猪IGF2、MC4R、JHDM1A及TEF-1多基因标记遗传效应研究

  【目的】在大白猪群体中检测和分析猪生长和背膘厚性状候选基因（IGF2、MC4R、JHDM1A和TEF-1）的多态性，并进行多基因标记效应分析，为分子标记辅助选择在育种中的应用提供理论基础。【方法】采用PCR-RFLP方法对候选基因多态性进行检测，并运用SPSS软件对单基因标记和多基因标记与生长和背膘厚性状之间的关联性进行分析。【结果】在试验群体中检测了IGF2、MC4R、TEF-1和JHDM1A 4个基因的单核苷酸多态位点。单基因标记分析结果显示，IGF2基因与100 kg腰荐结合处背膘厚显著关联（P＜0.05），AA型为优势基因型，分别比AG和GG基因型薄0.541 cm和0.629 cm；MC4R基因与生长和背膘厚性状无显著关联；JHDM1A基因与100 kg腰荐结合处背膘厚呈显著关联（P＜0.05），CC型为优势基因型，分别比GG和GC基因型背膘薄0.520 cm和0.489 cm；TEF-1基因与100 kg腰荐结合处背膘厚趋于显著关联（0.05＜P＜0.1），GG基因型背膘厚分别比AA和AG基因型薄0.973 cm和0.379 cm；与达100 kg体重呈显著关联（P＜0.05），AG为优势基因型，分别比AA和GG基因型缩短了0.445 d和2.258 d。【结论】对4个候选基因的多基因标记效应进行分析发现，多基因标记效应与单基因标记效应一致。IGF2、TEF-1和JHDM1A基因多态位点合并基因型AGCCGG和AACCGG对于100 kg腰荐结合处背膘厚性状为优势基因型组合，可以作为分子标记在育种中应用。     

长白-蓝塘猪资源群第6号染色体的QTL检测

 以国外猪种长白猪和华南地区优良地方猪种蓝塘猪为亲本 ,建立了用于QTL定位研究的F2 资源群。应用 6号染色体上的 7个微卫星遗传标记和USDA MARC 2 .6公、母猪平均遗传连锁图谱 ,采用区间定位方法进行基因组扫描。结果表明 ,在 38～ 4 1cM间发现影响猪胴体A点膘厚的QTL ,达到染色体极显著水平 (P <0 .0 1) ,该QTL与MN0 0 7标记紧密连锁 ,其加性方差解释F2 表型方差的比例为 5 .90 %。 6 0～ 6 5cM间发现影响猪胴体瘦肉率的QTL ,达到染色体极显著水平     

猪12号染色体几个微卫星标记与部分生产性状的关系研究

众多的微卫星位点及其丰富的多态性是微卫星在各领域广泛应用的基础。在定位ＱＴＬ方面 ,现在通过建立猪资源家系 ,人们已把一些与繁殖、生长、胴体和肉质等方面有关的数量性状位点定位在某些微卫星附近。例如 ,3号染色体上微卫星ＳＷ2 4 2 7-ＳＷ2 51区域与猪的日增重、4号染色体上Ｓ0 1 0 1 -Ｓ0 1 0 7区域与背膘、腹脂、7号染色体上Ｓ0 0 64-Ｓ0 0 66区域与胴体组成和初生重有着很大的关联[1] 。 1 2号染色体为最短的中部着丝粒染色体 ,因与猪生产性状紧密相关的生长激素 (ＧＨ)基因位于其上而倍受重视[2 ,3] 。虽然目前对ＧＨ基因研究得…     

猪RTL1基因多态性及其与胴体、肉质性状的关联分析

旨在研究反转录转座子1基因(retrotransposon-like-1,RTL1)潜在的变异与猪胴体和肉质性状的相关性。测序发现在猪RTL1基因编码区1 209 bp处存在G/A突变,利用PCR-Fnu4H I-RFLP方法在9个猪种中进行了基因分型,并且在360头大白猪×梅山猪F2代群体中进行性状关联分析。结果表明,该位点与皮率、内脂率、6-7腰椎间膘厚、胸腰椎间膘厚、背最长肌pH、股二头肌肌肉色值呈显著相关(P0.05),与骨率、肩部膘厚、臀部膘厚、平均背膘厚、背最长肌失水率、背最长肌系水力、背最长肌肌肉色值呈极显著相关(P0.01)。     

猪ARID5B基因多态性及其与脂肪沉积性状的相关性分析

为探究猪ARID5B基因多态性及其与脂肪沉积性状的相关性,在DNA水平上对藏猪、大白猪ARID5B(AT-rich interaction domain 5B)基因5′侧翼区进行了单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)位点筛选;在mRNA水平上对两猪种的肝脏、背脂和背最长肌组织中的ARID5B基因表达量进行了RT-qPCR检测;并对两猪种的背膘厚和背最长肌组织中IMF(Intramuscular fat)含量进行测定。结果表明:在ARID5B基因5’侧翼区,存在T-2 216C和In-2 029Del缺失2个连锁突变位点,藏猪与大白猪呈极显著差异(P0.01);在相同组织不同品种间,ARID5B基因在肝脏、背脂和背最长肌中mRNA相对表达量趋势完全一致,且藏猪ARID5B基因表达量均极显著低于大白猪(P0.01);藏猪背膘厚和IMF含量均极显著高于大白猪(P0.01);经DNA、mRNA水平、背膘厚和IMF含量相关性分析发现,ARID5B基因mRNA相对表达量与背膘厚和IMF含量呈显著负相关(P0.05)。     

PPARγ2基因外显子1多态性对猪胴体性状的影响

利用PCR-SSCP技术,对约克夏、杜洛克、长白猪、金华猪、碧湖猪和嵊县花猪共6个品种258头猪的PPARγ2基因外显子1进行多态性分析,并采用SPSS程序中GLM模型分析该位点与胴体性状的相关性。研究结果发现编码区175 bp处存在A175G单核苷酸多态。国内外猪种的基因型频率间存在较大差异,在国外种猪中,AA基因型频率较高,国内猪种中AG基因型频率较高。相关性分析结果表明,在长白猪群中,PPARγ2基因与肩部背膘厚、腰荐结合部背膘厚均存在极显著相关性(P<0.01),与6/7th肋背膘厚和眼肌面积均存在显著相关性(P<0.05)。在金华猪群内,PPARγ2基因与肩部背膘厚显著相关(P<0.05)。因此推测PPARγ2基因可能是影响猪胴体性状的潜在分子育种标记。     

猪OLR1基因克隆及其与生产性状的关联、表达分析

为鉴定对猪生产性状有重要影响的新分子标记,采用电子克隆技术结合PCR方法获得了猪氧化型低密度脂蛋白受体1(oxidized low-density lipoprotein receptor 1,OLR1)基因编码区序列,在OLR1基因第4内含子246bp处发现了1个新SNP位点A246G,并建立了PCR-Pag1-RFLP基因分型方法,分析了4个不同品种猪群中该等位基因频率,发现国外品种大白、长白猪群G等位基因频率高于A等位基因频率,而国内品种梅山、大梅群体A等位基因频率高于G等位基因频率。在大梅猪群体中的关联分析结果发现,A246G位点与胸腰椎间膘厚、平均背膘、背最长肌含水量、背最长肌肌内脂肪含量、屠宰率、板油质量、6~7腰椎间膘厚、背最长肌大理石纹、股二头肌大理石纹显著或极显著相关。通过RT-PCR分析发现,OLR1在恩施黑猪和大白猪群中心脏表达量最高,其次是背脂,同品种不同组织间表达量差异大,表明OLR1基因是脂肪相关的候选基因。     

猪10号染色体上影响血常规指标的数量性状基因座(QTL)定位

 【目的】检测定位猪10号染色体上影响血常规指标的数量性状位点。【方法】以3个品种(大白猪、长白猪、松辽黑猪)16个公猪家系共计368头试验猪组成资源群体,在猪10号染色体上共选取13个微卫星标记,采用基于线性混合模型方法,对影响与猪白细胞、红细胞和血小板相关的共计18项血常规指标的数量性状基因座(quantitative trait loci,QTL)进行了检测。通过似然比检验,利用置换法确定显著性阈值。【结果】()13个标记在群体中绝大多数的微卫星属于中度多态的遗传标记,所有微卫星标记在3个品种中的平均等位基因数为3.1754,平均杂合度为0.5215,平均多态信息含量为0.5999,平均香浓指数为1.3222。(2)达到了染色体极显著水平的3个QTL(P＜0.01),分别是影响着红细胞压积(HCT)、血红蛋白含量(HGB)和平均红细胞体积(MCV),影响血小板总数(PLT)的QTL也达到染色体显著水平(P＜0.05)。【结论】定位的4个影响猪血常规的QTL集中在10号染色体81—136cM区域,临近的标记分别为SW249、SWR136、S0070和SW1894。     

大约克夏猪群遗传结构及其经济性状生化遗传标记筛选研究Ⅰ.大约克夏猪血浆酶活性与部分经济性状的关系

为了准确描述猪血浆酶活性与经济性的关系，以湖南衡阳和望城种猪场大约克夏猪群为研究对象，采用通用线性模型分析了6种血浆酶活性与11个经济性的相关关系。结果表明：血浆中谷草转氨酶活性与日增重、皮率呈极显著正相关，与屠宰率、背膘厚呈显著正相关，而与瘦肉率呈显著负相关。谷丙转氨酶活性与日增重、瘦肉率呈极显著正相关，与后腿比例呈显著正相关。碱性磷酸酶活性与骨率、淀粉酶活性与屠宰率均呈显著正相关。γ-谷氨酰转肽酶活性与胴体长呈显著负相关。     

ADD1基因PCR-SSCPs标记与猪肌内脂肪含量及背膘厚的关系

采用PCR SSCPs方法在苏太猪脂肪细胞定向分化因子 1(ADD1)基因第 347和 374位点发现单核苷酸多态性(SNP) ,分别为ADD1第 90和 99位氨基酸密码子的第 3位碱基 ,但这两个位点碱基的替换均没有引起氨基酸序列的变化。通过对 10 0头苏太猪肥育猪背最长肌中肌内脂肪含量的相关分析 ,发现杂合子AB肌内脂肪含量最高 ,极显著地高于AA纯合子 (P <0 0 1) ,BB纯合子肌内脂肪含量介于AB和AA之间 ,并有高于AA纯合子的趋势 (P =0 11)。各基因型间背膘厚没有显著差异。提示ADD1基因该位点上的PCR SSCPs可能作为选择肌内脂肪含量 ,而不影响背膘厚的一个辅助选择标记     

IGF2基因多态性检测与生长性状相关性分析

采集395头核心群的种猪耳样,采用PCR-SNaPshot方法检测长白猪和大白猪胰岛素样生长因子2(IGF2)基因内含子3的位点多态性,并分析各基因型与生长性状的相关性.结果表明,长白和大白猪中均存在3种基因型,大白猪3种基因型分布为:AA＞GA＞GG,长白猪3种基因型分布为:GA ＞AA＞GG.大白和长白猪的A等位基...     

母猪妊娠期背膘厚度与体况评分及繁殖性能的关系

利用2 552胎约克夏母猪的历史繁殖数据,分析背膘厚度与体况评分,分别对初产母猪和经产母猪不同妊娠阶段的背膘厚度与繁殖性状进行相关分析。结果表明,体况评分法并不能准确地评判妊娠母猪背膘厚度,更不能反映母猪繁殖性能的高低。初产母猪不同妊娠期的背膘厚度和主要繁殖性状无显著相关性。经产母猪不同妊娠阶段的背膘厚度与繁殖性状显著相关(P<0.05),妊娠期背膘厚度变化量与繁殖性状显著相关(P<0.05)。回归分析表明,为使经产母猪繁殖性能达到最佳,妊娠期间母猪的背膘厚度应控制在10~14 mm,并且保持相对稳定。在妊娠期不同阶段应根据母猪背膘厚度进行精确饲喂,以确保母猪达到最佳背膘厚度,并在整个妊娠期维持相对稳定,这样有利于母猪繁殖性能的提高。     

妊娠母猪背膘和哺乳期采食量对繁殖性能的影响

根据海南俊英云龙种猪场5个生产车间选取的妊娠母猪在产前时的背膘厚度的分析,得出妊娠母猪背膘厚对断奶仔猪数影响差异显著(P0.05),对总采食量和母猪断奶体重影响差异极显著(P0.01)。     

应用多元多项式回归估测猪胴体瘦肉率的研究

应用多元多项式回归分析研究了102头“大长北”三品种杂种猪的六个胴体性状与瘦肉率之间的关系,结果表明,①与猪胴体瘦肉率关系最密切的六项因素依次为:膘厚二次幂、膘厚一次幂、腿肉率一次幂、膘厚三次幂、后腿比一次幂和腿肉率二次幂;②瘦肉率与膘厚和腿肉率呈曲线关系;③各性状间的互作对瘦肉率的影响不可忽视;④各性状的三次幂多数对瘦肉率的作用较小,为了便于生产上的应用,采用逐步回归建立了一组估测胴体瘦肉率的简易多项式回归方程,它们的复桐关系数多在0.83以上,p<0.005,比用线性回归方程估计的决定系数(R~2)提高12％左右。     

Ultrasonic assessment of meat quality traits in pigs

Meat quality indicators were studied in Large White pigs using an ultrasound real-time AQUI-LAVET PRO system. A slide-format passport specifying the fat-deposition and muscle-development topography was provided for each animal selected for a replacement stock. The lean meat yield (57.8) was associated more with a section of longissimus dorsi (r = 0.85) than with a value of backfat thickness (r = ? 0.66). Equations and coefficients were estimated for a “daughter-mother” rectilinear regression to obtain age indicators for reaching a 100-kg weight and some backfat thickness.     

Associations of Two Polymorphic Loci: A HinfⅠLocus of the Porcine Subunit C of Succinate Dehydrogenase Complex (SDHC) Gene and A MspⅠLocus of the Porcine Rod cGMP-Phosphodiesterase γ-Subunit (PDE6G) Gene

A Hinf I locus of the porcine subunit C of succinate dehydrogenase complex (SDHC) gene and a Msp I locus of the porcine rod cGMP-phosphodiesterase γ-subunit (PDE6G) gene had been reported before, but the association analysis between the different genotypes and the traits had not been done. 300 Large White × Meishan F2 pigs were used as experimental materials to performe the PCR-RFLP analysis and association analysis for the two loci, results revealed that the polymorphism of the porcine subunit C of succinate dehydrogenase complex (SDHC) gene was significantly associated with the traits which included the carcass length, the estimated lean meat percentage, the estimated backfat thickness at last rib, the estimated backfat thickness at last 3-4th rib, the fat meat weight, the fat meat percentage, the lean meat weight,the lean meat percentage, the ratio of lean meat to fat meat, the leaf fat weight, the backfat thickness at shoulder, the backfat thickness at thorax-Waist, the backfat thickness at 6-7th thorax and the average daily gain. Seven other traits, the meat color value (Biceps femoris, BF), the meat marbling (Biceps femoris, BF), the water moisture (Longissimus dorsi, LD),the bone weight, the bone percentage, the loin eye width and the loin eye area, were found to be significantly correlated with the polymorphism of the porcine rod cGMP-phosphodiesterase γ-subunit (PDE6G) gene. Based on these results, it is necessary to apply the two genes as candidate genes to marker assistant selection (MAS) in pig breeding.     

Lpin1基因多态性与黄牛经济性状的关联研究

以6个黄牛品种502个个体为材料,利用PCR-SSCP和DNA测序相结合的方法检测脂素1(Lpin1)基因的多态性,并分析该基因多态性与秦川牛经济性状的相关性。结果发现,黄牛Lpin1基因存在3个SNPs:31735A>G、46137A>C和65969G>A,分别位于内含子1、外显子6和内含子15,其中位于外显子6的突变导致脂素蛋白质第82位的组氨酸变为脯氨酸,为错义突变。3个SNP多态位点与秦川牛的体尺和肉质性状的关联分析表明,31735A>G位点GG基因型个体的胸深、胸围、背膘厚显著高于AA和AG基因型个体(P<0.05);46137A>C位点AC和CC基因型个体的背膘厚显著高于AA基因型个体(P<0.05),CC基因型个体的眼肌面积和大理石花纹评分等级显著高于AA基因型个体(P<0.05);65969G>A位点AA基因型个体的胸深、胸围、眼肌面积和背膘厚显著高于BB基因型个体(P<0.05),BB基因型个体的大理石花纹评分等级显著高于AA和AB基因型个体(P<0.05)。可见,Lpin1基因可能是影响秦川牛眼肌面积、大理石评分和背膘厚性状的主效QTL或者是与之紧密连锁,可作为秦川牛品质改良的辅助选择标记。     

用基于Gibbs抽样的贝叶斯方法估计大白猪遗传评估中主选性状的遗传参数

用基于Gibbs抽样的贝叶斯方法估计了大白猪遗传评估中主选性状的遗传参数.结果为:达100 kg体重日龄的窝效应c2为0.182,遗传力为0.346,属于中等遗传力;100 kg体重校正背膘厚的窝效应c2为0.059,遗传力为0.479,属于高遗传力,后备猪达100 kg体重日龄的窝效应大于背膘厚的窝效应;达100 kg体重日龄与100 kg体重校正背膘厚的遗传相关系数为-0.249;大白母猪总产仔数的遗传力较低,为0.119.     

超声波技术在肉牛宰前评定中的应用

为探讨超声波扫描仪在肉牛活体测定中的应用价值,本试验选取30头成年新疆褐牛为研究对象,集中育肥屠宰后,对其中20头牛用超声波测定背膘厚度、眼高、肌间脂肪含量、眼肌面积及体重,建立了牛宰后性状背膘厚度、眼高、肌间脂肪含量、眼肌面积、高档肉质量、后部位肉质量、优质肉质量、全部肉块质量)回归方程,并对预测模型进行验证。结果表明:通过测定宰前背膘厚度、眼高、肌间脂肪含量、眼肌面积及体重指标,建立宰后膘厚度、眼高、肌间脂肪含量、眼肌面积、高档肉质量、后部位肉质量、优质肉质量、全部肉块质量回归方程。经验证分析,所有模型预测结果与实测结果无显著差异p>0.05),说明利用超声波技术用宰前肉质性状来预测宰后肉质性状和产肉性状是可行的。同时这些模型可以作为制定新疆褐牛胴体产量标准的参考。