不同生长年限桔梗根部内生细菌种群结构分析

[目的]分析不同生长年限桔梗根部内生细菌种群结构及多样性,为深入理解植物—微生物互作和挖掘可培养细菌资源,建立功能细菌资源库提供理论支持.[方法]采用Illumina MiSeq高通量测序技术,对1~3年生桔梗根部内生细菌的16S rDNA V3~V4区进行PCR扩增,对PCR产物进行高通量测序.使用QIIME软件统计不同样本的群落丰富度(Chao1指数和ACE指数)及多样性(Shannon指数和Simpson指数),运用R软件计算各样本共有OTU数量,并通过Venn图呈现各样本共有和独有OTU数量.同时,借用热图和LEfSe进行不同样本间的差异显著单元分析,共同阐述不同生长年限桔梗根部内生细菌种群的多样性变化规律.[结果]不同生长年限桔梗根部内生细菌种群结构及多样性存在一定差异.随着生长年限的增加,桔梗根部内生细菌的丰富度及群落多样性持续降低,桔梗根部内生细菌特有的OTU数量持续减少.1~2年生样本的优势菌群为变形菌门(Proteobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)、蓝细菌门(Cyanobacteria)和放线菌门(Actinobacteria),3年生桔梗根部以变形菌门、厚壁菌门、蓝细菌门和栖热链球菌门(Deinococcus-Thermus)为优势菌群.变形菌门的相对丰度在3个样本中最高,分别为76.35%、82.38%和86.46%.1年生桔梗根部内生细菌中变形菌门的相对丰度显著低于2年生和3年生样本(P<0.05),2年生与3年生桔梗样本间差异不显著(P>0.05).芽孢杆菌属(Bacillus)、慢生根瘤菌属(Bradyrhizobium)及Dyella的相对丰度在1年生桔梗中最高,假单胞菌属(Pseudomonas)的相对丰度在3年生桔梗样本中最高.[结论]桔梗根部内生细菌具有丰富的多样性,不同生长年限桔梗根部内生细菌的群落结构不同,随着生长年限的增加,桔梗内生细菌的特有OTU、丰富度和群落多样性持续降低.生长年限是造成桔梗内生细菌种群结构及多样性变化的因素之一.芽孢杆菌属、慢生根瘤菌属、假单孢菌属及Dyella可作为可培养细菌资源进行深入研究.     

3种杀菌剂对小白菜内生细菌多样性的影响

应用末端标记限制性片段长度多态性(T-RFLP)技术,分析比较了3种杀菌剂代森锌、恶霉灵、农用链霉素分别对小白菜喷雾处理后,其根、茎、叶内生细菌多样性的变化。结果表明:小白菜根部内生细菌较丰富,茎部较少;杀菌剂处理后叶片内细生菌多样性变化最复杂,先刺激后抑制内生细菌多样性;恶霉灵对小白菜茎的影响最大,其内生细菌多样性明显增加,根部内生细菌多样性有所增加,叶部内生细菌多样性先增加后降低;农用链霉素处理后可使小白菜根、茎内内生细菌多样性明显降低,叶片处理后内生细菌多样性先增加后降低,之后趋于平缓;代森锌对小白菜根、茎内生细菌也有抑制作用,对叶片内内生细菌多样性有先增加后降低作用;根、茎、叶内的优势种群主要为Clostridium(梭菌属)、Fusobacterium(梭菌属)、Halobacillus(喜盐芽孢杆菌)、Lactobacillus(乳杆菌属)、Nostoc(念珠蓝细菌属)、Sphingomonas(鞘氨醇单胞菌属)、Synechocystis(集胞蓝细菌属)。处理后14 d各处理与对照差异不明显,种群结构趋于稳定。     

油樟内生细菌的多样性及抑制植物病原菌初步研究

从油樟（Cinnamomum longepaniculatum）根茎叶中分离得到203株内生细菌,通过形态观察选出形态特征不完全相同的68株内生细菌（根56株、叶9株、茎3株）,初步显示油樟中内生细菌具有多样性和器官特异性的特点。通过平板拮抗的方法,对选择出的68株内生细菌进行抑制植物病原真菌试验。68株内生细菌中有17株（全部分离自根部）对辣椒疫霉菌（Phyto phthora capsici）、胶孢炭疽菌（Colletotrichum gloeosporioides）、禾谷镰刀菌（Fusarium graminearum）、大斑凸脐蠕孢菌（Exserohilum turcicum）等4种植物病原真菌中的至少1种有抑制作用。这些内生细菌对辣椒疫霉菌的抑制效果最好,对胶孢炭疽菌的抑制效果最差。     

植物内生菌资源多样性研究进展

植物内生菌是植物微生态系统的重要组成部分,植物内生菌资源丰富多样.对内生菌的起源、概念、内生菌多样性、寄主植物多样性、内生菌生理功能多样性、植物内生菌检测方法多样性等进行总结.植物内生菌是人类开发自然的另一微生物资源宝库,对其进行深入研究对农业、环保、医药等领域的发展具有重要意义.     

油樟内生细菌的多样性及抑制植物病原茵初步研究

从油樟(Cinnamomum longepaniculatum)根茎叶中分离得到203株内生细菌,通过形态观察选出形态特征不完全相同的68株内生细菌(根56株、叶9株、茎3株),初步显示油樟中内生细菌具有多样性和器官特异性的特点.通过平板拮抗的方法,对选择出的68株内生细菌进行抑制植物病原真菌试验.68株内生细菌中有17株(全部分离自根部)对辣椒疫霉菌(Phytophthora capsici)、胶孢炭疽菌(Colletotrichum gloeosporioides)、禾谷镰刀菌(Fusarium graminearum)、大斑凸脐蠕孢菌(Exserohilum turcicum)等4种植物病原真菌中的至少1种有抑制作用.这些内生细菌对辣椒疫霉菌的抑制效果最好,对胶孢炭疽菌的抑制效果最差.     

油菜内生细菌种群多样性分析

植物内生细菌(Endophytic bacteria)指定殖在植物组织内部但不引起明显病害症状的细菌。内生细菌对其宿主具有许多生物学作用,如促进植物生长,帮助植物抵抗病虫害侵袭等,因而植物内生细菌概念提出的时间虽然较短,但已引起了多学科科学家们的广泛关注。本研究对油菜不同组织器官中的内生细菌进行了系统分离并初步归类,利用16S rD-NA序列系统发育分析对分离获得的内生分离物进行了鉴定。从健康油菜的根、茎、叶、柄部位共分离获得122株内生细菌,其中根部分离到29株,叶部25株,叶柄24株,茎部44株。根据菌落大小、形态、颜色、突起特征、边缘特…     

植物内生菌对植物生长的影响

目前,国内对植物内生菌的研究愈演愈热,在植物内生菌对于植物生长的影响机制方面的研究也更加深入,植物内生菌的种类繁多,生长方式多种多样,其中包括内生真菌、内生细菌和内生放线菌。据报道,植物内生菌所分泌的活性代谢物多种活性,具有抗菌、促生长、抗病毒、抗氧化等很多功能。本文概括了近年来对于植物内生菌研究所取得成果,分析讨论了植物内生菌的生物防治作用,内生菌对于增强植物的抗逆作用和对病害的防治作用,为以后在植物内生菌方面的研究和内生菌资源的开发利用提供理论依据。     

不同栽培模式人参根内生菌群落多样性分析

人参内生菌广泛存在于健康人参组织内部,是其微生态系统的重要组成部分。为了全面真实客观评估人参内生菌的多样性和资源开发的潜力,采用第二代高通量测序技术分析野生抚育模式(MCG)、农田栽参模式(FCG)及伐林栽参模式(DSGP) 3种不同栽培模式下人参根部内生菌的丰度和多样性。研究发现,3种栽培模式下人参共有内生细菌OTUs 108个(占比22. 27%),共有内生真菌OTUs 218个(占比16. 50%)。野生抚育模式人参根部内生细菌和内生真菌的群落指数Chao1、ACE、Shannon指数值均高于伐林栽参模式,而农田栽参模式下这3种指数最低。农田栽参模式Simpson指数最高。通过相对丰度分析发现,人参根部相对丰度最高的内生真菌类群为子囊菌门(Ascomycota)(80%);内生细菌相对丰度最高的类群为变形菌门(Proteobacteria)(78%)。研究结果表明栽培模式显著影响人参内生菌的形成和多样性。     

植物内生细菌及其生物防治植物病害的研究进展

综述了植物内生细菌及其生物防治植物病害的研究进展。植物内生细菌分布广,种类多,存在于大多数高等植物中,已在生物防治细菌性病害、真菌性病害和线虫病害方面发挥了巨大的作用。植物内生细菌的防病机理主要通过与病原菌竞争生态位和营养物质、产生抗菌活性物质以及诱导植物产生系统抗性等多种作用方式。同时,对植物内生细菌防治植物病害存在的问题及未来发展前景进行了讨论。     

东北地区羊耳蒜根部内生真菌多样性研究

兰科植物的生长发育离不开其根部内生真菌的共生。为探明羊耳蒜(Liparis japonica)根部内生真菌种类和多样性规律,选取东北地区7个不同地理种群的羊耳蒜植株进行根部内生真菌的分离、培养,根据形态特征和ITS序列进行种类鉴定及其多样性与环境因子的相关性分析。共分离到内生真菌9个类群201个菌株,其中大部分菌株属于Tulasnella和Sordariomycetes真菌,在所调查的地理种群中均有分布,而其余7类真菌为稀有属。不同地理种群羊耳蒜根部内生真菌的多样性无显著差异,但CBS种群分离得到的真菌类群较少。各地理种群根部内生真菌的类群数量和多样性均与羊耳蒜株高呈显著正相关,推测内生真菌种类越丰富对宿主的促生作用越明显。而Tulasnella真菌作为目前公认的兰科菌根真菌,其相对多度受环境因子影响较小,在一定程度上验证了该类真菌在土壤中存在的广泛性及与宿主羊耳蒜共生的专一性。结论认为东北地区羊耳蒜根部内生真菌资源丰富,并能与宿主形成良好的共生关系。     

白骨壤内生细菌的多样性及其抑菌活性分析

【目的】分析红树植物白骨壤(Avicennia marina)内生细菌的多样性并检测其抗菌活性,为红树植物微生物资源的开发利用提供理论依据。【方法】以广西北部湾北仑河口红树植物白骨壤为试验材料,通过传统稀释涂布法和16S rRNA序列鉴定分析其内生细菌的多样性;通过发酵得到内生细菌中的次级代谢产物,并采用牛津杯法测试内生细菌次生代谢产物对5种病原菌的抑菌活性。【结果】从白骨壤的果实、花、根、叶和皮等部位共分离到61株内生细菌,隶属于3门4纲12目16科20属36种,其中有8株潜在新种,放线菌是白骨壤内生细菌的优势类群。各部位的内生细菌数量排序为果实花皮根=叶,果实的内生细菌共10个属,占总属数的50.00%。36株细菌至少对1种指示菌株具有抑菌活性,有4株细菌具有广谱抑菌活性,其中文昌小单胞菌YA350对枯草芽孢杆菌和扩展青霉的抑菌活性最强。【结论】从白骨壤的果实、花、皮、根和叶部位分离得到的内生细菌多样性较丰富,且部分具有广谱抑菌活性,可作为开发新型生物活性化合物的重要来源。     

植物内生细菌的应用研究进展

近年来植物内生细菌受到越来越多的关注。对植物内生细菌分离研究的历史作了简要的介绍,并概述了内生细菌的多样性及其应用,提出了植物内生细菌的研究中可能出现的问题,展望了其应用前景。     

植物内生细菌研究进展

内生细菌是植物病害生物防治的天然资源菌,是植物微生态系统的重要组成部分,具有广阔的理论研究价值和开发应用前景.本文从植物内生细菌的概念、生物学作用及其机制等方面对近年来植物内生细菌的研究现状进行了综述,并展望其开发与应用前景.     

淹水胁迫对秋华柳内生细菌抗氧化能力的影响

以三峡河岸带植物秋华柳(Salix variegata)为研究对象,分离了其在淹水胁迫前后不同部位的内生细菌,在测定其总抗氧化能力的基础上,对部分具高抗氧化能力的内生细菌进行了生物学鉴定。结果共分离获得105株内生细菌,其中淹水前共分离54株,淹水后共分离51株。分析表明秋华柳内生细菌的多样性程度较高,无明显组织偏爱性,而且其丰富度和多样性不会显著受淹水胁迫影响。抗氧化试验结果表明,72 h是测定秋华柳内生细菌总抗氧化能力的最佳时间,淹水胁迫后的内生细菌抗氧化能力强,根部的内生细菌抗氧化能力强。筛选出2株具强抗氧化能力的内生细菌sar3和sar4,其发酵液的抗氧化值达到40 U/m L,生物学鉴定结果显示,这2株菌都是耐寒短杆菌(Brevibacterium frigoritolerans)。     

药用植物青阳参可培养内生菌分离与多样性分析

[目的]从云南民间药用植物青阳参的根、茎和叶中分离内生菌,并且进行初步分类鉴定,对分离出的内生菌多样性进行分析.[方法]利用平板分离法分离内生细菌和真菌,通过菌落形态、革兰染色形态观察和生理生化特征鉴定细菌,根据显微形态观察分类鉴定真菌.[结果]从植物根、茎和叶中共分离获得56株内生菌,包括22株细菌和34株内生真菌.22株内生细菌经鉴定归属于6个属,25株真菌经鉴定归属为5目7科12个属.[结论]青阳参植物内生菌存在多样性.不同部位内生菌的数量、组成与种群分布存有差异.该研究为青阳参资源的开发利用提供了理论依据.     

热带地区植物内生真菌生物多样性研究进展

植物内生真菌是指在其生活史的一定或全部阶段生活于健康植物体内部的真菌。内生真菌具有重要的生物学和生态学作用。简要介绍了热带地区植物内生真菌研究概况、资源多样性、寄主选择,并对热带内生真菌生物多样性的发展前景作了分析。     

植物内生菌及其对植物病害的防治作用综述

植物内生菌分布广、种类多,几乎存在于目前已研究过的所有陆生及水生植物中,内生菌次生代谢产物丰富,在植物病害生物防治方面发挥着巨大作用。本文综述了植物内生菌的种类和多样性,植物内生菌对植物病害的防治作用及其防病机制;同时,对植物内生菌在植物病害生物防治中的应用前景及存在的问题进行讨论,以期为植物内生菌资源的开发利用提供参考。     

植物内生细菌作为生防因子的研究进展

对植物内生细菌作为生防因子的研究进展进行了综述,探讨了内生细菌在植物抗病性方面的作用机理;讨论了植物内生细菌在实际应用中存在的问题及发展方向。     

乙酰甲胺磷对菠菜内生细菌的影响

用传统法分离了喷施与未喷施乙酰甲胺磷菠菜的内生细菌,应用细菌16S r DNA全序列分析,探讨杀虫剂对植物内生细菌的影响。结果表明:喷施乙酰甲胺磷后显著减少了菠菜叶部可培养内生细菌的数量,一定程度上减少了菠菜根部可培养内生细菌的数量。喷施乙酰甲胺磷后菠菜共分离获得24株内生细菌,鉴定为6属7种,另有3株可能是新种或新属,其中2种特异性菌株分别为蒙氏假单孢和阿氏节杆菌。未喷施乙酰甲胺磷菠菜内分离获得35株内生细菌,鉴定为14属16种,另有6株为可能的新种或属。因此,喷施乙酰甲胺磷后减少了可培养内生细菌属水平上的多样性。     

植物内生细菌及其对入侵生态学的启示

植物体内往往生存着许多内生微生物,其中内生细菌属于主要的成员,它们与宿主植物长期协同进化,在演化过程中与植物形成了互惠共生关系,对宿主植物有固氮、促生、抗病、抗逆等多方面的有益作用,因此植物内生细菌已经成为了植物微生态系统中的重要组成部分.最近十几年,关于外来入侵植物的研究已经取得极大进展,但相关研究主要集中在入侵植物与本地植物的竞争、入侵植物对入侵地取食动物的防御能力等方面,而关于入侵植物与其内生菌(特别是内生细菌)关系的报道则极少见.植物内生菌不仅对工业、农业、医学等领域的研究有着重要的意义,而且在生态环境保护方面同样也有着重大的意义,内生菌对提高入侵植物的入侵性亦有重要的贡献.本文主要针对内生细菌的研究方法、生态学、有益生物学作用等进行了综述,并着重针对植物内生菌在入侵生态学中的研究前景做了展望,以期为入侵生态学的研究开辟新的思路.