原微生物全基因组测序的完成为抗微生物药物提供了大量潜在靶位。因而利用基因芯片技术进行抗微生物药学研究已逐渐成为热点之一。本文从药物作用机制、药物靶位研究、病原菌与寄主的相互作用、病原菌的鉴定及其耐药性的监测以及新药筛选、用药个体化等方面对其进行了综述。     

基因芯片及其在病原微生物检测中的应用

基因芯片是近年来迅速发展的一门生物高新技术,它以其能够快速、高效、大规模地同步检测生物遗传信息的卓越功能而得到发展。在基因测序、基因表达分析、药物筛选、基因诊断等领域显示出重要的理论和实用价值。作者就基因芯片技术的原理、技术要点以及在病原微生物检测中的应用作一综述。     

基因芯片在痘病毒研究中的应用

痘病毒(Poxvirus)为病毒粒子最大的一类DNA病毒.该病毒感染人和动物后常引起局部或全身化脓性皮肤损害,给人类健康和畜牧业生产造成巨大威胁.利用基因芯片进行病毒的检测与基础研究,具有高灵敏度和高通量的优势.论文综述了近几年国内外有关基因芯片在痘病毒的检测、基础研究方面的研究进展.     

基因芯片技术在兽医中的应用

基因芯片技术作为一种综合性新技术,具有高效、灵敏、准确等优点,目前已被广泛应用于医学的各个领域,并在基因功能表达、致病机理、临床诊断、药物开发等研究方面取得突出成效。文章主要对基因芯片技术在兽医中的诊断、兽药开发、基因防治、动物产品检疫等方面的研究与存在问题进行综述。     

基因芯片技术在药物研究中的应用

生物芯片是由现代分子生物学技术结合微加工技术制成的具有一定生物学分析检测功能的微型器件，以DNA芯片和PCR、毛细管电泳及介电电泳为代表。九十年代以来，在人类基因组实施计划的推动下，DNA芯片技术得到了迅猛的发展，具在生命科学的研究中开始发挥作用。DNA芯片技术能够同时分析成千上万个基因或基因组，研究与疾病诊断相关的基因序列，可用于药理基因组学研究与基因重复测序工作，它在药学领域将对于药物靶标的发现、多靶位同步超高通量药物工筛选、药物作用的分子机理研究、中医药基础理论的现代化、药物活性和毒性评价等领域具有其它方法无可比拟的优势。美国Affymetrix公司已开始与Merck公司、Hoffmanlaroche公司等合作，将基因芯片技术用于新药筛选；Incyte Pharmaceuticals,Synteni,Nanogen等公司也采用基因芯片技术进行新筛选，以期从天然药物或合成物中筛选出基因相关药物。     

基因芯片技术及其在动物微生物研究中的应用

介绍了基因芯片技术及其在动物微生物研究中病原体检测和分型、致病机理、宿主与病原体的相互影响以及耐药性检测等方面的应用情况,分析了限制该技术应用和发展的主要问题,并对其应用前景作了展望。     

基因芯片技术在传染病防治中的应用

基因芯片(BiologicalChip)技术是一种大规模平行检测生物分子的有效手段,兴起于20世纪90年代初。由于其快速、微量准确的应用优点,已成为新一代的自动化医学检验工具。本文着重介绍生物芯片技术的种类、原理以及基因芯片在传染病防制中的应用。     

基因芯片的应用

基因芯片技术是最近几年在国际上迅猛发展起来的一门高新技术，是生物技术与芯片技术相结合的产物。本文就基因芯片的应用作了简要的介绍。     

基因芯片在猪遗传育种中的应用

该文对基因芯片技术的原理、制备方式、分类、优点以及近些年在猪的遗传育种中的应用进行了综述,并对其应用前景进行展望。     

基因芯片技术及其在微生物检测中的应用

基因芯片技术是20世纪90年代发展起来的一门高新技术。应用该技术可以对大量的遗传信息进行快速、高通量、并行检测,解决了传统检测方法中遇到的难题,已广泛应用于基因表达分析、突变检测、核酸多态性分析、基因测序和药物筛选等几乎所有的生物学研究领域。作为一种高通量的基因检测方法,基因芯片技术在微生物检测和鉴定方面的应用越来越多,具有巨大的应用潜力。文章简要介绍了基因芯片技术的基本概念和技术流程,综述其在微生物检测和鉴定中的应用。     

DNA微阵列与基因表达研究概况

DNA微阵列技术是 90年代兴起的一种对成百上千甚至上万个基因同时进行检测的新技术 ,它具有高通量和并行化的特点 ,广泛应用于基因表达、预测基因功能、检测基因突变和多态性分析、发现新药物和药物靶器官以及疫苗设计等方面。文章对 DNA微阵列的基本原理、DNA微阵列制备技术、杂交信号检测以及数据分析。 c DNA微阵列与细胞周期相关基因表达、细菌基因表达、病毒基因表达、肿瘤基因表达进行了概述。     

不同被毛密度獭兔的皮肤组织差异表达基因研究

为了筛选出不同被毛密度獭兔皮肤组织中差异表达的基因,本研究采用Agilent公司家兔全基因表达谱芯片对不同被毛密度獭兔皮肤组织总RNA进行了芯片杂交,通过实时定量PCR对部分差异表达基因进行了验证,并对基因表达谱进行了分析.结果表明,芯片试验共检测到2 657个差异表达的基因,其中包含1 106个已知功能的基因,表达上调的基因687个,表达下调的基因419个.GO分析表明,参与细胞增殖、分化、凋亡,信号传导及离子转运等生命过程的多种基因的表达水平发生了明显改变.实时定量PCR所得结果与基因芯片结果基本吻合.结果说明不同被毛密度獭兔皮肤组织的基因表达谱存在差别,这些基因的异常表达,可能参与皮肤毛囊的形成或分化过程,最终导致獭兔被毛密度的差异.这些基因的发现为进一步寻找与被毛密度相关的分子标记,并最终实现獭兔生产中的早期选育提供了研究方向.     

PRRS-CSF-PCV2诊断DNA芯片构建研究

本研究旨在研制CSF-PRRS-PCV2诊断DNA芯片。根据各病毒序列选取靶标，制备相应探针，并构建DNA芯片。结果表明：该芯片能同时检测PRRS、CSF和PCV2感染，并能区分PRRSV欧洲型和美洲型毒株，芯片检测阳性判读标准为SNR≥1．5（信号总强度模式量化）或信号强度≥1000（信号中位值模式量化）。该芯片具有特异性高、灵敏度高和可重复利用的优点。应用PRRS-CSF-PCV2诊断DNA芯片检测20份临床病料发现PRRSV、CSFV和PCV2单独感染分别为0、15％和5％，PRRSV与CSFV、PRRSV与PCV2、PRRSV、PCV2和CSFV混合感染分别为15％、35％和15％。     

双顺反子表达质粒在DNA疫苗研究中的应用

简述了DNA疫苗的研究概况，介绍了真核双表达质粒的结构特点及其在基因佐剂和二价DNA疫苗中的应用情况，总结分析了双表达质粒的优点和存在的问题，并对其今后在DNA疫苗中的研究方向和前景进行了展望。     

应用cDNA微阵列芯片技术筛选猪蛔虫性别差异表达基因的研究

采用cDNA微阵列芯片技术，从所构建的猪蛔虫雌、雄成虫cDNA消减文库分别挑取1044和1119个克隆，PCR扩增其插入片段，经纯化后点样于预先处理好的基片上（双点杂交），制备成cDNA微阵列芯片。将分别标记荧光素Cy3-dUTP和Cy5-dUTP的雌虫和雄虫cDNA探针，与制备好的cDNA芯片杂交（平行进行反标杂交试验）。根据每个点杂交后的Ratio值，筛选出双点杂交和正反标中都同时具有表达差异的基因克隆共1559个。将表达差异最明显的前831个克隆进行测序，获得720个有效序列，经生物信息学分析发现，雄虫特异表达的主要精于蛋白和雌虫特异表达的卵巢信息蛋白的基因序列多数与新杆属线虫存在同源性，有31个可能是新的ESTs。性别差异表达基因及其相关生物信息的获得为下一步研究基因功能奠定了基础。     

Microarray analysis of Longissimus thoracis muscle gene expressions in vitamin A‐restricted Japanese Black steers in middle fattening stage

Vitamin A (VA) restriction in beef cattle improves meat marbling; however, the underlying molecular mechanisms remain incompletely understood. We performed microarray analysis to clarify the effect of VA restriction on Longissimus thoracis gene expressions in Japanese Black steers. Six Japanese Black steers 13–14 months of age were divided into two groups: S group (n = 3), which received VA supplementation, and R group (n = 3), in which dietary VA intake was restricted. Steers were fattened for 7 months, following which tissue samples were obtained. Extracted RNA samples were analyzed by Affymetrix Genechip Bovine Genome Array. Lists of genes highly expressed in the R and S groups were obtained. The lists were functionally interpreted using functional annotation software, DAVID. In the R and S groups, 48 and 40 genes were significantly highly expressed, respectively. The gene list of the R group included CD36, LPL, GPAM, DGAT2, and SCD and additional genes annotated ‘PPAR signaling pathway,’ ‘lipid biosynthesis’ and ‘mitochondrion,’ whereas that of the S group included COL1A2, FN1 and DCN and additional genes annotated ‘extracellular matrix.’ Changes in the expression of these genes are possibly involved in marbling improvement in beef cattle by VA restriction.     

动物基因定位的发展及其DNA标记技术研究进展

动物基因定位技术发展迅速,已在世界发达国家动物繁育领域得到了应用。本文介绍了动物基因定位技术发展的现状,以及动物基因定位标记的DNA技术,开创了动物基因定位和改良的新领域。研究动物的遗传结构和控制机制,揭示遗传结构和功能的内在联系。为动物定向培育的进一步发展提供参考。     

应用DNA芯片技术筛选禽致病性大肠杆菌和尿道致病性大肠杆菌的差异表达基因

为研究禽致病性大肠杆菌强毒株E058的毒力相关基因在鸡体内、体外表达情况以及E058和尿道致病性大肠杆菌HEC4在LB和尿液中培养的表达情况,本研究分别提取E058株在SPF鸡体内及E058株和HEC4株在LB和尿液中静置培养的总RNA,与构建的DNA芯片杂交,检测和分析RNA的差异表达情况。芯片的检测结果表明:E058株在鸡体内和LB中培养差异表达基因共有9个,上调基因为5个,分别为neuC、iutA、cvaC、aes-15和iucCD;下调基因为4个,分别为aes-8、gyrB、aec-30和mdh。另外,芯片检测结果也显示E058株和HEC4株在LB和尿液中静置培养,具有相似的基因表达情况。     

五种鸡呼吸道传染病基因芯片诊断技术的研究

用分子克隆方法获得新城疫病毒、禽流感病毒、传染性支气管炎病毒、传染性喉气管炎病毒,鸡毒支原体各一段高度保守基因片段作为探针,用芯片点样仪点样到硝酸纤维膜上,制成检测基因芯片;提取样品中的RNA进行反转录,然后在PCR过程中用生物素标记,将PCR产物滴加到芯片上进行特异性杂交,对杂交结果进行扫描分析,可同时对上述5种常见禽呼吸道疾病作出诊断。此方法与PCR检测方法结果符合率在95%以上,其检出率比临床分离法要高30%以上。