宏基因组学在红树林土壤微生物研究中的应用

红树林的土壤微生物群落蕴藏丰富的自然资源,但传统研究方法复杂、低效,而且只能获得极不完全的小部分信息,近年来兴起的宏基因组学克服了这些缺点。介绍了宏基因学的主要研究方法,在此基础上总结了宏基因组学在红树林土壤微生物多样性、空间分布特征、土壤理化性质与微生物群落结构之间的关系、土壤微生物代谢产物4个方面的具体应用,最后对该领域未来的研究方向提出了展望。     

宏基因组学——研究环境微生物的钥匙

介绍了宏基因组学的发展概况、基本研究方法和在微生物研究中的应用,并对该学科的发展前景进行了展望。     

水体宏基因组学研究进展及应用

微生物是水体生态系统中不可或缺的一环,占生物基因资源的绝大多数。目前传统的微生物研究手段只能培养0.1%-1%的环境微生物,无法整体分析水体微生物群落的构成和功能,形成了水体治理研究的瓶颈。近年来,不依赖于培养的微生物研究手段即宏基因组学的出现为解决这一难题提供了新方法。一方面宏基因组学技术可以用于研究水体的生物多样性、微生物系统中的物质代谢历程这些为研究水体污染的治理提供了可能;另一方面,用宏基因组学方法从水体中发现新型微生物来源酶具有极高的应用价值。虽然宏基因组学仍存在一些问题和不足之处,但是近年来也取得了巨大的成就,该文综述了宏基因组学的概念、方法、问题和水体宏基因组学研究进展。     

土壤微生物的宏基因组学及其研究进展

土壤宏基因组学技术是近来发展比较迅速的一种新方法,是研究土壤微生物生态学的基础,也是获是土壤中各种基因资源的一种有效手段。介绍了土壤宏基因文库的构建、筛选及土壤宏基因组研究现状和这一技术的局限性。     

微生物区系的功能基因组研究方法学

微生物在生态环境中具有重要作用,与整个生态系统中物质循环和能量流动密切相关。目前微生物区系的研究不断揭示环境样品中微生物群体的结构和功能。系统生物学研究思路不断地被引入进来,例如微生物区系基因组学、宏蛋白组学、生物信息学等。后基因组研究将对微生物区系的发展起到极其重要的作用。文章对应用到微生物区系研究的一些生物学方法进行了综述。     

西北高海拔地区放养偶蹄类动物肠道微生物多样性的宏基因组比较研究

[目的]分析西北高海拔地区偶蹄类动物肠道的微生物多样性。[方法]从动物粪便样品中提取全部微生物的DNA,利用宏基因组学方法,通过高通量测序及生物信息学分析对肠道微生物多样性及群落功能进行比较。[结果]在相似的地理环境下,不同物种偶蹄类动物的肠道微生物多样性存在高度的相似性,暗示着生存环境对动物肠道微生物的多样性发挥着重要影响。[结论]该研究初步阐明了西北地区高海拔环境下不同种类动物的肠道微生物多样性,为进一步了解高原环境中微生物的构成提供了重要参考。     

宏转录组学在微生物生态学研究中的应用

宏转录组学是一门在整体水平上研究某一特定环境、特定时期群体生物全基因组转录情况以及转录调控规律的学科。概述了新兴的宏转录组学在微生物生态学研究中的进展,并总结了其与微生物宏基因组学研究方法相比的优缺点。宏转录组学是一种新颖有效的方法,在微生物生态学,甚至在复杂微生物群落的生态学研究中都具有广阔的应用前景。     

根际固氮微生物功能基因组及微生物肥料研究进展

固氮微生物为植物提供了大量的氮素来源,开展生物固氮的研究对缓解我国粮食短缺、能源消耗、环境污染等重大社会问题具有重要意义。综述了国际上关于固氮微生物功能基因组学以及微生物肥料产业的发展状况,并以巴西、阿根廷等国家在农业生产中的节肥增产的成功经验进行了案例分析。针对目前我国微生物肥料产业的发展状况以及行业前景提出了建设性意见,认为在功能基因组学平台上加强对固氮微生物基因表达调控及与宿主互作机制的研究将为后续开发性能优良的高效固氮、综合抗逆的固氮微生物工程菌株奠定重要理论基础。     

养猪发酵床微生物宏基因组基本分析方法

养猪微生物发酵床分解猪粪、消除恶臭,将猪粪形成生物菌肥,实现了养猪污染的微生物治理和猪粪的资源化利用,微生物起到关键作用。然而,关于发酵床微生物群落的种类、数量、结构等方面系统研究鲜见报道。课题组采用高通量宏基因组学方法,系统地开展了微生物发酵床的微生物组研究,揭示不同空间、不同深度、不同发酵程度、不同垫料组成、不同季节发酵床中的微生物组成及其区系演替规律。本文就相关的宏基因组测序的样本采集、样本处理、测序原理、分析模型、数据统计、结果表述等分析流程和方法进行了归纳,阐明微生物组操作分类单元(OTU)鉴定,物种累积曲线,核心微生物组,种类丰度主成分分析,种类秩-多度曲线,物种组成丰度柱状图、热图、星图等分析的原理与方法,列举微生物组种类复杂度α-多样性分析、β-多样性分析、种类显著性差异LEfSe分析,冗余分析等实例,为深入研究发酵床微生物群落提供了完整的分析思路和范例。     

第五届全国微生物基因组学及合成微生物学学术研讨会

<正>微生物基因组学及合成微生物学已成为当前生物学前沿的研究热点。为了及时交流研究进展,加强合作,推广新的研究技术和分析方法,推动我国在该领域研究的进步,"第五届全国微生物基因组学及合成微生物学学术研讨会,暨陈华癸先生诞辰100周年纪念大会"将在武汉召开。热忱欢迎全国各地的微生物基因组学及合成微生物学专家、同行参会,交流学术研究成果。一、会议组织:中国微生物学会华中农业大学农业微生物学国家重点实验室;武汉大学组合生物合成与新     

超级稻新品种淮稻11号的选育及高产栽培技术

[目的]为徐淮地区优质水稻新品种的选育和生产利用提供技术支持。[方法]供试种子参加了2004～2007年江苏省中熟中粳稻预备试验和区域试验及迟熟中粳稻生产试验。[结果]徐淮11号在预备试验中的平均产量为9375.0kg/hm2;在区域试验中的平均产量为8682.0kg/hm2;在迟熟中粳稻生产试验中的平均产量为9439.5kg/hm2。淮稻11号在大面积示范试种中的一般产量为9750.0kg/hm2。淮稻11号分蘖成穗率和颖花分化能力均较高,有效穗数为285万穗/hm2,每穗实粒数为120～130粒,千粒重高达28.0～29.0g,结实率为90.0%。淮稻11号的糙米率为84.3%,整精米率为72.0%,垩白率为10.0%,垩白度为1.0%,碱消值为7.0,直链淀粉含量为18.4%,胶稠度为76mm,透明度为2级,综合品质评价达国标2级优质米标准。[结论]该试验成功选育出了超级稻新品种淮稻11号并为其推广种植提供了技术指导。     

宁夏引种金银花与原产地金银花中绿原酸和总黄酮含量的比较测定

[目的]为宁夏引种金银花的质量评价和质量控制提供依据。[方法]以原产地山东省平邑县和引种地宁夏自治区贺兰县不同花期的金银花为试材,HPLC测定绿原酸含量,分光光度法测定总黄酮含量,并进行比较分析。[结果]引种地金银花大白期绿原酸含量最高,为3.792%。原产地金银花银花期绿原酸含量最高,为4.076%。原产地金银花二白期和银花期绿原酸含量明显高于引种地。原产地金银花各个花期总黄酮含量均明显高于引种地,原产地以金银花二白期总黄酮含量最高,为1.968%,引种地以金银花金花期总黄酮含量最高,为1.683%。以上差异因山东平邑和宁夏贺兰的最低月均气温、年均降水、海拔等生态因素存在较大差异所造成的。[结论]原产地与引种地金银花中的绿原酸、总黄酮含量存在差异。     

黔西南优质烤烟种植分区农业气象关键因子研究

[目的]为黔西南地区优质烤烟种植提供技术指导。[方法]通过分析黔西南烤烟主要种植区的温度、降水、日照条件考察了黔西南烤烟产量和质量的影响因子。[结果]Ⅰ区海拔高度为1 450～1 650 m,≥20℃的天数为80 d左右,活动积温为1 200～2 100℃,年均温为13.5～14.6℃。Ⅱ区海拔高度为1 300～1 450 m,≥20℃的天数为110 d左右,活动积温为2 100～2 700℃,年均温为14.6～16.3℃。Ⅲ区海拔高度为1 050～1 300 m,≥20℃的天数为150 d左右,活动积温为2 700～3 600℃,年均温为16.3～17.0℃。Ⅳ区分两个区,一区海拔高度〈1 000 m,≥20℃的天数〉160 d,活动积温〉3 600℃,年均温为〉17.5℃;二区海拔〉1 700 m,基本无连续≥20℃日数,年均温〈13.0℃。[结论]该研究提出了各海拔区域的优质烤烟种植农业气候指标条件,为贵州发展烤烟生产提供了参考。     

东北地区虫草属二新记录种

报道了采自长白山的吹泡虫虫草(Cordyceps tricentri Yasuda)和蜻蜓虫草(Cordyceps odonatae Kobayasi)东北地区虫草属二新记录种。吹泡虫虫草的子座单生于寄主的胸部，浅黄色；产孢部位棒状或椭圆形；子囊壳埋生，瓶状，孔口稍外突；孢子线形，成熟后断裂成次生孢子，此前在国内仅见于浙江、河北、云南、广东、贵州、安徽省。蜻蜓虫草的子座单生于寄主胸部，浅黄色，柄多弯曲，产孢部位长椭圆型，有纵沟；子囊壳埋生，瓶状。孔口疣状微突起；孢子线形，成熟后断裂成柱型次生孢子，此前在我国仅见于贵州省。此2种虫草在中国东北均首次发现。     

壬酸水溶液对云南木蠹象幼虫拒食作用研究

[目的]为防治云南木蠹象找到无公害的新型药剂。[方法]按内比法将90%壬酸配成所需浓度,用非选择性拒食法测定药剂的拒食作用,以幼虫校正死亡率为指标评价拒食效果。[结果]保湿饲养法的死亡率回归方程为y1=4.883+0.292x,相关系数为0.408,LC50=2.517 7 mg/L,其拒食率回归方程为y2=4.562+0.337x,相关系数为0.423,AFC50=19.952 6 mg/L。喷枝保湿饲养法的死亡率回归方程为y3=4.388+0.793x,相关系数为0.373,LC50=5.915 6 mg/L,其拒食率回归方程为y4=5.175+0.274x,相关系数为0.420,AFC50=0.229 6 mg/L。2 000 mg/L壬酸水溶液的初始死亡率和最高死亡率最高,达到最高死亡率的时间最佳,1 000 mg/L次之。2 000mg/L壬酸水溶液的致死中时间最短,为6.9 d,而对照的致死中时间最长,为53.7 d。[结论]2 000和1 000 mg/L壬酸水溶液的拒食作用较好。     

黄粉虫粪和蚕沙的常规营养成分分析

采用饲料常规养分分析方法对黄粉虫粪和蚕沙非常规饲料样品中的干物质、粗蛋白质、粗脂肪、粗灰分、钙和磷含量进行测定,并将黄粉虫粪与玉米粉、鱼粉,蚕沙与玉米粉、豆粕的营养成分进行比较。结果表明:黄粉虫粪粗灰分比鱼粉低,显著高于玉米粉;粗蛋白含量显著低于鱼粉,但显著高于玉米粉;粗脂肪含量显著低于鱼粉;钙含量比玉米粉和鱼粉均高;磷含量显著高于鱼粉和玉米粉;干物质含量显著低于鱼粉。蚕沙粗灰分含量显著高于豆粕和玉米粉;粗蛋白含量显著高于玉米粉,低于豆粕;粗脂肪含量显著高于豆粕;钙含量显著高于玉米粉和豆粕;磷含量显著低于豆粕;干物质含量均显著高于玉米粉和豆粕。     

水稻倒伏扶扎对产量及其产量构成的影响

[目的]探究水稻倒伏后的扶扎效果。[方法]通过不同时间倒伏水稻的扶扎试验,分析扶扎对倒伏水稻产量及其构成因素的影响。[结果]与倒伏未扶扎相比,9月23日,倒伏扶扎水稻的结实率低4.27个百分点,千粒重低2.58 g,减产9.30%;9月30日,其结实率高5.99个百分点,千粒重低0.54 g,增产8.97%;10月6日,其结实率高9.13~9.40个百分点,千粒重高0.54~1.00 g,增产12.79%~15.91%。9月23日,倒伏扶扎连6号较倒伏未扶扎的总粒数少12.3粒,实粒数低11.77粒;9月30日,倒伏扶扎连6号较倒伏未扶扎的实粒数高,瘪粒数低。连9号倒伏未扶扎的实粒数最少,瘪粒数最多。[结论]与倒伏未扶扎水稻相比,灌浆前期倒伏扶扎水稻减产,灌浆后期倒伏扶扎水稻的增产效果明显。     

籼稻温敏核不育系皖2311S的选育·育性·特征特性

[目的]介绍籼稻温敏核不育系皖2311S的选育过程、育性表现和农艺性状。[方法]以籼稻温敏核不育系2301S为母本,与籼稻品系3401杂交,经5年8代选择育成籼稻温敏核不育系皖2311S(简称2311S)。[结果]2009年8月3日至9月21日2,311S表现雄性不育,镜检花粉败育率99.93%～100.00%,套袋自交不结实,稳定不育期50 d。2010年7月21日至9月6日,表现雄性不育,镜检花粉败育率99.82%～100.00%,套袋自交不结实,稳定不育期48 d9,月8～10日表现雄性可育,镜检花粉败育率97.11%～99.93%,套袋自交结实率0.24%～1.08%9,月13～21日,又表现雄性不育,镜检花粉败育率99.73%～100.00%,套袋自交不结实。2011年7月8日至9月21日,连续表现雄性不育,镜检花粉败育率99.55%～100.00%,套袋自交结实率0.00%～0.13%。长日不育起点温度低于23.0℃。[结论]该不育系稳定不育期30 d以上,米质优,比较适宜选配中籼优质米组合。     

野生大百合的引种适应性研究

[目的]为在苏州地区引种大百合,丰富该地区百合科球根花卉的种类提供理论依据。[方法]在为期2年的大百合引种试验中观察其适应性,并进行鳞茎繁殖试验。[结果]11月至翌年1月为其休眠期。其鳞茎中央芽2月中旬开始萌动,3月初破土．1个月后株高约为25cm。4月上旬茎节开始伸长,直立茎顶端花芽已经形成。4月下旬株高可达1m,花芽高10cm。5月10日前后进入始花期。1周后进入盛花期,6月初花谢子房开始膨大。6月下旬果实长至7cm左右,色泽加深。疏林下生长的大百合平均株高达1．73m,光照充足时平均株高为1．51m。疏林下生长的大百合单株花朵数为16．88朵,花序长为16．17cm,平均开花天数为24d;光照充足时单株花朵数13．16朵,花序长为14．96em,平均开花天数为18d。[结论]该研究对在园林绿化中推广应用野生大百合具有重要意义。     

乐东拟单性木兰木材物理力学性质的研究

对福建省南平市延平区23年生以上的乐东拟单性木兰木材的物理力学性质进行测定和分析.结果表明:乐东拟单性木兰木材密度、干缩性、综合强度均属中等水平,其基本密度和气干密度分别为0.579和0.708 g·cm-3,体积干缩系数为0.516,抗弯强度为134.8 MPa,顺纹抗压强度为61.94 MPa,综合强度为196.7...