RAPD标记检测与肉鸡肥度性状关联的QTLs--肉鸡个体间RAPD指纹变异

采用随机扩增多态 DNA( RAPD)技术分析了肉鸡群个体间 RAPD指纹的变异程度。 1 0个随机引物在 3 6只公鸡中共扩增出 83个片段 ,其中有 67个是多态性片断 ,多态率为 80 .72 %,1 1个随机引物在 3 6只母鸡中共扩增了 99个片段 ,其中有 86个是多态性片段 ,多态率为 86.87%。公、母鸡群体内个体间遗传相似系数分别为 0 .7858、 0 .73 2 8。结果表明 :RAPD标记的多态性明显 ,作为一种 DNA标记 ,它可以用于分析鸡群体的遗传结构。     

槟榔江水牛群体遗传结构的RAPD分析

 为探讨RAPD标记在水牛遗传多样性方面检测的应用价值，以及了解槟榔江水牛的群体遗传结构状况，研究采用随机扩增多态性DNA标记技术对槟榔江水牛20个个体进行了遗传变异分析，从70个随机引物中筛选出15个多态性丰富的引物对其所有个体的总基因组DNA进行了PCR扩增，结果15条引物共产生105种扩增片段，多态片段95条，平均每条引物的扩增带数为7，各引物多态性片段范围在2～12之间，多态频率在40%～100%之间，多态座位平均为90.48%。表明槟榔江水牛的遗传多样性较丰富。     

RAPD标记检测与肉鸡肥度性状关联的QTLs——肉鸡个体间RAPD指纹变异

采用随机扩增多态ＤＮＡ（ＲＰＡＤ）技术分析了肉鸡群个体间ＲＡＰＤ指纹的变异程度。１０个随机引物在３６只公鸡中共扩增出８３个片段,其中有６７个是多态性片断,多态率为８０．７２％,１１个随机引物在３６只母鸡中共扩增了９９个片段,其中有８６个是多态性片段,多态率为８６．８７％,公、母鸡群体内个体间遗传相似系数分别为０．７８５８、０．７３２８。结果表明：ＲＡＰＤ标记的多态性明显,作为一种ＤＮＡ标记,它可以     

澳洲鸵鸟的随机扩增多态DNA研究

采用随机扩增多态性DNA标记技术对澳洲鸵鸟20个个体进行了遗传变异分析，从60个随机引物中筛选出17个多态性丰富的引物，并对其所有个体的总基因组DNA进行了PCR扩增，结果17条引物共产生103种扩增片段，其中共有片段13条，多态片段90条，平均每条引物的扩增带数为6．06，各引物多态性片段范围在2—9，多态频率在40％-100％。表明澳洲鸵鸟的遗传多样性较丰富。     

WHBE兔遗传特异性的RAPD分析

应用随机扩增多态DNA技术(RAPD)对WHBE兔、日本大耳白兔和新西兰兔进行了遗传分析.用10个随机引物对其基因组DNA进行PCR扩增.根据电泳结果选用其中8个引物扩增的条带进行遗传分析,共检测到107条扩增片段,其中多态性片段32条,占29.91%,反映了家兔品系间的遗传变异.多态性统计分析表明,WHBE免和日本大耳白兔的遗传相似度最高,为0.7948.其中4个引物既可扩增出3个品系共同的DNA条带,也可扩增出不同品系的特征条带,表明WHBE兔与日本大耳白兔和新西兰兔之间有遗传的相似性,也存在遗传差异.这些结果表明应用RAPD技术可以很好地检测家兔不同品系间以及同一品系不同个体间的亲缘关系.     

采用RAPD技术分析4个猪种的遗传资源多态性

以野猪、杜洛克、东北民猪和杂种猪(杜洛克×野猪)为试验材料,采用随机扩增多态DNA(RAPD)技术从DNA水平对这4个猪品种的遗传资源多态性进行了研究,计算了4个猪品种之间的遗传相似度。本研究还从133个引物中筛选出10个可以对4个猪品种进行遗传检测的多态性引物,共检测出89条扩增片段,其中多态性片段53条,多态率59.55%。这10个引物在4个品种中共产生品种特异带30条,反映了4个猪品种间的遗传变异,它们可能成为明显区分这4个猪种的稳定的遗传标记。     

德宏水牛和摩拉水牛及杂交后代的遗传差异分析*

 为了解德宏水牛、摩拉水牛及二者杂交后代之间的遗传差异，本研究采用随机扩增多态性DNA标记技术，从70个随机引物中筛选出11个多态性丰富的引物对德宏水牛、摩拉水牛及二者杂交后代共80个个体进行了遗传变异检测，结果11条引物共产生89种扩增片段，多态片段73条，多态率82.02%。两亲本群体相对遗传距离为 0.220 3 ,杂交后代群体与德宏水牛、摩拉水牛群体的相对遗传距离分别为 0.101 7 和 0.135 3 ，表明杂交后代群体与两亲本群体间的遗传差异小于两亲本群体间的遗传差异，杂交后代群体与德宏水牛群体遗传关系更接近。     

常绿阔叶林优势种福建青冈的遗传多态分析

利用随机扩增多态DNA标记技术,对福建黄楮林自然保护区7个样地的福建青冈群体进行了基因组DNA多态性分析。从60条引物中共筛选出10个引物,获得随机扩增多态DNA(random amplified polymorphic DNA,RAPD)扩增位点76个,多态性位点占48.68%,揭示了福建青冈群体具有较高的遗传变异水平。数据分析显示群体间的遗传距离处于0.099 1-0.230 8的范围内。应用DPS数据处理系统对环境因子进一步作对应分析研究,分析环境因子对群体遗传变异的影响,发现遗传距离越接近的群体,其所处的生态环境指标也越接近,表明了福建青冈群体间的遗传差异与生态环境间的差异具有明显相关性。     

中国水稻二化螟5个地理种群遗传差异的RAPD分析

以中国水稻二化螟5个地理种群的基因组DNA为材料,对其进行随机扩增多态性DNA(RAPD)分析.从50个引物中筛选出29个稳定性好、多态性高的引物,单个引物扩增出的DNA条带数从2～15条不等,其片段大小为200～3 000 bp,5个地理种群共扩增出条带220条,其中为多态片段的97条,平均每条引物扩增出条带7.59条.通过公式计算多态性位点、遗传相似性指数和遗传距离,结果表明:(1)5个地理种群遗传变异较高,其中以广西省全州市多态位点百分率最高(52.73%),吉林省柳河县多态位点百分率最低(34.55%);(2)5个二化螟地理种群间的遗传相似性指数的变异范围为0.551 88～0.849 00,遗传距离指数为0.121 42～0.448 12,平均遗传距离指数为0.312 28;安徽省庐江县与湖北省武汉市地理种群间的遗传距离最小,而吉林省柳河县与广西省全州市地理种群间的遗传距离最大.     

DDK品系小鼠遗传特异性的RAPD分析

应用随机扩增多态DNA技术(RAPD)对DDK,C57BL/6,BALB/c,KM,PWK 5个品系的小鼠进行了遗传分析.选用130个随机引物对其基因组DNA进行PCR扩增.根据电泳结果,其中31个引物扩增出明显的多态性条带,共检测到345条扩增片段,其中多态性片段277条,占80.3%,反映了5个品系间的遗传变异.多态性统计分析表明,C57BL/6与BALB/c之间的遗传距离指教为0.013 29,遗传关系最近;DDK与KM,C57BL/6遗传距离指数相似分别为0.014 73,0.0147 6,遗传关系较近,与PWK遗传距离指数为0.016 86,遗传关系最远.结果显示DDK品系小鼠与其他实验室品系之间有遗传的相似性,也存在差异.同时也证明了RAPD技术可以作为分子标记,很好地检测实验室近交系小鼠间的亲缘关系及其遗传特异性.     

肉鸡肥度性状的RAPD标记研究

 供试鸡为30只AA肉仔鸡,其中公、母仔鸡各15只。测定49日龄活重、屠体重、腹脂重、腹脂率、肝脏鲜重、干肝脂肪含量、胸肌干样脂肪含量和血浆VLDL浓度。采血分离出DNA后,对公、母鸡群分别利用已筛选出的17个随机引物分别对所有个体的基因组进行PCR扩增。对多态性片段,将“有带”、“无带”个体组成的群体看作是独立样本,比较两样本间数量性状的差异。结果在公、母鸡群分别发现了29、35个显著关联的标记与性状组合。经对与同一标记同时关联的性状间的相关分析及两样本间个体表型值分布的分析,发现上述大部分标记与性状关联是不可信的。在公鸡群没有发现显著的标记与性状关联,在母鸡群检测到两个显著的标记与性状关联,它们是OP1308-腹脂重和OP1308-腹脂率。     

海雀稗种质资源RAPD分子标记的遗传多样性研究

以来自广东省海雀稗的3个野生居群和1个草坪型栽培品种为材料,采用RAPD分子标记技术对其遗传多样性及在居群内和居群间的大小和分布格局进行了分析.结果发现,20条引物共扩增出176条带,其中114条带为多态性带,占总带数的64.77%.从Shannon信息指数分析的结果来看,居群内、居群间和总居群的遗传多性指数分别为0.023 0、0.276 7和0.299 7,遗传分化系数为0.923 3,表明在总的遗传变异中,有92.33%的变异存在于居群间,而只有7.67%的变异存在于居群内,充分反映了海雀稗无性繁殖的内繁育系统在遗传变异调节中的重要作用.UPGMA聚类分析的结果表明,来自4个居群的所有个体被分为2支,一支包括栽培品种和番禺居群,另一支包括珠海居群和广州市区居群,这一聚类结果与植株的高矮和茎的粗细等形态特征有一定的相关性.     

圆鼻巨蜥遗传多样性的RAPD分析（摘要）

[目的]采用RAPD技术对圆鼻巨蜥（Varanus salvator）进行遗传多样性分析。[方法]用20个随机引物对圆鼻巨蜥36个个体的基因组DNA进行PCR扩增。[结果]有10对引物能扩出清晰稳定的条带,共扩增出2952条DNA片段,平均每个个体扩增出82个条带,其中47条具多态性,多态性位点比为57.32%,36个个体间遗传距离为0.0359～0.3359,平均遗传距离为0.13592。Neis基因多样性指数H=0.1819,Shannons多样性指数I=0.2630,表明圆鼻巨蜥具有较高的遗传多样性。[结论]采用UPGMA法构建了36个个体相互关系的分子聚类图,发现没有形成明显的种群分化。     

三个鸡品系遗传关系的RAPD分析*

 为了从分子水平上阐明快羽系、绿壳蛋系和合成系3个鸡品系之间的遗传差异及其遗传关系,为进一步开展这3个鸡品系的杂交配套利用提供依据,本文采用RAPD标记对3个品系的血样进行了群体遗传关系分析。实验共筛选出27条随机引物,对3个鸡品系的池DNA进行了RAPD分析。27条引物共产生235种扩增片段,扩增产物片段的长度大小在277~2441bp范围内。利用电泳分析数据分别计算了3个品系群体之间的遗传相似系数和遗传距离指数。结果表明:快羽系与绿壳蛋系间的遗传关系最近;而快羽系与合成系间的遗传关系最远。     

雅江报春天然居群RAPD遗传多样性

用随机扩增多态性DNA(RAPD)标记检测3个雅江报春天然居群的遗传多样性。结果表明,28个引物共扩增出173条片段,平均每个引物扩增出6条,其中多态性带纹为82条(47·4%)。材料间的平均遗传距离为0·4584,17个植株可被聚为四类。居群间随海拔差异的增大,遗传距离增大,遗传关系较远。居群内木格措居群遗传多样性较高,木格错居群与理塘居群遗传关系较近,康定居群与木格错居群分离出差异较大的个体。     

短枝木麻黄群体的遗传分化和遗传结构

利用RAPD技术对4个短枝木麻黄(Casuarina equisetifolia)种群的遗传分化和群体遗传结构进行了分析。结果表明,短枝木麻黄具有较高的遗传多样性,但各种群的遗传多样性大小不一,由大到小依次为天然分布于澳大利亚、太平洋群岛的原生种群(YSAP)>引种于亚洲的次生种群(CSAS)>引种于非洲的次生种群(CSAF)>天然分布于东南亚的原生种群(YSAS)。遗传变异分析表明,短枝木麻黄群体的遗传变异主要存在于群体内,种群间遗传多样性比例(Hsp-Hpop)/Hsp=0.246,遗传分化系数GST=0.263,种群间变异比率φST=0.278 9,即群体内变异占了72.11%,群体间变异占27.89%。UPGMA聚类分析将4个短枝木麻黄种群归为2类,YSAS与CSAS的亲缘关系较密切,而YSAP与CSAF有着更亲密的关系,这在一定程度上反映了次生种群的主要引种来源。     

圆鼻巨蜥遗传多样性的RAPD分析

[目的]采用RAPD技术对圆鼻巨蜥（Varanus salvator）进行遗传多样性分析。[方法]用20个随机引物对圆鼻巨蜥36个个体的基因组DNA进行PCR扩增。[结果]有10对引物能扩出清晰稳定的条带,共扩增出2952条DNA片段,平均每个个体扩增出82个条带,其中47条具多态性,多态性位点比为57.32%,36个个体间遗传距离为0.035 9~0.335 9,平均遗传距离为0.135 92。Nei s基因多样性指数H=0.181 9,Shannon s多样性指数I=0.263 0,表明圆鼻巨蜥具有较高的遗传多样性。[结论]采用UPGMA法构建了36个个体相互关系的分子聚类图,发现没有形成明显的种群分化。     

新扬州鸡与莱航鸡遗传变异的RAPD分析

应用 2 1个 1 0碱基寡聚核苷酸随机引物对新扬州鸡、莱航鸡进行 RAPD扩增。结果表明 :1 3个随机引物有扩增条带 ;平均条带共享率 ,新扬州鸡公鸡与母鸡差异不显著 (P>0 .0 5) ,母鸡群与莱航鸡差异显著 (P<0 .0 5) ;遗传多样性指数 ,新扬州鸡公鸡与母鸡无显著差异 (P>0 .0 5) ,而新扬州鸡公、母鸡与莱航鸡存在显著和极显著差异。新扬州鸡遗传变异大于莱航鸡 ,说明新扬州鸡仍有选择余地     

南阳牛遗传多样性的RAPD分析

用RAPD技术对南阳牛种质资源的DNA进行检测,采用Popgene软件对扩增结果进行统计分析表明:筛选的16个引物共得到了236条扩增DNA片断,其中89.7%的扩增条带表现出多态性。平均每个位点有1.989 6个等位基因,有效等位基因数为1.233 3。Nei遗传多样性指数为0.159 7,Shannon's遗传多样性指数为0.270 3。种群总的遗传多样性Ht为0.163 7,种群内的遗传多样性Hs为0.130 5,种群的基因分化系数为0.202 8,种群间的基因流为1.965 3。