KDR等6个基因多态性与鸡生长和体组成性状的相关研究

以东北农业大学高、低脂肉鸡双向选择品系第14世代群体(NEAUHLFG14)和AA肉鸡商业随机群体(AA群体)为试验材料,利用PCR-RFLP对鸡腹脂性状的全基因组关联分析(GWAS)鉴定出6个多态位点进行单核苷酸多态性(SNPs)检测,分析这些位点的多态性与鸡生长和体组成性状的关系。结果表明,在NEAUHLFG14中KDR基因的rs14483313位点多态性对腹脂重(AFW)和腹脂率(AFP)有显著影响(P<0.05),TUSC3基因的rs13548811位点对鸡后期体重有影响,EXOC1基因的GGaluGA263078位点在两个群体中都对7周龄体重(BW7)有显著影响(P<0.05)。TUSC3、PPAT、EXOC1和KIAA1211基因的突变位点对NEAUHLFG14极低密度脂蛋白(VLDL)浓度有显著影响(P<0.05),结果显示,6个基因可能是影响鸡腹脂性状的重要基因,但多态位点是否为功能性位点仍需进一步验证。     

ACOX3基因多态性对鸡体脂沉积的影响

文章通过分析酰基辅酶A氧化酶（Acyl-Coenzyme A Oxidases 3,ACOX3）基因单核苷酸多态性与鸡脂肪性状的关系,旨在了解该基因对鸡体脂沉积的影响。以东北农业大学高、低脂双向选择品系肉鸡为材料,采用PCR-RFLP方法检测ACOX3基因的多态性,并分析该基因多态性与鸡脂肪性状的关系。结果表明,ACOX3基因c.-228C>T突变位点在肉鸡高、低脂双向选择品系第10、11世代混合群体中,对腹脂重、腹脂率和血浆VLDL浓度有显著影响（P<0.05）;c.-442A>C突变位点在第8-11世代混合群体低脂系中,对腹脂重有显著影响（P<0.05）;c.27035A>G突变位点在第10、11世代混合群体低脂系中,对血浆VLDL浓度有显著影响（P<0.05）;c.16802C>T突变位点在第11世代低脂系中,对腹脂重、腹脂率有显著影响（P<0.05）。结果显示,ACOX3基因对鸡的体脂沉积有重要影响。ACOX3基因c.-228C>T突变位点对鸡脂肪性状有显著影响,可以尝试作为遗传标记对脂肪性状进行分子标记辅助选择。     

I-FABP基因侧翼区多态性与鸡生长和胴体组成性状的相关研究

本研究以东北农业大学高、低腹脂双向选择品系第9世代肉仔鸡为试验材料,利用PCR-RFLP法对鸡肠型脂肪酸结合蛋白基因进行单核苷酸多态性(SNPs)检测,分析该基因多态性与鸡生长和胴体组成性状的关系。统计分析结果表明,该基因c.*822G>A突变位点不同基因型对肉仔鸡5周龄、7周龄体重和屠体重有显著影响(P<0.05),对出生重、1周龄和3周龄体重有一定的影响(P<0.2)。AA基因型个体的5周龄、7周龄体重和屠体重显著高于AG和GG基因型个体(P<0.05)。本研究首次推测I-FABP基因可能是影响鸡体重的主效基因或与影响该性状的主效基因紧密连锁。     

Ⅰ-FABP基因侧翼区多态性与鸡生长和胴体组成性状的相关研究

本研究以东北农业大学高、低腹脂双向选择品系第9世代肉仔鸡为试验材料.利用PCR-RFLP法对鸡肠型脂肪酸结合蛋白基因进行单核苷酸多态性(SNPs)检测,分析该基因多态性与鸡生长和胴体组成性状的关系.统计分析结果表明,该基因c.·822G>A突变位点不同基因型对肉仔鸡5周龄、7周龄体重和屠体重有显著影响(P<0.05),对出生重、1周龄和3周龄体重有一定的影响(P<0.2).从基因型个体的5周龄、7周龄体重和屠体重显著高于AG和GG基因型个体(P<0.05).本研究首次推测,I-FABP基因可能是影响鸡体重的主效基因或与影响该性状的主效基因紧密连锁.     

基于case-control法分析鸡脂肪性状QTL区域SNP与性状的关系

以华南农业大学杏花鸡×隐性白羽洛克鸡全同胞家系为群体,选取腹脂重性状两尾样本共96个个体,在已报道家禽腹脂重性状QTL区域相关基因中选取14个SNP,采取PCR-RFLP法进行基因定型、case-control法进行关联分析,经100000次重排检验后,发现rs16480367、rs15687533、rs16481126、rs15685408均达到显著水平,P值分别为0.0202、0.0215、0.0257、0.0319。说明这4个SNP位点与脂肪性状有一定的相关性,可为家禽的标记辅助选择提供理论参考。     

珍禽贵妃鸡体尺性状与屠宰性能的相关分析

[目标]探析贵妃鸡、体尺性状与屠宰性能的相关性,为今后科学系统地进行珍禽资源优势挖掘及良种选育提供理论依据.[方法]对12周龄贵妃鸡进行活重、体尺性状和屠宰性能指标测定,采用SPSS 19.0统计软件对其屠宰性能和体尺性状进行相关分析,并采用逐步回归法构建主要屠宰性能的回归方程.[结果]12周龄贵妃公鸡的龙骨长、胫围和胫长显著高于母鸡（P＜0.05,下同）,活重、屠体重、半净膛重、全净膛重、胸肌重、腿肌重、翅膀重和脚重极显著高于母鸡（P＜0.01,下同）,腹脂重显著低于母鸡,腹脂率极显著低于母鸡,其余指标则差异不显著（P＞0.05）.在贵妃鸡体尺性状与屠宰性能的相关性方面,体斜长与活重、屠体重、半净膛重、胸肌重和腿肌重呈显著正相关,与全净膛重呈极显著正相关,与腹脂重呈极显著负相关;龙骨长与活重、屠体重、半净膛重、全净膛重、胸肌重和腿肌重呈极显著正相关,与腹脂重呈极显著负相关;胫围与活重、屠体重、半净膛重、全净膛重和腿肌重呈极显著正相关,与胸肌重呈极显著负相关,与腹脂重呈显著负相关.[结论]贵妃鸡的屠宰性能与大多数体尺性状存在显著或极显著相关性,将对屠宰性能影响显著的相关体尺性状代入回归方程,即可预测出相应的屠宰性能.     

鸡ApoB基因多态位点与生长和体组成性状的相关性研究

载脂蛋白B(Apolipoprotein B,ApoB)是血浆脂蛋白的主要成分,对脂类代谢具有重要的调控作用。本研究以东北农业大学高、低腹脂双向选择品系第9世代仔鸡为试验材料,对鸡ApoB基因进行SNP检测,分析ApoB基因多态性与生长和体组成性状的关系。根据鸡基因组测序结果提供的SNP,发现鸡ApoB基因5′调控区的-112A>G、3′调控区的9 bp插入缺失以及exon26上T>G的同义突变3个突变位点在研究群体中存在多态性。统计分析结果表明,5′调控区的-112A>G突变位点和3′调控区的插入缺失突变位点对7周龄体重和屠体重有显著影响(P<0.05),exon26上T>G对屠体重有显著影响(P<0.05),对7周龄体重有一定的影响(P<0.01)。本研究首次推测ApoB基因可能是影响鸡体重的主效基因或与影响该性状的主效基因紧密连锁。     

鸡资源群体脂肪相关性状的遗传分离特性

以固始鸡和安卡红鸡杂交建立的F_2代资源群为研究材料,探讨肌间脂肪宽、皮下脂肪厚、腹脂重和腹脂率的遗传分离规律。结果表明:肌间脂肪宽、皮下脂肪厚、腹脂重和腹脂率在F_2代发生了很大的分离,4个性状在不同性别间均呈极显著差异,公鸡极显著低于母鸡;正交群体皮下脂肪厚显著低于反交群;肌间脂肪宽、皮下脂肪厚、腹脂重和腹脂率在家系间存在极显著差异;体重等级对4个脂肪相关性状的效应在公、母鸡群间有明显差异,体重等级对公鸡脂肪性状的影响较弱,仅对公鸡肌间脂肪性状有显著影响,而对母鸡的肌间脂肪宽、皮下脂肪厚、腹脂重和腹脂率的影响均达极显著水平。结果提示该资源群体可有效地用于脂肪相关性状的定位和功能基因的克隆。     

FTO基因多态性及其与2个绵羊群体生长性状的相关性

【目的】本文探讨了FTO基因多态性与不同绵羊群体生长性状的相关性。【方法】采用飞行质谱技术检测了FTO基因在杜泊羊和滩寒杂交群体中的多态性及其与生长性状的相关性。【结果】FTO基因的rs160915957位点的AA基因型个体体重在杜泊和滩寒绵羊群体中分别为极显著(P0.01)和显著(P0.05)低于GG型个体。GG型绵羊胸围最大,且GG型杜泊羊胸围显著大于滩寒羊GG型个体(P0.05)。GG型个体在2个群体中的体斜长最大,同一群体不同基因型间差异不显著(P0.05);不同基因型间,滩寒群体绵羊体高大于杜泊羊,但只有AA型个体在2个群体间显著差异(P0.05)。此外,GG型个体的杜泊羊胸宽最大,AA型的最小,这与滩寒群体相反,但均没有显著性差异(P0.05)。FTO基因的rs160915957位点不同基因型对绵羊其他性状的影响差异不显著。【结论】FTO基因的rs160915957位点对杜泊及滩寒绵羊群体的体重、体斜长及胸围等具有显著影响。FTO基因是否是影响绵羊生长性状的主效基因尚待进一步探讨,但FTO基因的rs160915957位点多态性将为不同绵羊群体后代的体重、胸围等性状的选择提供参考依据。     

长链非编码RNA基因NRON与肉鸡生长性状关联分析

近年发现长链非编码RNA参与调控多种生理活动及疾病发生。长链非编码RNA基因NRON可抑制活化T细胞核因子(NFAT),且与心肌发育、免疫反应等密切相关。文章检测东北农业大学肉鸡腹脂双向选择系和爱拔益加(AA)肉鸡群体中NRON基因单核苷多态性位点,并作关联分析。结果表明,两个群体中NRON与心脏重均极显著相关(P0.01);NRON与AA肉鸡3周龄和5周龄体重显著相关,与高、低脂系肉鸡肌胃重、腺胃重、骨盆宽、胸角度和胸宽性状间也显著相关(P0.05)。NRON基因表达水平在高、低脂系肉鸡心脏、胸肌、肌胃和腹部脂肪组织中均差异极显著(P0.01)。NRON和NFAT在腹部脂肪组织中表达水平随周龄增加而显著升高。研究结果为进一步探讨NRON基因影响肉鸡肌肉和脂肪组织生长发育分子机制奠定基础。     

肉种鸡血浆VLDL浓度与肥度性状的相关研究

以肉种鸡为试验素材 ,分别测定其 16周龄、5 4周龄血浆VLDL浓度和 5 4周龄腹脂重 (率 ) ,探讨肉种鸡血浆VLDL浓度与肥度性状和体重的关系。结果表明 :16周龄公、母鸡血浆VLDL浓度差异不显著 ,5 4周龄母鸡血浆VLDL浓度显著高于公鸡 ;5 4周龄母鸡血浆VLDL浓度显著高于 16周龄母鸡 ,5 4周龄公鸡血浆VLDL浓度小于 16周龄公鸡 ;5 4周龄公鸡腹部无脂肪沉积 ,母鸡腹脂重为 12 0 .9g ,腹脂率为 3 .2 2 % ;16周龄血浆VLDL浓度与 5 4周龄体重呈显著相关 ,而与 5 4周龄腹脂重 (率 )相关不显著 ,5 4周龄血浆VLDL浓度与体重、腹脂重 (率 )相关不显著     

Integration of association and computational methods reveals functional variants of LEPR gene for abdominal fat content in chickens

Leptin receptor(LEPR) plays a vital role in obesity in humans and animals. The objective of this study is to assess LEPR functional variants for chicken adipose deposition by integration of association and in-silico analysis using a unique chicken population, the Northeast Agricultural University broiler lines divergently selected for abdominal fat content(NEAUHLF). Five online bioinformatics tools were used to predict the functionality of the single nucleotide polymorphisms(SNPs) in coding region. Further, the possible structure–function relationship of high confidence SNPs was determined by bioinformatics analyses, including the conservation and stability analysis based on amino acid residues, prediction of protein ligand-binding sites, and the superposition of protein tertiary structure. Meanwhile, we analyzed the association between abdominal fat traits and 20 polymorphisms of chicken LEPR gene. The integrated results showed that rs731962924(N867 I) and rs13684622(C1002 R) could lead to striking changes in the structure and function of proteins, of which rs13684622(C1002 R) was significantly associated with abdominal fat weight(AFW, P=0.0413) and abdominal fat percentage(AFP, P=0.0260) in chickens. Therefore, we are of the opinion that rs13684622(C1002 R) may be an essential functional SNP affecting chicken abdominal fat deposition, and potentially applied to improvement of broiler abdominal fat in molecular marker-assisted selection(MAS) program. Additionally, the coupling of association with computer electronic predictive analysis provides a new avenue to identify important molecular markers for breeders.     

两个贵州山羊品种GHSR和GHRL基因遗传变异及其与生长性状的关联性

【目的】探讨GHSR和GHRL基因作为山羊体重体尺性状候选基因的可能性,寻找与山羊生长性状相关的分子遗传标记。【方法】以贵州白山羊和贵州黑山羊为研究素材,采用DNA混合池结合PCR产物直接测序及PCR-SSCP技术检测GHSR和GHRL基因的单核苷酸多态性,利用SPSS (18.0)软件GLM统计模型分析基因SNPs不同基因型及合并基因型与贵州山羊生长性状的关联性,同时采用在线软件对GHSR基因进行生物信息学分析。【结果】在GHSR基因外显子2和3′UTR分别检测到G200A同义突变和T628C位点,而在5′UTR区和外显子1则未发现多态性。设计一对特异性引物对G200A位点进行PCR-SSCP分析,表现为3种基因型,依次命名为GG、GA和AA。GG基因型为优势基因型,在贵州白山羊和贵州黑山羊母羊群体中等位基因G为优势等位基因,其等位基因频率分别为0.6731和0.5243。而在贵州黑山羊公羊群体中A则为优势等位基因,其频率为0.5122。多态信息含量均表现为中度多态(0.25＜PIC＜0.50)。在GHRL基因内含子2处发现1个G141A突变,外显子2和外显子4处分别检测到2个同义突变(T78C和C14T),设计一对特异性引物对C14T位点进行SSCP分析,显示为2种基因型CT和CC。在所有试验群体中,CC基因型为优势基因型,其频率分别为0.7692、0.9417和0.9390,等位基因C为优势等位基因,其频率依次为0.8846、0.9709和0.9695,多态信息含量均显示为低度多态(PIC＜0.25)。χ²检验显示所有试验群体G200A和C14T位点基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡(P＞0.05)。关联分析表明,GHSR基因G200A位点与山羊体重、体高、体斜长和管围显著相关 (P＜0.05),纯合子GG基因型优势较为明显,贵州白山羊GG基因型个体的体高显著高于GA基因型个体和管围显著高于AA基因型个体(P＜0.05)。C14T位点贵州黑山羊 (公羊) CC基因型个体的体重、体高和胸围显著高于CT基因型 (P＜0.05)。组合基因型对体高和胸围指标的影响显著(P＜0.05),表现为CCGG合并基因型个体的体高显著高于CCAA合并基因型个体 (P＜0.05)。生物信息学分析揭露,GHSR基因5’UTR处未检测到核心启动子区和CpG岛,仅发现1个CAAT-box和部分潜在的转录因子结合位点,G200A导致mRNA二级结构发生明显变化。GHSR蛋白二级结构以α-螺旋为主 (48.90%),三级结构及跨膜螺旋结构预测表明该蛋白是膜蛋白。【结论】研究初步推测GHSR基因和GHRL基因多态性及合并基因型对山羊生长性状具有较显著的影响,G200A和C14T位点可作为山羊生长性状的有效遗传标记用于指导山羊的分子育种。     

PPARγ基因5'侧翼区单倍型与鸡生长和体组成性状的相关研究

 【目的】研究PPARγ基因5'侧翼区多态性及其单倍型效应对鸡生长和体组成性状的影响,寻找影响肉鸡生长和体组成性状的QTL,为分子标记辅助选择提供相应依据。【方法】以东北农业大学肉鸡高、低腹脂双向选择品系第8、9和10世代肉仔鸡为试验材料,采用测序、PCR-RFLP等方法进行多态性位点检测及基因型分析。利用基因型信息重构单倍型并分析不同单倍型与生长和体组成性状的关系。【结果】PPARγ基因5'侧翼区存在3个多态性位点（g.-1784_-1768del17,c.-1241G＞A及c.-75G＞A）,利用其构建的单倍型对腹脂重、腹脂率、肝脏重、肝脏比例、胫骨长、股骨重、龙骨长、跖骨围等性状有显著影响（P＜0.05）;对胸大肌重、胸小肌重、胸小肌率、跖骨长等性状具有一定的影响（P＜0.2）。最小二乘分析结果表明,对于腹脂重、腹脂率等性状,BGA单倍型个体显著高于其它单倍型个体（P＜0.05）;相对于其它单倍型个体,AAG单倍型个体有较高的肝脏重、肝脏比例、胸小肌重和胸小肌率（P＜0.05）;在股骨重、胫骨长、跖骨长、跖骨围、龙骨长等骨骼生长发育性状方面,AAG单倍型个体显著优于AGG单倍型个体（P＜0.05）。【结论】PPARγ基因5'侧翼区可能存在影响鸡脂肪性状的QTL,PPARγ基因可能是影响鸡骨骼性状的重要基因之一。     

The Study on Correlation Analysis of Single Nucleotide Polymorphism of IGF2 Gene and Body Fatness Traits in Chicken

Insulin-like growth factor Ⅱ has profound effects on the growth and differentiation of animal embryo. Some researches indicated that it affects the fat metabolism of poultry.This study was designed to investigate the effect of IGF2 on chicken fatness traits.Broiler, Hyline Brown layer and three native breeds (Shiqiza, Beijing You, Baier) were used in this research. Body weight and body composition traits were measured in broiler line at the age of 7 weeks. Primers for exon2 in IGF2 were designed from database of chicken genomic sequence. Polymorphisms were detected by PCR-SSCP and DNA sequencing.The total χ2 test results showed that there was a significant difference (P＜ 0.01) in the frequency of genotype among breeds. A C/G mutation at base position 139 was found among individuals in broiler line and the least square analysis showed that BB genotype birds had significant lower (P＜ 0.05) abdominal fat weight and percentage of abdominal fat than AA or AB genotype birds. From the results we can conclude putatively that IGF2 gene is the major gene affecting the fatness traits of chicken or it links with the major gene,and the mutation could be used as the molecular genetic marker to select the chicken for low abdominal fat.     

MC4R基因多态性与鸡生长和体组成性状的相关研究

黑素皮质素受体4(melanocortin4receptor,MC4R)是G蛋白偶联受体(GProteincoupledreceptors,GPCRs)超家族的一个成员,在人和鼠的体重、能量稳态和采食量的调控中具有重要作用。实验以东北农业大学建立的高低脂双向选择肉鸡品系为研究材料,采用PCR-SSCP和测序方法检测MC4R基因编码区的SNPs,结果在编码区发现1个G315T的突变。最小二乘分析表明,该位点基因型在高低脂系6世代中与7周龄体重、屠体重呈显著相关(P<0.05),多重比较显示,AA型个体的7周龄体重、屠体重显著高于AB型的个体(P<0.05);在高低脂系8世代中基因型与1、5、7周龄体重、屠体重、胸肌重、胸肌率显著相关(P<0.05),多重比较结果表明,AA型个体的5、7周龄体重、屠体重、胸肌重显著高于AB型和BB型个体(P<0.05)。由结果可初步推测MC4R基因可能是影响鸡早期生长和肌肉性状的主效基因或与主效基因相连锁。     

Haplotypes at the 5"-Flanking Region of Peroxisome Proliferator-Activated Receptor y Gene and Their Association with the Growth and Body Composition Traits in Chickens

Peroxisome proliferator-activated receptor y (PPARy) is an important regulator of chicken preadipocyte proliferation and differentiation. In this study, polymorphisms were detected by DNA sequencing, PCR-RFLP and some other methods and three polymorphisms (g.-1784_-1768de117, c.-1241G>A and c.-75G>A) were found in the 5' flanking region of PPARy gene.Growth and body composition traits were measured in the 8th-10th generation populations of the Northeast Agricultural University broiler lines were divergently selected for abdominal fat content. Polymorphisms among individuals were screened in the above populations. The haplotype-based association analysis on growth and body composition traits was carried out. The association analysis showed that haplotypes based on three polymorphisms at 5' flanking region of PPARy gene were significantly associated with abdominal fat weight (AFW), abdominal fat percentage (AFP, AFW/BW,),liver weight (LW), liver weight percentage (LFP, LW/BW,), shank length (ShL), femur weight (FeW), keel length (KeL), and metatarsus circle (MeC) (P<0.05) and suggestive significantly associated with pectoralis major weight (PMaW), pectoralis minor weight (PMiW), pectoralis minor weight percentage (PMiWP, PMiW/BW,), and metatarsus length (MeL) (P<0.2).The least square analysis showed that the birds with BGA haplotype had significantly higher AFW and AFP than the birds with other haplotypes (P<0.05). The birds with AAG haplotype had significantly higher LW and LW/BW than the birds with other haplotypes (P<0.05). The birds with AAG haplotype had significantly higher PMiW and PMiW/BW than the birds with other haplotypes (P<0.05). The birds with AAG haplotype had significantly higher ShL, FeW, MeL, MeC and KeL than the birds with AGG haplotypes (P<0.05). The results in this study revealed that QTL affecting fatness traits may exist in 5' flanking region of PPARy gene in chickens and PPARy gene might be one of the genes having important influences on the growth and bone traits in chickens.     

乌珠穆沁绵羊RIPK2基因多态性与生长性状的关联

【目的】基于前期绵羊肉用性状GWAS研究结果,旨在探讨RIPK2基因对乌珠穆沁绵羊生长性状的影响,找到该基因中与绵羊生长性状相关的分子标记,同时对GWAS结果进行验证。【方法】在343只乌珠穆沁绵羊试验群体中,选取其中30个个体的血液DNA样本,以相同浓度组成池DNA,设计引物对RIPK2基因外显子及其上下游1 000bp的调控区进行PCR扩增,PCR产物检测为目的条带后测序。使用DNAMAN和Chromas2软件对测序峰图进行分析,采用飞行质谱方法对检测到的SNP位点及前期GWAS得到的SNP位点进行基因型分型。使用Haploview软件对多态位点构建单倍型及连锁不平衡分析。使用SPSS （22.0）软件进行RIPK2基因SNP位点与生长性状间的关联分析。【结果】共发现了4个多态位点,A5536G的同义突变rs01位于第四外显子内,在该位点检测到三种基因型,AA基因型频率为0.42,AG基因型频率为0.45,GG基因型频率为0.13,优势等位基因为A,其频率为0.65;在第七外显子上检测到T8952C错义突变rs02,在该突变位点检测到3种基因型,其中TT基因型频率为0.82,TC基因型频率为0.16,CC基因型频率为0.02,T为优势等位基因,基因频率为0.9;在第十外显子检测到 T2836C的突变rs05,在该位点检测到两种基因型TT和CC,没有检测到杂合子基因型,TT基因型频率为0.25,CC基因型频率为0.75;上游调控区发现一个G5181C的突变rs30,有3种基因型,其中GC基因型频率为0.50,CC基因型频率为0.18,GG基因型频率为0.32,G为优势等位基因,其频率为0.58; GWAS得到的SNP位点是T4456C,在本研究中被命名为rs34,在该位点有3种基因型,其中TT基因型频率为0.49,TC基因型频率为0.37,CC基因型频率为0.14,优势等位基因T的频率为0.68。χ²适合性检验发现,除rs34位点外,其余位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P＞0.05)。rs02位点处于低度多态(PIC＜0.25),其余位点处于中度多态(0.25＜PIC＜0.5)。连锁不平衡分析发现,rs01和rs02位点强连锁,在群体中共构建了3种单倍型,AT 为优势单倍型,其频率为0.645,这两个位点共构建了6 种基因型组合,其中AATT为优势基因型组合,频率为0.425。单标记关联分析表明：rs01位点的AA、AG基因型的个体和GG基因型个体在4月龄体重、胸围上差异显著（P＜0.05）,在6月龄体高、胸围上差异显著(P＜0.05)。rs02位点CC基因型个体在4月龄体重、体高、胸围和6月龄胸宽上显著优于TT、TC基因型个体（P＜0.05),在4月龄体斜长、6月龄体高和体斜长上极显著优于TT、TC基因型的个体（P＜0.01）。rs30位点上,GG基因型的个体在4月龄体重、胸围与其他两种基因型个差异显著(P＜0.05),3个基因型的个体在6月龄胸围上均有显著差异（P＜0.05）。rs34位点的3个基因型的个体仅在4月龄体重上差异显著(P＜0.05)。rs01-rs02组合基因型关联分析发现：GGCC基因型组合的个体在4月龄体重、体高、体斜长、胸围上与其他基因型之间差异显著（P＜0.05）,GGCC基因型组合的个体在6月龄体高、体斜长、胸宽上与其他基因型组合的个体差异显著（P＜0.05）。【结论】RIPK2基因对绵羊生长性状具有较显著的影响,其SNPs作为分子标记对乌珠穆沁绵羊生长性状的选育具有一定的指导意义。     

猪POU1F1基因启动子区多态分析及其与生长性状的关联

 【目的】获得猪POU1F1基因启动子区的多态信息,揭示其在不同品种中的分布特点,阐明其与生长性状的关联性。【方法】采用PCR克隆、DNA测序和PCR-RFLP技术进行POU1F1基因启动子区多态分析,利用一般线形模型分析其与生长性状的关联性。【结果】在POU1F1基因1.5 kb的启动子区域内发现5个多态位点;其中,5 bp短片段插入或缺失突变的A等位基因频率在引入品种猪中最高,在培育品种中中等,在中国地方品种最低。一般线形模型分析表明,该多态位点与猪的生长性状存在显著相关。多重比较分析发现,AA基因型个体的体高、体长、胸围和体重显著高于AB和BB基因型个体（P＜0.05）,而AB和BB基因型个体的体高、胸围和体重差异不显著（P＞0.05）,但AB基因型个体的体长显著高于BB基因型个体（P＜0.05）。【结论】5 bp短片段插入或缺失突变的A等位基因是生长性状的优势等位基因,是生长性状可能的分子标记。