桉树Genomic-SSR和EST-SSR分子标记的遗传差异性分析

为探讨Genomic-SSR与EST-SSR标记在桉树种间的遗传差异,本研究利用两种不同来源的SSR标记对6种桉树进行遗传差异性分析.分析结果表明:Genomic-SSR标记在6种桉树中具有高的遗传多样性,EST-SSR标记在揭示不同基因型间遗传关系方面更具优势.对两种标记进行聚类分析发现,EST-SSR标记比Genomic-SSR标记能更准确地鉴别基因型.两种不同来源SSR标记的遗传差异性,为更有效利用SSR标记在桉树遗传多样性分析、种质鉴定等相关研究提供了理论支持.     

玉米杂交种子纯度的SSR分子标记与盐溶蛋白检测法的比较研究

以我国推广面积较大的9个玉米杂交种为试材,利用盐溶蛋白电泳法与SSR分子标记鉴定法对试验材料进行了杂交种纯度鉴定的比较试验。结果表明:盐溶蛋白电泳法可以很好地鉴定出8个组合,且具有简单、快速、准确、稳定和低成本的特点,可用于大批量检测。但因一些种子蛋白质水平差异较小,有1个组合难以鉴定,具有一定的局限性。而SSR分子标记法经过40对引物的重复筛选,仅用3个多态性好的SSR引物能鉴定出所有的组合,具有更好的精确性。但因实验条件要求高,成本相对较高,不宜用于大批量检测。因此,可将盐溶蛋白电泳法作为首选大批量种子纯度的检测方法,而对难以鉴定的品种可采用SSR分子标记法进行鉴定。     

SSR标记技术在杨属植物研究中的应用

SSR标记具共显性和多态性等特点,是一种很有价值的分子标记,微卫星在林木基因组中广泛存在。本文综合国内外SSR标记在杨属植物研究中的应用,并探讨了该技术存在的问题及发展趋势。     

竹类植物SSR引物开发策略及应用

微卫星(SSR)指的是以核苷酸为单位,串联重复的DNA序列,分布于真核生物的整个基因组中。SSR标记是基于DNA长度多态性的分子标记技术,广泛应用于群体遗传结构分析、构建遗传图谱、基因定位、亲缘关系等领域。本文综述了竹类植物中的SSR引物开发方法及应用,旨在为SSR分子标记在竹类植物中的应用提供参考。     

SSR分子标记在梨遗传育种研究中的应用

对SSR分子标记在梨的品种鉴定,种质资源评价,重要农艺性状的基因定位以及分子标记辅助选择育种等4个方面的研究应用进展进行了综述,并对当前SSR标记在梨研究中存在的主要问题和应用前景进行了分析,旨在为开展梨分子遗传育种提供参考。     

马尾松实生种子园F1代的RAPD分子鉴别

为了筛选出鉴定马尾松优良杂种F1代的RAPD特征标记,从DNA水平上区分杂交子代,以从23个马尾松实生种子园F1子代嫩叶中抽提的DNA作为试验材料,采用RAPD分子标记技术检验DNA序列的多态性。从99条引物中筛选出5条适合马尾松F1代RAPD扩增且具有多态性的引物S1026、S1110、S1040、S1180、S1172。利用这5条引物,采用RAPD分子标记技术,对23个F1子代进行了标记基因型的研究,得到了27个标记位点,确立了各样品的标记基因型,并在此基础上进行了马尾松子代的分子分类研究。     

杨树抗逆转录因子基因内SSR标记的开发

利用直接测序法开发小叶杨抗逆转录因子基因内一套新的核基因组SSR标记。通过对3个抗逆转录因子共21个成员在36个小叶杨基因型个体中的序列比较分析后共检测到31个SSR多态性位点,SSR出现的频率为1/1916bp。在小叶杨自然群体中,SSR多态性位点的碱基重复呈现出2～5碱基形式,基元重复次数变异范围为3～20次,其中以二碱基重复的位点较多,占总数的51.6%。在此基础上,依据SSR位点两侧的保守序列,设计31对SSR位点PCR扩增引物对。利用设计的引物检测所开发的SSR位点在杨属内22个基因型个体中PCR扩增的有效性及SSR位点的保守性。PCR扩增结果显示,93.5%的SSR位点能够在杨属内至少4个派内有效扩增,每对引物组合可检测到SSR多样性位点数3～12个,平均6个。基于抗逆转录因子基因内开发的SSR标记位点为分子标记辅助小叶杨抗逆性状育种提供工具。     

分子标记法和形态学特征对杏仁栽培种及野生种基因型的遗传关系构建的辨别

应用23个形态学特征,19个扩增片段长度多态性(AFLP)引物组合,80个随机扩增多态DNA(RAPD)引物和32个简单序列重复(SSR)引物对,比较三种分子标记法在29个杏仁栽培种和3个野生种遗传关系构建中的信息景和效率.根据预期杂合度的评价,与AFLPs和RAPDs相比,SSRs具有较高水平的多态性和较大的信息量.AFLPs预期朵合度值最低,但其辨别效率值最高,因为AFLPs能揭示每个反应中的大量条带,导致各种类型的多样性指数均较高.三种分子标记法对杏仁基因型的辨别效率均较高,只是SSRs无法辨别‘Monagha'和‘Sefied'杏仁基因型.三种分子标记法基因型相似性相关系数统计上显著,但SSR数据要低于RAPDs和AFLPs的值.尽管三种分子标记法树形图拓扑结构存在一些差异,但相似性水平均较高.SSRs、RAPDs和AFLPs的系统树图及其综合数据都能依据地理散布反映大多数栽培种的关系.AMOVA检测到每个地理组中栽培种和野生种的变异.辅助程序分析表明,实验所应用的标记物数量足以保证基因相似性估计的可靠性和标记法间的比较是有意义的.     

马尾松生长和产脂性状在SSR和ESTP标记不同基因型间的变异研究

对广东省4个试验点内拥有共同母本的马尾松7个全同胞家系和1个自由授粉家系5 a生试验林进行了调查,采用微卫星（SSR）和表达序列标签多态性（ESTP）的分子标记对360个单株进行了检测,筛选得到有多态性的SSR标记4个,ESTP标记15个,位点共21个,其中ESTP标记est8704不同基因型间的产脂量有显著差异,可作为马尾松辅助产脂量选择的候选标记.     

分子标记在林业辅助选择育种中的应用

本文主要阐述分子标记在林木辅助选择育种中的应用。利用多种分子标记(RAPD,RFLP,AFLP,STS,SSR,STR等),可以在林木早期生长阶段对一些性状进行鉴别, 构建单种分子标记遗传连锁图谱或几种分子标记共存的混合连锁图谱和对控制数量性状的基因进行定位, 对林木群体遗传结构、遗传变异、遗传分化和基因流动进行研究, 在基因工程中, 能够追踪目的基因行为和对控制质量性状的基因进行鉴别, 对单株进行指纹图谱, 对种子质量进行监测和对品系、品种和无性系进行鉴定。     

杨树基因组SSR标记在康定柳中的通用性分析

SSR分子标记因具有共显性遗传、高度多态性、重复性和稳定性好、易于实现自动化等优点,在遗传育种等方面有着广泛的应用前景。本研究在杨树基因组中随机选取622对SSR引物对来自5个不同群体的康定柳雌雄各20个个体,共计200个进行了通用性分析。结果表明：杨树基因组SSR标记在康定柳中的通用性达到7.88%。     

利用分子标记技术对林木近缘种进行遗传鉴别的研究

不同树种近绝种的种子和苗木的真实性鉴别是林木种苗检验过程中常常遇到的难题。本文对国外林木种苗的真实性鉴别研究及相关信息进行了综述，并在此基础上，对利用种特异分子标记鉴别林木种苗真实性的技术和方法进行了探讨：根据在进化上有同源性的突变基因位点或DNA区段可发展种特异的SNP标记；而利用物种在进化过程中固定的特异基因位点或DNA区段可发展种特异的STS或SCAR标记。这2种类型的种特异分子标记均可直接应用到实际的检验过程中。     

银杏种质资源分类研究综述

银杏为单科属种,雌雄异株,长期系统发育和个体发育的演变使其产生了较多的分化,形成了丰富的种质资源。银杏种质资源通过植物学、果树学及同工酶标记等方法已得到初步分类并命名。该文在进行银杏种质资源的分类及其DNA分子标记研究的基础上,收集国内外有关文献,主要介绍了目前银杏种质资源的特点、DNA分子标记技术在银杏种质资源分类中的应用及银杏分子基因组研究中常用的RAPD,SSR,ISSR,AFLP等4种分子标记方法,并阐述了分子标记在银杏种质鉴别、遗传图谱构建以及新品种培育等方面的应用前景。     

SSR分子标记与林木遗传育种

阐述了一种新兴的基于PCR的微卫星分子标记技术在林木遗传育种中的应用情况及发展趋势.由于微卫星位点多态性高、共显性、中性突变及遍布于整个基因组,因此使之广泛应用于遗传连锁图谱的构建与QTL定位、亲缘关系分析、遗传结构分析、基因流监测、基因突变以及系统发生等领域.文中指出SSR标记可以为林木遗传改良、种质资源保存、濒危物种保护、基因定位及分子克隆等许多应用研究领域提供理论依据,它将是一种近乎理想的新一代的分子标记.     

分子标记辅助选择在林木育种中的应用

历史上,数量遗传学被认为是指导林木育种的唯一有效工具,这有两个方面的原因：第一,在林木上具有重要经济价值的性状,如树干材积生长、木材纤维长度及适应性等,均是以数量方式遗传的性状,并且控制这些性状的每一个过程是假设受微效多基因所控制的;第二,林木具有很长的世代间隔,很高的遗传杂合性和很高的遗传负荷,这些特性限制了一些经典的遗传材料,如近交系,突变体及特异类型的产生。然而,传统的数量遗传学方法用于指导林木育种的实践并不是完美无缺的。林木个体高大,占地面积大,且大多栽植在非农用耕地上,这样的环境异质性在很大程度上影响性状遗传力的提高,有些林木树种人工杂交比较困难,很难获得足够大的家系,从而产生不平衡的交配设计。Ｎａｍｋｏｏｎｇ 和Ｒｏｂｅｒｄｓ（１９７６） 认为,不平衡的交配设计很难获得准确的遗传参数估计。到目前为止,大多数成功的林木育种方案往往都是基于对表型的简单选择。这种表型选择不能利用林木固有的非加性效应,以及对异质环境的反应潜能,因而育种效果是极为有限的。分子标记技术为现代数量遗传学的发展提供了新的方向。通过利用中性标记与影响数量性状的位点（ＱＴＬ） 之间的连锁关系,人们已经提出了一套统计方法用来鉴定重要的Ｑ     

微卫星分子标记及其在林业中的应用

微卫星(SSR)是建立在聚合酶链式反应(PCR)技术上的一种应用广泛的分子标记, 具有含量丰富、多态性高、共显性、操作简便、重复性好、稳定可靠等优点。文中介绍了微卫星序列的分布特征、分布模式、多态性的产生机理及重复序列所具有的功能, 综述了微卫星分子标记的引物获取途径及其在林业研究上的主要应用。     

Analysis of SSR loci and development of SSR primers in Eucalyptus

In this study,28,691 genome sequences and16,566 expressed sequence tags(ESTs) of Eucalyptus were derived from the Gen Bank database.A total of 2292 SSR loci were sought out from 1785 effective sequences.Through analyses of SSR loci information,the SSR motif length was negatively correlated with the abundance of the SSRs.In the EST sequences of Eucalyptus,triplet repeat motifs were the most abundant,and dinucleotide repeats motifs had the highest frequencies.Subsequently,395 pairs of primers were designed based on the SSR loci.Using optimized SSR-PCR conditions,340 pairs of primers were successfully screened,with a success rate of 86.1%.By construction of a maximum likelihood phylogenetic tree of six eucalypt species,represented by five species of the genus Eucalyptus and one of the genus Corymbia,the genetic relationships of Eucalyptus urophylla and E.camaldulensis suggested by this tree was found to differ from that suggested by traditional morphological taxonomy.The results provide insights for evaluating geneticdiversity of Eucalyptus and analysis of Eucalyptus phylogenetics using SSR markers.     

磁珠富集法快速制备油茶基因组微卫星标记

利用磁珠富集高效微卫星分离法,设计生物素标记的寡核苷酸（AG）15与（AC）15作为探针,快速分离油茶微卫星序列并建立其SSR分子标记体系。从获得的52份具微卫星序列的克隆测序结果中,成功开发40对油茶SSR引物,序列开发引物成功率在76.9%;对扩增结果进行比较分析后,共得到14对具有清晰扩增条带的SSR引物,占总引物的35%;进一步利用18个油茶无性系开展引物多态性检测,显示6对SSR引物具良好的多态性。研究结果可为油茶遗传学研究提供新的分子标记工具,同时为山茶属其他重要经济树种的相关研究提供很好的借鉴。