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相似文献
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1.
湘鄂西地区珙桐天然群体遗传结构的研究   总被引:3,自引:0,他引:3  
以珙桐叶为材料,对湘西和鄂西两天然珙桐群体的60个样品进行RAPD分析.结果表明,9个随机多态引物,获得24个多态标记位点,平均每个引物产生2.67个多态位点;湘西和鄂西两群体之间的遗传多样性差异不明显,Shannon指数分别为0.427 4和0.448 1;种内平均遗传多样性为0.326 9,群体内平均遗传多样性为0.297 6,群体间的遗传多样性为0.029 3,基因分化系数为0.089 6,基因流为5.079 2.两个天然珙桐群体的遗传相似性非常高,达到0.923 3,遗传距离为0.079 8;湘西群体的多态百分位率略高于鄂西.这表明,湘西和鄂西两群体间存在着非常频繁的基因流.  相似文献   

2.
紫胶虫主要生产种的RAPD分子标记分析   总被引:1,自引:0,他引:1       下载免费PDF全文
用RAPD技术研究了紫胶虫7种主要生产种12个群体之间的亲缘关系,研究中每个群体使用了24个标本,共有288个个体用于研究.在试用的45种随机引物中,筛选出9种引物用于随机引物扩增,共得到121个清晰稳定的位点,其中118个为多态性位点,多态百分率为97.52%,每条引物检测到的位点数为11~16个,长度为150~3 000 bp.根据扩增结果,用UPGMA法对Nei's遗传距离进行聚类分析,构建分子系统树.7种紫胶虫聚类结果显示:紫胶虫各群体间的遗传距离为0.044 3~0.791 7,其中,种间的遗传平均距离为0.443 0,种内的遗传平均距离为0.170 7.根据聚类分析,讨论了紫胶虫主要生产种的亲缘关系.  相似文献   

3.
用随机扩增多态DNA(RAPD)分子标记方法对巨桉11个种源80个个体进行了遗传变异的比较分析.通过20个10bp随机引物的扩增,共检测到149个位点,其中89个为多态性标记位点,总的多态位点百分率为59.73%.各个种源多态位点百分率较高,为42.86%~55.89%,多态位点最多的是8号种源,最低的是6号种源.Shannon表型多样度估测值的统计表明,遗传多样性主要存在种源内部.遗传变异在种源间占28.74%,在种源个体间占71.26%.Shannon表型多样度估测值在种源间为0.1720~0.2650,平均为0.2373.8号种源的遗传多样性最高,6号种源的遗传多样性最低;种源间的遗传距离为0.0391~0.1344,平均为0.0817.这些遗传变异为巨桉优良种源的早期选择提供了科学依据.  相似文献   

4.
香榧天然群体遗传多样性的AFLP分析   总被引:3,自引:1,他引:2       下载免费PDF全文
利用AFLP分子标记技术,采用8对引物对6个香榧天然群体的92个个体进行了总基因组DNA水平上的多态性检测,共检测出364个位点,其中多态性位点63个.方差分析表明:基因谱带频率在群体间差异不明显,方差分量贡献率在群体间占11.14%,群体内占88.86%.6个群体均具有丰富的遗传多样性,多态位点百分率为79.73%~98.41%,其中绍兴>东白湖>磐安>钟家岭>嵊州>黄山,且群体内遗传多样性大于群体间遗传多样性.等位基因数为1.7939~1.9841,有效等位基因数为1.5416~1.6759,Shannon信息指数为0.4548~0.5471.群体分化系数为0.1136,群体内遗传多样性为0.3512,基因流为3.8997.遗传一致度平均值为0.9174,遗传距离平均值为0.0797.根据遗传一致度进行了UPGMA聚类分析.  相似文献   

5.
6个复叶槭品种间亲缘关系的RAPD分析   总被引:1,自引:0,他引:1  
采用RAPD法对复叶槭5个品种及1个芽变品种进行基因组DNA多态性分析,从300个引物中筛选出具有丰富多态性的20个10bp的随机引物,这20个引物共扩增出170个DNA片段,片段大小在200bp~2800bp之间,其中多态性谱带为112条,多态率为65.88%,表现出较为丰富的RAPD多态性;利用UPGMA进行遗传距离计算的结果表明,6个复叶槭品种间的亲缘关系和遗传距离均有较大差异.  相似文献   

6.
乐昌含笑种群遗传多样性的研究   总被引:10,自引:0,他引:10       下载免费PDF全文
基于随机扩增多态DNA(RAPD)方法分析了珍稀木兰科植物乐昌含笑6个种群的遗传多样性及分化程度。19条随机引物扩增出111个可分析位点,多态位点百分比为81.98%,经POPGENE分析发现,乐昌含笑的Nei’s基因多样度(Hc)为0.3255,Shannon表型指数(I)为0.4751,与其它植物比较具有较高水平的遗传多样性。6个乐昌含笑群体间基因分化系数(Gst)值为0.2226。群体内的遗传变异大于群体问的遗传变异。按照遗传距离将乐昌含笑6个群体划分为两类:第1类有广西三江、湖南宜章、湖南双牌和湖南资兴的群体,第2类包括江西官山和湖南醴陵的群体;研究表明:第2类种群的遗传多样性指数高于第1类种群的遗传多样性指数。  相似文献   

7.
毛竹居群遗传多样性的RAPD分析   总被引:5,自引:0,他引:5  
利用RAPD技术,对来自不同地区的18个毛竹居群遗传多样性及居群间的关系进行了研究.从184条10碱基随机引物中筛选到14条能稳定产生多态标记的引物,共扩增出129个位点,主要集中在400~1 400bp之间,其中多态性位点有101个,比率高达78.3%,Shannon多态性指数较高平均为0.377.根据POPGENE32软件分析和聚类分析,计算各居群间的遗传相似性I和遗传距离D,遗传距离的变异范围为0.081~0.503,遗传相似性变异范围为0.605~0.923,表明各居群间的遗传距离和遗传相似性存在着较大的差异.地理上较近的居群多聚在一起,表现出比较明显的地域性,说明各居群的亲缘关系与地理分布有着密切的关系.  相似文献   

8.
为了解马兰遗传多样性,提高配制马兰杂交组合及品种选育的目的性,利用RAPD分子标记对丽水市10个马兰种质遗传多样性进行研究。试验通过优化马兰DNA提取方法,建立马兰RAPD反应体系,筛选出26个RAPD引物,扩增出146个条带,其中多态位点为109个,多态性比率为74.66%。依据RAPD标记数据,建立遗传距离和遗传相似系数矩阵,进行聚类分析,构建了遗传关系树状图。结果表明这10个供试材料之间的遗传距离都比较远,可以作为育种的亲本材料。  相似文献   

9.
撑篙竹遗传变异的RAPD分析   总被引:14,自引:0,他引:14       下载免费PDF全文
采用随机扩增多态DNA(RAPD)方法对6个群体30丛撑篙竹个体进行了遗传变异的研究。28个随机引物共检测到173个位点,其中85个是多态位点,平均每个引物提供6.18个RAPD信息量,扩增出的DNA片段大小一般在200~2000bp范围之间;用POPGENE1.31版软件进行遗传多样性分析:平均Nei’s基因多样性为0.2114,Shannon’s信息指数为0.3277,基因分化系数0.1853,表明群体间有一定的分化;各群体平均遗传距离0.0350,表明群体亲缘关系较近;试用UPGMA方法对不同产地的撑篙竹群体作聚类分析,初步可将6个群体聚为3类。  相似文献   

10.
运用随机扩增多态DNA (RAPD)标记对分布于我国4省6病区63份茶藨生柱锈菌寄主红松和华山松进行遗传多样性分析.用6个随机引物对寄主松针进行PCR扩增,共得到138个DNA位点,其中多态位点117个,多态位点比率为84.78%,RAPD的Shannon指数遗传多样性为0.315 5,RAPD的Nei指数基因分化系数为0.525 5.不同来源寄主的遗传多态性规律顺序:辽宁清原红松>云南洱源华山松>山西沁水华山松>云南巧家华山松>四川广元华山松>云南东川华山松.从RAPD聚类分析树状图可以看出,先将63个松针样品分成2个不同的RAPD组群(红松组群和华山松组群),然后又将不同地理来源的华山松组群按地理区域分成5个亚群,同一采集的华山松亚群中又分成感病组和抗病组.研究表明,种间的遗传多样性是由种的遗传属性所决定的,而地理因素只是影响种内遗传多样性的一个因子.  相似文献   

11.
天然蒙古栎群体遗传多样性的RAPD分析   总被引:24,自引:3,他引:21  
夏铭  周晓峰  赵士洞 《林业科学》2001,37(5):126-133
蒙古栎 (QuercusmongolicaFisch)为壳斗科、栎属植物 ,主要分布区包括中国的华北、东北、内蒙古东部 ,朝鲜半岛 ,俄罗斯远东和蒙古的连续分布区及日本桦太、北海道的间断分布区 (吴晓春 ,1 993)。蒙古栎是我国东北的典型植被类型———红松阔叶林的主要伴生树种之一 ,同时在红松林被干扰破坏后是形成次生阔叶林面积较大的主要树种 ,也是分布区超过北纬 45°的唯一栎属植物。近年来 ,蒙古栎的分布区和群体数量呈扩张趋势 ,其原因除人为干扰外 ,可能涉及气候变化、物种特性、种内遗传多样性、种间互作等等。对蒙古栎群体…  相似文献   

12.
The molecular variation and genetic relationships among five populations of the fall webworm (Hyphantria cunea Drury) in China were assessed using microsatellite technology. Ten microsatellite primers, producing polymorphic bands, were used across 300 samples. The percentage of polymorphic loci (PPB) was 98.36%; the percentage of polymorphic loci in five populations ranged from high to low in the following order: Cangzhou population, Yantai population, Qinhuangdao population, Dandong population, and Shijiazhuang population. The results showed that 34.38% of the total genetic variation of the fall webworm (GST) occurs among populations, while most variation (65.62%) exists within populations. Nei’s genetic distances ranged from 0.1386 to 0.3224. Using the unweighted pair group method with arithmetic mean (UPGMA), Nei’s genetic distances were analyzed by a clustering technique and the dendrogram shows that population differentiation is closely related to the time and geographic origin of the invasion. The major factors impacting genetic diversity of fall webworm populations are longitude, the plain area ratio, annual precipitation, latitude and time of invasion. The formation of genetic structure is correlated with characteristics of the life history and invasion ecology of the species.  相似文献   

13.
七子花种群遗传多样性的RAPD分析   总被引:6,自引:0,他引:6  
按胸径将浙江省天台山天然七子花划分为大树、中树、小树和幼树 4个大小级种群 ,利用RAPD分子标记技术对 4个大小级种群共 4 5株个体的遗传多样性及遗传分化进行了比较分析 ,结果表明 :通过 12种随机引物扩增共检测到 6 4个可重复的位点 ,4个大小级种群的多态位点百分率高低为大树 >中树 >小树 >幼树。Shannon信息指数估计七子花 4个大小级种群的遗传多样性高低为大树 >中树 >小树 >幼树 ,大小级种群内的遗传变异占总变异的 5 4 4 1% ,大小级种群间的遗传变异占总变异的 4 5 5 9% ,表明不同大小级种群内、大小级种群间个体均存在一定的遗传分化 ,但大小级种群内的遗传分化比大小级种群间高。Nei指数估计的七子花不同大小级种群的基因多样性的高低与Shannon指数估计的一致 ,大小级种群内的遗传分化高于大小级种群间 ,大小级种群间的基因分化系数为 0 3939。不同大小级种群间的遗传相似度以大树与中树最高 ,大树与幼树最低。聚类分析显示大树与中树先聚成一组 ,小树与幼树再聚成一组 ,最后 2组聚在一起  相似文献   

14.
Gmelina arborea is a valuable plantation tree species that is native to South and Southeast Asia. In this study, 534 samples representing 19 natural populations in India, China, Thailand and Myanmar were analyzed with 10 polymorphic microsatellite markers. The genetic diversity analysis revealed highly polymorphic loci (Na?=?16.4), a good level of genetic diversity (Ho?=?0.56; He?=?0.83) and the deficiency of heterozygotes in G. arborea populations evidenced by positive fixation index and deviation from Hardy?CWeinberg Equilibrium in all loci and most populations. The Analysis of Molecular Variance attributed 21, 10 and 69% of total genetic diversity to among-region, among-population (within region) and within-population variation. Unweighted Pair Group Method with Arithmetic Mean dendrogram and Principle Coordinate Analysis revealed three separate clusters composed of China, India and Thailand/Myanmar that were consistent with geographical distance and the presence of natural barriers to gene flow. Populations from within India grouped together genetically consistent with geographical locations, with the exception of the Nowgong population (eastern India), that might have originated from the Kasa area (western India) with which it has high genetic similarity. Understanding genetic diversity and structure of G. arborea populations serve as an important reference for tree breeding programs and conservation strategy. Breeding populations of G. arborea should include selections from each of the major geographic regions to maximize genetic diversity and heterosis. Vegetative propagated clones of elite trees can be used for plantation to address the issue of high level of segregation among seed derived plants.  相似文献   

15.
巨桉群体遗传结构分析   总被引:3,自引:0,他引:3  
用20个l0bp随机引物对巨桉11个种源80个个体进行了群体遗传变异的比较分析。共检测到149个位点,其中89个为多态性标记位点,总的多态位点百分率为59.73%。其种源内多态位点百分率(P)、香农信息指数(SI)及遗传分化指数(DC)值均较高,巨桉各种源内遗传变异性丰富;种源间遗传分化指数百分比(PDC)显示,PDC值介于1.52%~10.42%之间,说明巨桉种源间遗传变异较小,即种源群体的变异主要存在于群体内部。8号、10号种源内具有较高的遗传变异,3号和6号种源内的变异水平较低。这些为巨桉种源的选择提供了有利的遗传基础。  相似文献   

16.
Vitellaria paradoxa C.F.Gaertn. is one of the most economically and socially important tree species in the Sudano-Sahelian region. Little is known of the pattern of variation within its natural range. Eight populations covering most of the natural range from Senegal to Uganda were sampled and leaves of 118 individual trees were collected. An analysis of molecular diversity was carried out using random amplified polymorphic DNA (RAPD) markers. Fifteen random primers generated 67 polymorphic and 15 monomorphic RAPD loci ranging from size 1670 bp to 280 bp. Shannon's diversity index varied from Central Africa/Ndele (0.374) to Uganda/Amoya (0.350) but the differences between populations were smaller than the population standard errors. Correspondence analysis of unrooted neighbour-joining trees suggested that genetic distances between populations were correlated with geographic distances. This trend was confirmed by a Mantel test giving a coefficient of correlation between genetic and geographic distances of R = 0.88 (P = 0.0001). Result of AMOVA (analyses of molecular variance) showed that 14.8% (P = 0.002) of the RAPD variation was distributed among populations. Nested analysis of variance indicated that variance between the western and eastern groups of population represented 8.7% (P = 0.001) of the total variation and the variation amongst populations within group was 9.5% (P = 0.001). Eighty two percent of the variation was explained by variation amongst individuals within populations. The origin of genetic structure and level of diversity may be explained by the glacial refugia, the biological traits of Vitellaria paradoxa and by the impact of semi-domestication. Based on these results, sampling options of the natural populations are suggested for in or ex situ conservation. For the development of Vitellaria paradoxa breeding population, the sampling should consist of many individual trees selected within a few populations to capture a large proportion of variation.This revised version was published online in November 2005 with corrections to the Cover Date.  相似文献   

17.
【目的】在我国野生土沉香被大量被采伐,种质资源越来越少,甚至面临消失的情况下,为了利用与保护野生土沉香提供理论依据,采用SRAP分子标记对其种源遗传多样性进行分析。【方法】基于我国11个土沉香种源群体和越南2个土沉香种源群体的SRAP结果,应用POPGEN32软件对遗传多样性参数进行计算。【结果】各群体Nei's基因多样度指数的变化范围为0.1715~0.5394,Shannon多样性指数的变化范围为0.2491~0.4837,多态位点百分比的变化范围为42.03%~76.81%。运用GenAlex 6.4软件对土沉香13个群体进行分子方差分析(Analysis of molecular variance,AMOVA),结果显示有30%的遗传变异来自土沉香群体间,70%的遗传变异来自土沉香群体内。【结论】13个土沉香种源有中度的遗传多样性和遗传分化,野生土沉香种质资源正日渐稀少,应该加强资源的保护与利用。  相似文献   

18.
采用SRAP分子标记技术,对分布于我国西南3个藏族地区山杨9个居群130个个体进行了遗传结构分析。结果表明,筛选出的7对引物组合共检测到多态性条带(AP)99条,多态性条带百分比(PPB)为59.28%。采用POPGENE软件分析,山杨9个居群平均多态位点百分率(PPB)为33.80%,Nei’s基因多样性指数(H)和Shannon’s信息指数(I)分别为0.130 9和0.213 7,较东北地区山杨具有偏低的遗传多样性。遗传分化系数Gst=0.325 5,表明遗传变异主要存在于居群内个体间。地理距离与遗传距离之间具有弱相关关系(r=0.349,P=94.5%),山脉阻隔效应是导致西南藏族地区山杨居群间遗传分化的主要因素。UPGMA聚类表明,甘孜地区4个居群与迪庆地区的维西居群具有较近的亲缘关系,迪庆地区的德钦、香格里拉居群和昌都地区2个居群的遗传相似度较高。基于西南藏族地区山杨遗传结构分析,建议实施就地保护的同时,建立山杨种质资源库,促进不同居群间的基因交流。  相似文献   

19.
以东北地区的5个白桦天然种群为研究材料,在木材纤维形态性状测定的基础上,采用ISSR、RAPD分子标记研究了5个种群的遗传变异以及种群间纤维形态性状与DNA分子标记的相关性.结果表明:白桦天然林成熟材(18~31年生)的木材纤维长度在种群间差异不显著,纤维宽度和长宽比差异显著,帽儿山种群的木材纤维形态性状最好,汪清最差;利用ISSR和RAPD 2种标记检测5个白桦种群的遗传多样性,所得的研究结果基本一致,多态位点比率最高的为辽宁新宾种群,其次是帽儿山和汪清,而塔河和金山屯最低;ISSR标记的AMOVA分析表明白桦种群间的遗传变异占总遗传变异的10.82%;RAPD标记的AMOVA分析表明白桦种群间的遗传变异占总遗传变异的12.94%,研究结果均显示白桦的遗传变异主要发生在种群内部.利用2种标记技术的种群聚类结果基本一致,这一结果与基于木材纤维性状的表型聚类基本一致, 而且种群间遗传距离和地理距离之间存在一定的相关性.  相似文献   

20.
The molecular variation and genetic relationships among five populations of the fall webworm (Hyphantria cunea Drury) in China were assessed using microsatellite technology. Ten microsatellite primers, producing polymorphic bands, were used across 300 samples. The percentage of polymorphic loci (PPB) was 98.36%; the percentage of polymorphic loci in five populations ranged from high to low in the following order: Cangzhou population, Yantai population, Qinhuangdao population, Dandong population, and Shijiaz...  相似文献   

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