苜蓿新品系Dy-2006亲缘关系的SSR分析

应用SSR分子标记对苜蓿新品系Dy-2006等6个苜蓿品种(品系)亲缘关系进行了分析.8对SSR引物共扩增出128个位点,106个位点显多态性,多态位点比率82.81%;不同苜蓿品种(品系)SSR多态性百分率存在一定差异,在32.81%～45.31%之间.遗传相似度(F)和遗传距离(D)的变化分别范围在0.9062～0.9689和0.0326～0.0762.聚类分析结果显示,新品系Dy-2006与龙牧801亲缘关系相对较近,与阿尔冈金亲缘关系较远,并与其它供试品种存在一定差异,为一个相对独立的品系.     

中国苜蓿地方品种种子贮藏蛋白标记：遗传多样性的研究

利用ＳＤＳ－ＰＡＧＥ方法对中国１８个地方苜蓿品种和北美９个苜蓿基本种质来源的代表品种,各选２０粒种子进行贮藏蛋白分析。结果表明,苜蓿品种内和品种间均具明显的多态性,但采用混合样分析则掩盖了品种内的多态性。     

部分中国黄牛BoLA-DRB3基因序列分析

通过DNA测序,分别对4个中国黄牛地方品种的MHC-Ⅱ类基因DRB3 外显子2的多态性进行分析。通过序列比对,共检测到DRB3＊exon2等位基因259种,其中新等位基因131个。等位基因的分布具有品种特异性。各等位基因之间存在大量多态位点,统计分析表明：发生非同义替换的多态位点均主要分布在抗原结合位点对应的编码序列中,共有17个变异位点的氨基酸组成在品种间具有显著差异,其中7个位点差异显著（P＜0.05）;10个位点差异极显著（P＜0.01）。在变异位点中,有8个位点为抗原结合位点。     

利用ISSR标记分析几个家蚕品系的遗传多样性

利用ISSR技术对6个家蚕品种和2个不同地域的野桑蚕群体进行了遗传多样性分析。通过6条ISSR引物扩增，共检测到66个位点。平均每条引物扩增的条带数为11条，其中65条具有多态性，多态位点百分率为98.48％。基于Ne＆Li遗传算法计算出各品种间的遗传距离，家蚕品种问的遗传距离为0．4286—0．6491。根据遗传距离，用UPGMA方法进行了聚类分析。     

草原红牛群体中微卫星DNA多态性的研究

选用草原红牛42头作为试验牛群体,经过牛血液基因组DNA的提取、8对微卫星引物的PCR扩增、扩增产物的聚丙烯酰胺电泳分型、UVIBAND计算机凝胶成像分析系统分析各位点等位基因及全部个体的标记基因型、PPAP3.0软件计算基因频率、多态信息含量(PIC)和杂合度等步骤,从分子水平上分析了草原红牛在8个位点的遗传多态性。结果表明,ETH225、IDVGA2、IDVGA46和IDVGA44等位基因数分别为5、4、3和4,多态信息含量分别为0.542 0,0.673 6,0.521 8和0.575 0,这4个位点为高度多态位点。而另4个位点BM2113、BM1824、IDVGA55和TGLA44等位基因数分别2、2、2和5,多态信息含量分别为0.369 8,0.360 4,0.353 8和0.470 8,属于中度多态性位点。8个位点作为遗传标记应用于草原红牛遗传育种研究之中是可行的。     

鸡肉嫩度候选基因CAPN1多态性的检测研究

建立基于聚合酶链反应-连接酶检测反应的基因多态性并行检测系统,探讨鸡肉嫩度候选基因钙蛋白酶I（CAPN1）基因的多态性,并分析其在优良地方鸡种-清远麻鸡和快大型隐性白羽鸡中的分布差异。用PCR-LDR方法检测CAPN1 2546、CAPN1 3535和CAPN19950的基因型作单倍型分析,进行各组间基因型分布和等位基因频率x2检验。结果CAPN12546位点未检测到多态,其他两个位点的结果同直接测序分型结果一致,其基因型分布在不同品种中均存在差异,并且在CAPN1 3535位点上达到显著水平,两个位点的单倍型分布在不同品种间也存在较大差异。     

苜蓿DUS测试标准品种SSR分子标记指纹图谱的构建

苜蓿在育种过程中,由于其异花授粉特性和骨干亲本的集中使用,导致品种间的遗传差异日益缩小,品种之间通过形态学鉴定愈加困难。通过构建苜蓿DUS测试标准品种DNA指纹图谱数据库,可以实现苜蓿品种的快速、准确鉴定。本研究利用筛选得到的10个SSR标记对33个苜蓿DUS测试标准品种进行指纹图谱构建和遗传多样性分析。结果表明,10对SSR引物共扩增出69个等位基因,平均每个标记可产生6.9个等位基因;多态性比率(PPB)从25%到90%不等,平均值为56.7%;各SSR标记的多态信息含量(PIC)范围为0.56~0.87,平均值为0.75。利用不同引物间的组合能有效区分33个苜蓿DUS标准品种,并为每份标准品种建立了唯一标识的指纹代码,为苜蓿品种的审定和保护以及遗传背景分析提供了技术依据。     

马生长激素(GH)基因的PCR-SSCP研究

选取4个蒙古马地方品种、1个国内培育品种和1个国外引人品种共281匹马，采用PCR—SSCP技术，检测了GH基因5’侧翼区、第1内含子、第2外显子和第5外显子4个位点的遗传多态性。结果显示：仅第5外显子出现多态性，表现出AA、BB和AB3种基因型，其余位点未检测到多态。群体遗传学分析结果表明：除纯血马外，其余品种都是等位基因A为优势基因；Hardy-Weinberg平衡检验显示，乌审马、乌珠穆沁马、巴尔虎马处于平衡状态，锡尼河马、三河马、纯血马处于非平衡状态；各品种马的多态信息含量均为中度多态（0．25〈PIC〈0．5）。本研究为今后马的分子育种奠定一定基础。     

鸡肉嫩度候选基因CAPN1多态性的检测研究

建立基于聚合酶链反应-连接酶检测反应的基因多态性并行检测系统,探讨鸡肉嫩度候选基因钙蛋白酶I (CAPN1)基因的多态性,并分析其在优良地方鸡种-清远麻鸡和快大型隐性白羽鸡中的分布差异.用PCR-LDR方法检测CAPN1 2546、CAPN1 3535和CAPN1 9950的基因型作单倍型分析,进行各组间基因型分布和等位基因频率x2检验.结果CAPN1 2546位点未检测到多态,其他两个位点的结果同直接测序分型结果一致,其基因型分布在不同品种中均存在差异,并且在CAPN1 3535位点上达到显著水平,两个位点的单倍型分布在不同品种间也存在较大差异.     

中国柞蚕DNA多态性的RAPD分析

用随机扩增多态DNA(RAPD)标记技术对 4个代表性的柞蚕品种河 41、四青、青黄 1号、杏黄和 3个家蚕品种大造、C10 8、75 32的 2 8个个体进行了DNA多态性分析。结果表明 :柞蚕具有极为丰富的DNA多态性 ;不同品种的个体间 (种内 )的多态性为 80 7%,而同一品种个体间的多态性也达到 45 8%～ 49 4 %;同一品种个体间的遗传距离为 0 133～ 0 2 38,远大于家蚕的 0 0 0 8～ 0 0 81;不同品种个体间的遗传距离为 0 2 15～ 0 382 ,与家蚕相似。柞蚕的DNA多态性有 6 0 %来源于品种内的个体间 ,而来源于品种间的部分只占 40 %。UPGMA聚类时 ,柞蚕的各个体均能按品种聚在一起。     

中国苜蓿地方品种亲缘关系的研究：Ⅱ RAPD标记

利用ＲＡＰＤ分子标记技术对我国１８个苜蓿地方品种和北美９个苜蓿基本种质来源的代表品种进行了分析,根据分析结果计算了品种间的欧氏遗传距离,并进行聚类分析,结果表明;我国１８个苜蓿地方品种间的平均遗传距离为１．５６,以１．５的遗传距离进行划分可将我国１８个苜蓿地方品种分为７组,品种间的亲缘关系与地理分布有一定的相关性。     

紫花苜蓿耐盐种质资源的遗传多样性分析

利用RAPD技术分析了25个紫花苜蓿耐盐品种的遗传结构和遗传多样性.结果表明,30条引物在25个紫花苜蓿耐盐品种单株DNA间的多态性位点比率(P)为81.52％,在各品种混合DNA间的多态性位点比率为61.65％,说明采用单株DNA样品比采用混合DNA样品能更好地揭示紫花苜蓿品种内和品种间的遗传变异水平.基因分化系数(...     

中国苜蓿地方品种亲缘关系的研究 Ⅰ 种子贮藏蛋白标记

利用ＳＤＳ—ＰＡＧＥ方法对我国１８ 个苜蓿地方品种和北美９ 个苜蓿基本种质来源的代表品种各２０ 粒单粒种子贮藏蛋白及１４ 份豆科牧草种（品种）种子贮藏蛋白进行了分析,根据电泳分析结果计算品种间的欧氏遗传距离,并进行聚类分析。１４ 份豆科牧草种（品种）种子贮藏蛋白的电泳分析结果表明,种内种子贮藏蛋白带谱差异较小,同属不同种间的差异明显,而属间的差异明显大于种间。在聚类分析中,以３．６１ 的遗传距离划分时,１４ 份材料被分为４ 组,分属于４ 个属,这与分类上是一致的。我国１８ 个苜蓿地方品种间的平均遗传距离为０．５７,以０．５ 的遗传距离进行划分时,１８ 个品种可分为７ 组,品种间亲缘关系的远近与品种的地理分布有一定的相关性。北美９ 个苜蓿品种间的平均遗传距离为０．８９,聚类结果表明,杂花苜蓿（Ｍｅｄｉｃａｇｏｓａｔｉｖａ ｓｓｐ． ｖａｒｉａ）与紫花苜蓿（Ｍｅｄｉｃａｇｏ ｓａｔｉｖａ ｓｓｐ． ｓａｔｉｖａ）之间的遗传差异相对较小,而与黄花苜蓿（Ｍｅｄｉｃａｇｏ ｓａｔｉｖａ ｓｓｐ． ｆａｌｃａｔａ）间的遗传差异相对较大。与北美９ 个苜蓿品种相比,我国苜蓿地方品种间的遗传差异较小,这与我国苜蓿地方品种的地理分布相对较窄,品种间基     

利用SSR、ISSR和RAPD技术构建苜蓿基因组DNA指纹图谱

在建立可靠的苜蓿基因组DNA提取分离和PCR扩增技术体系的基础上,筛选具有稳定多态性位点的RAPD、SSR和ISSR引物,建立苜蓿基因组DNA的SSR、ISSR和RAPD分子标记技术体系,并利用分子标记检测苜蓿品种(系)的DNA分子标记多态性,构建苜蓿品种的DNA指纹图谱.筛选出36个RAPD引物,8个SSR引物和12个ISSR随机引物,通过PCR扩增在55个国内外苜蓿品种(系)中获得了182个RAPD多态性位点和丰富的SSR和ISSR多态性位点,构建了55个苜蓿品种(系)的SSR、ISSR和RAPD指纹图谱.结果表明,不同苜蓿品种(系)的SSR多态性有较大差异;苜蓿品种ISSR指纹图谱多态性丰富,稳定性比RAPD强;可以通过2～3个引物鉴别我国主要苜蓿品种和引进品种,SSR和ISSR指纹图谱可以更好地用于苜蓿品种鉴定和遗传多样性分析.     

甘肃省苜蓿种质资源遗传多样性RAPD分析

苜蓿(Medicago sativa L.)是世界上重要的豆科牧草,了解栽培品种的遗传关系和遗传距离对于育种工作具有重要意义。本研究利用RAPD标记技术对甘肃省11个苜蓿栽培品种(群)进行遗传多样性分析,以期为进一步开展苜蓿新品种选育奠定基础。结果表明:10个随机引物共检测到132条谱带,其中107条为多态性带,多态性条带比率(PPB)高达81.1%;天水苜蓿和定西苜蓿之间的Roger’s遗传距离较远(0.4610),而与陇中苜蓿之间的遗传距离较近(0.1406);进一步的AMOVA分析显示苜蓿种群大部分的遗传变异发生在种群内(61.25%),有38.75%的遗传变异发生在种群间,种群分化不明显。     

燕麦种质资源遗传多样性ISSR研究

 采用ＩＳＳＲ 分子标记技术对来自中国、加拿大、美国和欧洲等国家的４２个有代表性的饲用燕麦品种及６个裸燕麦品种进行遗传多样性分析。筛选出８个引物共扩增出多态性带１４４ 条，多态性条带比率（ＰＰＢ）为８６．１％。由Ｎｅｉ’ｓ指数（ｈ）估测，应试皮燕麦、裸燕麦品种平均变异分别为０．２０３６和０．２０１５，平均Ｓｈａｎｎｏｎ’ｓ信息指数估计值为０．３２５９和０．３０５８；４８个燕麦品种间遗传相似系数为０．５８３３～０．９４１７，遗传距离的变化范围是０．０６０１～０．５３９０。结果表明燕麦具有较丰富的遗传多样性，且皮燕麦的遗传多样性高于裸燕麦。根据ＩＳＳＲ 数据进行了聚类分析和主成分分析，可将４８ 份燕麦材料分为五大类，来源相同的品种大致聚在一类，呈现出一定的地域性分布规律。皮燕麦与裸燕麦在遗传相似度０．６６处被明显分为２类，与形态学及其他标记分类结果一致，由ＩＳＳＲ 揭示的品种间遗传关系与品种实际来源基本一致。     

利用SRAP标记研究紫花苜蓿和黄花苜蓿种质资源遗传多样性

利用SRAP分子标记对31份苜蓿材料遗传多样性进行研究,探究不同地域来源的苜蓿种质的遗传变异和亲缘关系。筛选出24对引物,经PCR扩增后获得320条片段,其中多态性片段有287条,每对引物组合均能扩增出7～17多态性条带,平均为11.96条多态性条带;采用类平均法(UPGMA)Nei氏遗传距离进行聚类,将31份苜蓿材料聚成5类,但个别同一地域来源的苜蓿品种被归到不同的类型中,表明试供苜蓿材料具有较高的异质性。     

利用RAPD技术构建四倍体苜蓿遗传连锁图谱

 利用随机扩增ＤＮＡ 多态性分子遗传标记（ＲＡＰＤ）对Ｆ₂ 群体进行分析。Ｆ₂ 群体由Ｆ_１ 群体（高产紫花苜蓿×高抗黄花苜蓿得到Ｆ_１代）自交获得。应用ＭＡＰＭＡＫＥＲ／ＥＸＰ（３．０）与ＪｉｏｎＭａｐ４．０并结合ＭａｐＤｒａｗＶ２．１软件构建四倍体苜蓿的遗传连锁图谱。从１９２个随机引物中筛选出７２个引物，对９４个Ｆ_２ 个体及Ｆ_１ 双亲ＤＮＡ 样本进行了ＲＡＰＤ 扩增，共获得５１个ＲＡＰＤ 标记，构建了四倍体苜蓿分子遗传连锁框架图，其中包含８个连锁群，标记覆盖的基因组总长度约为１２６１．５ｃＭ，标记间平均距离为２４．７３ｃＭ。本图谱为构建饱和的四倍体苜蓿分子遗传图谱提供了框架结构，为进一步开展苜蓿分子遗传方面的研究奠定了基础。     

沙打旺种质资源遗传多样性RAPD分析

利用RAPD技术对我国沙打旺育成品种，地方材料和野生材料的遗传多样进行研究。结果表明，沙打旺野生材料的多态性明显高于育品种和地方材料，在13份品种（材料）中，山西沁野生沙打旺基因多样性最大，山西五台山野生沙打旺多态位点比例最高，沙打旺生材料总基因多样性和平均基因多样性均大于育成品种和地方材料，其遗传变异幅度最大，而育成品种最小，沙打旺野生材料间遗传分化明显，其基因分化系数比育成品种和地方材料间大。