杭州湾与海州湾彩虹明樱蛤遗传差异的ISSR分析

利用ISSR分子标记技术对慈溪、乍浦、连云港3个彩虹明樱蛤地理群体的遗传差异进行了研究.试验结果表明,乍浦、慈溪、连云港3个彩虹明樱蛤群体的遗传多样性指数分别为0.3987、0.3670、0.4084,以连云港群体遗传多样性较高,慈溪群体最低.群体遗传结构显示,大多数(94.75%)的遗传多样性是由群体内不同个体间的差异造成的,只有小部分(5.25%)的遗传多样性与群体间的遗传分化有关.Nei's遗传多样性分析结果表明,群体结构水平较低而基因流水平较高(Gst=0.0525; Nm= 9.0295),提示彩虹明樱蛤群体间可能发生过较强的基因交流.     

浙江沿海彩虹明樱蛤营养物质积累的多元分析

为了研究环境与贝类的营养物质积累的关系,寻找影响贝类品质的主要因素、恢复经济贝类野生资源,本文研究了慈溪、六横、温岭和乐清等海区的彩虹明樱蛤的氨基酸、脂肪酸含量,利用SPSS软件对不同海区、不同生长时间的彩虹明樱蛤进行了差异性比较和主效因素分析.研究结果显示:5月份六横和乐清地区的彩虹明樱蛤群体间氨基酸差异最小,六横和慈溪最大,其主效成分为半胱氨酸.7月份慈溪和温岭彩虹明樱蛤群体间氨基酸差异最小,慈溪和乐清最大,主效成分为苏氨酸.9月份慈溪和六横的氨基酸差异最小,乐清和温岭最大,主效成分为蛋氨酸.5月份和7月份六横、乐清和温岭,9月份,温岭,乐清和慈溪地区的彩虹明樱蛤群体间脂肪酸差异最小,主效成分为C14:0,C22:6和C22:5.     

浙江沿海彩虹明樱蛤营养物质积累的多元分析

为了研究环境与贝类的营养物质积累的关系，寻找影响贝类品质的主要因素、恢复经济贝类野生资源，本文研究了慈溪、六横、温岭和乐清等海区的彩虹明樱蛤的氨基酸、脂肪酸含量，利用SPSS软件对不同海区、不同生长时间的彩虹明樱蛤进行了差异性比较和主效因素分析。研究结果显示：5月份六横和乐清地区的彩虹明樱蛤群体间氨基酸差异最小，六横和慈溪最大，其主效成分为半胱氨酸。7月份慈溪和温岭彩虹明樱蛤群体间氨基酸差异最小，慈溪和乐清最大，主效成分为苏氨酸。9月份慈溪和六横的氨基酸差异最小，乐清和温岭最大，主效成分为蛋氨酸。5月份和7月份六横、乐清和温岭，9月份，温岭，乐清和慈溪地区的彩虹明樱蛤群体间脂肪酸差异最小，主效成分为C14：0，C22：6和C22：5。     

黄海、东海近海七个棘头梅童鱼地理群体的形态差异分析

对2013年采自连云港、大丰、崇明、舟山、宁德、厦门和温州的7个棘头梅童鱼(Collichthys lucidus)群体共238个个体进行形态学比较研究,运用单因素方差分析、主成分分析、聚类分析和判别分析等多元统计分析方法对13项可量性状以及20项框架参数进行形态差异分析。单因素方差分析结果显示,7个地理群体之间确实存在显著性差异;主成分分析得到的4个主成分对不同群体间总差异的贡献率分别为53.131%、9.328%、4.249%和3.406%,累积贡献率为70.113%,躯干部最能用以区分不同的地理种群;主成分分析和聚类分析结果基本一致,认为7个棘头梅童鱼地理群体在形态上不存在明显的南北分化现象;通过判别分析得到14个比例变量并构建判别函数,将7个群体的数据代入函数,得到群体的综合判别率为85.3%,判别准确率P1为62.5%~96.7%(群体判别正确的尾数/群体的实际尾数),P2为78.1%~90.6%(判别正确的尾数/判入该群体的尾数),舟山群体由于其特殊的地理因素,判别准确率较低(P1=62.5%,P2=78.1%)。本研究为棘头梅童鱼地理种群判别、种质资源保护以及良种选育等提供了基础的形态学数据。     

河川沙塘鳢4个不同地理群体的形态差异分析

运用聚类分析、主成分分析和判别分析3种多元分析方法,对河川沙塘鳢(Odontobutis potamophila)4个不同地理群体的15项形态比例参数进行比较分析。聚类分析结果表明,河川沙塘鳢射阳群体(SY)和太湖群体(DXS)的形态最接近,与当涂群体(DT)、建德群体(JD)趋异程度较大。主成分分析构建了5个主成分,对不同群体间总变异方差的贡献率分别为18.070%、16.717%、11.374%、9.504%、7.182%,累积贡献率为62.847%。主成分分析结果表明,4个河川沙塘鳢群体在形态上的差别主要体现在体长、头长、眼后头长、体高和体厚这5个形态性状上。判别分析中采用8个不同的变量,分别建立了河川沙塘鳢4个群体的判别函数,判别准确率P1为62.0%~100.0%,判别准确率P2为62.0%~98.0%,综合判别准确率为77.0%。     

缢蛏7群体的形态差异与判别分析

运用多变量形态度量学分析方法,对我国沿海庄河、汉沽、海阳、盐城、崇明、宁波、漳州7个地理群体缢蛏的12个形态性状进行了形态差异研究。聚类分析和主成分分析结果表明,汉沽群体和海阳群体首先与庄河群体聚类,之后依次与崇明群体和盐城群体聚类,最后与宁波和漳州群体聚为一支。主成分分析构建了3个主成分,其贡献率:主成分1为36.28%,主成分2为22.23%,主成分3为12.72%,累积贡献率为71.23%。判别分析结果表明,7群体间形态差异显著(P<0.01)。建立7群体缢蛏的判别函数,其判别准确率P1为66.67%~86.67%,P2为68.96%~100%。7群体的综合判别率为77.93%。     

大菱鲆4个进口群体的形态差异分析

选择2003～2004年进口的4个大菱鲆不同进口群体(英国、法国1、法国2、法国3),测定了其全长、体长、头长、吻长、体高、尾柄高和尾柄长等7项形态性状.采用聚类、主成分分析和判别分析3种多元分析方法,对大菱鲆的6项比例形态性状参数进行比较研究.聚类分析与主成分分析结果均表明,法国1和法国2群体间形态最接近,而与英国群体、法国3群体的趋异程度较大.主成分分析构建了两个主成分,其贡献率:主成分1为61.069%,主成分2为34.343%,累计贡献率为95.412%.以判别分析建立了4个群体的判别函数,判别准确率分别为46.7%～80.0%(P1)和51.7%～77.4%(P2),综合判别率为62.5%.3种多元分析结果表明,4个大菱鲆群体在形态上已经产生一定程度的差异,且集中表现在全长、体长、头长、吻长和尾柄长这5个形态性状指标上.     

浙江沿海彩虹明樱蛤生物学特性初步研究

通过对浙江沿海4个海区彩虹明樱蛤的壳长、壳宽、软体质量、鲜出肉率、肥满度、蛋白质和脂肪含量等在一年生长最快的季节(5—9月)变化趋势的研究,进一步证明了壳长与壳宽、壳长与软体质量均呈线性正相关,慈溪的彩虹明樱蛤的鲜出肉率、肥满度、蛋白质含量都是最高的。如果以出肉量为标准,7月是最佳的采捕季节。乐清的彩虹明樱蛤脂肪含量最高可作种贝。     

山东沿海不同地理群体中国蛤蜊形态差异分析

为研究山东沿海不同地理群体中国蛤蜊(Mactra chinensis)形态差异和地理分化特点，运用多变量形态度量学方法，通过方差分析、主成分分析、聚类分析和判别分析对日照东港(DG)、烟台海阳(HY)、青岛黄岛(HD)、威海文登(WD)和东营垦利(KL)5个中国蛤蜊野生群体形态数据进行比较分析。生长指标指数显示，文登群体贝壳最厚，黄岛群体贝壳最薄、肥满度最低，海阳群体软体部最肥；5个群体间最大差异系数为0.515～1.245,均小于1.28,尚未达到亚种水平；主成分分析共提取3个主成分，主成分1贡献率为33.71%,主成分2贡献率为27.16%,主成分3贡献率为14.42%,累计贡献率达75.29%;聚类分析结果表明，5个中国蛤蜊群体聚为2类，海阳群体、文登群体和垦利群体聚为一类，东港群体和黄岛群体分别聚为一类；通过判别分析，共建立了4个判别函数，判别准确率为70.0%～94.0%,综合判别率为80.0%。研究结果可为中国蛤蜊的地理群体识别、种质资源保护与利用提供重要依据。     

凡纳滨对虾６群体的形态差异及判别分析

运用3种多元分析方法对6个不同地理群体凡纳滨对虾的形态差异进行了比较研究，聚类分析显示广东和厦门的群体形态较为接近，而与浙江，海南三亚（盐度10‰、70‰）的差异程度较大，渤海湾捕捞的野生凡纳滨对虾与另外5个群体欧氏距离最远；主成分分析构建了4个主成分，贡献率分别为主成分1：28.96%，主成分2：18.22%，主成分3：14.89%，主成分4：10.51%，累计贡献率72.58%；判别分析结果，判别准确率P1为76.7%-96.6%，判别准确率P2为82.3%-100%，综合判别准确率为88.33%。虽然6个凡纳滨对虾群体在形态上已有一定程度的差异，但均未达到亚种水平。     

不同地理群体三疣梭子蟹mtDNA本底甲基化水平分析

利用重亚硫酸盐测序法,对适于三疣梭子蟹(Portunus trituberculatus)线粒体基因组甲基化分析的BSP(Bisulfite sequencing PCR)引物进行了筛选,在设计的21对引物中,获得了12对BSP引物。利用这12对引物分析了三疣梭子蟹海州湾群体(江苏连云港)和莱州湾群体(山东东营)线粒体基因组本底甲基化水平,结果表明:海州湾群体不存在甲基化现象,莱州湾群体发现了2个个体在ND2基因(NADH脱氢酶亚基2)位点存在甲基化现象;在存在甲基化的个体中,甲基化类型主要为CHG和CHH类型,还有少量Cp G类型。该研究结果说明,莱州湾群体和海州湾群体线粒体基因组本底水平上的甲基化特征存在一定差异,相关研究值得进一步深入探讨。     

梭鱼(Liza haematocheila) 4个野生地理群体遗传多样性的微卫星分析

利用14对微卫星引物,对采捕于辽宁葫芦岛、山东青岛、江苏连云港以及浙江舟山附近海域的梭鱼(Liza haematocheila)4个野生地理群体进行群体遗传多样性分析.结果显示,14对微卫星引物均能扩增出清晰的条带且具有一定的多态性,4个野生群体的多态性百分率分别为92.86％、92.87％、100.00％和85.71％.4个群体共扩增出61个等位基因,4个群体的等位基因数为3.786-4.000,有效等位基因数为2.673-2.899,观测杂合度为0.359-0.389,期望杂合度为0.503-0.561,多态信息含量为0.465-0.513,说明4个群体遗传多样性处于中等多态水平.运用SPSS软件对杂合度期望值进行Kruskal-Wallis检验,其结果(H=0.187,df=3,P=0.980)表明,4个群体间的遗传多样性差异无统计学意义(P＞0.05),各群体大部分微卫星位点偏离Hardy-Weinberg平衡(P＜0.05).另外,研究发现,葫芦岛和舟山均出现两个位点呈现杂合子过剩,其他两群体均出现3个位点呈现杂合子过剩(Fis＜0),表明近期可能出现过瓶颈效应.所有群体间遗传分化系数为0.148,基因流值为1.444,群体间出现中度遗传分化,群体间出现一定程度基因流.两群体间的遗传相似性系数为0.623-0.818,遗传距离为0.202-0.473,青岛和葫芦岛的遗传距离最近(0.202),而连云港和舟山的最远(0.473),这可能与梭鱼幼体的扩散能力及近海沿岸生态环境及群落结构有关.采用UPGMA法对4个群体进行聚类分析,结果显示,4个地理群体按其地理位置由北向南依次聚为一类.     

长江主要一级支流中华倒刺鲃形态差异比较

采用传统形态学和框架分析法,运用单因素方差分析、聚类分析、主成分分析和判别分析4种多元分析方法对嘉陵江、赤水河、清江3个中华倒刺鲃(Spinibarbus sinensis)种群288尾样本的30个形态比例性状进行比较研究.结果表明,3个种群的全长/体长、叉长/体长、体宽/体长等29个性状差异显著(P＜0.05);聚类结果显示,嘉陵江种群与赤水河种群首先聚为一类,认为嘉陵江种群与赤水河种群形态最为相似;主成分分析构建了8个主成分,累计贡献率为62.93％;以Bayes逐步判别分析方法选用16个判别效果较好的比例性状建立了3个中华倒刺鲃地理种群的判别函数,综合判别率达到99.31％.研究结果显示,嘉陵江种群与赤水河种群形态较为相似,而两者与清江种群形态差异较大.本研究从形态特征上为长江上游中华倒刺鲃种群的划分提供了科学依据.     

莱州湾小拟哲水蚤(Paracalanus parvus)丰度分布周年变动

利用2011年5月?2012年4月(除冰期12月和翌年1?2月外)在渤海莱州湾逐月由底至表垂直拖网(网孔目160 µm)获得的浮游动物样品，开展小拟哲水蚤丰度分布周年季节变动研究。结果显示，小拟哲水蚤季节变化呈单峰型，7?10月份丰度较高，高峰值出现在8月份；水平分布以湾中部偏东侧丰度较集中，其次为湾口站位，湾顶站位为相对低值区。应用Primer 6.0软件中的BIOENV程序分析发现，小拟哲水蚤总丰度的月变化主要受水温影响、特别是1月前的水温，可能还受黄河径流量的间接影响；水平分布则与盐度、水深关系密切。     

不同投喂方式对鳙形态特征的影响

为分析不同投喂方式对鳙形态特征的影响,本研究采用了传统形态度量法和框架分析法构建了31个反映体型的形态比例性状,运用单因素方差分析、聚类分析、主成分分析和判别分析等统计方法对4种投喂方式下,施肥(组A)、施肥+1/2投饲(组B)、施肥+投饲(组C)、投饲(组D)总共56尾鳙的这些性状进行分析比较。方差分析结果显示,不同处理组间头高/体长、4–6/体长、5–6/体长、5–8/体长等7个比例性状无显著差异,其他24个性状差异显著,但头长/体长在组A、组C和组D中无显著差异。聚类分析结果显示,不同处理组分成2支,其中组A单独聚为一支,而组B、组C和组D共同聚为一支。主成分分析构建了7个主成分,累计贡献率达到了94.6%,其散点图显示,组B、组C和组D部分样本重叠在一起,与组A完全分开。以Bayes逐步判别分析方法选用了6个判别效果较好的比例性状,建立了4个种群的判别函数,不同处理组鳙判别准确率分别为92.7%、87.5%、64.3%和87.5%,说明了本结果的可靠性。结果表明,投饲养殖方式下鳙形态特征发生显著变化,但头部相关的主要比例性状无显著差异,头部至背鳍躯干部距离显著增大,形成了头部偏小的假象。本研究首次以数据结果阐释投饲养鳙仍符合人们喜食的大鱼头特征,为该养殖技术奠定了理论基础。     

不同地理种群泥蚶的形态差异与判别分析

泥蚶(Tegillarca granosa Linnaeus)为印度椢魈洋海域的广温广盐性贝类,在我国主要分布于山东以南沿海,是我国沿海滩涂的主要经济养殖贝类.有关泥蚶人工育苗、繁殖与生长和生理生化等方面的研究已有较多报道[1-9],但种内形态特征的地理变异未见报道.本文利用多变量形态度量学方法对我国山东、浙江、广西和韩国4个地理种群泥蚶的形态变异进行了比较研究,探讨了泥蚶种内的形态变异特点与地理分化规律、并建立判别函数,为泥蚶地理种群的识别、种质保护和良种选育提供理论依据.     

不同地理群体菲律宾蛤仔壳形态对体重性状的影响研究

采集我国南北沿海9个地理群体的菲律宾蛤仔(Ruditapes philippinarum)，利用通径分析等方法评估各群体形态性状对活体重和软体重的影响。结果显示，各群体壳长、壳高、壳宽和壳厚4 个形态性状对菲律宾蛤仔活体重和软体重的影响存在显著差异。除壳厚外，其他形态性状与活体重和软体重呈显著相关(P < 0.05)。通径分析和决定系数分析显示，大多数群体的壳宽对活体重和软体重的直接作用最大。2个形态比例参数(壳宽/壳长和壳高/壳长)最大值出现在山东莱州群体(0.49和0.74)，而最小值出现在大连东港群体(0.42和0.67)。壳厚的变异系数最大(22.74)，而壳高的变异系数最小(9.47)。通过检验偏回归系数的显著性，建立了各群体形态性状对软体重的最优回归方程。聚类分析表明，菲律宾蛤仔不同群体未出现明显的地域分布特征，而呈现出不规律的南北交替聚类现象。本研究查明了不同地理群体菲律宾蛤仔壳形态性状对体重性状的影响，为菲律宾蛤仔地理群体的形态判别、种质资源分析和遗传育种研究等提供了重要科学依据。     

Connectivity of the bay scallop (Argopecten irradians) in Buzzards Bay,Massachusetts, U.S.A.

The harvest of bay scallops (Argopecten irradians) from Buzzards Bay, Massachusetts, U.S.A. undergoes large interannual fluctuations, varying by more than an order of magnitude in successive years. To investigate the extent to which these fluctuations may be due to yearly variations in the transport of scallop larvae from spawning areas to suitable juvenile habitat (settlement zones), a high‐resolution hydrodynamic model was used to drive an individual‐based model of scallop larval transport. Model results revealed that scallop spawning in Buzzards Bay occurs during a time when nearshore bay currents were principally directed up‐bay in response to a persistent southwesterly sea breeze. This nearshore flow results in the substantial transport of larvae from lower‐bay spawning areas to settlement zones further up‐bay. Averaged over the entire bay, the spawning‐to‐settlement zone connectivity exhibits little interannual variation. However, connectivities between individual spawning and settlement zones vary by up to an order of magnitude. The model results identified spawning areas that have the greatest probability of transporting larvae to juvenile habitat. Because managers may aim to increase scallop populations either locally or broadly, the high‐connectivity spawning areas were divided into: (i) high larval retention and relatively little larval transport to adjoining settlement areas, (ii) both significant larval retention and transport to more distant settlement areas, and (iii) little larval retention but significant transport to distant settlement areas.     

额尔齐斯河银鲫形态学及COI基因序列分析

采用传统形态学方法和线粒体COI基因序列分析对额尔齐斯河银鲫(Carassius auratus gibelio)两个群体的形态和遗传差异进行了比较。结果显示:通过对8个可量性状和20个框架数据的主成分分析可以看出,两个群体分别占据两个不相重叠的区域,两个群体在形态上存在明显分化。COI基因序列分析显示,两群体之间遗传距离为0.012,群体间遗传距离是群体内最大遗传距离的4倍,两群体间在编码的氨基酸序列上出现了一处替换,群体遗分化指数值为0.96078,基因流值为0.01,表明群体间缺乏基因交流,群体间有明显的遗传分化。