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相似文献
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1.
长白山区野生软枣猕猴桃种质RAPD分析   总被引:2,自引:1,他引:2  
以长白山区8个县市30个取样点采集的软枣猕猴桃样品叶片为试验材料,利用RAPD技术对其进行遗传多样性分析.用14个RAPD引物共扩增出104条带,其中多态带占82%.聚类分析结果表明,长白山区野生软枣猕猴桃各居群样品存在一定程度的地理区域聚类趋势,表明遗传变异与地理距离间没有显著的相关性.  相似文献   

2.
文冠果DNA提取及RAPD反应体系的优化   总被引:1,自引:0,他引:1  
以山西省20个县的文冠果为材料,采用改良的CTAB法提取文冠果基因组DNA,并对文冠果RAPD分析的最佳反应体系进行优化。结果表明,文冠果RAPD分析的最适反应体系为:PCR扩增的总体积为20μL,包括30ng的模板DNA,10×PCR buffer 2μL,2.0mmol.L-1 Mg2+,0.1mmol.L-1dNTP,Taq酶1U,不足的体积用超纯水补足。扩增程序为:94℃预变性120s,94℃变性30s,36.9℃退火45s,72℃延伸90s,45个循环后在72℃延伸300s,结束后在4℃条件下保存。在此最佳反应条件下,RAPD分析具有良好的稳定性和可重复性。  相似文献   

3.
水稻DNA快速提取及RAPD分析体系的优化   总被引:3,自引:0,他引:3  
以水稻幼苗为材料,比较了3种不同DNA提取方法,获得了一种以CTAB法为基础的DNA的简便、快速提取方法,并对RAPD反应体系进行了优化。结果表明,改良CTAB法所提取的DNA产量高、质量好,完全能够满足RAPD分析的要求。通过对DNA模板、Mg2+、dNPT、Taq DNA聚合酶浓度等因素的试验,对水稻RAPD分析体系进行了优化。新建的分析体系扩增谱带清晰、多态性强,稳定性好。  相似文献   

4.
【目的】利用有效的分子标记技术,对秦岭山区野生猕猴桃的遗传多样性及系统进化关系进行研究,为猕猴桃新种质的挖掘和品种遗传改良奠定基础。【方法】利用随机扩增多态性DNA标记(RAPD)技术,对采自秦岭山区的野生猕猴桃24个优良单株和中华猕猴桃等6个种或变种及其品种的22份资源进行了遗传多样性和亲缘关系分析。【结果】通过引物筛选,用16个RAPD引物对46份猕猴桃资源扩增出235条带,其中227条为多态性条带,多态性位点比例为96.29%;各猕猴桃资源间的遗传距离为0.139 53~0.807 34;UPGMA聚类分析结果显示,‘野生99-13’与‘武植2号’、‘魁蜜’、‘金阳1号’、‘武植6号’、‘中华♂’和‘广西红肉’等中华系列猕猴桃(A.chinensis Planch.)聚在一起,其余23份野生猕猴桃与‘哑特’、‘秦美’、‘徐冠’、‘徐香’等猕猴桃品种遗传距离较近。【结论】24份秦岭野生猕猴桃资源中,‘野生99-13’属中华系列猕猴桃,其余23份均属于美味猕猴桃(A.deliciosa var.deliciosa)。  相似文献   

5.
秦巴山区野生山丹百合DNA提取与RAPD反应体系建立   总被引:6,自引:1,他引:5  
以秦巴山区野生山丹百合幼嫩叶片为材料,采用常规CTAB法提取百合基因组DNA,得到的DNA基本能满足RAPD-PCR分析。通过单因素逐一递进优化,得到在20μL的PCR反应体系中,野生山丹百合RAPD分析的最佳反应体系为:40 ng的模板DNA,0.4μmol/L随机引物,2.25 mmol/L Mg2 ,0.2 mmol/LdNTPs,Taq DNA聚合酶1.5U,1×buffer缓冲液,ddH2O补足20μL。RAPD扩增反应程序为:94℃预变性4 min,94℃30 s,37℃45 s,72℃90 s,35个循环,最后72℃10 min,4℃保存。该反应体系具有较好的稳定性及可重复性。  相似文献   

6.
库尔勒香梨基因组DNA提取及RAPD体系建立   总被引:22,自引:1,他引:21  
通过比较试验,使用SDS-氯仿-异戊醇法,添加BME及Vc,简便、快速地从库尔勒香梨成熟叶中提取大分子量DNA,有效地去除了梨属植物组织中所含的多酚类、单宁、色素及多糖类物质,该DNA能很好地被酶切并用于RAPD分析。  相似文献   

7.
阙生全  张芳 《安徽农业科学》2008,36(3):902-903,905
[目的]为建立油茶RAPD分析的最佳反应体系。[方法]分别用改良SDS法和CTAB法从12个油茶品种的新鲜幼叶中提取基因组DNA。通过测定OD260和OD280来比较两种方法提取DNA的纯度。建立油茶的RAPD反应程序,通过优化反应条件获得油茶RAPD分析的最佳反应体系。[结果]CTAB法提取的油茶基因组DNA纯度高于SDS法。油茶RAPD分析的最佳反应体系为:1.0 UTaq DNA聚合酶、1.5 mmol/L MgCl22、00μmol/L dNTP1、0 pmol/L随机引物2、0 ng DNA模板2、μl 10×PCR buffer,加重蒸水至20μl。油茶的RAPD反应程序为:95℃预变性3 min;94℃变性1 min,40℃退火1 min,72℃延伸2 min,40循环;72℃延伸7 min。[结论]该研究所用DNA纯度较高,反应条件控制严格,试验中扩增稳定性较好,是适合油茶RAPD分析的最佳反应体系。  相似文献   

8.
猕猴桃种质资源RAPD分析   总被引:2,自引:0,他引:2  
以猕猴桃10个种42个样品叶片为试验材料,采用改良CTAB法提取基因组DNA,优化确立RAPD-PCR的反应体系.从80个随机引物中筛选出38个引物进行扩增,应用SPSS 11.0 for Windows 软件进行聚类分析.结果表明,美味猕猴桃和中华猕猴桃亲缘关系近,可将其归为同一个种;品种之间确有按原产地聚类的趋势;"海沃德"与其营养系品种"皖翠"有14个引物扩增出了18条特异性条带,变异条带较多.  相似文献   

9.
枣树基因组DNA提取及其RAPD体系优化   总被引:1,自引:0,他引:1  
李瑞环  李新岗  黄建  高文海  张亚利 《安徽农业科学》2007,35(17):5102-5104,5148
以不同生长期的枣和酸枣为研究对象,采用CTAB法提取枣基因组DNA;通过单因素5水平试验,筛选模板、Mg2+、Taq酶、dNTPs和随机引物的浓度及其用量,建立了枣和酸枣RAPD技术最优体系,即25μl反应体系中各组分含量为10×Taq Buffer+KCl 2.5μl;Taq DNA聚合酶0.04 U/μl;MgCl22.0 mmol/L;模板DNA2 ng/μl;引物0.3μmol/L;dNTP为0.2 mmol/L。适宜的扩增程序为:94℃预变性5 min;94℃循环变性50 s,36℃退火50 s,72℃延伸1.5 min,38个循环;72℃延伸10 min。  相似文献   

10.
扁桃基因组DNA提取及RAPD扩增体系的建立   总被引:12,自引:4,他引:12  
以 13 个扁桃品种幼叶为试材,针对扁桃叶片含有较高的多糖、多酚、色素以及单宁等次生物质的特点,采用改进 SDS 法,在缓冲液中使用 5 mol/L 的 NaCl并在温浴后加入 1/5 体积的 5 mol/L 的 KAc,置于-20℃冰冻 30min,提取到了高质量的基因组 DNA,完全能够用于 RAPD 扩增。同时,分析了模板 DNA 浓度、Taq DNA 聚合酶、dNTPs 浓度对 RAPD 反应体系的影响,建立了一套适合扁桃基因组 RAPD 分析的技术体系。  相似文献   

11.
几种茄属植物基因组DNA提取与RAPD分析   总被引:11,自引:1,他引:11  
研究了适于茄子及其近缘野生种基因组DNA的提取方法,并对DNA初步进行了RAPD分析。结果表明:SDS-氯仿-异戊醇法不适于茄属植物DNA提纯,而改进的CTAB-酚-氯仿-异戊醇对其成株叶/芽即可获得较高产率及纯度的DNA;PCR反应扩增出不同片段,引物OPG—11扩增片段在栽培品种与野茄中无差异,而在红茄与龙葵中呈现出一定的多态性。  相似文献   

12.
长白山杜鹃花基因组DNA提取及RAPD体系的建立   总被引:1,自引:0,他引:1  
采用改良的CTAB法提取杜鹃花的基因组DNA,所得的DNA纯度高、质量好,可用于RAPD分析.筛选出的杜鹃花RAPD反应的最佳体系为25μL反应体系中包括模板DNA20~200ng.引物10pmol,dNTPs100μmol·L-1,TaqDNA聚合酶0.5U,Mg2 2.5 mmol·L-1,10xbuffer缓冲液2.5 mmol·-1,其余部分用无茵超纯水补充.PCR扩增程序为94℃预变性5 min;94℃变性1 min,37℃退火1min,72℃延伸2min,40次循环;72℃最终延伸7min.应用优化后的反应体系PCR扩增获得的RAPD指纹图谱带型清晰,重复性好,为长白山杜鹃花品种鉴定、分类的研究提供了一定基础.  相似文献   

13.
长白山林下参基因组DNA提取及RAPD体系的优化   总被引:2,自引:1,他引:1  
采用改良的CTAB法提取林下参的基因组DNA,所得的DNA纯度高、质量好,可用于RAPD分析.筛选出的林下参RAPD反应的最佳体系为20“L,反应体系中包括模板DNA20ng,引物20pmol,dNTPs0.1875mmol/L,TaqDNA聚合酶1.5U,Mg^2+2.0mmol/L,10×Reaction Buffer2.0mmol/L,其余部分用无菌超纯水补充.PCR扩增程序为94℃预变性5min,94℃变性1min,37℃退火1min,72℃延伸2min,40次循环,72℃最终延伸7min.应用优化后的反应体系PCR扩增获得的RAPD指纹图谱带型清晰,重复性好,为通过分子标记获得丰富的林下参遗传信息奠定了基础.  相似文献   

14.
[目的]研究石鲽基因组DNA的提取及其RAPD体系的建立和优化。[方法]以石鲽为试材,按常规酚/氯仿抽提法提取其基因组的DNA,对影响RAPD反应的各因素进行优化,建立了石鲽的最佳RAPD反应体系和程序。[结果]采用常规酚/氯仿抽提法获得的DNA完全能够满足RAPD分析的要求。通过优化建立一套适合石鲽的稳定的RAPD反应体系:反应体系总体积为25μl,包括10×buff-er2.5μl,MgCl22 mmol/L,dNTPs 0.15 mmol/L,引物0.2μmol/L,模板30 ng,Taq酶1 U。扩增程序为:94℃预变性5 min,45次PCR循环(94℃变性45 s,36℃退火45 s,72℃延伸2 min和72℃延伸10 min。利用该体系对OPK和OPV系列共40条引物进行扩增,发现其中部分引物能产生稳定、清晰的条带。[结论]该体系为石鲽遗传多样性以及相关分子标记的研究奠定了基础。  相似文献   

15.
花生属野生种质的RAPD鉴定   总被引:12,自引:1,他引:12  
利用RAPD技术 ,对栽培种与花生属野生种的杂交后代进行了分子标记鉴定 ,结果表明 :从 60个随机寡核苷酸引物中筛选出具多态性的引物 2 7个 ,其中一个引物能检测到来自野生种的DNA特异片段。  相似文献   

16.
枸杞基因组DNA的提取及RAPD反应体系的优化   总被引:2,自引:0,他引:2  
张磊  任贤 《安徽农业科学》2009,37(30):14611-14613
[目的]研究枸杞基因组DNA的提取及RAPD反应体系的优化。[方法]采用了进一步优化的CTAB法提取枸杞基因组DNA,检测所提取的DNA的浓度范围,并对RAPD反应体系进行了科学、合理的优化。[结果]结果表明,浓度范围在3.5~5.5μg/μl,完全能够满足RAPD—PCR的要求。[结论]该方法具有步骤少、费用低、效率高等特点,比较适用于枸杞基因组DNA的提取。  相似文献   

17.
旨在筛选出绣线菊属 RAPD 反应的最佳体系,为绣线菊属植物种质资源遗传多样性和亲缘关系的研究奠定基础.试验以 10 种绣线菊属植物为材料,采用改良 CTAB 法进行冬芽和嫩叶的总 DNA 提取并对影响 RAPD 扩增效果的因素进行优化.通过单因素优化筛选出最佳的 20μl 反应体系10×Taq buffer 2μl,Taq 酶 1.0U,0.15mmol/L dNTP,DNA 2ng/μl,引物 0.21μ mol/L,Mg2 2.0mmol/L;反应程序94℃预变性 4min,然后进行 40 个循环94℃变性 45s,37℃退火 1min,72℃延伸 1min.最后72℃延伸5min,4℃终止反应.结果发现,采用改良 CTAB 法所提取绣线菊冬芽的 DNA 达到 RAPD 反应的要求.筛选体系扩增出清晰稳定的多态性条带,可用于对绣线菊属遗传育种方面的研究.  相似文献   

18.
蜜蜂DNA提取纯化与RAPD反应体系的建立   总被引:5,自引:9,他引:5  
以意大利蜜蜂为材料,研究了蜜蜂DNA的提取以及对RAPD分析的影响因素,包括模板浓度、Mg^2 、dNTP和引物,建立了适于蜜蜂RAPD分析的PCR反应体系,即20μL反应体系中,包括10mmol/L Tris—HCl(pH8.3)、50mmol/L KCl、20~60ng DNA、3.0mol/L MgCl2、0.2mmol/L dNTP、0.5μmol/L随机引物和1.5unit Taq聚合酶。扩增程序为:94℃预变性5min,94℃变性1min,36℃退火1min,72℃延伸2min,40个循环:最后在72℃延伸10min.  相似文献   

19.
菟丝子RAPD反应体系的建立和优化   总被引:3,自引:0,他引:3  
以南方菟丝子基因组DNA为试材,采用单因素递进筛选方法对菟丝子的RAPD反应体系进行了优化。结果表明,在25μL总反应体积中,最佳浓度配比为:模板DNA 20 ng,MgC l23.0 mmoL/L,引物10μmoL/L,dNTP 400μmoL/L,TaqDNA聚合酶1个单位(U),10×反应缓冲液2.5μL。扩增程序为:94℃变性3 m in,再进入循环;94℃变性1 m in,40℃退火1m in,72℃延伸1 m in,共40个循环;72℃最终延伸10 m in,于4℃保存。  相似文献   

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