斑马鱼SSLP标记检测鲤鱼种间的遗传多态性

用500对斑马鱼SSLP标记引物对黑龙江野鲤（Cyprinus carpio haematopterus Temminck et Schlegel)和柏氏鲤（Cyprinus Pellegrini pellegrini Tchang)进行种间遗传差异分析，共发现110个斑马鱼标记在鲤鱼种间表现出差异，故可作为黑龙江野鲤和柏氏鲤间的分子标记，也可作为建立遗传连锁图谱的遗传标记。     

与鲤鱼抗寒性状相关的RAPD分子标记的筛选及其克隆

以黑龙江鲤（Cyprinus carpio haematopterus Temminck et Schlegel）、荷包红鲤抗寒品系（Cyprinuscarpio var.wananensis）、荷包红鲤（Cyprinus carpio var.wananensis）、柏氏鲤（Cyprinus pellegnini Tchang）以及荷包红鲤抗寒品系和柏氏鲤的杂交F2的DNA样品为材料,用200个随机引物对其进行PCR扩增,获得了1个与鲤鱼抗寒性状相关的分子标记RAG20,并在F2代分离个体中得到验证.至此,本实验室共获得10个与鲤鱼抗寒性状相关的分子标记,更加证明抗寒性状是数量性状（QTL）受微效多基因控制.此外,将其中4个标记从琼脂糖凝胶上进行回收,并与pMD18-T vector连接,将其转入感受态大肠杆菌E.coli DH 5α,对克隆片段进行序列分析,旨为根据每一序列重新设计引物,将RAPD标记转化为稳定的SCAR标记.[中国水产科学,2006,13（3）：360-364]     

鲤野生和养殖群体遗传多样性分析中的微卫星(SSLP)分析

采用7个微卫星标记,研究了鲤(Cyprinus carpio)、高寒鲤和荷包红鲤抗寒品系(Cyprinus carpio var.wananensis)三个群体的遗传变异。结果显示,鲤野生群体、高寒鲤、荷包红鲤抗寒品系的平均杂合度分别为0.276、0.147、0.0952,平均无偏倚杂合度期望值为0.431、0.355、0.305。鲤野生群体的杂合度明显高于其他两个养殖品种,说明其较其他两个养殖品种的遗传多样性丰富。     

荷元鲤(荷包红鲤_♀×元江鲤_♂)杂种优势利用及性状遗传的研究

<正> 前言鲤鱼(Cyprinus carpio L.)在我国淡水鱼类资源和淡水养殖业中居有重要地位。为了提高鲤鱼的生产性能,改良某些经济性状,近年来,鲤鱼的良种选育及杂种优势利用的研究日益受到人们的重视,并取得了一定的成绩。我所于1973年引进元江鲤(Cyprinus carpio yuankiang Wu et al.)、荷包红鲤(Cyprinus carpio var.wuyuanensis)等鲤鱼后,1974年以来,以荷包红鲤和元江鲤为主体进行了多组合杂交,并对其子一代进行了试养观察,其中以荷包红鲤♀×元江鲤♂长势较好。几年来,在我国各地试养的     

3个鲤群体的微卫星标记与生长性状相关性分析

利用筛选出鲤（Cyprinus carpio）的15对多态性较高的微卫星引物，分析其与黄河鲤（C．carpio haematopterus Temminck et Schlegel）、建鲤（C．carpio var．jian）和黑龙江野鲤（C．carpio haematopterus）群体中90个个体的体质量、体长、体厚和体高性状的相关性．利用SAS的一般线性模制（GLM）对15个微卫星标记与3个鲤群体的生长性状进行显著性检验。结果表明，Mfw5与黄河鲤的体高相关（P〈0．05）；Hlj013、Cca09和Mfw7均与建鲤的体质量、体长和体高相关（P〈0．05）；Mfw2与建鲤的体质量和体厚相关（P〈0．05）；Mfw29与建鲤的体质量相关（P〈0．05）；Mfw6与黑龙江野鲤的体质量、体长、体厚和体高均相关（P〈0．05）；Mfw4与黑龙江野鲤的体质量、体长和体高相关（P〈0．05）；Mfw11与黑龙江野鲤的体厚和体高相关（P〈0．05）。对同一性状不同基因型间进行多重比较，找到3个群体中与生长性状相关的基因型。     

中国鲤几个代表种群基因组DNA遗传多样性分析

中国鲤具有悠久的养殖历史和重要的经济价值,无论是天然种群还是养殖品种,年产量远超过其它鱼类。近几十年来,养殖新品种的开发获得成功,大大提高了产量,改善了品质。但是由于盲目的开发利用,许多重要的鲤养殖种类的种质资源遭到破坏。"江西三红"(Cyprinuscarpiovar.xingguonensis、Cyprinuscarpiovar.wuyuanensis、Cyprinuscarpiovar.wananensis)、黄河鲤(Cyprinusycarpiovar.)和黑龙江野鲤(Cyprinuscarpiohaematopterus)是中国鲤几个具有代表性的养殖品种和野生种,在我国鲤鱼遗传育种研究中均占有非常重要的地位。应用第二代分子标记,即微卫星标记(microsatellite)84个,对以上5个具有代表性的中国鲤进行了全基因组DNA检测。结果表明,当退火温度提高至60℃时,有43对标记引物扩增出清晰的条带,其中有14对在群体间呈现多态性,扩增等位基因位点为2～4个。微卫星座位MFW4,MFW19,MFW23和MFW26在群体内显示了高度的多态性,扩增等位基因位点为7～13个。统计实验结果发现,"江西三红"3个品种间遗传差异较小,兴国红鲤和荷包红鲤的亲缘关系较近(0.93);属于同一亚种不同地理种群的黄河鲤和黑龙江野鲤具有较高的遗传相似性(0.89)。另外,根据微卫星多态性分析结果,探讨了这5种鲤的遗传多样性。     

6个野生与选育鲤群体的微卫星遗传分析

利用12个微卫星标记对鲤(Cyprinus carpio)的4个野生群体[清水江鲤、太湖鲤、黄河鲤(C.carpio haematopterus)和黑龙江鲤(C.carpio amurensis)]和2个选育群体[福瑞鲤(C.carpio var.FFRC)和松浦镜鲤(C.carpio var.specularis'Song-pu')]共208尾个体进行遗传分析。结果显示,12个位点共检测到341个等位基因,平均等位基因数为28.67,其中1个位点(HLJ1127)检测到正向选择压力;选育群体的遗传多样性参数普遍低于野生群体,其中松浦镜鲤群体的各项参数均值最低(Na=6.82,Ho=0.54,PIC=0.50),清水江鲤群体的各项参数均值最高(Na=21.25,Ho=0.80,PIC=0.91);分子方差分析显示,整体遗传变异主要来自群体内,但群体间呈极显著遗传分化(P0.01);基于群体Nei's遗传距离的UPGMA聚类树和PCo A分析表明,鲤4个野生群体间遗传距离较近,而与2个人工选育群体间遗传距离较远;基于个体遗传结构及PCo A分析显示部分野生个体遗传结构比较混杂,而选育个体的遗传结构则相对单一。研究表明,中国鲤野生资源具有较高的遗传多态性,而人工选育群体维持着较纯的遗传种质。     

红鲤4群体间主要组织相容性复合体的差异

应用鱼类主要组织相容性复合体(MIC)基因来探讨鱼类种群间遗传结构,寻找分子遗传标记。根据已报道的鲤鱼MICI类基因序列,设计了一对特异性引物,从兴国红鲤、荷包红鲤、玻璃红鲤及瓯江彩鲤基因组DNA中扩增了编码MICI类分子α2链的基因片段,并进行克隆、测序。结果表明,(1)编码MHC I类分子α2链的基因多态性较为丰富,234bp长度中有106个变异位点,多态位点百分率达45．3％;荷包红鲤的基因序列与其它3群体红鲤有显著差异;(2)由编码MICI类分子α2链的基因和氨基酸序列构建的系统进化树一致,兴国红鲤与团江彩鲤关系较近,属于同一进化支,玻璃红鲤和荷包红鲤分别属于另外两个不同的进化支,荷包红鲤是较为特化的群体;(3)多态性丰富的编码MICI类分子α2链的基因,适宜作为鲤鱼不同群体的分子遗传标记。     

黑龙江和乌苏里江唇的微卫星引物筛选及群体遗传结构

利用鲤（Cyprinus carpio L．）（20对引物）和Hemibarbus mylodon（21对引物）共41对微卫星引物对黑龙江（逊克，XK）和乌苏里江（虎头，HT；海青，HQ）的3个野生唇[鱼骨]（Hemibarbus labeo）群体进行引物适合性研究，并将获得的多态性微卫星位点用于唇[鱼骨]群体遗传结构分析。引物筛选结果表明，5对鲤引物可对唇[鱼骨]扩增出条带，但产物均无多态性；11对H.mylodon引物能在唇鱼骨中成功扩增，10对引物（10个位点）的扩增产物具有多态性，其中7个位点为高度多态（PIC〉0．5）。对3个唇[鱼骨]群体进行遗传多样性分析，结果显示10个位点的平均杂合度为0．4834，共检测到96个等位基因（40个有效等位基因），以HT群体的遗传变异水平最高。卡方检验结果表明，8个位点在3个群体中不同程度地偏离遗传平衡（P〈0．05），且偏离平衡的位点均表现为杂合体缺失（Fis〉0）。3个群体两两间具有较多的基因交流（Nm〉11），以XK和HQ间最高（17．27），二者的遗传距离也最近（0．0497），群体间的遗传分化微弱（Fst=0．0236）。以上结果表明，H．mylodon的微卫星引物适合于唇[鱼骨]的群体遗传变异研究。黑龙江和乌苏里江的野生唇[鱼骨]资源受人为及环境因素的影响较大；3个群体间的遗传分化不明显，乌苏里江的HT群体更适合在人工繁殖计划中利用。[中国水产科学，2008，15（2）：230-236]     

元江鲤与荷包红鲤的生态类型及其杂交后代(荷元鲤)经济性状的分析

以属于华南鲤Cyprinus carpio rubrofuscus lacepede的高原河流性野生种元江鲤为父本与经人工选育的地方养殖种荷包红鲤为母本进行杂交获得的F1（荷元鲤），具有明显的杂种优势。     

鲤鱼的遗传连锁图谱（初报）

建立了鲤鱼的遗传连锁图谱。图谱有ＲＡＰＤ分子标记５６个，鲤鱼的ＳＳＬＰ标记２６个，鲤鱼ＳＳＬＰ标记１９个，斑马鱼的ＳＳＬＰ分子标记７０个，鲤鱼基因标记９１个，共有标记２６２个；图谱有５０个连锁组，连锁图给出鲤鱼的基因组大小在５７８９ＣＭ左右。     

不同鲤鱼种间DNA遗传标记多态性

用８４个随机引物对黑龙江野鲤（Ｃｙｐｒｉｎｕｓ ｃａｒｐｉｏ ｈａｅｍａｔｏｐｔｅｒｕｓ Ｔｅｍｍｉｎｃｋ ｅｔ Ｓｃｈｌｅｇｅｌ）和柏氏鲤（Ｃｙｐｒｉｎｕｓ ｐｅｌｌｅｇｒｉｎｉ ｐｅｌｌｅｇｒｉｎｉ Ｔｃｈａｎｇ）进行种间ＲＡＰＤ分析，结果共扩增出４８４个片段，二者共有扩增片段为１３个，黑龙江野鲤特有的为２３３个，柏氏鲤特有的为２２５个，这些特异片段可做为黑龙江野鲁和柏氏鲤的分子遗传标记。并对     

鲤回交群体4种生长性状的相关性分析

利用132对SSRs(simple sequence repeat)标记和63对在EST(expressed sequence tag)上的微卫星标记对柏氏鲤和荷包红鲤抗寒品系回交子代的84个个体基因组DNA进行检测,共得到565个等位基因,各等位基因数2～4个,片段长度72～484 bp,平均等位基因数为2.897 4,平均多态信息含量为0.584 9,平均杂合度为0.592 8。利用统计软件SPSS的GLM程序对195个微卫星标记与鲤体重、体长、头长和尾柄长的相关性进行分析,其中HLJ133、HLJ346、HLJ360与体重具有极显著相关；HLJ133,HLJ368,HLJ390,HLJ673,HLJE96与体长具有显著相关；HLJ133,HLJ346,HLJ360与头长极显著相关；HLJ529,HLJE538,HLJE586与头长具有显著相关；HLJ673,HLJE282与尾柄长具有极显著相关；HLJ348,HLJ368,HLJ382,HLJ437,HLJ483,HLJ752,HLJE169,HLJE586与尾柄长具有显著相关,并对同一标记不同基因型间进行了多重比较。根据实验求出的体重与体长、头长、尾柄长之间的相关系数和通径系数,可得知体重与尾柄长的直接相关性非常小。     

鲤 IGF-I 基因 2 个高度多态微卫星位点的鉴定及其与生长相关性 状的关联分析

??利用PCR结合测序方法, , 在鲤(Cyprinus carpio)类胰岛素生长因子-I (insulin-like growth factor-I, , IGF-I)基因内含子1和内含子2中各鉴定1个微卫星多态性位点, , 分别命名为intron1189和intron2310, , 这两个位点均以4碱基为重复单元。以黑龙江鲤(Cyprinus cario haematopterus, , YL)(n=263)、德国镜鲤选育系(Cyprinus carpio L. mirror, , JL)(n=229), 及荷包红鲤抗寒品系(Cyprinus carpio var. wuyuanensis, , HL)(n=255)为研究对象, , 评估了这两个位点不同基因型(频率>3%)与鲤4个生长时段(135 d 、325 d、335 d和445 d)生长表型的关联。结果显示, , 2个位点在3个鲤群体中均表现为高度多态(PIC>0.5)。intron1189位点多态性主要对YL的135 d、325 d体长和325 d、385 d体质量有显著影响(P<0.05), , 而intron2310位点多态性对JL各检测时段的体长和体质量均有显著影响(P<0.05)。对不同基因型个体的体长和体质量性状进行多重比较, , 结果显示, , 在intron1189位点, , 185/229基因型YL的135 d、325 d体长和325 d、385 d体质量最低, , 而205/221基因型YL的135 d、325 d体长和325 d体质量最高。在intron2310位点, , 290/350基因型JL在各检测时段的体长及135 d、325 d、385 d体质量最低, , 而318/350基因型JL的135 d、325 d、385 d体长和体质量均为最高。上述结果表明, , 鲤IGF-I基因内含子中的这两个高度多态微卫星位点潜在影响鲤的生长性能。

     

回交鲤与回交荷包红鲤染色体核型的比较分析

在23～25℃下,给平均体质量104.2g和106.8g的回交鲤（鲤鲫杂交♀×鲤♂）和回交荷包红鲤（鲤鲫杂交♀×荷包红鲤♂）胸腔注射植物凝集素（PHA）和秋水仙素,然后观察对比了染色体核型,探讨回交后代的染色体遗传。结果表明,两种鲤鲫杂交回交子代染色体组均由150条染色体组成,按着丝粒位置染色体组型可分为四组,每个染色体小组均由三条同源染色体组成。其中,回交鲤染色体数目为3n=150,染色体臂数NF=234,其核型公式为：3n=60m＋24sm＋36st＋30t;回交荷包红鲤的染色体数目为3n=150,染色体臂数NF=252,其核型公式为：3n=66m＋36sm＋18st＋30t。     

鲤鱼基因组同源框Hoxa3a序列同源性分析与分子进化研究

本文利用生物信息学软件分析了鲤（Cyprinus carpio）基因组中同源框基因Hoxa3a与多种鱼类及其它生物的同源性,构建了分子进化树。结果表明：鲤与斑马鱼（Danio rerio）的序列同源性最高为95%,与大西洋鲑（Salmo salar）等四种鱼类的同源性次之为84%,与米氏叶吻银鲛（Callorhinch...     

鲤鱼基因组同源框Hoxa3a序列同源性分析与分子进化研究

本文利用生物信息学软件分析了鲤（Cyprinus carpio）基因组中同源框基因Hoxa3a与多种鱼类及其它生物的同源性,构建了分子进化树。结果表明：鲤与斑马鱼（Danio rerio）的序列同源性最高为95%,与大西洋鲑（Salmo salar）等四种鱼类的同源性次之为84%,与米氏叶吻银鲛（Callorhinchus milii）和鳐（Leucoraja erinacea）的同源性最低为74.5%,与三种鸟类的同源性为75%左右。这结果也说明,Hox同源框基因序列在进化上高度保守。在序列比较的同时发现了2个鲤的SNP位点,T101C和A213G。上述研究结果,对于保护生物多样性（尤其是遗传多样性）的研究,揭示生物进化历程及机理具有十分重要的意义。     

鲤四种经济性状的微卫星标记分析

获得与经济性状相关的分子标记或基因是开展该性状分子育种的先决条件。本文利用300个微卫星标记检测了以柏氏鲤和荷包红鲤抗寒品系杂交F2代1个家系、92个个体的基因型,回归分析了其体长、体厚、体高和体重4种经济性状的GLM单标记。Permutation检验结果显示：有23个标记分别与体长、体厚、体高和体重具有显著相关性（P...