鸡催乳素受体基因的多态性分析

[目的]研究PRLR基因对鸡就巢和产蛋性状的影响。[方法]设计10对引物,采用PCR-SSCP方法,扩增了旧院黑鸡、固始鸡、山地乌骨鸡以及新扬州鸡PRLR基因部分外显子及邻近内含子序列。[结果]检测到4个多态位点,分别为外显子3处的SNP1（A10862G,位于5’-UTR）、外显子6处的SNP2（A25670G,为同义突变）、内含子8处的SNP3（G30716A）以及外显子10处的SNP4（A31900G）。卡方独立性检验结果发现,4个多态位点不同基因型在4个群体间的分布差异极显著（P〈0.01）。[结论]PRLR基因可能是影响鸡就巢和产蛋性状的一个主效基因。     

猪催乳素受体基因3'-UTR多态性及其与产仔性能的关联分析

通过研究PRLR基因多态性与母猪产仔性能的关系,为该基因在标记辅助选择中的应用提供依据.采用PCR-SSCP技术检测了大白猪、长白猪、马身猪、山西黑猪和山西白猪5个品种(系)共计323个个体PRLR基因3'-UTR的多态性,并采用单变量动物模型,分析了多态位点对母猪产仔性能的影响.结果表明,PRLR基因3'-UTR存在多态性,在所研究的群体中检测到A、B两个等位基因和AA、AB、BB三种基因型.在马身猪和山西白猪中,A等位基因占优势,频率分别为0.97和0.88;而在大白猪、长白猪和山西黑猪中,A、B两个等位基因的频率基本相似,分布在0.47～0.53之间.PRLR基因3'-UTR多态位点对母猪产仔性能无显著影响(P>0.05),不同基因型母猪的头胎产仔数和产活仔数均没有显著差异,但均表现出AB>AA>BB的趋势.     

鸭催乳素基因外显子4单核苷酸多态性与就巢性状的相关分析

研究采用PCR-SSCP技术研究番鸭不同就巢群体(就巢1月群、就巢2月群、就巢3月群)、番鸭非就巢群和白改鸭5个群体250个个体PRL基因第4外显子多态性与就巢性状之间的相关性.结果表明,在外显子4编码区内发现2个SNP位点,分别位于该基因的3 777 bp (T/C)和3 785 bp(A/C)处.基因型与就巢性状指标相关分析的结果表明,番鸭非就巢群体与各就巢群体间差异极显著(P<0.01),同时番鸭与白改鸭差异显著(P<0.05),推测PRL基因与就巢性有一定的相关.     

猪催乳素受体基因3′-UTR多态性及其与产仔性能的关联分析

通过研究PRLR基因多态性与母猪产仔性能的关系,为该基因在标记辅助选择中的应用提供依据。采用PCR-SSCP技术检测了大白猪、长白猪、马身猪、山西黑猪和山西白猪5个品种(系)共计323个个体PRLR基因3′-UTR的多态性.并采用单变量动物模型,分析了多态位点对母猪产仔性能的影响。结果表明,PRLR基因3′- UTR存在多态性,在所研究的群体中检测到A、B两个等位基因和AA、AB、BB三种基因型。在马身猪和山西白猪中,A等位基因占优势,频率分别为0.97和0.88;而在大白猪、长白猪和山西黑猪中,A、B两个等位基因的频率基本相似,分布在0.47～0.53之间。PRLR基因3′-UTR多态位点对母猪产仔性能无显著影响(P>0.05),不同基因型母猪的头胎产仔数和产活仔数均没有显著差异,但均表现出AB>AA>BB的趋势。     

ESR基因与文昌鸡产蛋性状的关联性研究

 以海南文昌鸡为研究素材,运用PCR-SSCP和DNA测序技术检测了ESR基因多态,运用SPSS软件分析ESR基因多态对产蛋性状的关系。结果表明：①ESR基因出现了两个多态位点,并发现了在第580位AATA 4个碱基缺失,②ESR基因多态与产蛋性状中的300日龄产蛋数相关显著（P<0.05）,与平均连产天数(ADCE)相关极显著（P<0.01）,与400日龄产蛋数、双黄蛋数相关不显著（P>0.05）。ESR基因对文昌鸡产蛋性状有作用,但是仅仅关联性分析的结果是不能肯定ESR基因是影响鸡产蛋性状的主效基因或与主效基因紧密连锁的标记基因。     

NCOA1基因多态性与邵伯鸡母系产蛋性状的相关性分析

 以邵伯鸡核心群母系母鸡为试验材料,利用PCR SSCP技术检测核受体辅激活蛋白1（NCOA1）基因的SNPs,并分析基因多态性与开产日龄（AFE）、开产蛋重(WFE)、连产天数(CL)及300日龄产蛋数(EN)之间的关联性。结果显示：在NCOA1基因的第3和第12外显子上分别发现1个SNPs位点,其中第3外显子10155007处发生了T→A突变,检测到 AA,AB,BB 3种基因型;第12外显子108273423处发生了C→T突变,检测到CC,CD,DD 3种基因型。不同基因型与各性状间有显著相关,其中AA基因型个体的连产天数比BB型个体多0.59d,开产蛋重重0.6g,300日龄产蛋量高7.76%,且差异显著（P<0.05）;CC基因型个体比DD型个体的连产天数多0.51d,开产蛋重重1.04g,300日龄产蛋量高9.07%,且差异显著（P<0.05）;组合基因型发现,基因型AACC个体的开产日龄、连产天数和300日龄产蛋量均高于BBDD基因型组合。因而,NCOA1基因可作为鸡产性状的标记基因用于分子标记辅助选择中。     

鸭催乳素基因外显子4单核苷酸多态性与就巢性状的相关分析

研究采用PCR—SSCP技术研究番鸭不时就巢群体（就巢1月群、就巢2月群、就巢3月群）、番鸭非就巢群和白改鸭5个群体250个个体PRL三基因第4外显子多态性与就巢性状之间的相关性。结果表明,在外显子4编码区内发现2个SNP位点,分别位于该基因的3777 bp（T/C）和3785 bp（A／G）处。基因型与就巢性状指标相关分析的结果表明,番鸭非就巢群体与各就巢群体间差异极显著（P〈0．01）,同时番鸭与白改鸭差异显著（P〈0.05）,推测PRL基因与就巢性有一定的相关。     

新扬州鸡IGF-1基因5′调控区Hinf Ⅰ位点多态性与产蛋性状关系的研究

采用PCR-RFLP技术,对250只新扬州鸡的胰岛素样生长因子-1基因(IGF-1)的5′端调控区进行遗传多态性研究,发现该调控区的PCR扩增产物经酶切后出现CC、CD和DD 3种基因型。经χ~2检验,新扬州鸡在Hinf I位点上处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。分析基因型与产蛋性状的关系时发现,CC型50周产蛋数显著高于CD型(P<0.05),且3种基因型在30、40、50、60周产蛋数上呈CC>DD>CD的趋势。     

石岐杂鸡胰岛素样生长因子-Ⅰ基因型与产蛋性状相关性研究

采用PCR-RFLP技术对石岐杂黄鸡351个样本的胰岛素样生长因子-Ⅰ(IGF-Ⅰ)基因的5’端调控区进行遗传多态性研究,发现经PstⅠ酶切后出现3种基因型:AA、AB和BB,基因型分布符合哈代-温伯格定律。3种基因型与开产日龄(AFL)、50周龄产蛋量(EP50w)相关性分析结果显示,不同基因型开产日龄差异不显著;50周龄产蛋量,AA型最低,AA型与AB型有显著差异,AA型与BB型差异极显著,BB型与AB型差异不显著。试验结果表明等位基因B可能同IGF-Ⅰ基因表达调控有关,或同产蛋性状基因相连锁。试验为以IGF-Ⅰ基因型为分子标记进行辅助育种研究提供了基础。     

核受体辅激活蛋白1基因(NCOA1)作为鸡产蛋性状候选基因的研究

以清远麻鸡、白耳鸡、鹿苑鸡、藏鸡和S2系为试验素材,利用PCR-SSCP技术对核受体辅激活蛋白1(NCAO1)基因编码区进行SNP检测和基因型的判别,探讨NCAO1基因作为影响鸡产蛋性状候选基因的可能性。结果显示:在NCOA1基因的第3和第12外显子上分别发现一个SNP位点,其中第3外显子10155007处发生了T→A突变,检测到AA、AB、BB3种基因型;第12外显子108273423处发生了C→T突变,检测到CC、CD、DD3种基因型。χ2检验表明突变产生的基因型和基因频率在各品种(系)间差异极显著(P<0.01),A、C基因在蛋用型的地方品种白耳鸡中频率较高,B、D基因在肉用型的地方品种清远麻鸡、藏鸡和肉用型培育品系S2系鸡中频率较高。不同基因型与S2系鸡的开产日龄(AFE)、开产蛋重(WFE)、连产天数(CL)及300日龄产蛋数(EN)之间的最小二乘均数分析显示:AA基因型个体的连产天数比BB型个体多0.59 d,开产蛋重重0.6 g,300日龄产蛋量高7.76%,且差异显著(P<0.05);CC基因型个体比DD型个体的连产天数多0.51 d,开产蛋重重1.04 g,300日龄产蛋量高9.07%,且差异显著(P<0.05);组合基因型发现,基因型AACC个体的开产日龄、连产天数和300日龄产蛋量均高于BB、DD基因型组合。因而,初步推断NCOA1基因是影响鸡产蛋性状的主效基因或与主效基因连锁。     

宁都黄鸡 GH 基因 SNP 与鸡冠性状的关联分析

【目的】研究宁都黄鸡 GH 基因（Growth hormone,GH）5''- 侧翼和内含子 1 区域单核苷酸多态性（Single nucleotide polymorphism,SNP）与鸡冠性状的关联性,以期筛选地方鸡种鸡冠性状的早期选育分子标记。【方法】以 499 只宁都黄鸡公鸡为研究对象,测定 7 个不同周龄的冠高、冠长、冠厚、肉垂长、肉垂厚以及冠齿数指标,利用 SAS（Statistical analysis system）分析 GH 基因部分序列 SNP 与鸡冠性状的关联性。【结果】 有 13 个 SNP 与 冠 高 性 状 指 标 显 著 关 联（P < 0.05）, 即 C1272225T、G1272611A、C1271211T、C1270902T、A1270769G、G1270640C、T1270578C、G1270503C、T1270451C、C1270032T,其中 A1270769G 与 7 个周龄冠高指标均显著关联;G1272611A 与 5 个周龄冠高指标显著关联;有 10 个 SNP 与冠长性状显著关联（P < 0.05）,即 C1272225T、G1272611A、C1271211T、C1270902T、A1270769G、G1270640C、T1270578C、G1270503C、T1270451C、C1270032T,其中 C1271211T 与 6 个周龄冠长指标显著关联,G1272611A 与 5 个周龄冠长指标显著关联。G1272611A 位点与 5 个连续周龄冠长或冠高性状指标均显著关联,该位点在该群体中对应 GG 和 GA 2 种基因型,GG 基因型个体的 5 个连续周龄冠高或冠长均显著高于 GA 基因型个体。【结论】G1272611A 位点可作为宁都黄鸡冠高和冠长性状选育重要候选分子标记。     

淮南麻黄鸡CRBP2基因第3外显子PCR-SSCP多态性及其与蛋品质的相关分析

利用PCR-SSCP和DNA测序技术对淮南麻黄鸡CRBP2基因第3外显子的多态性进行了检测,并分析其与蛋品质的相关性。结果表明:在淮南麻黄鸡样本群中CRBP2基因第3外显子存在C/T的突变位点,共检测到3种基因型(CC、CT和TT),C和T等位基因的频率分别为0.45和0.55,多态信息含量和杂合度分别为0.37和0.47,表明该位点处于中度多态。χ2适合性检验表明淮南麻黄鸡样本群在该位点偏离Hardy-Weinberg平衡状态(P0.01)。淮南麻黄鸡CRBP2基因第3外显子各基因型间开产日龄、蛋形指数、蛋壳厚度、蛋壳强度、蛋黄色泽和蛋黄比率差异不显著(P0.05),CC基因型的开产蛋重和30周龄蛋重分别比TT基因型高1.66%和2.60%(P0.05),TT基因型的哈氏单位显著高于CC和CT基因型(P0.05)。     

太湖鸡PRL、PRLR和FSHβ基因多态与前期产蛋性状关系研究

采用PCR-SSCP法对太湖鸡催乳素(PRL)、催乳素受体(PRLR)和促卵泡激素β亚基(FSHβ)基因进行多态性检测,并分析其与开产50%后20周产蛋性状的关系。结果表明:PRL和FSHβpro2的基因型频率都是AA型最高,BB型最低,等位基因频率也是A高于B,FSHβ基因exon3位点没有多态;PRLR只有两种基因型,外显子3是AA型频率高于BB型,外显子6是CC型频率高于DD型,且等位基因A和C的频率分别高于等位基因B和D的频率。太湖鸡PRL、PRLR和FSHβ基因开产50%后20周产蛋性状的不同基因型间差异均不显著(P>0.05),但是PRLR基因外显子3的开产50%后9~11周蛋重平均数基因型间差异接近显著(P=0.08)。基因间交互作用分析发现,催乳素受体基因外显子3和外显子6有极显著的交互作用(P<0.01),产蛋量较高的合并基因型AADD可以作为太湖鸡选育的参考。     

CAPN1基因的多态性与鸡肉质性状的关系研究

采用PCR-SSCP方法对寿光鸡CAPN1基因的外显子14、外显子20及其侧翼区序列进行多态性检测,并分析它们的多态性与部分肉质性状的关系.CE14引物扩增的座位在群体发现3个单核苷酸多态性(SNPs)位点:g.13715409 A＞G、g.13715387 T＞C位于外显子14中,g.13715467 C＞T位于内含子13中;共检测到AA、AB、AC、BB、BC及CC 6种不同基因型,基因型频率分别为0.238、0.273、0.197、0.095、0.102、0.095,等位基因A、B、C的频率分别为0.473、0.282、0.245.CE20引物扩增的座位在群体发现6个SNPs位点:g.13713224 C＞A位于外显子20中,g.13713320 A＞T、g.13713289 G＞A、g.13713277 T＞C位于内含子19中,g.13713185T＞C、g.13713184 G＞A位于内含子20中;共检测到AA、AB、AC、BC、AD、BB、CD及DD 8种不同基因型,基因型频率分别为0.122、0.354、0.197、0.143、0.061、0.034、0.048、0.041,等位基因A、B、C、D的频率分别为0.429、0.282、0.194、0.095.最小二乘统计分析结果表明,CE14座位对胸肌pHu、腿肌pHu、肌内脂肪含量、腿肌剪切力及胸肌蒸煮损失存在显著性影响(P＜0.05),CE20座位对胸肌pHu及胸肌蒸煮损失存在显著性影响(P＜0.05).     

脂联素基因c.249 C>T突变对京海黄鸡部分主要经济性状的影响

以京海黄鸡为试验材料,采用PCR-SSCP技术,探讨脂联素基因第一外显子和部分第一内含子碱基突变对屠宰和母鸡产蛋性状的遗传效应。结果表明,脂联素基因c.249位C>T突变的3种基因型(AA、AB和BB)对京海黄鸡的活体质量、半净膛率、胸肌质量、腿肌质量、胸肌率和腿肌率差异均不显著(P>0.05)。BB型个体的300日龄产蛋数和66周龄产蛋数显著高于AB型个体(P<0.05)。BB型个体的腹脂质量和腹脂率显著高于AB和AA型个体(P<0.05)。Adipo基因座对京海黄鸡开产日龄,300日龄产蛋数,300日龄蛋质量和66周龄产蛋数的主效应指数(MEI)均小于1.21,而其对公母鸡的腹脂质量主效应指数(MEI)分别为8.68和7.40。说明该基因可能是调控脂肪沉积的主效基因或与主效基因连锁。     

Association of Bone Morphogenetic Protein-2 Gene with Skeletal Traits in Chickens

Bone morphogenetic protein-2 （BMP-2） plays a key role in bone formation and maintenance. BMP-2 can stimulate longitudinal bone growth by increasing the growth plate chondrocyte proliferation, hypertrophy, and cartilage matrix synthesis. The current study was designed to investigate the associations of the BMP-2 gene polymorphism with chicken skeletal traits. Northeast Agricultural University F2 resource population was used in this study. Body weight and body composition traits were measured in F2 population. Polymorphism between parental lines was detected by DNA sequencing, and PCR-fragment length polymorphism method was then developed to screen the population. The results showed that the BMP-2 gene polymorphism was associated with skeletal traits in F2 population. This research suggests that BMP-2 gene may be a candidate locus or linked to a major gene that affects skeletal traits in chickens.     

鸡FABP基因多态性研究

采用PCR-RFLP方法对金水乌鸡、武定鸡、湖北红鸡、青脚麻鸡、矮黄鸡和隐性白羽肉鸡6个品种共计360只鸡的FABP基因进行多态性分析,选用HhaⅠ、HaeⅢ、HinfⅠ、BamHⅠ、EcoRⅠ和PstⅠ6种限制性内切酶对PCR产物进行单酶切,结果发现HhaⅠ-RFLP具有多态性,有AA和AB两种基因型,该基因座频率分布经独立性χ2检验,结果表明,蛋用品种湖北红鸡与其他品种间存在显著或极显著差异,群体中B基因频率占明显优势;矮黄鸡与隐性白羽肉鸡2个肉用品种鸡与其他品种间也存在显著或极显著差异,这2个品种的优势基因为A基因。     

甘南牦牛GDF-10基因多态与生产性状的相关性分析

【目的】GDF-10基因又称作骨形成蛋白3b,最早通过骨形成蛋白寡聚核苷酸序列的PCR扩增所得,与骨骼的形成和发育有关。很多研究已经表明GDF-10基因在骨骼的形态变化过程中发挥着重要作用。本实验通过研究甘南牦牛GDF-10基因多态性与生产性状间的相关性,证明GDF-10基因与骨骼发育的相关性,发现与牦牛生产性状相关的分子标记,为加快牦牛选育进程,提高牦牛生产性能提供参考。【方法】以298头甘南牦牛血样为材料,随机选取其中的30个DNA样混合组成DNA池,设计9对引物对GDF-10基因外显子1,2和3进行扩增,扩增产物经琼脂糖凝胶回收后测序。运用BLAST 和Chromas软件通过测序峰图找出突变位点,然后采用高分辨率熔解曲线分析技术（high resolution melting curve,HRM）进行基因型分型和统计等位基因频率。采用SHEsis和PHASE软件对GDF-10基因多态位点进行配对连锁不平衡和单倍型分析,采用SPSS17.0进行基因多态位点与生产性状关联性分析。【结果】检测到甘南牦牛GDF-10基因外显子3的 3个多态位点12116（G/A）、12152（C/T）、和13041（T/C）。群体遗传学分析显示,3个多态位点均表现为低度多态（PIC＜0.25）;?2检验表明牦牛群体在13041（T/C）位点未达到Hardy-Weinberg平衡（P＜0.05）,其它两个多态位点处于Hardy-Weinberg平衡状态（P＞0.05）;多态位点配对连锁不平衡分析发现,三个突变位点之间存在弱连锁平衡;关联分析表明,甘南牦牛GDF-10基因不同突变位点的基因型与体斜长、体高、胸围、体重差异显著或极显著（P＜0.05或P＜0.001）,与管围差异不显著（P＞0.05）;单倍型分析后在群体中发现了7种单倍型组合,其中ATC和ATT组合与牦牛的体尺性状和体重显著相关。【结论】甘南牦牛GDF-10基因3个多态位点和两个单倍型组合与牦牛的体高、体长、体重和胸围显著相关,可以尝试作为牦牛生产性状的候选分子标记,为牦牛遗传资源的保护、开发与新品种的选育提供科学依据。     

仙人掌提取物对广西麻鸡产蛋性能的影响

为研究仙人掌提取物对广西麻鸡产蛋性能的影响,选取38周龄的广西麻鸡1 200只为试验动物进行为期7周的饲养试验.试验鸡群随机分为3组,每组两个重复.对照A组饲喂基础饲粮,试验B和C组分别在基础饲粮上添加仙人掌提取物300和500 mg· kg-1,结果表明,B和C组的产蛋率显著高于A组（P＜0.05）、不合格蛋数极显著低于A组（P＜0.01）.说明仙人掌提取物能显著提高广西麻鸡的产蛋性能.