细菌分类鉴定方法的研究概况

对细菌常规鉴定法、细菌的数值分类和自动化鉴定、化学分类法和分子遗传学分类鉴定法作了具体的介绍和全面的总结 ,从而为临床和科研中细菌鉴定方法的选择应用提供参考依据。     

细菌分类学方法研究概况

对细菌分类鉴定中采用的传统分类法、数值分类法、化学分类法、遗传学分类法等多项分类技术作了详细的介绍和全面的总结,从而为临床和科研中选择和应用恰当的细菌分类鉴定方法提供参考依据。     

不同年限苜蓿根际土壤细菌群落的多样性

为研究不同年限苜蓿根际土壤细菌群落多样性及群落结构变化,选取了0、4年苜蓿的根际土壤,采用高通量基因测序技术研究其细菌构成。结果表明,4年苜蓿根际土壤中细菌分类单元(OTU)和多样性指数高于0年苜蓿,苜蓿连作会改变细菌群落数量及结构。通过主坐标分析(PCoA)及热图分析发现,不同年限苜蓿细菌群落差异性较大,连作后酸杆菌门、放线菌门、芽单胞菌门和绿弯菌门细菌群落丰度提高,变形菌门、拟杆菌门和厚壁菌门细菌群落相对丰度降低。     

关于植物群丛划分的探讨

在传统的植物群落分类系统中,群丛是植物群落分类的基本单位.从群丛分类的必要性出发,综述了传统植物群落分类系统中对群丛的定义及其划分方法,即在群丛的划分中主要依据群落中不同层片的优势种或特征种；但是在利用传统植物群落分类方法划分群丛时也存在一些不确定性因素,主要表现在确定群丛的特征种(组)时需要人为确定；同时,论述了当前植物群落数量分类的研究现状,分析了利用双向指示种分析法(TWINSPAN)、主成分分析(PCA)等数量分类方法划分群丛时存在的一些问题,主要表现在数量分类结果与传统分类单位的对应关系不能达到协调一致,无法判断是否划分到了群丛的水平.最后提出了群丛划分方法的展望:数量方法是基础,特征种(组)是及其数量特征是关键.     

农村居民生活垃圾分类意愿的影响因素研究——基于湖南省的调查数据

基于湖南省9个市(州)380户农户的调研数据,运用二元Logistic回归模型研究了农村居民生活垃圾分类意愿及影响因素。研究结果表明:63.9%的样本农户愿意对家庭生活垃圾进行分类处理,农村居民垃圾分类意愿是个体认知和外部情境因素的综合体现,垃圾分类必要性、垃圾分类知识、垃圾投放便利性、垃圾分类宣传、以及环境整治政策等因素对农村居民垃圾分类意愿都有显著影响。     

基于高光谱技术的细菌生物被膜分类检测

针对现有生物被膜检测方法耗时、费力、低效的问题，以大肠杆菌、金黄色葡萄球菌、沙门氏菌为例，研究荧光高光谱技术对不同细菌生物被膜进行种类识别和成膜能力评价的可行性。采集细菌生物被膜样本荧光高光谱图像，并基于5种方法预处理后的光谱数据建立支持向量机分类（support vector classification machine,SVC）和偏最小二乘判别分析（partial least squares discriminant analysis model,PLS-DA）细菌被膜分类检测模型。利用连续投影算法（successive projections algorithm,SPA）、竞争性自适应重加权算法（competitive adaptive reweighted sampling,CARS）分别提取特征波长并建立相应简化模型。结果显示：细菌生物被膜种类识别全波长和特征波长模型中SVC性能均优于PLS-DA，最优模型为None-SPA-SVC，校正集和预测集分类准确率均为96.67%。在细菌生物被膜成膜能力的全波长模型分类判别中，SVC算法整体上分类准确率优于PLS-DA；对于简化模型...     

DNA芯片技术在动物医学中的应用研究进展（摘要）

从基因表达谱研究、病原微生物检测、细菌分型、基因突变和多态学研究等多方面概述了DNA芯片技术在动物医学中的应用进展,并对DNA芯片技术的原理和分类进行综述。     

亚洲栽培稻分类研究进展

阐述了亚洲栽培稻( Oryzasative) 分类研究的意义,总结了分类研究的历史发展,结合目前的研究水平和现状,提出了今后研究的方向。     

高光谱遥感影像分类方法综述

该文简述了高光谱遥感影像分类的策略,主要有监督分类与非监督分类,基于分类判据的实现策略划分,硬分类和软分类,基于像素的分类和基于对象的分类,单分类器和多分类器集成。并简单介绍了一些分类方法,包括监督分类法(最小距离分类法、最大似然分类法和平行多面体分类法)、基于光谱相似性度量的分类方法、人工神经网络分类法、支持向量机分类、决策树分类、面向对象分类和非监督分类。     

植物炭疽病病原菌分类研究进展

本文评述了植物炭疽病病原真菌分类研究的主要进展和问题,其主要内容包括:(1)植物炭疽病菌的属名;(2)炭疽菌属Colletotrichum的分类地位;(3)炭疽菌属的分类系统。     

植物病原细菌分类最新进展

随着人们对植物病原细菌研究的不断深入,细菌分类一直处于一个变化的过程。除了传统的属被拆分成若干个属以外,新属也不断增加,植物病原细菌属的数量已增至近40个。革兰氏阴性细菌中,传统的欧文氏菌属(Erwinia)又分出了4个属:果胶杆菌属(Pectobacterium)、迪基氏菌属(Dickeya)、泛菌属(Pantoea)和布伦纳氏属(Brenneria),导致作物软腐病的胡萝卜果胶杆菌(Pectobacterium carotovorum)和黑腐果胶杆菌(P.atrosepticum)最初分别归在胡萝卜欧文氏菌胡萝卜亚种(Erwinia carotovora subsp.carotovora)和黑腐亚种(subsp.atroseptica);从假单胞菌属(Pseudomonas)中分出了雷尔氏菌属(Ralstonia)、伯克氏菌属(Burkholderia)和噬酸菌属(Acidovorax)。新种的命名更是层出不穷,迪基氏菌属中已陆续增至8个种,导致玉米细菌性茎腐病和水稻细菌性基腐病的病菌现名为玉米迪基氏菌(Dickeya zeae)。有些亚种或致病变种上升为种,导致西瓜细菌性果斑病的病原菌由燕麦噬酸菌西瓜亚种(Acidovorax avenae subsp.citrulli)变为西瓜噬酸菌(Acidovorax citrulli)。很多病原菌的学名经历了数次变更,棉花角斑病的病原原名为野油菜黄单胞菌锦葵致病变种(Xanthomonas campestris pv.malvacearum)和柑橘黄单胞菌锦葵致病变种(X.citri pv.malvacearum),现为地毯草黄单胞菌锦葵致病变种(X.axonopodis pv.malvacearum)。革兰氏阳性细菌家族的成员也在不断壮大。国内学者在学名使用上存在落伍和不规范现象。论文对近年来植物病原细菌分类体系的变化进行了梳理,并呈现了新老拉丁文学名的变化过程。关注植物病原细菌分类学的变化,有助于我们的研究工作与国际接轨。     

秦岭落叶松林真菌病害区系

对秦岭落叶松人工纯林真菌病害进行了系统调查，鉴定出病原真菌７６种，其中１新种（另文报道），１个寄主新记录，１０个陕西新记录种。病原以Ｐｈｙｌｏｓｔｉｃｔａ、Ｐｕｃｉｎｉａ、Ｃｏｌｅｏｓｐｏｒｉｕｍ、Ｍｅｌａｍｐｓｏｒａ属真菌为主；寄主以杨柳科、禾本科、松科等８科植物为主，并以叶部病害为多。林分不同层次（乔木、灌木、草本层）、不同海拔的落叶松林病害各有特点。草本层锈病居多；随海拔升高，林分病害趋于单一化     

植物病原真菌毒素的研究进展

植物病原真菌毒素能使寄主产生特定病症反应,在植物病害的发生、发展过程中具有明显的致病作用,因此越来越受到植物病理学家的重视.文章综述了近年来有关植物病原真菌毒素的研究进展,对其分离、纯化、化学结构、致病机理和应用方面的研究做了简要概括.     

植物病原真菌致病分子机理的研究进展

综述了植物病原真菌致病分子机理的研究进展,围绕植物病原真菌粘附寄主表面、侵染结构的形成、侵入寄主、在寄主内定殖与扩展四个侵入寄主的主要步骤,进行分子解析的阐明,有助于更好的评估病原真菌致病性的影响,并对今后的工作进行了展望.     

4个放线菌株对植物病原真菌的拮抗作用初探*

 4个放线菌株（143号、36号、15号、179号）菌丝研磨液，选用玉米大斑病菌(Exserohilum turcicum)、稻褐色杆腐病菌(Sclerotium oryzae-satvae)、柚子炭疽病菌(Colletotrichum gloeosporioides)和稻黑粒病菌(Curvularia lunata)作为供试病原菌，进行平板抑菌试验，结果表明4个放线菌株的菌丝研磨液对供试病菌均有不同的抑制效果。143号放线菌株对供试的4个病菌均有显著的抑菌作用，抑菌率分别达到95.7%，94.4%，87.2%和73.1%。试验表明抑菌方式不同，除36和15号放线菌株使稻褐色杆腐病菌菌丝生长较快和稀薄，不能形成菌核外，4个放线菌株均抑制供试病原真菌菌丝伸长。结果显示143和179号菌株的菌丝研磨液抑菌谱较广。     

四种真菌基因组编码的细胞壁降解酶生物信息学分析

为了比较病原性真菌和非病原性真菌基因组编码的植物细胞壁降解酶,用BLAST(Basic Local Alignment Search tool)结合人工二次筛选的方法确定了四种真菌基因组编码的多种植物细胞壁降解酶,并用SignalP来判断细胞壁降解酶能否被分泌到细胞外.结果表明病原性真菌和非病原性真菌基因组编码的植物细胞壁降解酶在种类和数量上存在着明显的差异,其中E3(endoglucanase Ⅱ)仅由病原性真菌基因组编码,而且能够被分泌到细胞外,可能与病原性真菌对植物的致病性有着密切的关系.     

植物病原真菌分子生物学研究进展

就近年来分子生物学技术在植物病原真菌研究中的进展进行了综述。内 容涉及植物病原真菌的种类鉴定、群体遗传、致病机理、发育调控及抗药性机制等方面，列举了代表性应用实例，并就植物病原真菌分子生物学研究的重要性及分子生物学技术在植物病原真菌研究中的广阔前景进行了展望。     

植物病原丝状真菌RGS的研究进展

G蛋白信号调控因子（RGS）作为G蛋白信号途径中发挥重要的负调控作用的蛋白，其功能主要表现影响真菌菌丝生长、产孢等发育阶段，以及次生代谢产物、色素合成等致病性方面。近些年，随着学术界对于植物病原丝状真菌RGS蛋白研究的不断深入，产生了大量的学术报道，然而，尚缺乏对模式真菌与植物病原丝状真菌中RGS蛋白系统性对比分析的研究报道。该文对模式真菌与植物病原丝状真菌RGS蛋白的结构、分类进行综述，并通过SMART保守结构域、二级结构组成情况以及遗传关系分析，明确了植物病原丝状真菌与模式真菌中的RGS蛋白均具有保守的RGS结构域以及相似的二级结构组成情况，以及根据RGS蛋白的序列同源性，明确真菌中RGS蛋白可分为6大类，具有不同结构域的RGS蛋白分别聚类。同时，对不同真菌中RGS蛋白功能进行综述，明确植物病原丝状真菌中RGS的数量和类型均多于模式真菌，RGS蛋白功能具有保守性和独特性特征。为今后学术界进一步开展植物病原丝状真菌中RGS蛋白的作用机制解析，以及植物病原丝状真菌与其他模式真菌中RGS蛋白之间的关系解析提供理论基础。      

植物病原真菌产漆酶菌株的筛选

 【目的】从常见植物病原真菌中筛选具有漆酶活性的病原菌,对相对酶活力较高的菌株进行漆酶致病力测定,为深入研究漆酶在植物病原真菌致病过程中所发挥的作用及病菌的扩展机理奠定基础。【方法】以2,2’-连氮-双[3-乙基苯并噻唑-6-磺酸](ABTS)为底物,通过平板显色反应筛选得到产漆酶的病原菌,同时利用苯胺蓝(Azure-B)脱色法确定目标菌株降解木质素作用,采用分光光度计法在420 nm下测定漆酶活性,最后利用组织病理学分析漆酶对病原菌致病力的影响。【结果】从20种重要植物病原真菌中筛选得到10种产漆酶的病原菌,且均具有降解木质素的作用,对其中6种颜色变化不同的病原菌进行漆酶活力测定,发现玉米大斑病菌的胞内漆酶活力最高,为18.984 U?mL-1,小孢拟盘多毛孢的胞外漆酶活力最高,为0.919 U?mL-1。致病力测定表明,在玉米大斑病菌的致病过程中,漆酶可以氧化玉米叶片并能够促进病原菌在寄主组织中的扩散。【结论】在产漆酶的植物病原真菌中,漆酶大多以胞内酶形式存在,并具有降解木质素的作用,漆酶可以促进玉米大斑病菌在寄主组织中扩展。     

土壤中木霉的分离纯化以及对植物病原真菌的拮抗研究

从土壤中分离纯化获得3个木霉集合种:哈茨木霉(Trichoderma harzianum),绿色木霉(Trichoder-ma viride)和绿木霉(Trichoderma virens)。用这3种木霉菌分别与小麦纹枯病菌(Rhizoctonia solania)和番茄灰霉病菌(Botrytis cinerea)作平板对峙培养及显微观察,测定木霉菌对病原菌的抑制作用。结果表明:3种木霉菌对供试的2种病原菌抑菌强度不同,其中绿木霉对小麦纹枯病菌和番茄灰霉病菌都具有较好的拮抗作用;显微观察到木霉菌对病原菌菌丝的缠绕、使病原菌菌丝细胞质变稀薄、菌丝解体等现象。