苹果微型反向重复转座元件（MITE）的分离与鉴定

【目的】从苹果基因组中分离微型反向重复转座元件(MITE),研究其对苹果基因组进化的作用。【方法】利用PIF转座酶简并引物扩增苹果PIF转座酶基因,采用染色体步移技术获得PIF转座酶基因的未知侧翼序列,使用EMBOSS的Eiverted软件查找靶位点重复(target site duplication,TSD)和末端反向重复(terminal inverted repeat,TIR)序列。【结果】苹果MITEs拥有MITEs的典型特征,包括长度短,不具有潜在的编码能力,富含A+T,易插入非编码区,有TIRs和TSDs,有形成二级结构的可能。【结论】苹果MITEs属于Tourist家族,与苹果PIF DNA转座子相关;苹果MITEs与基因相连,在基因调节上起重要作用;苹果MITEs具有潜在的转座能力,对苹果遗传多样性、进化及育种有重要作用。     

植物转座因子研究进展

本文综述评述了植物转座因子的研究进展，主要包括植物转座因子的研究历史，类型、结构，功能，影响转座因子表达的因素以及转座因子标签技术。     

Ac/Ds转座子及其作为插入序列标签的应用

简要介绍了Ac/Ds转座子作为插入序列标签的构建形式及其在植物基因组中的插入特点、影响Ds转座子跳跃的因素,并且对其在植物功能基因组的发展前景作了分析。     

生物基因组中的转座因子

转座因子是细胞中能改变自身位置的一段脱氧核糖核酸（ＤＮＡ）序列。转座因子不仅存在于原核生物的多种细菌质粒上，也存在于真核生物如玉米、果蝇、家鼠以及人等高等动植物体内。本文阐明了转座因子在生物体中存在的普遍性，较为系统地论述了原核生物和真核生物的转座因子的类别及其遗传学效应。     

植物转座因子研究进展

本文综合评述了植物转座因子的研究进展,主要包括植物转座因子的研究历史、类型、结构、功能,影响转座因子表达的因素以及转座因子标签技术。     

bHLH转录因子对植物形态发生的影响

bHLH转录因子为植物基因组中的一个大家族,在拟南芥中有162种bHLH转录因子,在水稻中则有131种。bHLH转录因子对植物的生长发育、营养吸收、生物合成、信号转导等方面具有重要影响。仅对bHLH转录因子对植物形态发育的影响作综述。     

植物LTR类反转录转座子的研究概述

LTR类反转录转座子是植物基因组中的重要成分,对基因组的大小、结构、功能和进化都有重要影响.文中从结构特征、转座机制、分类、分离鉴定及对基因组的影响等多个方面概述了植物LTR类反转录转座子的研究进展,为进一步揭示LTR类反转录转座子在植物基因组中的功能奠定基础.     

枣树基因组中转座元件分析

转座子是基因组演化的重要因素。为了探明转座子在枣树(Ziziphus jujuba Mill.)基因组演化中可能的作用,采用生物信息学工具对枣树基因组中的转座元件进行分析。结果表明,所有转座元件占枣树基因组的23.38%,其中DNA转座子占8.60%(包括0.34%的MITEs)、LTR反转录转座子占12.23%、Non-LTR反转录转座子占2.30%、内源性反转录病毒占0.25%。系统进化树分析结果表明,MITEs和LTR反转录转座子在演化过程中进行过复制和扩增,这说明转座子的活动和枣树基因组的进化是相关的。本研究将有助于研究枣树基因组的遗传多样性及进行相关种质资源的鉴定。     

植物基因组上游开放阅读框的挖掘方法及其翻译调控

基因组中约有20％的基因具有上游开放阅读框（upstream open reading frame，uORF），它位于成熟mRNA 5''端非编码区（5''-UTR）。本文简介了uORF同源群的挖掘方法、分类和进化，以及调控下游mORF翻译的研究进展。植物（拟南芥和水稻等）和昆虫（果蝇等）基因组中普遍存在保守肽uORFs，并且在序列多样性方面有相似之处。但它们在平均长度、基因组聚类、与甲基转移酶的关联性上有所不同。植物uORF的长度通常短于昆虫uORF。借助拟南芥和水稻全长cDNA序列比较，不同的uORF同源群对其下游如转录因子，信号转导因子、发育信号分子和翻译起始因子eIF5等编码基因的mORF具有调控功能。对于真核生物基因组中包含CHCH域的uORF进行贝叶斯系统发育分析，结果表明，同源群8-like分属5个物种（绿藻、节肢动物、线虫、无脊椎动物和真菌）。在真核生物生长、发育和生理过程中，uORF通常作为反式因子对mORF表达起调节器作用，例如，在植物蔗糖、多胺、磷脂酰胆碱，以及甲基转移酶反应中，相当大比例的uORF参与介导mORF的翻译调控。     

植物中Ac/Ds转座子的研究与应用

Ac/Ds转座子作为研究较为深入的植物转座子,已被广泛应用于植物功能基因组研究.利用Ac/Ds标签系统构建插入突变体库是研究功能基因组学的有效途径,也是进行基因克隆及功能分析的有利工具.结合课题组利用Ac/Ds转座子标签分离基因并进行基因功能验证方面的研究工作,综述了Ac/Ds转座子在植物基因组中的插入特点、转座机制以及转座子标签法的应用与发展前景,为更有效的利用Ac/Ds转座子提供参考依据.