基于优化ACGM标记的甘蓝型油菜大籽粒材料聚类分析(英文)

[目的]利用AGGM标记对甘蓝型油菜大籽粒材料进行聚类分析。[方法]根据18个拟南芥籽粒发育相关基因,并结合同源油菜EST序列,设计开发44对ACGM引物。选择其中18对引物对16份大籽粒材料和4份小籽粒材料进行聚类分析。[结果]这18对引物分别稳定扩增出2-6条特异条带,扩增差异明显,多态性丰富,重复度高,表明优化的ACGM标记在甘蓝型油菜中具有良好的通用性。聚类结果显示20份材料在相似系数0.6处分为A、B、C3个类群,其中A、B类又可在相似系数0.67处分为A1、A2、A3、B1、B2五个亚群。[结论]为下一步利用这些材料进行育种及相关科研工作提供一定的理论基础。     

Cluster analysis of the Ogura male sterile lines and fertility restorer lines in Brassica napus using SSR markers

[目的]对Ogura胞质雄性不育系及恢复系进行遗传差异分析,为生产上利用Ogura胞质不育系统选育强优势甘蓝型油菜杂交组合提供参考.[方法]利用分布于连锁群上的76对SSR标记分析79份甘蓝型油菜Ogura细胞质雄性不育系及恢复系材料间的差异并进行聚类分析.[结果]在76对SSR标记引物(每条连锁群4对SSR标记)中可筛选出38对标记;在79份材料中,38对SSR标记共扩增到123条清晰条带,扩增片段大小为100～400 bp;获得89个多态性位点,材料间遗传相似系数为0.52～0.99.聚类分析结果表明,在相似系数0.68处,可将79份材料分为A、B、C、D、E5个类群,92.4％的材料可归入A、B两类,其中72.1％的恢复系材料归入A类,72.8％的不育系材料归入B类.A类和B类又可在相似系数0.74处分别分为A1、A2、A3、A4、A5、A6、A7及B1、B2、B3、B411个亚群.[结论]SSR标记可用于甘蓝型油菜Ogura细胞质雄性不育系及恢复系的分类鉴定.     

甘蓝型油菜Ogura胞质雄性不育系及恢复系聚类分析

【目的】对Ogura胞质雄性不育系及恢复系进行遗传差异分析,为生产上利用Ogura胞质不育系统选育强优势甘蓝型油菜杂交组合提供参考。【方法】利用分布于连锁群上的76对SSR标记分析79份甘蓝型油菜Ogura细胞质雄性不育系及恢复系材料间的差异并进行聚类分析。【结果】在76对SSR标记引物（每条连锁群4对SSR标记）中可筛选出38对标记;在79份材料中,38对SSR标记共扩增到123条清晰条带,扩增片段大小为100～400 bp;获得89个多态性位点,材料间遗传相似系数为0.52~0.99。聚类分析结果表明,在相似系数0.68处,可将79份材料分为A、B、C、D、E 5个类群,92.4%的材料可归入A、B两类,其中72.1%的恢复系材料归入A类,72.8%的不育系材料归入B类。A类和B类又可在相似系数0.74处分别分为A1、A2、A3、A4、A5、A6、A7及B1、B2、B3、B4 11个亚群。【结论】SSR标记可用于甘蓝型油菜Ogura细胞质雄性不育系及恢复系的分类鉴定。     

24份葡萄种质亲缘关系的ISSR分析

利用ISSR标记对24份葡萄材料进行了基因组多态性分析,从50条引物中筛选出6条扩增稳定且多态性丰富的引物用于葡萄的ISSR扩增.共扩增出59条条带,其中多态性条带53条,多态性百分率为90％.根据ISSR扩增结果,利用NTSYSpc2.10e软件进行Jaccard相似性系数分析,24份葡萄材料的遗传相似系数为0.42 ～0.88,平均遗传相似系数为0.6495.在遗传相似系数为0.55处,24份葡萄材料明显分为2大类群.第1类包含10个欧美杂种、7个欧亚种、1个华欧杂种,第2类包含3个美洲杂交种、1个河岸葡萄、1个冬葡萄、1个东亚葡萄.由此可见,美洲杂交种与欧美杂种、欧亚种葡萄的亲缘关系较远,欧美杂种与欧亚种葡萄之间亲缘关系较近.此外,引物BC820与引物BC847分别在我国自主选育砧木品种华佳8号与抗砧3号中扩增出一条特异条带,可为利用ISSR标记鉴定葡萄品种或品系提供参考依据.     

基于SCoT标记的木奶果种质资源遗传多样性分析

利用SCoT标记对37份不同来源的木奶果种质资源进行遗传多样性分析。从75条引物中筛选出9条重复性好、条带清晰的引物用于PCR扩增,共扩增出109条条带,其中多态性条带94条,多态性比率为86.24%;供试材料相似系数介于0.58～0.92之间,9条引物平均多态性信息含量为0.8728,说明供试样品具有较高的遗传多样性。UPGMA聚类分析显示,SCoT标记能将37份木奶果资源完全区分开,并在相似系数0.69和0.70处将供试材料分成A、B、C 3个大组,C组在相似系数0.72处可进一步分为C1和C2两个亚组。     

向日葵DNA指纹图谱构建及遗传多样性分析

以12份向日葵杂交种和18份向日葵亲本为材料,利用SSR分子标记,从502对SSR引物中筛选了34对核心引物。34对引物在30份研究材料中共检测到81个多态性片段,平均每对引物的多态性片段为2.38个。基于34个SSR标记的扩增结果,利用NTsys 2.10e软件计算遗传相似系数,并建立UPGMA聚类图,结果表明:30份材料之间的遗传相似系数变化范围为0.432 0~0.901 2,在遗传相似系数0.62处可以将30份材料分为两大类,一定程度上反映了材料间的亲缘关系。同时SSR标记指纹图谱的建立为向日葵品种纯度和真伪鉴定提供了科学数据。     

茉莉花种质资源遗传多样性的ISSR分析

利用ISSR技术对茉莉花30份材料的遗传多态性进行了分析.从100个随机引物中筛选出10个多态性引物,共扩增出70条DNA条带,其中34条为多态性条带,占48.57%,平均每个引物扩增出3.4条DNA带.按照相同迁移位上有扩增带记为1、无带为0的方法构建ISSR表型数据的矩阵,用NTSYSpc 2.0软件对茉莉花30个材料进行UPGMA聚类分析.计算出30份材料的遗传相似系数为0.86～0.98,平均相似系数为0.91,并在此基础上建立了聚类分析树状图,在相似系数0.86处,将30份材料划分为A、B 2大聚类组.     

39份油菜品种的SRAP遗传多样性分析

为从分子水平上了解油菜的遗传性,采用SRAP标记,对39份2010—2011年度参加国家区试的油菜品种的遗传多样性进行了分析。结果显示:13对SRAP引物共扩增出314条带,其中,68条带具有多态性,多态率为21.7%,平均每对引物组合的谱带数和多态性带数为24.2条和5.2条。通过UPMGA法进行聚类分析显示,在相似系数0.670处供试材料可被分为(A,B,C,D,E,F)6个簇,其中,A簇包括11份材料,B簇15份材料,C簇6份材料,D簇4份材料,E簇2份材料,F簇1份材料。同一地区或同一育种单位的材料除少数表现出亲缘关系较近外,其余均表现出更丰富的多态性。来自于湖北的10个材料分属于A、B1、B2、D、E、F共6个簇;来自四川的7个材料分属于A、B、C共3个簇。各育种单位的育种材料遗传多样性较之前有所增加。     

狼尾草遗传多样性SRAP分析

利用SRAP分子标记技术分析了19份狼尾草资源间的遗传关系.结果表明:100对SRAP引物中,38对引物多态性较好,每对引物产生9～22条条带,共扩增出682条谱带,其中多态性条带为157条,平均每对引物组合产生4.13个多态性条带,表明在这19份狼尾草资源中具有较高的遗传多样性.经NTSYS pc2.01软件聚类分析,狼尾草品种间简单匹配相似系数为0.53～0.82.在相似系数为0.60时,可将19个狼尾草品种分为A、B、C3类;在相似系数为0.67时,B类分为2个亚类,C类分为3个亚类.此结果与狼尾草形态学特征相配合,为鉴别狼尾草资源亲缘关系提供了科学依据.     

基于SSR标记的福建省若干水稻品种DNA指纹图谱构建及遗传多样性分析

以24份杂交稻品种和18份杂交稻亲本为材料,利用SSR分子标记进行DNA指纹图谱构建和遗传多样性分析。24对引物在研究材料中共检测到74个多态性片段,平均每对引物的多态性片段为3.1个。基于24个SSR标记的扩增结果,利用NTSYS 2.10e软件计算Dice遗传相似系数,并建立UPGMA聚类图,结果表明:42份材料之间的相似系数变化范围为0.60~1.00,在遗传相似系数0.68处可以将42份材料分为6个类群,较好地反映了供试材料的亲缘关系,可为水稻育种中亲本选择提供参考。同时建立了42份材料×12个SSR标记的指纹图谱,为杂交水稻品种纯度和真伪鉴定提供科学数据。