中国兰SRAP-PCR体系的建立及优化

序列相关扩增多态性(SRAP)是新一代的分子标记技术,尚未在兰花中应用过.本实验运用改进了的CTAB法提取国兰总DNA,并L16(45)正交设计,对影响中国兰PCR反应的4个因素(引物浓度、Mg2+浓度、dNTPs 浓度、扩增模版)在4个水平上进行优化试验,结果采用DPS软件分析.结果表明,在25 μl总体积中,Taq酶为1个单位的情况下,中国兰SRAP-PCR反应最佳扩增体系为: Mg2+ 2 mmol·L-1、DNA模版100 μg、dNTPs 0.25 mmol·L-1、引物0.3 μmol·L-1.这一优化的SRAP-PCR体系的建立为后续国兰SRAP分析奠定基础.     

三华李SRAP反应体系的建立与优化

以三华李品系中的白脆鸡麻李1为供试材料,利用分步优化法对影响SRAP-PCR反应的5个因子进行优化,确立了三华李的SRAP-PCR反应体系：模板DNA 15 ng,Mg2+浓度3.0 mmol·L-1,引物浓度0.25 μmol·L-1,dNTPs 0.3 mmol·L-1,Taq DNA聚合酶1.0 U,10×Buffer 2.5 μL,反应总体积为25 μL,其余部分用ddH2O补充。利用优化的体系对18份李属种质资源进行扩增,经6%聚丙烯酰胺凝胶检测显示：条带清晰可靠、多态性好,可用于三华李的分子标记研究。     

怀地黄SRAP分子标记优化体系的建立

为了建立适宜怀地黄的SRAP反应体系,以22个不同类型的怀地黄品种为材料,研究了PCR反应体系的主要成分对SRAP扩增结果的影响.对SRAP反应体系中的DNA模板浓度、TaqDNA聚合酶浓度、Mg2+浓度、引物浓度以及dNTP浓度进行了探索,确立的适合怀地黄SRAP反应的体系为:在25 μL的反应体系中,模板DNA20 ng、2.5 mmol·L-1 Mg2+、0.32 μmol·L-1的上下游引物、0.30 mmol·L-1的dNTPs以及2.5U Taq酶.并利用该反应体系对怀地黄22个不同品种进行了SRAP反应,发现不同品种间的DNA谱带多态性丰富,证实该体系稳定可靠,可以用于怀地黄的分子标记研究.     

扁玉螺ISSR-PCR反应体系的建立及其优化

以扁玉螺基因组DNA为材料,分析了Mg2 ,dNTP、Taq DNA聚合酶、引物以及模板DNA浓度对ISSR-PCR扩增效果的影响,建立了一套适合扁玉螺的ISSR-PCR反应体系.该反应体系包括:2.0mmol·L-1的Mg2 ,0.25 mmol·L-1的dNTP,0.8 U的Taq DNA聚合酶,0.2 μmol·L-1的ISSR引物和40 ng模板DNA.利用优化后的反应体系,从30条ISSR引物中筛选出13条扩增效果较好的引物,为进一步利用ISSR标记研究扁玉螺的遗传多样性奠定了基础.     

水稻SSR-PCR技术反应体系的优化

以水稻为材料,研究了SSR-PCR反应体系中Mg2+、dNTPs、引物、TaqDNA聚合酶及模板DNA浓度时水稻SSR扩增效果的影响.结果表明,在试验设计范围内,Mg2+和dNTP浓度对扩增影响较大,引物浓度在1.6～3.0μmol·L-1范围内对扩增影响较小,TaqDNA聚合酶和模板DNA浓度对扩增影响也很小.确定的最佳反应体系为20μL,Mg2+浓度为1.75 mmol·L-1、dNTPs为0.20 mmol·L-1、引物为2.4 μmol·L-1、Taq DNA聚合酶为0.75U、模扳DNA为45ng.     

草莓RAPD反应体系的优化

以草莓幼叶为试材,进行RAPD反应扩增体系的优化.对模板、dNTP、引物、MgCl2和Taq DNA聚合酶等条件进行优化.结果表明,在20 μL的反应体系中,以DNA模板用量25 ng,引物用量为0.15 μmol·L-1,dNTP用量为120μmol·L-1,Mg2+用量为2.5 mmol·L-1,Tap DNA聚合...     

泡桐SSR分子标记反应体系的建立

以健康毛泡桐二倍体为材料,通过对影响SSR扩增效果的泡桐DNA,dNTP和引物浓度,Taq酶量及退火温度等因素的筛选,建立了适宜的泡桐SSR分子标记反应体系.结果表明,泡桐的适宜SSR分子标记反应体系中,退火温度为53℃,泡桐DNA质量浓度为0.05 mg·L-1,dNTP和引物浓度分别为0.1 mmol·L-1和0.3μmol·L-1,而Taq酶量和10×Taq酶缓冲液则为0.025 U·μL-1和2.0 mmol·L-1.     

苹果IRAP反应体系的建立和指纹图谱构建

利用已获得的苹果Ty1-copia类逆转座子LTRs建立了苹果逆转座子间扩增多态性(IRAP)技术体系,对影响IRAP-PCR扩增结果的若干因子进行了研究.优化的反应体系包含:2.5 μL 10×buffer,50 ng模板DNA,2.5 mmol·L-1 Mg2+,0.2 mmol·L-1 dNTPs,0.4 μmol·L-1引物,1 U Taq DNA聚合酶,反应体积为25 μL;优化的PCR扩增程序为:94℃ 2 min; 94℃ 1 min,退火1 min,72℃ 2 min,循环35次;72℃延伸10 min;退火温度根据引物温度设定.该IRAP体系分别用于‘元帅'和‘富士'的短枝和着色芽变指纹图谱的分析,构建的指纹图谱可以作为芽变鉴定的依据,表明这些突变可能系逆转座子转座插入或逆转座子间重组所致.     

珍珠黄杨RAPD最佳反应体系研究

以RAPD遗传标记为手段,对野生珍珠黄杨种群RAPD最佳反应体系进行研究。结果表明,在36℃时珍珠黄杨有比较好的片段数量和片段亮度。此外,2.5 mmol·L-1 Mg Cl2,0.25 mmol·L-1 d NTP,0.3μmol·L-1引物浓和2.0 U·(20μL)-1 Taq DNA聚合酶构成了珍珠黄杨RAPD扩增的最佳组合反应体系。     

大明竹属部分植物ISSR-PCR反应体系优化及有效引物筛选

采用单因素试验方法,建立了适合大明竹属25个竹种的ISSR-PCR反应体系,优化了各影响因子的用量,筛选出18条有效引物,并确定它们的退火温度,最后对体系进行了检验.优化后大明竹属植物ISSR-PCR的20 μL反应体系含2.0 μL10×PCR Buffer、2.5 mmol·L-1 Mg2＋、0.15 mmol·L-1 dNTPs、0.5 μmol·L-1引物、1.0 U Tap DNA聚合酶、50 ng模板DNA、10.6μL灭菌ddH2O.扩增程序为：94℃预变性5 min;94℃变性60 s,55℃复性45s,72℃延伸90 s,循环40次;72℃延伸7min,4℃保存.该ISSR-PCR反应体系可用于大明竹属部分植物的遗传多样性及遗传结构研究.