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植物重要性状相关的数量性状基因座(QTL)和基因定位一直是结构基因组学的研究重点,也是遗传机制解析和分子育种的重要基础。木本植物具有重要的经济、生态价值,但用于其研究的传统基因定位方法存在耗时长、工作量大、通量低、成本高且效果不佳等问题。近年来,由于测序技术发展日新月异,基于二代测序技术的集群分离分析法(NGS-based BSA)开始应用于木本植物中。与传统的集群分离分析法(BSA)技术相比,NGS-based BSA周期短、效率高,能对质量或数量性状进行精确定位,在木本植物遗传学和组学研究方面具有广阔的应用前景。文中简述了BSA的发展历程和研究策略,综述了其在木本植物研究中的进展,分析了NGS-based BSA的优势及存在的问题,展望了其在木本植物遗传学、组学和种质改良领域中的应用潜力。 相似文献
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世界林业科技发展的现状与趋势 总被引:2,自引:0,他引:2
《中国林业》2001,(13)
主要林业学科领域科技发展水平的国内外比较 世界主要发达国家的林业科技总体发展水平是比较高的,这主要受益于所在国家整体上比较发达的技术经济水平与实力。在林业生物技术、信息技术和新材料技术等高新技术领域,其科技发展水平较高,优势较明显。 林木良种选育领域。主要林业发达国家在分子遗传育种等林业生物技术领域取得了显著进展,特别是在控制木素合成基因的识别、定位、分离、克隆和基因转移等方面,以及把分离和改造过的基因分别导入到山杨、枫香、桉树、相思、火炬松和辐射松等重要树种的试验应用方面成就突出。我国在这一领域… 相似文献
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[目的]为探究光敏色素相互作用因子(PIF)基因在杨树生长发育中的功能。[方法]利用生物信息学方法预测了杨树基因组中的PIF基因家族成员并对各成员的基因结构、保守基序进行了系统分析;在此基础上,采用实时荧光定量PCR技术检测了PIF成员在不同组织及低温、干旱和Na Cl胁迫下的表达模式。[结果]表明:杨树基因组中至少含有10个Pt PIF成员,这些成员在进化上相对保守,均具有典型的b HLH结构域。基因表达分析显示:Pt PIF基因在杨树不同组织及不同非生物胁迫条件下存在明显的表达差异。[结论]杨树Pt PIF基因家族包含10个成员参与不同的生物学过程,研究结果将为深入解析杨树Pt PIF基因的功能奠定了基础。 相似文献
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RNA干扰是生物进化的结果,是生物体对病毒基因等外源核酸侵入的一种保护性反应。它普遍存在于各种生物中,具有抗病毒、稳定转座子及监控异常表迭mRNA的生物学功能。应用RNAi技术,将病毒在复制中起关键作用的基因作为目标,设计dsRNA导入植株培育抗病毒植株。 相似文献
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为研究桃果实酯类香气的生物合成,克隆了桃醇酰基转移酶基因AAT,并研究了外源乙烯对该基因mRNA转录水平的影响。根据桃基因组测序结果,采用RACE和反转录PCR技术克隆到1个与醇酰基转移酶基因同源的cDNA,序列全长1 486 bp,CDS区长度为1 353 bp,编码450个氨基酸,命名为PpAAT2。PpAAT2蛋白属于PLN02481超级家族,含有植物转移酶基因2个高度保守结构域HXXXD和D(N)F(V)GWG。基因位于桃第5条染色体,BAC注释为1条包含1个内含子的mRNA序列转录链,CDS区有2处碱基突变,其中,555 bp处碱基由C突变为G,导致丙氨酸突变为缬氨酸。AAT基因响应乙烯表达,0℃冷藏桃施加外源乙烯促进AAT基因表达水平;该基因在叶片、花和成熟果肉中均表达,且在叶片和花中的表达丰度比果实高,推测其在不同的生理过程中均发挥作用。 相似文献
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mRNA差异显示法研究杉木木材形成相关cDNA 总被引:1,自引:0,他引:1
利用差异显示法(DDRT-PCR)研究杉木的2个自然变异类型(句容0号及独干杉)木材形成过程中基因表达差异.通过银染后切割回收54个差异条带,经2次扩增和纯化、克隆转化及反向Northern杂交验证后共获得29个阳性克隆.测序后进行比对分析,结果表明:1)Blastn比对(分值>60)有9个cDNA克隆在GeneBank中找到了相似的功能,分别与核糖体蛋白基因、信号传导功能、泛素蛋白基因、抗性功能、组氨酸磷酸转移蛋白、细胞发生功能及能量代谢相关;2)Blastx比对有12个序列可进行功能推测;3)还有8个cDNA在数据库中未发现匹配信息.这些信息可为杉木木材形成相关基因的分离和克隆提供研究基础. 相似文献
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论述了老杉木基因库的营建与管理技术 ,对从福建、贵州、浙江、湖南 4个省 17个县 (市 )收集到 2 5株老杉木的种质基因资源的表现进行比较分析 ,提出老杉木基因库的利用价值 相似文献
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Yoshiaki Kato Yoh Sakuma Tomonori Azuma Akira Ando Kiyoshi Miura Keiji Takabe Yutaka Tamai 《Journal of Wood Science》2001,47(3):165-170
A cDNA clone fromPopulus nigra L. var.italica Koehne, denoted PCY2-6, coding for an anionic peroxidase has been isolated, cloned, and characterized. PCY2-6 is 1160 bp long; and its deduced product, PnC26, contains 343 amino acid residues. The mature protein has a calculated isoelectric point of 4.09. The protein contains two motifs typical of peroxidase and 10 potentialN-glycosylation sites. PnC26 is therefore classified as an anionic peroxidase. The mRNA of the PCY2-6 gene family was detected in immature and mature leaves and in two parts of current-year stems: the shoot tip and the older stem. The mRNA of PCY2-6 gene family was found to localize in the phloem and cortex of the current-year stems. We therefore conclude that expression of the PCY2-6 gene family is related to bark development. 相似文献
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杨树受损伤后能诱导一些基因的表达,其编码的蛋白质可能在杨树的防卫反应中起一定作用.用PCR方法从新疆杨叶片中克隆出一个损伤诱导型Kunitz胰蛋白酶抑制剂基因PaTI1.序列分析表明:此基因不含内含子,其翻译起点上游具有'TATA'和 'CCAAT'等转录控制元件,包含的阅读框架能编码一个长为213个氨基酸的多肽.此多肽与克隆自美洲山杨的PtTI2 和PtTI1氨基酸序列同源性最高,分别为95%和80%,其N端存在一长度为27个氨基酸的信号肽.将此基因以融合蛋白的形式在大肠杆菌中进行表达,纯化后的融合蛋白对胰蛋白酶的活性有抑制作用,每8.5 μg融合蛋白可完全抑制1 μg牛胰蛋白酶的活性.Western blot分析表明融合蛋白与PtTI2特异的抗体之间有明显的血清学反应. 相似文献