查看系谱和计算近交系数在计算机上的实现

查看系谱和计算近交系数在计算机上的实现周敏，顾建新，佟立伟（沈阳农业大学，沈阳１１０１６１）选配在家畜育种工作中是一项非常重要的措施，是改良现有家畜种群和创立新种群的强有力手段，而亲缘选配是实现这种措施和手段的主要内容。亲缘选配就是考虑双方亲缘关系远...     

逐代比较累加近交系数的程序设计

在家畜育种工作中,近交系数占有相当重要的地位,它是家畜选种选配的依据之一。过去人们寻找系谱用手工计算的方法,耗时多,效率低易错算。采用计算机贮存家畜系谱和计算近交系数,可大幅度地提高计算速度和准确性。70年代初,日本畜产试验场的西田朗用 Fortran 语言编写了近交系数和血缘系数的程序.1986年,北京农业大学畜牧系的师守堃发表了用 Basic 语言编写的“近交和亲缘系数”程序。这两种方法计算前都要将原始系谱中所有的个体进行整理编码,并按人为规定的先后次序排列,方可送入计算机处理。为了简化这一工作,我们摸索了一套方     

混合家系随机抽样群体期望亲缘系数的计算

为了对多仔动物所构成的“全同胞半同胞”混合家系,在不能获得详细系谱资料的情况下,快速、有效的计算抽样群体期望亲缘系数,使用递归和迭代设计特定算法,实现对后代随机抽样情况下样本个体在家系内各雌亲间分布情况的计算,并对各种符合参数要求的样本后代分布进行同胞对数和频数的统计,最终实现抽样群体期望亲缘系数的计算机自动求解和输出。对采用本算法和近似公式计算得到的亲缘系数进行对比分析,结果表明：当雌亲数d≥5时,2种方法计算的亲缘系数差值〈0.01;当d≥50时,两者差值〈0.001。本算法适用于多种参数组合混合家系期望亲缘系数的计算;依照本算法编制程序计算亲缘系数,计算结果精确,运行速度快。本算法可为动物遗传育种工作提供比较可靠的参数估计。     

混合家系随机抽样群体期望亲缘系数的计算

为了对多仔动物所构成的"全同胞-半同胞"混合家系,在不能获得详细系谱资料的情况下,快速、有效的计算抽样群体期望亲缘系数,使用递归和迭代设计特定算法,实现对后代随机抽样情况下样本个体在家系内各雌亲间分布情况的计算,并对各种符合参数要求的样本后代分布进行同胞对数和频数的统计,最终实现抽样群体期望亲缘系数的计算机自动求解和输出.对采用本算法和近似公式计算得到的亲缘系数进行对比分析,结果表明:当雌亲数d≥5时,2种方法计算的亲缘系数差值<0.01;当d≥50时,两者差值相似文献   

近交系数与亲缘系数迭代算法

本文提出了适于任何无世代交叉系谱的近交系数与亲缘系数迭代算法。迭代过程是先利用亲代的近交系数和亲代间的亲缘系数计算出子代的近交系数,然后利用亲代的近交系数、亲代间的亲缘系数和子代的近交系数计算出子代间的亲缘系数。这种迭代算法不仅以统一的形式描述了连续全同胞、半同胞等有规律系谱近交系数迭代公式,而且突破了有规律系谱的限制,使迭代算法的适用范围拓宽到了任何无世代交叉的不规则系谱。     

我国原生,引入和育成苹果品种的类群划分及亲本溯源

本文在参考众多资料的基础上，将已查明的５００余个苹果品种划分为我国原生、国外引入和国内选育三大类群，并进一步以生产常见品种为代表追溯其亲缘相关，形成各族品种演化系谱，使众多苹果品种有一个明晰的亲缘体系。     

4个优质高产水稻品种的系谱分析

研究水稻品种亲缘系谱的关系对进一步提高优质高产品种的水平很有必要。介绍了中二软占、丰华占、齐粒丝苗和野丝占等4个软米优质品种的特性和亲缘系谱以及推广种植情况。     

CodeFinder,一个用于育种系谱信息查找的Excel宏

系谱信息管理在育种工作中占有重要地位。以广泛使用的Microsoft Excel电子表格为平台,利用内嵌的Visual Basic for Application语言编写了一个用于育种系谱信息查找的Excel宏,该程序具有从系谱信息数据库中按照给定的编号清单自动将其对应的系谱信息查找出来的功能,在作物育种中具有广阔的应用前景。     

观赏海棠资源谱系分析及育种研究进展

观赏海棠品种在全世界大约有700多种,大多数品种亲本不详,本文对已知亲本的96种观赏海棠追溯其亲缘相关,形成四个系谱,使这些观赏海棠有一个较明晰的亲缘体系,并综合叙述其主要性状,寻找主要性状的遗传规律,供观赏果树工作者在栽培、选育及分类中借鉴与参考,并提出了要综合利用多种育种手段,培育观赏海棠新品种的建议.     

肉羊遗传评估方法及其研究进展

对我国肉羊遗传育种评估的发展历程进行了简述,并对遗传评估方法和软件进行比较。结果发现:我国目前使用的肉羊育种软件大部分是单机版的,已经不适应现代肉羊业发展和规模化生产的需要,亟需研制出基于网络的肉羊遗传育种软件。     

陕北马海毛山羊选育方案

在分析陕北发展马海毛山羊的必要性与可能性的基础上,提出选育陕北马海毛山羊新品种的选育指标、杂交方案。计划从1988年开始,用安哥拉山羊为父本、陕北黑山羊为母本,采取级进杂交方式,开展大规模改良工作,要求在15～20年内选育出陕北马海毛山羊新品种,并提出相应的选种、饲养、管理、繁殖等一系到配套技术。     

规模化奶牛场数字化网络管理平台开发与应用

【目的】利用网络数据库技术,建立规模化奶牛场生产过程数据网络整合与智能分析共享平台,以满足规模化奶牛场数字化管理水平,提高繁育效率及遗传进展。【方法】基于奶牛从发情、配种、孕检、妊娠、产犊、泌乳、干奶到下一个繁殖周期的生产管理流程,将奶牛划分为犊牛、青年牛、育肥牛、泌乳牛、干奶牛5种类型,在设计采集生产母牛及公牛基本信息及数据标准规范后,采用Microsoft.Net框架、SQL Server 2008网络数据库及FusionCharts网络绘图等技术,研究构建规模化奶牛场繁殖、泌乳及健康等数据管理及智能分析平台。【结果】平台一级子系统包括系统维护、牛只管理、繁殖管理、产乳管理、饲养管理、健康管理、统计分析及场内管理。在8大子系统上总共实现的功能模块多达96项。其中,系统维护6项,牛只管理10项,繁殖管理13项,含DHI数据的产乳管理14项,饲料管理4项,健康管理10项,统计分析18项以及场内管理21项。平台主要实现了对奶牛繁殖与泌乳生产核心数据的网络远程数字化管理,主要包括公、母牛个体繁殖状态的全程记录、不同胎次的泌乳数据的记录、牛只资料卡等在线动态分析、各类基础数据的排序与输出等。在数据挖掘分析上,可在线计算平均胎间距、泌乳牛胎次结构、高低产母牛数量、系谱跟踪及近交系数等。在生产提示功能设计上,可处理的项目包括发情配种、初检复检、产犊泌乳、干奶、催乳、淘汰及犊牛断奶等各类将发生的生产事件,而且可对大部分统计分析数据进行可视化图形渲染处理,如胎次产量分布图、年度产奶比较图、二叉树谱系图及泌乳曲线图等。【结论】对生产过程基本数据的分析与数据挖掘,提升了基础数据的利用价值,更有利于奶牛场管理者的科学决策。     

山羊mtDNA多态性及其遗传结构的研究*

 对中国6个山羊品种（辽宁绒山羊,内蒙古绒山羊,西藏山羊,中卫山羊,济宁青山羊和龙陵山羊）的52个样本进行mtDNA的D-Loop区的全序列测定,用来研究中国山羊品种的线粒体DNA遗传多态性及系统发育。用NJ法构建单倍型系统发育树,结果发现6个山羊品种的线粒体DNA控制区聚类后得到了4个很明显的分支,即单倍型A,B,C,D.品种间遗传结构分析发现内蒙古绒山羊、辽宁绒山羊两个绒山羊品种与西藏山羊、中卫山羊3个可产绒的山羊品种聚在一起,接着与产羔皮的济宁青山羊聚在一起,最后与产肉性能强的龙陵山羊聚在一起。     

皖北地区山羊业情况调查分析

阐述了皖北地区发展养羊业的有利条件,指出该地区山羊饲养业在养羊模式、放牧技术、良种繁育体系、饲料生产与加工方法等方面存在的问题。     

圈养山羊疫病防控措施

山羊圈养具有提高成活率和生产效益,保护生态环境,促进畜牧业的可持续发展的优势。但由于养殖密度大,如饲养管理不到位,增大了疫病爆发的机率。本文以武鸣县宁武镇圈养山羊为例,分析山羊圈养发生疫病的原因,总结饲养经验,从加强基础设施建设、搞好饲养管理、建立卫生消毒制度、规范疫病免疫程序等几个方面进行阐述,提出圈养山羊防控疫病具体措施。     

Why do farmers decide to produce meat goats? Evidence from the United States

This paper addresses the reasons why US meat goat producers selected to engage in meat goat production. A mail survey of US meat goat producers was conducted. Potential reasons for entering meat goat production included those associated with lifestyle, farm management, productivity, and economics. Reasons for entering meat goat production were assessed and analyzed using ordered probit models. The most important reasons for entering meat goat production included enjoyment working with goats, goat production fitting well into the farm management plan, goats could be raised on a relatively small acreage, goat grazing preferences were different from other species, and the family could be involved in the goat enterprise. The 12th and 13th most important reasons were goat production profitability and low cost associated with purchasing and raising goats. Larger-scale farmers were more likely to have selected meat goat production for profitability and productivity reasons while smaller-scale farmers were more likely to have selected it for lifestyle reasons. Farmer demographics, farm characteristics, and farm location also impacted reasons why the farmer selected the goat enterprise. Results have implications for development of the meat goat industry.     

波尔山羊的品种特性及利用途径

详细介绍了波尔山羊的起源、分布、品种特性、生长发育、生产性能、繁殖性能、利用途径、适应性、抗病力及饲养条件等。指出目前中国各地购买种羊 ,开展纯繁和杂交 ,必须注意相应地改善饲养管理条件 ,以舍饲为主 ,放牧为辅 ,小群管理 ,加强防疫 ,否则难以达到预期效果     

奶牛育种资料的电脑管理

本文论述了用APPLE—Ⅱ型微型电子计算机对一个奶牛场的中国黑白花奶牛的育种资料进行管理的做法和结果。该项工作以一个有650头成母牛的奶牛育种场的全部育种资料为数据来源,完成了一个容量为2600头母牛的奶牛育种资料电脑管理系统的设计、研制和调试。现已写入育种资料40万个数据,并编制了相应的系统管理程序和一组功能较强的实用程序。从而实现快速、准确地管理育种资料的目的。其结果可以供该场现场利用。文章还就畜禽育种资料电脑管理有关问题作了若干理论分析,提出一些看法。     

济宁青山羊羔羊初生重、死亡率及其影响因素分析

为分析济宁青山羊初生重和死亡率2个重要经济性状的影响因素,利用SPSS 19.0和SAS 9.2软件对这2个指标进行描述性统计、最小二乘方差分析和协方差分析,分析2012—2017年产羔记录中出生年份、出生季节、配种季节、性别和产羔类型5个因素对济宁青山羊羔羊初生重和死亡率的影响并求得羔羊初生重、死亡率的最小二乘均值。结果表明：1)出生年份、出生季节、性别和产羔类型对羔羊初生重均有极显著的影响(P<0.01);产羔类型对羔羊死亡率有显著影响(P<0.05)、配种季节对羔羊死亡率有极显著影响(P<0.01)。2)2012—2017年6年羔羊初生重呈先下降后增加再下降的趋势,死亡率呈先下降再增加的趋势。3)公羔初生重极显著高于母羔初生重(P<0.01)。4)随着母羊产羔数的增加,死亡率升高。单羔的初生重极显著高于四羔及以上(P<0.01),双羔的初生重与三羔差异显著(P<0.05)。5)秋季出生的羔羊初生重极显著高于其他季节。春季所产羔羊的初生重显著高于夏季和冬季(P<0.05)。综上,济宁青山羊初生重和死亡率受出生年份、出生季节、配种季节、性别和...     

基于Web的猪育种管理系统设计

针对种猪场育种管理中存在的弊端和技术力量薄弱,提出构建基于Web的猪育种管理系统的设想,利用Web的资源共享功能,采用Asp.net技术完成系统设计。将系统应用到实践中,养殖户不需单独购买育种管理软件,只需登录到此系统的网络平台即可完成所有与育种相关的工作,可以降低猪场育种管理方面的成本。系统还可完成有遗传联系的猪场育种数据集成化,促进区域联合育种。与同类系统相比,系统添加了专家评估模块和猪性状优良库。专家可以分析猪场的育种现状,提供有针对性的技术服务。场方以猪性状优良库为参照标准,了解本场猪种优良情况,明确自身努力方向,提高本场种猪选育水平。