家蚕基因组序列解读及其展望

20 0 3年 10月中国科学家完成了家蚕基因组工作框架图 ,开创了蚕丝科学研究的新阶段。基于支持和推动家蚕基因组乃至后基因组的研究 ,阐述了家蚕基因组研究的内容和意义 ,以及家蚕功能基因组研究有关的基础工作。     

桑树基因组研究进展(Ⅰ)国外重要学术期刊发表论文简介

<正>桑树是一种多年生木本植物,具有重要的生态和经济价值,其多用途综合利用开发方兴未艾。目前对桑树遗传资源的研究仍处于资源的收集整理以及传统的遗传改良阶段,这与已进入后基因组学的分子生物学时代以及桑树重要的生态经济价值亟待开发不相匹配。为推进桑树学科发展,西南大学家蚕基因组学国家重点实验室(筹)联合国内3家科研单位启动了桑树基因组计划,将大规模展开桑树的基因分析,揭示其优     

国际奶牛基因组选择的发展概况

二十一世纪初,基因组选择(Genomic Selection,GS)技术给传统奶牛育种体系带来新的活力。该方法利用基因芯片技术实现规模化的SNP标记多态检测,基于各国积累的大量后裔测定遗传评估结果,实现单个遗传标记或多个遗传标记构成单倍型的遗传效应估计。基因组选择的方法仅利用新生后备种公牛的基因组检测信息,即可实现动物个体的基因组育种值(GEBV)估计,据研究报道,其可靠性高于传统的系谱选择,最高可达75%左右。基因组选择策略实现乳用种公牛的早期选择,极大缩短了奶牛遗传改良的世代间隔,节约选育成本,提高选育效率,目前已在多个奶业发达国家具体实施并公开发布评定结果。本文对国际奶牛基因组选择的发展概况进行归纳综述。     

家禽基因组选择研究进展

基因组选择(Genomic selection,GS)是新一代畜禽遗传评估方法,具有早期选择准确率高、可缩短世代间隔、对于低遗传力性状以及难以测量或测量费用较高的性状选择效率高等优点,目前已经广泛应用于奶牛育种中。本文综述了基因组选择方法在家禽中的研究进展,并对我国家禽实施基因组选择方法进行展望。     

桑树基因组计划与桑树产业

桑树是一种重要的生态经济型林木,桑树资源的综合利用及桑树产业的开发正得到越来越多的重视。桑树的基础研究是实现桑树产业核心技术创新及产业发展的重要支撑。从桑树DNA分子标记、重要功能基因克隆和转基因研究3个方面概述了桑树分子生物学的研究现状,在此基础上阐明桑树基因组研究的意义,并以桑树蛋白质合成代谢、次生物质合成代谢以及优势性状的分子机制为例,阐述桑树功能基因组实施的关键问题,探讨桑树产业可持续发展的策略。     

美加等国正式启动牛基因组测序工程

由美国、加拿大、澳大利亚和新西兰等国政府机构和私营公司参与、总预算为5300万美元的国际“牛基因组测序工程”日前正式启动。 美国农业部长维尼曼当天在美国农业部举行的启动仪式上说,测定牛的基因组将造福人类健康和促进农业科技的突破。她认为,这项工程所产生的研究成果,将为提高食品安全、控制和治疗动物疾病等提供巨大机遇。     

家禽RNA病毒的反向遗传学原理及其应用

目前绝大多数家禽病毒基因组序列已经测定完毕,家禽病毒基因组的研究已经由结构基因组时代进入功能基因组的时代,于是家禽病毒的反向遗传学应运而生。经典的正向遗传学研究策略是从功能或表型的突变体出发,寻找主导相关功能或表型的基因;而反向遗传学则是从制造基因的突变体以检测生物体表型出发,得知基因的功能。     

利用基因组信息提高畜禽生产性能研究进展

为了满足人们对畜产品需求的快速增长，必须在加快畜禽产业发展的同时把对环境的影响降到最低，提高畜禽遗传特性有望促进这一问题的解决。进入21世纪以来，以基因组选择为核心的分子育种技术迎来了发展机遇，利用该技术可实现早期准确选择，从而大幅度缩短世代间隔，加快群体遗传进展，并显著降低育种成本。虽然在某些畜种中（如奶牛），基因组选择取得了成功，群体也获得较大遗传进展，但仍无法满足快速增长的需求。因此，亟需寻找能够进一步加快遗传进展的方法。研究表明，在SNP标记数据中加入目标性状的已知功能基因信息，可以提高基因组育种值预测的准确性，进而加快遗传进展。而挖掘更多基因组信息的同时，开发更优化的分析方法可以更有助于目标的实现。文章总结了主要畜禽物种的可用基因组数据，包括牛、绵羊、山羊、猪和鸡以及这些数据是如何有助于鉴定影响重要性状的遗传标记和基因，从而进一步提高基因组选择的准确性。     

基因型测定对生猪生产者有怎样的用处

像SNPs、基因组选择和基因组育种类似术语在奶牛业早已为人们所熟悉了,与猪基因组测序相关的技术虽然在猪业起步较晚一些,但是现在的工作进行得不错.本文介绍了目前的工作进行情况以及该项技术给养殖业提供的前景.     

Research Progress on Genomic Selection Methods in Livestock and Poultry

Selection and breeding are very important in production of livestock and poultry,and breeding value estimation is the core of selection and breeding.Genomic selection (GS) is a novel molecular breeding method to estimate genomic breeding value using high-density markers across the whole genome.At present,GS has been successfully applied in cattle,pig,chicken and so on,and made significant progress.This method can achieve early selection,decrease the testing costs,shorten generation interval,improve the accuracy of breeding value estimation and accelerate genomic progress.GS estimates the effect of SNP by phenotype information and SNP genotype of each individual in the reference population,and measures the SNP genotype to calculate the genomic estimated breeding value in the candidate population,then selects the best individuals according to the genomic estimated breeding value.With the rapid development of genotyping technology and the decrease of detection cost,and the continuous optimization and high efficiency of genomic selection methods,genomic selection has become an important research method in the selection and breeding of livestock and poultry.The authors reviewed some of the widely used genomic selection methods,compared the differences between different methods,analyzed the problems and challenges of genomic selection,and looked forward to its application prospects in breeding.     

畜禽基因组选择方法研究进展

畜禽的选种选育在生产中至关重要,育种值估计是选种选育的核心。基因组选择（genomic selection,GS）是利用全基因组范围内的高密度标记估计个体基因组育种值的一种新型分子育种方法,目前已在牛、猪、鸡等畜禽育种中得到应用并取得了良好的效果。该方法可实现畜禽育种早期选择,降低测定费用,缩短世代间隔,提高育种值估计准确性,加快遗传进展。基因组选择主要是通过参考群体中每个个体的表型性状信息和单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism,SNP）基因型估计出每个SNP的效应值,然后测定候选群体中每个个体的SNP基因型,计算候选个体的基因组育种值,根据基因组育种值的高低对候选群体进行合理的选择。随着基因分型技术快速发展和检测成本不断降低,以及基因组选择方法不断优化,基因组选择已成为畜禽选种选育的重要手段。作者对一些常用的基因组选择方法进行了综述,比较了不同方法之间的差异,分析了基因组选择存在的问题与挑战,并展望了其在畜禽育种中的应用前景。     

全基因组选择模型研究进展及展望

全基因组选择是一种利用覆盖全基因组的高密度标记进行选择育种的新方法,可通过早期选择缩短世代间隔,提高育种值估计准确性等加快遗传进展,尤其对低遗传力、难测定的复杂性状具有较好的预测效果,真正实现了基因组技术指导育种实践。随着芯片和测序技术日趋成熟,高密度标记芯片检测成本不断降低,全基因组选择模型的不断升级和优化,预测准确性不断提高,全基因组选择已成为动物遗传改良的重要手段和研究热点。目前,全基因组选择已经成为奶牛遗传评估的标准方法,并取得重要进展,在其它物种中的应用正在逐步开展。本文主要对全基因组选择的统计模型发展进行综述,总结全基因组选择在动物遗传育种中的应用现状,讨论当前存在的问题,并对全基因组选择模型的发展方向和应用前景进行展望。     

蜜蜂基因组：一个社会的秘密

蜜蜂最近成为了第三种加入基因组测序俱乐部的昆虫。这让科学家得以一窥蜜蜂社会令人惊叹的秘密,并有助于揭开蜜蜂的身世之谜。自从人类基因组工程进入收尾阶段,随着测序技术的进步,越来越多的生物加入了基因组测序俱乐部。从病毒到杨树再到小鼠和黑猩猩,越来越多的基因组序列为科学家提供了珍贵的信息,这也让关于基因组测序的新闻变得不那么引人注目了。如果说人类基因组计划启动之初曾经被比作生物学的登月计划,那么今天一种生物基因组测序的完成可能不过是一次普通的太空旅行。但是,上个月科学家公布的一种生物的基因组序列似乎有着不同…     

绵羊基因组测序及应用研究进展

随着测序技术的不断发展,测序价格的平民化使得基因组测序及应用普及到各个物种。绵羊作为人类重要的经济动物,其基因组研究近年来取得了重要进展,在绵羊起源、进化和适应性及功能基因鉴定等方面的研究取得了重要成果。该文重点综述绵羊的全基因组de nono测序进展及全基因组重测序在解析绵羊品种遗传多样性、揭示进化适应机制、功能基因定位等方面的研究应用,以期为绵羊的生物学研究提供方法参考,也为绵羊品种资源的保护和利用及分子育种提供参考。     

动物染色质三维基因组及转录调控研究进展

真核生物细胞核内基因组染色质并不是以线性分子的形式无序存在,而是以不同层次的三维结构有序地压缩在细胞核内,这种复杂的三位基因组结构在基因转录、DNA复制、细胞分裂和减数分裂等过程中具有重要作用。染色质构象捕获技术(chromosome conformation capture,3C)及其衍生技术是目前鉴定基因组染色质三维结构的主要手段。本文将从基因组染色质三维结构层次、研究技术、表达调控机制、在动物育种中的应用及展望等方面概述三维基因组学的研究进展。     

牛基因组学新进展

牛遗传学最新研究主要是对具有经济价值的质量性状和数量性状的表型不同来研究生物学性状的变异。以DNA为基础工具来指导常规选择育种,以期望得到更大的遗传效应以及扩大利益幅度。自从二十多年前提出这个理论以来,一直还没有得到实现。然而,即将在2005年公布的高质量的基因组草图序列,标志着这些工作的转折点。以下我们将讨论的是牛遗传学研究机构怎样充分利用基因组序列资源以及怎么样将基因组序列信息很好的实行标记辅助选择,而且还能满足消费者所日益关注的动物健康和食品安全性问题。     

国务委员陈至立为基因组应用研究联合实验室揭牌

鉴于家蚕基因组研究的重大理论意义与广阔应用前景,西南农业大学与中国科学院北京基因组研究所在合作完成了家蚕基因组框架图绘制的基础上,紧接着于2 0 0 3年11月在西南农业大学建立“西南农业大学·中国科学院北京基因组研究所基因组应用研究联合实验室”。两单位拟在联合实验室的合作框架下,深入开展家蚕等基因组信息与功能基因的产业应用研究。11月15日下午,国务委员陈至立在视察西南农业大学蚕桑学重点实验室后,与重庆市市长王鸿举、科技部吴忠泽等领导一起为该联合实验室揭牌。联合实验室的建立,有利于发挥两单位在资源、技术、信息等…     

家蚕基因组测序 世界首个"框架图"在渝问世

有关专家介绍,家蚕基因组“框架图”的完成只是家蚕基因组研究和开发计划的第一步,而其“精细图”预计在明年完成。家蚕基因组“框架图”与“精细图”有什么区别呢?中国家蚕基因组计划项目主持人、中国工程院院士向仲怀介绍,“框架图”是相对于“完成图”或“终图”而言,但实际上,真正的“完成图”并不存在,因为它总会存在一些空隙,而“精细图”则比“框架图”更进一步,更为准确、精细。基因组“框架图”的要点包括:测序工作量达到基因组的5倍;基因覆盖率达到90 %以上,即经初步组装的“一致性”序列占整个基因组的90 %以上;经初步组装的“一…     

水禽基因组选择研究进展

水禽是世界家禽养殖的重要组成部分，我国水禽产业包括肉鸭、蛋鸭及鹅三大产业。中国已经成为世界上最大的水禽生产国，中国的鸭和鹅饲养量和出栏量稳居世界第一。基因组选择作为一项重要的育种技术，已经在奶牛、生猪等家畜中得到广泛应用，其利用覆盖整个基因组的SNP位点，通过固态芯片、液态芯片、全基因组重测序、简化基因组测序等多种基因型测定手段，通过提高育种值估计的准确性、早期选择并为难以度量性状的提供基因组育种值等方法来加快性状改良速度，显著加快了性状遗传进展。然而，水禽基因组选择刚刚起步，如何根据水禽育种特点，加快基因组选择在水禽育种应用具有重要价值。本文综述了水禽基因组育种相关技术发展现状，并对未来发展提供了相关建议，以期为我国水禽育种工作提供参考和借鉴。