首页 | 本学科首页   官方微博 | 高级检索  
相似文献
 共查询到20条相似文献,搜索用时 46 毫秒
1.
为了提高向日葵遗传图谱的密度和实用性,以125个来源于PAC-2和RHA-266杂交的F8代重组自交系(RILs)群体为材料,利用简单序列重复(Simple sequence repeat,SSR)标记,采用MAPMARKER软件对向日葵遗传图谱进行标注,并从300对SSR引物中筛选出51对多态性引物对群体进行标记。结果表明:①51对多态性引物中有19对引物无多态性或条带不清晰,32对引物表现多态性;②共检测到35个多态性位点,分布在图谱的15条连锁群上。③标记后的图谱总长度为2914.5 cM,比原来的图谱增长7.5 cM。④标记间平均距离由9.0 cM缩短为8.1 cM。  相似文献   

2.
绿豆高密度分子遗传图谱的构建   总被引:1,自引:0,他引:1  
【目的】在前期研究的基础上,进一步利用绿豆基因组SSR、EST-SSR、STS和普通菜豆基因组SSR等标记构建绿豆遗传连锁图谱,为绿豆重要性状相关基因的定位、克隆及分子标记辅助选育新品种等研究搭建技术平台。【方法】利用澳大利亚引进的Berken(高感豆象绿豆栽培种)× ACC41(高抗豆象绿豆野生种)及其重组自交系(recombinant inbreed line,RIL)群体,对6 686对引物进行PCR扩增及多态性筛选,包括6 100对绿豆基因组SSR、149对EST-SSR、13对STS和424对普通菜豆基因组SSR引物,将亲本间多态性引物,进一步分析重组自交系群体。结合前期研究的分子标记数据,利用Mapmarker/Exp 3.0软件构建遗传图谱,并设置LOD≥3.0,最大图距50.00 cM。用Joinmap 4.0软件进行图谱整合。【结果】用2个亲本共筛选了6 686对SSR引物,共有3 691对引物有稳定的扩增产物,得到有多态的引物有588对。其中,通过磁珠富集法开发的绿豆SSR引物6 100对,有效扩增3 459对,有效扩增率56.7%,得到多态性引物559对;通过转录组测序开发的绿豆MGCP引物149对,有效扩增126对,有效扩增率84.6%,得到多态性引物21对;通过磁珠富集法开发的菜豆SSR引物424对,有效扩增97对,有效扩增率22.9%,得到多态性引物6对;绿豆STS引物13对,有效扩增9对,有效扩增率69.2%,得到多态性引物2对。表明不同来源和种类的SSR引物在RIL群体亲本中的有效扩增率有明显差别,绿豆EST-SSR引物(84.6%)最高,绿豆STS引物(69.2%)和SSR引物(55.7%)次之,菜豆SSR引物(22.9%)最低。获得一张含有585个标记(499个SSR标记、74个RFLP标记、9个STS标记和3个RAPD标记)的绿豆遗传图谱,图谱总长732.9 cM,包括11个连锁群,每个标记间的平均距离为1.25 cM,平均长度为66.63 cM。每个连锁群长度为45.2—112.8 cM,每条染色体上面的标记数为35—92个,平均53.18个。标记位点数最多的连锁群LG1含92个标记,长度为112.8 cM;标记位点数最少的连锁群LG11仅含有35个标记,长度为48.7 cM。对图谱的585个标记位点进行χ2测验,在P<0.05和P<0.01条件下,分别有79个和151个标记表现为偏分离,占总标记位点数的39.3%。【结论】构建了一张目前国内外发表的标记数最多、密度最高的绿豆遗传连锁图谱。  相似文献   

3.
以自育的高抗玉米粗缩病自交系QR-001为母本、高感自交系QS-001为父本,配制了包含281个单株的F2分离群体为作图群体。选用在玉米基因组中均匀分布的1 028对SSR引物在双亲间进行多态性引物的筛选,共检测到110个可以鉴别F2群体各单株标记基因型的SSR多态性标记。借助QTL IciMapping Version 3.3软件构建了较好覆盖玉米10条染色体的分子标记连锁图谱,图谱总长度为1 343.2 cM,标记间平均距离为10.3 cM。其中1个分子标记(bnlg161)不与连锁群连锁。所建连锁群中有26.6%的SSR分子标记发生偏分离。该图谱的构建为玉米抗粗缩病QTL定位、分子标记辅助选择和分子设计抗病育种等研究奠定了基础。  相似文献   

4.
[目的]提高向日葵遗传图谱的密度和实用性。[方法]以123个来源于PAC-2和RHA-266杂交的F8代重组自交系(RILs)群体为材料,利用简单序列重复(Simple sequence repeat,SSR)标记,采用MAPMARKER软件对向日葵遗传图谱进行标注。从300对SSR引物中筛选出51对有多态性的引物对(RILs)群体进行扫描。[结果]有19对引物无多态性或条带不清晰,32对引物表现多态性;共检测到35个多态性位点,分布在图谱的15条连锁群上。标记后的图谱总长度为2914.5cM,比原来的图谱增长7.5cM。标记间平均距离由9.0cM缩短为8.1cM。[结论]为进一步的向日葵遗传图谱整合和分子标记辅助选择提供参考。  相似文献   

5.
【目的】李(Prunus salicina L.)是我国东北地区极具经济开发前景的树种,具有重要的社会、经 济价值。通过分子标记技术对李进行遗传连锁图谱构建,为李新品种选育提供理论基础。【方法】以吉林 6 号 和龙园秋李为作图亲本,利用 SSR 引物对 F1 子代进行真实性鉴定,经多态性筛选,选出 14 条 ISSR 引物和 16 对 SRAP 引物用于遗传连锁图谱的构建,应用 Join Map 4.0 软件,结合“双假测交”理论构建李遗传连锁图谱。 【结果】试验获得 72 个真实性 F1 子代,ISSR 引物和 SRAP 引物在 F1 群体产生 5 种分离类型、120 个标记位点, 经软件分析获得 1 张拥有 16 个连锁群的遗传连锁图谱,该图谱总长度为 528.5 cM,包含 38 个分子标记位点, 连锁群平均长度为 13.9 cM,最长的连锁群为 71.1 cM、最短的连锁群为 9.6 cM,多态性标记间最大遗传距离为 52.8 cM、最小遗传距离为 1.4 cM。【结论】研究获得的李遗传连锁图谱丰富了寒地李的遗传研究基础,有助于 李 QTL 定位、分子标记辅助育种和基因定位研究。  相似文献   

6.
小麦SSR连锁图谱的构建及多态性研究   总被引:1,自引:0,他引:1  
为构建小麦遗传图谱并对小麦主要蛋白品质性状进行QTL定位,以普通小麦99G44×京771的178个重组自交系RIL(F2:8)为作图群体,利用721对SSR引物筛选出RIL群体双亲表现多态性的引物180对,多态性频率为24.9%。利用这180对引物对RIL群体进行分析,共检测到98个多态性标记位点,利用Mapmaker 3.0 Mapdraw v2.1软件将其中的82个SSR位点绘在小麦21条染色体上。该图谱覆盖小麦基因组全长1532.38cM,标记间的平均遗传距离为19.15 cM。  相似文献   

7.
玉米重组自交系群体遗传图谱的构建及标记   总被引:2,自引:0,他引:2  
以黄早四和Mo 17为亲本,组建了含239份重组自交系的F9代分离群体.共选取了370对SSR引物用于亲本多态性筛选,结果有126对引物能扩增出清晰的多态性条带.用这些有多态性的引物进一步作群体分析,除有23对引物扩增效果较差外,其余引物在多态性、重复性方面均表现较好.最后,用该重组自交系群体构建了玉米分子标记遗传连锁图谱,该图谱拟合了103个分布于10个连锁群的微卫星标记位点,覆盖玉米整个基因组1 455.4 cM,标记间平均图距14.1 cM.  相似文献   

8.
利用SSR分子标记构建甜瓜遗传图谱   总被引:2,自引:0,他引:2  
以中国甜瓜地方品种自交系4G21与3A823杂交产生的114个F2单株为作图群体,采用SSR法构建了一张包含14个连锁群、196个标记位点的甜瓜遗传连锁图谱,新增加48个SSR标记.构建的遗传图谱覆盖基因组总长度806 cM,平均间距7.54 cM,最小间距1 cM,最大间距29 cM.将48个SSR标记定位于甜瓜遗传图谱,可作为锚定引物与不同群体构建的甜瓜遗传图谱整合.  相似文献   

9.
小麦T型细胞质雄性不育恢复基因Rf6的ISSR标记分析   总被引:13,自引:0,他引:13  
 以小麦T型恢复系 2 114和不育系ND4 4A配制杂交组合 ,并以 14 7株个体组成的F2 分离群体作为恢复基因的标记群体。用 4 3个ISSR引物对两个亲本进行了扩增 ,发现 18个引物能在两者间产生明显的多态性 ,其中引物UBC 80 8、UBC 84 8在 2个亲本间以及可育池和不育池间都能产生一致、稳定的多态性。用这 2个引物在F2群体中进行扩增。经连锁分析 ,证明这 2个标记与小麦T型细胞质雄性不育恢复基因Rf6连锁 ,遗传距离分别为7.9cM和 4 .9cM。用 181对SSR引物对两个亲本进行扫描 ,其中有 34.3%SSR引物能在亲本间扩增出多态性 ,但没找到与Rf6连锁的SSR标记。对ISSR、SSR等方法在小麦中的多态性比例进行了比较 ,发现ISSR具有更高的多态性 ,特别是在外源基因的检测中能提供更丰富的遗传信息。  相似文献   

10.
以不结球白菜品种暑绿的112个双单倍体(double haploid,DH)株系构成的群体作为作图群体,利用SRAP、SSR、RAPD和ISSR 4种分子标记来构建不结球白菜分子遗传连锁图谱.通过Mapmaker 3.0/EXP软件分析,得到1张不结球白菜分子遗传图谱,图谱总长度1 116.9 cM,共包括14个连锁群,186个多态性分子标记,其中包括114个SRAP、33个SSR、24个RAPD和15个ISSR标记,其中偏分离标记44个,占23.7%.每条连锁群上的标记数在4~27个之间, 连锁群的长度在30.3~165.8 cM的范围内,平均图距在3.4~11.1 cM之间,总平均距离6.0 cM.  相似文献   

11.
黄精是百合科黄精属的多年生草本植物,是我国传统的药食同源的中药材之一,具有补气养阴,健脾,润肺,益肾的功效,用于脾胃气虚,体倦乏力等症。黄精属内植物的形态上相似,种间鉴别较为困难,容易造成混乱现象,黄精遗传多样性的研究不仅可以鉴别黄精资源,而且是种质资源的创新及品种筛选改良的基础。近年来人们采用了多种方法来揭示黄精资源的遗传多样性,本文对黄精的形态学标记、细胞学标记、生物化学标记、分子标记的遗传多样性研究进展,进行分析和展望,为黄精种质资源的保护和利用提供理论依据。  相似文献   

12.
我国红花分子及生化标记研究进展   总被引:1,自引:0,他引:1  
红花是传统药用植物,同时兼具油料及工业用途,具有很大的开发应用潜力.随着分子生物技术的发展,国内外学者利用生化标记及分子标记技术对红花进行了深入研究,并取得了很大的进展.综述了我国生化标记及分子标记技术在红花研究中的应用,为更深入地开展红花研究奠定理论基础.  相似文献   

13.
遗传标记的发展和分子标记的检测技术   总被引:13,自引:0,他引:13  
概述了遗传标记的发展 ,比较了各种遗传标记的特点 ,并重点介绍了近年来发展起来的分子标记及其检测技术。  相似文献   

14.
分子标记在植物遗传育种中的应用原理及现状   总被引:14,自引:0,他引:14  
分子标记是继形态标记、细胞标记和生化标记之后发展起来的一种新的较为理想的遗传标记 ,已被广泛地应用于生命科学研究的各个领域。在植物遗传育种中 ,分子标记主要用于基因组图谱构建、基因定位、辅助标记选择、种质资源评价、基因克隆、杂种优势预测、杂交育种及跟踪育种过程等方面。文章主要介绍了分子标记在植物遗传育种中的应用原理及分析方法 ,并对其应用前景进行了展望。  相似文献   

15.
植物异源单体附加系是利用外源基因进行品种改良和基因组研究的重要材料。综合阐明了形态标记、细胞学标记、生化标记、分子标记和原位杂交技术在鉴定植物异源单体附加系中的作用,并对各种技术的优缺点进行了综合比较。  相似文献   

16.
利用1 286对SSR标记和66对SFP标记对水稻转绿型新叶黄化突变体ygr和正常绿叶水稻品种日本晴(NBP)的基因组进行多态性研究。结果表明:1 236对SSR标记和63对SFP标记有扩增产物,扩增效率为96.08%;亲本间共筛选到248对SSR多态标记和12对SFP多态标记,平均每条染色体有22对,多态检出率为19.23%;多态标记覆盖水稻基因组达1 626.2 c M,相邻多态标记间平均遗传距离为6.25 c M。不同类型标记间比较发现,SSR标记的多态检出率比SFP标记高1.1个百分点,两者相差不大。  相似文献   

17.
【目的】以玉米制种田父本为研究对象,建立真实性鉴定试剂盒。【方法】采用优化的SSR分子标记技术,对制种田父本进行实证分析。【结果】利用SSR标记技术筛选出玉米的特异性引物,结合单籽粒DNA快速提取方法,建立了种子鉴定试剂盒。【结论】应用此试剂盒可快速、有效地鉴定父本的种子纯度和真实性,为田间间苗、定苗提供依据;为制种田父本去除杂株提供技术支撑。  相似文献   

18.
生化标记和分子标记在玉米轮回选择中的应用   总被引:2,自引:0,他引:2  
生化标记及分子标记在玉米轮回选择中的应用,使育种家对表现型的选择逐步过渡到对主基因和单个数量性状基因(quantitativetraitloci即QTL)的操作方面,可作为传统育种方法的辅助手段.  相似文献   

19.
小麦抗白粉病基因Pm6的RAPD标记和SCAR标记   总被引:10,自引:2,他引:8  
用 1 8 1条 1 0碱基随机引物扩增感病亲本豫麦 1 3号和含Pm6基因的抗病亲本Tim galen ,有 37条引物在Timgalen中检测到多态性片断 ,经多次重复和F2 验证 ,引物S1 38仍能在Timgalen中扩增出稳定的多态性片断 ,对该多态性片断进行回收、克隆和测序 ,根据其序列合成 1对特异引物 ,成功地将RAPD标记转化成稳定的SCAR标记 ,并用此引物对豫麦 1 3号和Timgalen的杂交F2 单株检测 ,计算出该标记与抗病基因之间的遗传距离为 2 7.1cM。并对含不同抗白粉病基因的载体品种进行了SCAR分析。  相似文献   

20.
对分子标记在疫霉菌遗传多样性、抗性基因、分离菌株分子鉴定、基因定位克隆及DNA指纹图谱构建、亲缘关系分析、线粒体遗传等方面的应用进行了综述。  相似文献   

设为首页 | 免责声明 | 关于勤云 | 加入收藏

Copyright©北京勤云科技发展有限公司  京ICP备09084417号