家兔HSL基因多态性及其与生产性状关联性分析

本实验采用PCR-SSCP方法对齐卡巨型白兔和齐兴肉兔HSL基因外显子1的遗传多态性进行研究,并进一步分析HSL基因对生产性状的遗传效应。结果表明:HSL基因外显子1第784位处发生了碱基突变(A→C),共出现AA、AB和BB 3种基因型,在2个品种兔群体中AA型均为优势基因型,A均为优势等位基因;卡方适合性检验表明,2个品种兔群体均显著偏离哈代-温伯格平衡(P0.05);在齐卡巨型白兔中,HSL基因AA型和AB型个体的宰前活体重均显著高于BB型个体(P0.05),AA、BB型个体的全净膛屠宰率和半净膛屠宰率均显著低于AB型个体(P0.05);在齐兴肉兔中,HSL基因AA型个体的宰前活体重显著高于AB、BB型个体(P0.05),BB型个体的全净膛屠宰率和半净膛屠宰率均显著低于AA、AB型个体(P0.05);在2个品种兔群体中,不同基因型个体的滴水损失和剪切力差异均不显著(P0.05)。     

4个绵羊品种MHC-DRB3基因外显子2的多态性分析

采用PCR-RFLP方法分析4个绵羊品种（阿勒泰羊、中国美利奴肉用多胎品系、湖羊和陶塞特羊）MHC-DRB3基因第2外显子的多态性，并进行聚类分析以及基因杂合度和多态信息含量的计算。结果表明：在绵羊MHC-DRB3基因第2外显子第122、154、168、220和241 bp碱基处表现出多态性；χ2适合性检验结果表明，4个绵羊群体MHC-DRB3基因的第2外显子的PstⅠ酶切位点达到了Hardy-Weinberg平衡状态，TaqⅠ和HaeⅢ酶切位点多态性均未达到Hardy-Weinberg平衡状态；4个绵羊群体基因杂合度和多态信息含量值分别在0.693～0.774和0.662～0.738之间，表明4个绵羊品种具有丰富的遗传多样性；聚类结果表明，中国美利奴肉用多胎羊和湖羊亲缘关系最近，阿勒泰羊和陶塞特羊关系较远，与实际选育过程一致，MHC-DRB3多态性可作为绵羊育种标记进一步研究。     

不同品种家兔背最长肌肌纤维类型的发育性变化特点研究

为了研究不同品种家兔背最长肌肌纤维类型的发育性变化特点,试验采用RT-PCR方法检测齐卡巨型白兔和加利福尼亚兔背最长肌中I、2A、2B和2D 4种肌球蛋白重链(My HC)的基因表达。结果表明:齐卡巨型白兔和加利福尼亚兔背最长肌中均存在4种肌纤维类型,从35日龄到10月龄,不同品种家兔背最长肌肌纤维组成存在差异,其中齐卡巨型白兔背最长肌My HC-2B型肌纤维含量显著或极显著高于加利福尼亚兔,而My HC-2D型肌纤维含量明显低于加利福尼亚兔,2个品种家兔背最长肌My HC-I和My HC-2A型肌纤维含量均比较低,说明My HC类型可能与2个品种家兔体重的差异有直接关系。     

鹅甲状腺素应答蛋白α基因外显子2的多态性研究

为了解鹅THRSPα基因多态性,根据鸭THRSPα基因序列,设计引物扩增籽鹅、皖西白鹅、浙东白鹅和狮头鹅THRSPα基因外显子2,运用PCR-SSCP技术进行单核苷酸多态性分析。结果共检测到3个等位基因,6种基因型。测序结果表明,鹅THRSPα基因外显子2存在6个SNP位点。各品种中等位基因A占绝对优势。卡方检验结果表明,4个鹅群体均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P0.05)。试验结果证实,鹅THRSPα基因第2外显子存在序列多态性。     

利用微卫星标记分析五个家兔群体的遗传多样性

利用15个微卫星座位,分析了新西兰白兔、德系安哥拉兔、美系獭兔、齐卡G系肉兔、福建黄兔5个家兔群体的遗传多样性。结果表明：15个微卫星位点的平均等位基因数和平均有效等位基因数分别为7．400±1．639个和5．694±1．470个;5个家兔群体的平均基因杂合度和平均多态信息含量分别为0．7367和0．6994;新西兰白的平均基因杂合度和平均多态信息含量最高,福建黄兔最低。5个家兔群体的平均总近交系数（F_is）为-0．03,群体内平均近交系数（F_is）为-0．151,群体平均分化系数（F_is）为0．105（P〈0．001）。采用UPGMA法进行聚类分析,5个家兔群体聚为三类：新西兰白兔和德系安哥拉兔聚为一类;齐卡兔G系和美系獭兔聚为一类,福建黄兔独自为一类。     

5个家兔群体白细胞介素10基因外显子的遗传多样性分析

本研究旨在分析家兔IL-10基因外显子的多态性,以期为进一步研究家兔IL-10与疾病抗性的相关性提供理论依据。根据GenBank上收录的IL-10基因序列设计5对特异性引物,采用PCR-SSCP方法对海狸色獭兔、白色獭兔、皖系长毛兔、闽西南黑兔、九疑山兔这5个家兔群体IL-10基因的5个外显子序列进行多态性分析。结果表明:在IL-10基因外显子3上检测到4种等位基因,10种基因型,存在3个SNPs位点;在外显子4上检测到2种等位基因,3种基因型,存在1个SNP位点。而外显子1、2、5对于实验群体未发现有遗传多态性。在外显子3中,D等位基因只在闽西南黑兔和九疑山兔中检测到,除海狸色獭兔和闽西南黑兔外其余群体均处于哈代-温伯格平衡,各群体不同基因型分布存在极显著差异(P<0.01)。在外显子4中,A1B1基因型在獭兔群体中没有检测到;除海狸色獭兔外其余各群体均处于哈代-温伯格平衡,海狸色獭兔跟白兔獭兔不同基因型分布差异不显著(P>0.05),而其余群体彼此不同基因型分布存在显著性差异(P<0.05或P<0.01)。结果提示:5个家兔群体在IL-10基因外显子3和4中存在遗传多态性,不同家兔群体在遗传基础上存在着一定的差异。     

新西兰白兔、福建黄兔遗传多样性分析

利用经筛选多态性较好的18对微卫星引物,对新西兰白兔、福建黄兔进行遗传多样性检测。研究结果表明,2个兔品种在18个微卫星座位上的基因频率存在一定的差异;新西兰白兔群体的基因杂合度和多态信息含量分别为0.593和0.533;福建黄兔群体的基因杂合度和多态信息含量分别为0.613和0.560。福建黄兔群体基因平均杂合度和平均多态信息含量较新西兰白兔高;说明福建黄兔的遗传多样性较新西兰白兔丰富。     

海南3个地方猪种SLA-DQB基因外显子2的PCR-RFLP多态性分析

采用PCR-RFLP法对海南五指山猪、临高猪及屯昌猪的SLA-DQB基因外显子2的PCR产物进行多态性分析。结果表明:五指山猪和临高猪SLA-DQB基因外显子2经限制酶RsaⅠ酶切后出现7种基因型,均由4个复等位基因A、B、C、D控制。屯昌猪中仅出现4种基因型,由3个复等位基因A、C、D控制。经HaeⅢ酶切结果出现8种基因型,这8种基因型在五指山猪群体中均存在,由E、F、G、H4个复等位基因控制;临高猪、屯昌猪经HaeⅢ酶切分别出现6种和5种基因型,均由3个复等位基因E、F、G控制。χ2适合性检验结果表明,五指山猪的RsaⅠ和HaeⅢ酶切位点突变未达到Hardy-Weinberg平衡。临高猪SLA-DQB基因外显子2RsaⅠ酶切位点不符合Hardy-Weinberg平衡状态,而HaeⅢ酶切位点处于Hardy-Weinberg平衡状态,屯昌猪SLA-DQB基因外显子2的2个酶切位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态。     

不同品种肉兔肌肉MSTN和MyoG基因表达水平及其与屠宰性状的关联分析

为了探讨不同品种肉兔肌肉生长抑制素(MSTN)和肌细胞生成素(MyoG)表达水平差异及其与屠宰性状的关联性,试验采用实时荧光定量PCR方法比较齐卡巨型白兔和加利福尼亚兔背最长肌MSTN和MyoG基因的表达水平。结果表明:84日龄时,齐卡巨型白兔背最长肌MSTN基因表达量极显著低于加利福尼亚兔(P0.01),而MyoG基因表达量极显著高于加利福尼亚兔(P0.01)。相关分析结果表明,MSTN基因表达量与宰前活重和日增重呈极显著负相关(P0.01),与全净膛率呈显著负相关(P0.05);MyoG基因表达量与宰前活重及全净膛率呈极显著正相关(P0.01),与日增重呈显著正相关(P0.05)。说明MSTN和MyoG表达量与不同品种家兔在84日龄的体重差异可能有直接关系。     

不同品种肉兔FAS、HSL基因发育性表达特性研究

为了研究不同品种肉兔肌内脂肪沉积的特点,试验采用相对定量RT-PCR方法检测了齐卡巨型白兔和加利福尼亚兔不同组织中脂肪代谢关键酶脂肪酸合成酶(FAS)、激素敏感脂酶(HSL)基因的发育性表达特性。结果表明:齐卡巨型白兔和加利福尼亚兔的背最长肌(简称背肌)、腿肌、肝脏、脂肪中FAS、HSL基因的发育性表达变化均存在差异,其中齐卡巨型白兔背肌和肝脏中FAS基因表达有逐渐下降的趋势,腿肌和脂肪中表现为逐渐上升的趋势;而加利福尼亚兔背肌和腿肌表现为逐渐下降的趋势,脂肪和肝脏中表现为逐渐上升的趋势。而HSL基因的发育性表达变化模式在2个品种中极为相似,除加利福尼亚兔背肌中表现为波动呈下降趋势外,其余均表现为逐渐下降趋势(P0.01)。相关分析结果表明,FAS、HSL基因的表达与不同品种肉兔肌内脂肪的差异可能有直接关系。     

3个品种兔微卫星标记的遗传多样性研究

为分析福建黄兔、新西兰兔、日本大耳白兔群体内的遗传变异情况和群体间的遗传相关性,本试验选取3个品种兔各25只,分别耳静脉采血并采用试剂盒抽提全血基因组,运用15个微卫星标记,结合荧光PCR技术和毛细管电泳方法获得目的片段,通过计算等位基因数、有效等位基因数、杂合度、多态信息含量和遗传距离,分析3个品种兔的遗传多样性。结果显示,3个品种兔在15个座位共检测到110个等位基因,平均等位基因数为7.3个,其中福建黄兔、新西兰兔和日本大耳白兔分别检测到95、95和88个等位基因,且分别在11、12和11个微卫星座位表现为高度多态,表明3个品种兔在筛选的15个微卫星座位均呈现较丰富的遗传多态信息。Hardy-Weinberg遗传平衡检验结果表明,福建黄兔、新西兰兔和日本大耳白兔分别有8、8和6个座位处于Hardy-Weinberg不平衡状态。Nei氏遗传距离分析显示,福建黄兔与新西兰兔、福建黄兔与日本大耳白兔、新西兰兔与日本大耳白兔的Nei氏遗传距离分别为0.1761、0.2347和0.0432。遗传距离越小时,相似度越高,亲缘关系越近,因此,新西兰兔与日本大耳白兔间的亲缘关系最近,福建黄兔与日本大耳白兔间的亲缘关系最远。     

云南高峰牛MHC-DQB基因外显子2遗传多态性分析

本研究采用PCR直接测序和PCR-RFLP法研究了云南高峰牛MHC-DQB基因外显子2(DQB.2)的遗传多态性,并利用DNAMAN软件分析了云南高峰牛与部分物种DQB.2相应核苷酸序列的同源性。结果发现,共检测到了17个等位基因,其中Hae Ⅲ酶切位点存在10种基因型,由A、B、C、D和E 5个复等位基因控制;RsaⅠ酶切位点存在22种基因型,由A、B、C、D、E、F、G、H、I、J和K共11个复等位基因控制;TaqⅠ酶切位点只出现了1种基因型。分析发现,云南高峰牛DQB.2基因的12、25、63、96、106、126、152、156、165、204位的碱基表现出了多态性。所分析的物种该基因片段大小相同均为270 bp,云南高峰牛第224位碱基缺失及236位碱基插入现象。云南高峰牛与人、猪、马、绵羊、黄牛×瘤牛的核苷酸序列的同源性分别为81.4%、83.3%、78.1%、87.7%、86.6%。经χ²检验结果表明,Hae Ⅲ和TaqⅠ酶切位点处于Hardy-Weinberg平衡状态(P＞0.05),而RsaⅠ酶切位点则未达到Hardy-Weinberg平衡状态(P＜0.05)。     

不同品系家兔的RAPD遗传分析

应用随机扩增多态ＤＮＡ技术（ＲＡＰＤ）对新西兰白兔、加利福尼亚兔、布列塔尼亚配套系（ＥＬＣＯ）进行了遗传分析。从２０个随机引物中筛选出８个,对其基因组ＤＮＡ进行ＰＣＲ扩增,对扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳,共检测到７１条扩增片段,其中多态片段４５条,占６３．４％,反映了家兔品种的遗传变异。多态性统计表明：品种内的遗传相似度大于品种间的遗传相似度。聚类分析表明：ＥＬＣＯ的Ｄ系与新西兰白兔、加利福尼亚兔的     

两个家兔品种肌肉MyHC类型及肌肉生成抑制素和肌细胞生成素基因表达的比较

本研究的主要目的是比较体重不同的两个家兔品种背最长肌的肌纤维类型(肌球蛋白重链,MyHC)以及肌肉生成抑制素(MSTN)和肌细胞生成素(MyoG)的表达水平。采集84日龄的齐兴肉兔(n=12)和齐卡大型新西兰白兔(n=12)的背最长肌,提取RNA,实时荧光定量PCR分析显示,背最长肌中存在4种肌纤维类型,其中MyHC-1和MyHC-2D是主要类型。在两个家兔品种的背最长肌中,MyHC类型的比例未见显著差异。此外,两个家兔品种背最长肌中MSTN和MyoG的mRNA水平无显著差异。这些结果提示,MyHC类型、MSTN和MyoG表达水平与这两个家兔品种84日龄的体重差异可能没有直接的关联。     

利用微卫星分析中国家兔的遗传多样性

利用10个微卫星DNA标记对7个家兔品种(9个群体)进行了遗传检测。结果表明:所选择的10个微卫星位点在所检测群体中均表现了较好的多态性,平均多态信息含量为0.569905。平均杂合度范围在0.5885～0.6826。表明所研究的家兔品种的遗传多样性较丰富,还可以做进一步的选择利用。根据遗传距离所做的聚类分析图表明,吉戎-Ⅰ系和吉戎-Ⅱ系、哈尔滨大白兔、塞北兔的亲缘关系依次较近,与它们的培育历史相吻合。     

不同比例白三叶草粉对肉兔生产性能的影响

为获得白三叶草粉在肉兔日粮中的适宜添加比例,本研究选取了(30±2)日龄、健康状况良好、体重(650±30)g、公母各半的150只断奶新西兰兔为试验动物,采用5处理5重复单因子完全随机设计的方法,设计了5个试验组,其中1个为对照组,4个处理组,每个试验组5个重复,每个重复6只兔子。分别在饲料中添加0%(对照组)、10%(处理Ⅰ组)、20%(处理Ⅱ组)、30%(处理Ⅲ组)和40%(处理Ⅳ组)的白三叶草粉,研究不同比例的白三叶草粉对肉兔生长性能、屠宰性能和消化代谢的影响。结果表明:(1)处理Ⅳ组平均日增重最高,为30.5 g/d,极显著高于其他组(P<0.01),较对照组提高11.48%(P<0.01)。处理Ⅳ组料重比最低,为3.5,较对照组降低5.15%。(2)处理Ⅳ组的全净膛屠宰率为50.67%,极显著高于对照组5.6%和处理Ⅰ组6.32%(P<0.01),显著高于处理Ⅱ组4.09%(P<0.05)。(3)各处理组的营养物质消化率均高于对照组,且均以处理Ⅳ组最高。综上,在日粮中添加适宜比例的白三叶草粉,对肉兔的生产性能是有利的,本试验条件下,40%白三叶草粉饲养效果最好。     

POU1 F1基因多态性与南方荷斯坦牛产奶量的相关性分析

采用PCR-RFLP技术研究了364头荷斯坦牛POU1 F1基因第二外显子的TaqⅠ酶切位点(e2-TaqⅠ)和第六外显子的HinfⅠ酶切位点(e6-HinfⅠ)多态性,并分析了两个位点多态性与泌乳量的关系。结果表明,实验群体中这两个多态位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态,e2-TaqⅠ位点等位基因G/A的频率为0.2706/0.7294,e6-HinfⅠ位点等位基因G/A频率为0.3228/0.6772。性状关联结果表明,两个位点的基因型与第一、二胎泌乳量相关性不明显。