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相似文献
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1.
龙胆种质资源RAPD评价   总被引:1,自引:0,他引:1  
目的应用RAPD标记对60份龙胆种质资源遗传多样性进行分析评价,为龙胆种质资源评价与资源库构建提供理论依据。方法应用RAPD对龙胆基因组DNA进行扩增,扩增产物在1%琼脂糖凝胶电泳后,在NTSYS-pc软件系统下进行统计分析。结果22条引物共得到147条扩增条带,其中96.6%的片断具有多态性。平均每个引物可获得6.6个DNA片断。各种质间的遗传相似系数(GS)范围为0.2353.-0.8214,平均值为0.5992。聚类分析表明:利用RAPD标记将60份供试材料全部分开,根据GS平均值将所有材料分为12类,其中有6份材料分别单独聚为1类,有34份材料聚为1类,其余20份材料分别聚为5类。结论所有材料间的Gs值都小于0.83,相似度较低,60份种质问的遗传差异较大,个体间具有较高的遗传多样性水平;RAPD遗传相似系数划分的类群同地理分布有一定关系。  相似文献   

2.
新疆梨种质资源亲缘关系的ISSR和RAPD分析   总被引:3,自引:0,他引:3  
【目的】探讨新疆梨种质资源亲缘关系以及遗传多样性,旨在为供试梨资源的分类提供科学依据。【方法】采用ISSR和RAPD分子标记对48份梨种质资源进行聚类分析和遗传关系研究。【结果】14条ISSR引物共扩增出113条清晰的谱带,其中101条显示多态性,平均每个引物扩增出7.2条多态性谱带。19条RAPD引物共扩增出163条清晰的谱带,其中多态性谱带138条,平均每个引物扩增出7.2条多态性谱带。基于ISSR和RAPD两种标记,利用UPGMA分别构建了48份梨资源的聚类树状图。ISSR和RAPD分别聚类以及两种标记混合聚类均将48份梨种质分为3类:第Ⅰ类群中包括1份种质;第Ⅱ类群中包括23份种质;第Ⅲ类群中包括24份种质。【结论】两种标记适合于梨种质资源亲缘关系和遗传多样性分析,可为梨资源的开发利用及新品种的选育提供科学依据。  相似文献   

3.
对22份枸杞属种质材料进行RAPD分析。研究结果表明,32个引物在22份种质中共扩增出了204条带,其中162条为多态性条带,多态性条带的比例为79.41%。UPGMA聚类分析结果表明,RAPD分子标记的聚类结果与枸杞属形态分类基本相似,能将种间亲缘关系划分出,但是对变种与种间关系的区分不佳。  相似文献   

4.
石榴品种资源的RAPD亲缘关系分析   总被引:2,自引:0,他引:2  
以36份石榴品种(类型)为研究对象,用RAPD技术对其亲缘关系进行分析。从128个随机引物中筛选出12个重复性好、条带清晰的多态性引物,并用这些引物对36份材料进行RAPD扩增,共扩增出111条谱带,平均每个引物9.25条。12个引物扩增出不同的多态性条带,多态性程度达到72.07%。用Statistic分析软件计算出的遗传距离在0.027~0.441之间,并对36份材料进行了UPGA法聚类,RAPD结果的亲缘关系树状图显示,36个品种或类型基因背景较复杂,说明了我国的石榴栽培品种有丰富的种质资源。  相似文献   

5.
辣椒种质资源的RAPD分析   总被引:22,自引:2,他引:22  
为明确辣椒种质资源的遗传基础,利用RAPD技术对来自不同生态环境不同类型的辣椒种质资源亲缘关系进行了研究.从160个随机引物中筛选9个用于PCR反应,88.68%的扩增条带表现多态性,聚类分析结果表明,46份辣椒种质资源可分为六大类,DNA分子水平上辣椒亲缘关系与传统方法研究结论基本一致.  相似文献   

6.
应用RAPD标记技术研究大花蕙兰种质资源亲缘关系   总被引:2,自引:0,他引:2  
利用RAPD标记技术对来自2个企业的18个大花蕙兰品种进行了检测。结果表明:从50个10碱基随机引物中筛选出15个多态性高、重复性好的引物,共扩增出92条DNA条带,其中90条为多态性带,占97.8%,平均每个引物扩增多态性带6条。18个种质之间的相似系数变化范围为0.1975~0.6704,平均相似系数为0.4761;遗传距离变化范围为0.3296~0.8025,平均遗传距离0.5239。基于RAPD的扩增结果建立了UPGMA亲缘关系聚类图,18份种质在遗传距离0.5239处被划分为4个类群。供试的18份种质间的遗传亲缘关系与其花色和花枝类型存在一定的相关性。  相似文献   

7.
薹菜种质资源的RAPD和ISSR分析   总被引:1,自引:0,他引:1  
【目的】对29份薹菜(Brassica campestris L.ssp.chinensis Makino var.tai-tsai Hort) 种质资源进行遗传多样性和亲缘关系分析,为薹菜的种质资源保护和利用奠定基础。【方法】利用优化的RAPD和ISSR标记体系,对采自山东、江苏和北京的29份薹菜品种进行DNA多态性分析,并采用类平均法对29份薹菜品种的RAPD和ISSR扩增结果进行聚类分析。【结果】从273条RAPD引物中筛选的33个RAPD引物,共扩增出了336条清晰的谱带,其中293条显示多态性,平均每个引物扩增出10.2条多态性谱带,多态性比率为87.2%。利用RAPD标记构建了29份薹菜资源的聚类树状图,距离系数为0.63~0.79。从100条ISSR引物中筛选的45个ISSR引物,共扩增出了522条清晰的谱带,其中414条显示多态性,平均每个引物扩增出9.2条多态性谱带,多态性比率为79.3%;利用ISSR标记构建了29份薹菜资源的聚类树状图,距离系数为0.70~0.86。【结论】基于RAPD和ISSR标记构建的29份薹菜品种的聚类树状图虽有一定差异,但总体趋势一致,1、20、21号薹菜与其他品种的遗传距离相对较远。  相似文献   

8.
辣椒材料亲缘关系的RAPD初步分析   总被引:3,自引:0,他引:3  
为明确 1 6个辣椒种质资源的亲缘关系 ,利用RAPD技术对不同类型的辣椒种质资源亲缘关系进行了初步分析。从 4 0个随机引物中筛选 1个A2用于PCR反应 ,6 0 %的扩增条带表现多态性 ,聚类结果表明 ,1 6份辣椒种质资源可以分为 8大类 ,DNA分子水平上辣椒亲缘关系的分析和传统研究结论基本一致  相似文献   

9.
利用RAPD技术对龙眼的95份种质资源和一份荔枝种质资源进行研究。从200条随机引物中筛选出18条多态性引物,共扩增出197条带,DNA扩增带的多态性为100%,这表明96份材料的遗传多样性和遗传资源的丰富性。利用SPSS13.0统计软件对RAPD表型数据矩阵进行分析。根据欧氏距离(ED)法计算各样品间的遗传距离,采用UPGMA(类平均法),进行分析,建立亲缘关系聚类树状图。结果表明,RAPD标记能在分子水平揭示龙眼的遗传背景与亲缘关系。  相似文献   

10.
采用RAPD标记对7份德化淮山种质进行遗传多态性和遗传距离分析,并构建聚类图。从63个RAPD引物中筛出31个多态性较好的组合,扩增得到了156个多态性标记。结果表明,7份淮山种质依据遗传距离可分为2类,组间的遗传距离为0.32,其中,大铭薯、泉淮1513和泉淮1547的亲缘关系较近,组内的平均遗传距离为0.21,另一类组内的平均遗传距离为0.44。对照田间表型可见,聚类结果相近于传统分类结果。利用RAPD标记能有效地分析淮山的遗传多样性,对杂交优势的利用具有较大的指导意义。  相似文献   

11.
应用SRAP分子标记构建红麻种质资源分子身份证   总被引:2,自引:2,他引:0  
【目的】以来源于不同国家和地区的127份红麻栽培种、野生种和近缘种为材料,利用SRAP标记构建红麻种质资源分子身份证。【方法】利用SRAP标记对127份红麻种质进行遗传分析,计算其遗传相似系数。利用UPGMA法作聚类图,构建分子身份证。【结果】40对引物组合在127份红麻种质材料中共扩增出383条DNA片段,其中,375条为多态性片段,总的多态性条带比率(PPB)为97.9%。UPGMA聚类分析结果表明,相似系数为0.70时,127份红麻种质资源被划分为4个类群。用SRAP特征谱带和多种引物组合2种方法可有效区分所有材料,并构建出127份红麻种质资源特异性分子身份证,置信概率达到99.99%。【结论】基于15对SRAP核心引物组合的36条谱带构建了一套127份红麻种质资源唯一性的分子身份证。  相似文献   

12.
用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术,对朱砂根3种类型的15份资源进行遗传多样性分析和聚类分析.从200个随机引物中,筛选出17个对15份供试朱砂根资源均能产生多态性谱带的引物.在这17个引物所检测的247个位点中,229个位点为多态性位点,多态性高达92.71%.聚类分析结果表明,不同朱砂根类型之间存在明显的遗传差异,而且根据RAPD标记进行的朱砂根类型聚类结果与其形态上的分类结果基本一致.  相似文献   

13.
【目的】采用SCo T分子标记技术分析丝瓜种质资源的遗传多样性和亲缘关系,为丝瓜种质资源的利用和品种选育提供参考。【方法】采用80条引物和SCo T-PCR对81份丝瓜种质资源进行遗传多样性分析和聚类分析。【结果】在优化的SCo T-PCR反应体系基础上,从80条引物中筛选获得10条多态性丰富、重复性好的引物,每条引物扩增获得10-17条100-2100 bp的条带;10条引物共扩增获得140条带,其中多态性条带124条,多态性比例87.57%。81份丝瓜种质材料的遗传相似系数在0.5900-0.9200,在0.5900处可将所有供试材料划分为两大类,第Ⅰ类包括46份有棱丝瓜材料,第Ⅱ类包括35份普通丝瓜材料,广西和广东的丝瓜种质材料主要聚在第Ⅰ类。在遗传相似系数0.7200和0.7900处,第Ⅰ、Ⅱ大类丝瓜材料均可划分为5个组,每组丝瓜材料主要来自相同地区。【结论】SCo T分子标记可作为ISSR、SRAP等标记的有效补充,为丝瓜种质资源的研究提供简单、可靠的工具。  相似文献   

14.
野生狗牙根种质资源SRAP与SSR的遗传多样性   总被引:2,自引:0,他引:2  
凌瑶  张新全  陈仕勇  刘伟  马啸 《中国农业科学》2012,45(10):2040-2051
【目的】为指导种质资源的引进和利用及选育优质狗牙根新品种提供科学依据。【方法】采用SRAP和SSR两种分子标记方法相结合,对52份野生狗牙根材料进行遗传多样性分析。【结果】①利用4个表型差异显著的野生狗牙根对SRAP的150对引物组合及SSR的200对引物组合进行扩增,分别筛选出有效引物组合各18对,SRAP和SSR扩增总条带分别为236和346条,多态性条带206和255条,平均每对引物扩增出多态性条带各11.4和14.17条,多态性位点百分率分别为87.29%和73.70%;②两种标记结合进行聚类分析,当GS=0.68时,可将所有供试材料分成5个组群;当GS=0.78时,可将第V个组群分成6个小组,大部分来自相同或相似生态地理环境的材料聚为一类;③基于聚类分析,可将供试材料分为8个生态地理类群,据各类群间的Nei氏遗传一致度和遗传距离的无偏估计值表明,生态地理环境相似的地理类群遗传距离较小;④SRAP和SSR标记之间具有显著的相关性,且相关性较高。【结论】野生狗牙根有丰富的遗传多样性,其聚类和生态地理环境有一定的相关性。  相似文献   

15.
油桃品种的RAPD分析   总被引:10,自引:0,他引:10  
为了用分子生物学方法对油桃品质进行分析,本研究利用RAPD技术,采用从200个10碱基随机引物筛选的22个引物对19个油桃品种的基因组DNA进行扩增,通过扩增180个位点谱带的聚类,分析供试油桃的系统发育,将供试油桃品种分为3类;并运用特殊谱带,建立了油桃的品种分子识别表,提出了重点保存的油桃种质有曙光、瑞光2号、五月火、艾米拉、红李光、阿姆肯。  相似文献   

16.
应用RAPD技术对19份膜荚黄芪种质资源进行了分析,从200条随机引物中筛选出12条引物,共扩增出148条条带,其中127条为多态带,多态性比率为85.8%,其比率较高.系统聚类分析将19份膜荚黄芪种质分为3大类群--野生黄芪、东北黄芪和华北黄芪,这与传统分类学的结果相符.  相似文献   

17.
利用RAPD技术对蜜桃种质资源的分析   总被引:2,自引:2,他引:2  
利用RAPD技术,采用从200个10碱基随机引物筛选的22个引物对14个蜜桃品种的基因组DNA进行扩增,通过扩增180个位点的谱带的聚类,分析供试蜜桃的系统发育,将供试的蜜桃品种分为3组;并运用特殊谱带,建立了蜜桃的分子检索表,提出了特殊保存的蜜桃种质有秋蜜,太原水蜜,深州红蜜和温州水蜜。  相似文献   

18.
蔡光泽  杨足君  刘成  任正隆 《安徽农业科学》2006,34(23):6121-6123,6167
利用中国粳稻种质滇粳优2号(B90)和日本粳稻冷香粳(X1)筛选100条ISSR引物。利用筛选出的10条引物对来自中国、日本等国家的40份特异粳稻进行遗传多样性分析。PCR扩增结果表明,10条ISSR引物在40份材料中共扩增出2 600条DNA带,其中多态性位点有42个,平均每条引物可以检测到4.2个多态性位点。聚类结果表明,各供试材料聚为3大类,遗传相似性系数范围为0.62~1.00。相同居群的中国特异粳稻种质基本能聚为一类,但是与部分日本粳稻交叉聚在一起。这表明:粳稻种质的遗传差异与气候变化类型的相关性不紧密;ISSR标记可以作为种质资源分类和保护的有效手段。并对中国特异粳稻种质的保护进行讨论。  相似文献   

19.
利用ISSR分子标记技术对不同地区的11种荆芥种质资源进行分析,以此来探讨我国荆芥种质资源的遗传多样性。以11种荆芥幼苗为材料,CTAB法提取其基因组DNA;采用正交试验优化ISSR技术体系影响因素;利用100条ISSR引物进行ISSR扩增,最后计算供试材料之间的遗传距离并进行聚类分析。结果表明,最优ISSR-PCR体系,在25 μL体系中,模板DNA 50 ng,引物0.75 μmol·L-1,Taq DNA聚合酶1 U;100条引物中55条引物可扩增出结果,共扩增出458条条带,平均每个引物扩增出8.3条,其中246条为多态性带,多态性比率为53.71%;11个荆芥种质资源的遗传距离在0.208 3~0.709 1;在遗传距离为0.50处,可将供试的11种荆芥材料分为2大类;在遗传距离为0.40处,可将供试的11种荆芥材料分为5大类,研究结果表明我国荆芥种质资源遗传多样性较低。  相似文献   

20.
利用ISSR和RAPD标记构建红麻种质资源分子身份证   总被引:5,自引:3,他引:2  
【目的】对来源于不同国家和地区的51份红麻栽培种、野生种和近缘种进行遗传分析,构建红麻种质资源分子身份证。【方法】利用ISSR和RAPD标记对不同类型的51份红麻种质资源进行分析,计算其遗传相似系数,利用UPGMA法作聚类图,建立分子身份证。【结果】19个ISSR标记共产生113条条带,其中101条为多态性带,多态性比率(PPB)为89.38%;20个RAPD标记共产生118条条带,其中112条为多态性带,多态性比率(PPB)为94.92%。品种间多态性丰富,结合特征带、特异谱带类型和不同引物组合3种分析方法,可有效建立51份红麻种质资源的特异分子身份证。【结论】材料间遗传多样性较高,有较远的遗传距离和较宽的遗传基础,ISSR和RAPD标记技术可有效用于建立红麻种质资源分子身份证。  相似文献   

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