中国中型鹅种的遗传多样性分析

通过微卫星标记技术对我国12个中型家鹅群体(丰城灰鹅、广丰白翎鹅、兴国灰鹅、浙东白鹅、钢鹅、四川白鹅、马岗鹅、织金白鹅、溆浦鹅、雁鹅、武冈铜鹅、皖西白鹅)的遗传多样性进行了分析。结果表明:12个品种的平均杂合度都较高,最高的为浙东白鹅,最低的为雁鹅,杂合度范围为0.4958~0.6547,12个鹅种资源群体平的均杂合度为0.5999,反映了各鹅种的杂合度都较高,遗传多样性丰富;通过计算DS遗传距离发现各群体的遗传距离较远,分化时间较长;NJ聚类结果将12个中型鹅种聚为3类,NJ的聚类结果分析与几个鹅品种的地域分布关系并不密切。     

基于自动扫描技术比较地方鹅品种群体遗传结构

本文运用10对荧光标记微卫星引物分析了皖西白鹅和豁眼鹅的遗传多样性,采用全自动扫描技术提高试验结果的可信度,经比较品种间等位基因频率、优势等位基因、特有等位基因、群体遗传参数等指标,了解2个品种之间存在的差异,为品种保护和开发利用提供参考资料。结果显示,在10个微卫星座位上,皖西白鹅检测到69个等位基因,豁眼鹅检测到52个等位基因。品种间有些座位优势等位基因是相同的,有些座位优势等位基因是不同的,少数等位基因是品种特有的。皖西白鹅的杂合度为0.6220,多态信息含量为0.5629;豁眼鹅的杂合度为0.5285,多态信息含量为0.4810,表明2个鹅品种都有丰富的遗传多样性。皖西白鹅和豁眼鹅之间的Reynolds’遗传距离为0.0682,基因流动值(Nm)为1.5909。     

基于STR技术的4个地方鹅种遗传多样性分析

利用9对高度多态的微卫星引物,运用STR自动化分析技术,对浙东白鹅、皖西白鹅、四川白鹅和太湖鹅等4个地方鹅种的群体遗传多样性进行微卫星分析。根据等位基因频率计算有效等位基因数、群体杂合度等群体遗传参数,分析群体内和群体间的遗传变异,并与上一世代保种群体的遗传信息进行比较。结果表明:在9个座位上共检测到74个等位基因;群体平均期望杂合度为0.605 6,平均多态信息含量为0.553 8。群体间遗传分化差异显著,遗传分化系数为0.043 7。群体间遗传距离为0.033 2~0.111 0,基因流动值为5.820~16.703。两世代遗传多样性无明显差异,表明基因库保种切实保持品种自身的种质特性。     

6个中国重点保护地方鹅品种的遗传多样性

对我国6个受重点保护的地方鹅品种资源(四川白鹅、狮头鹅、豁眼鹅、雁鹅、伊犁鹅和皖西白鹅)的遗传多样性进行了微卫星标记的研究。结果表明:6个品种的平均杂合度都较高,最高的是四川白鹅(0.6415),最低的是雁鹅(0.5010),表明了各鹅种的杂合度和遗传多样性水平都较高,而且杂合度的高低与PIC值的大小体现了较高的一致性;通过计算DS遗传距离发现6个品种的遗传距离较远,分化时间较长;UPGMA聚类结果将6个重点保护鹅品种聚为五类,安徽省的雁鹅和皖西白鹅聚为一类,豁眼鹅、伊犁鹅、狮头鹅、四川白鹅分别独自聚类。UPGMA的聚类结果分析与几个鹅品种的选育历史及地理分布是一致的。本研究结果为加强对我国现有鹅品种资源的保护和有效、合理、持续利用具有重大意义。     

利用微卫星标记技术分析我国部分鹅品种(类群)的遗传结构

以引进品种莱茵鹅作参照,利用6个微卫星标记对7个中国家鹅品种(类群)的H值及PIC、遗传分化系数、亲缘关系等进行了分析。结果表明,各家鹅群体均处于中度多态,其中,雁鹅具有最低的H值和PIC,浙东白鹅H值最高,皖西白鹅PIC最高;遗传变异主要存在于中国鹅品种(类群)内;莱茵鹅与7个中国鹅品种(类群)的遗传距离均较远。NJ聚类结果表明,雁鹅与兴国灰鹅聚为一类后和皖西白鹅聚在一起,然后与浙东白鹅与四季鹅的聚类体聚为一体,接着与扬州鹅聚类,最后和五龙鹅聚为一类;莱茵鹅则自成一体系。     

太湖鹅微卫星标记与体重的相关性

为了解太湖鹅群体的遗传特性，寻找其生长性状的辅助标记。该研究采用微卫星标记技术对太湖鹅群体进行了遗传多样性研究，初步探讨了微卫星标记与10周龄体重的相关性。结果显示：太湖鹅在10个微卫星标记座位上共检测到52个等位基因，群体平均杂合度为0.653 0，平均多态信息含量为0.611 2。与生长性状的关联分析发现，CKW1...     

中国长江中下游地区鹅种种群动态分析*

 通过资源调查摸清我国长江中下游地区6个鹅品种的保存现状，同时结合微卫星标记对种群结构和动态进行了检测。结果显示，6个鹅品种均处于正常保种状态； 群体平均杂合度最高的是太湖鹅（0.690），最低的是武冈铜鹅（0.567），各鹅种的平均杂合度为0.640。用UPGMA法进行聚类分析，将6个鹅品种聚为3类，四川白鹅、武冈铜鹅、道州灰鹅、酃县白鹅聚为第1类；溆浦鹅为第2类；太湖鹅为第3类。根据资源调查及分子研究结果提出了保种意见。     

江西4个地方鹅品种遗传多样性的微卫星标记分析

通过选用31个多态性较好的微卫星标记,检测江西4个地方鹅品种的遗传多样性。利用等位基因频率计算出各群体的平均遗传杂合度(H)、多态信息含量(P IC)和群体间的遗传距离(DA)。结果表明:31个微卫星位点中有25个微卫星位点在4个鹅群体中的多态信息含量均为中度多态,可作为有效的遗传标记用于各鹅品种的遗传多样性和系统发生关系的分析;4个鹅品种的杂合度都较高,平均杂合度为0.584 6~0.643 4,其中最高的是广丰白翎鹅(0.643 4),最低的是莲花白鹅,而且杂合度的高低与P IC值的大小表现出较高的一致性。用DA的U PGM A法进行聚类分析,结果4个鹅品种被聚为3类,莲花白鹅与丰城灰鹅聚为第1类,广丰白翎鹅自聚为第2类,兴国灰鹅自聚为第3类。     

利用微卫星标记分析湖南4个地方鹅品种遗传多样性

通过选用31个多态性较好的微卫星标记,检测了湖南4个地方鹅品种的遗传多样性.利用等位基因频率计算出各群体的平均遗传杂合度(H)、多态信息含量(PIC)和群体间的DA遗传距离.结果表明,31个微卫星位点中有25个微卫星位点在4个鹅群体中的多态信息含量均为中度多态,可作为有效的遗传标记用于各鹅品种的遗传多样性和系统发生关系的分析.4个鹅品种中,平均杂合度范围是0.5010 ～ 0.6705,各鹅种的杂合度都较高,最高的是酃县白鹅(0.6705),最低的是武冈铜鹅,而且杂合度的高低与PIC值的大小体现了较高的一致性.对DA遗传距离的计算表明,用UPGMA法进行聚类分析,结果4个鹅品种被聚为3类:道州黑鹅与酃县白鹅聚为第1类;武冈铜鹅自聚为第2类;溆浦鹅自聚为第3类.     

四川白鹅与莱茵鹅遗传多态性的比较

选用10个微卫星标记检测四川白鹅、莱茵鹅的遗传多样性。结果表明,10个微卫星座位共检出55个等位基因,基因频率分布在0.0000~0.6667,平均每对引物可检测5.5个等位基因;四川白鹅和莱茵鹅的平均杂合度分别为0.6561,0.7010,平均多态信息含量为0.6146,0.6522,表明2个鹅群体遗传变异大。根据基因频率推断,引物CKW10,CKW14,CKW18,CKW21,TTUCG5可作为鹅产蛋、产肉性能的辅助选择标记。     

6个白鹅品种GH基因第2外显子多态性研究

以太湖鹅、扬州鹅、豁眼鹅、浙东白鹅、皖西白鹅和四川白鹅6个鹅品种为试验材料,根据鸭、鹅GH基因序列设计1对扩增第2外显子的引物,用PCR-SSCP方法进行单核苷酸多态性分析,并对不同品种进行群体遗传学分析。结果表明,在鹅GH基因第2外显子上共发现2个单碱基突变位点,第39处的T-C突变,未发生氨基酸变化,为沉默突变;第74处T-C单碱基突变导致第25个氨基酸由缬氨酸(V)变为丙氨酸(A)。鹅群中表现出10种基因型(AA、AB、AC、AD、BB、BC、BD、CC、CD、DD)。统计结果发现10种基因型在6个鹅品种间分布存在极显著的差异(P<0.01)。所有品种均处于Hardy-Weinberg平衡状态。群体遗传分析表明太湖鹅杂合度、有效等位基因数、多态信息含量最低,浙东白鹅最高;除太湖鹅为中度多态外,其他品种均为高度多态。本研究表明鹅GH基因在不同品种中具有丰富的单核苷酸多态性,可以进一步作为候选基因来分析其与生产性状的相关性。     

中国鹅5个品种遗传多样性的随机扩增多态DNA分析

用４０个１０－寡核苷酸随机引物对中国鹅的５个品种－狮头鹅,皖西白鹅,太湖鹅,浙东白鹅和四川白鹅进行了随机扩增多态ＤＮＡ（ＲＡＰＤ）分析。结果表明,用筛选出的１４个引物共扩增出１７４个ＤＮＡ片段,其中的４８个（占２８．２％）在５个品种间表现为多态性。根据扩增ＤＮＡ片段的异同,计算了各品种和个体间的遗传多样性指数和遗传距离指数。同时,用分子进化遗传分析软件（ＭＥＧＡ）以ＵＰＧＭＡ法和ＮＪ法对遗传距离指     

白鹅脂联素基因内含子多态性检测及群体遗传分析

以扬州鹅、四川白鹅、皖西白鹅、豁眼鹅和浙东白鹅5个鹅品种为试验材料,每个品种各60只,公母各半,根据鹅脂联素基因序列设计了1对引物扩增部分内含子,用PCR-SSCP方法进行单核苷酸多态性分析,并对不同品种进行群体遗传学分析。结果表明,在鹅脂联素基因内含子上发现2个单碱基突变位点,分别为第16、26位点的A-G、T-C。鹅群中表现出3种基因型(AA、AB、BB);除豁眼鹅与皖西白鹅、浙东白鹅外,3种基因型在鹅品种两两之间分布无显著差异(P0.05)。群体遗传分析表明,豁眼鹅杂合度和多态信息含量最高,皖西白鹅最低,所有品种均表现为中度多态性。本研究表明鹅脂联素基因在不同品种中具有丰富的单核苷酸多态性,可以进一步作为候选基因来分析其与脂肪性状的关联性。     

鹅不同杂交组合肉品质比较分析

本研究选取太湖鹅、四川白鹅、皖西白鹅、五龙鹅、三花鹅设计了8个杂交组合,测定了鹅肌肉主要成分、常规肌肉品质、肌肉物理组织学特性、风味物质含量,分析比较不同鹅种的肉品质情况。结果表明,pH值8个组合没有差异,其余6个指标组间存在差异;剪切力3.09~3.78kg;系水力61.48~66.46%;水分含量66.77~73.05%;蛋白含量21.94~23.32%。脂肪含量1.67~3.06%。肌纤维密度970.79~3102.50根/mm2,各组间存在差异。肌纤维直径12.05~29.45μm,各组间存在差异。8个鹅杂交组合中必须脂肪酸百分含量以三花♀×五龙♂组合最高(13.02%),多不饱和脂肪酸百分含量以三花♀×太湖♂组合最高(15.39%);总游离氨基酸含量0.254~0.357g/100g;肌苷酸含量为1.33~4.63mg/g。总体来看三花♀×太湖♂组合肉品质较好。     

基于酶切的简化基因组测序在水禽品种进化关系研究中的应用

以基于酶切的简化基因组测序技术对5个鹅品种[狮头鹅(ST)、溆浦鹅(XP)、皖西白鹅(WX)、豁眼鹅(HY)、朗德鹅(LD)]进行测定,通过序列比较发现品种间存在SNP,在分析品种群体遗传参数的基础上,建立系统发生树。研究结果表明,所有样本酶切位点在20万左右,测序覆盖度在10%以上。狮头鹅群体平均突变位点26 172个,溆浦鹅群体34 153个,皖西白鹅群体35 179个,豁眼鹅群体为29 182个,朗德鹅群体18 675个。朗德鹅与其他鹅品种的Fst均在0.08以上,说明朗德鹅和其他鹅品种序列差异较大,狮头鹅与其他3个白鹅品种之间的Fst在0.04左右,3个白鹅品种的Fst较小。系统发生树分析表明,5个鹅品种大致分为三大类,溆浦鹅和狮头鹅聚为一类,皖西白鹅和豁眼鹅聚为一类,朗德鹅单独为一类。品种之间存在大量的SNP,该研究为鹅品种识别和进化提供依据。     

中国地方鹅种生长曲线拟合和比较分析

运用Logistic、Gompertz和von Bertalanffy3种生长模型分别对太湖鹅、五龙鹅、皖西白鹅、四川白鹅、三花鹅1～13周龄生长曲线进行拟合和比较分析。结果发现,3种模型均能较好地拟合各个鹅种的生长曲线(R2>0.96),但不同鹅种的最优拟合模型不尽相同。太湖鹅的最优拟合模型为Gompertz,三花鹅的最优拟合模型为Logistic,五龙鹅、皖西白鹅和四川白鹅的最优拟合模型为von Bertalanffy。总体来说von Bertalanffy拟合鹅生长曲线效果较好。利用最优拟合模型进一步分析模型拟合参数,皖西白鹅最早到达生长拐点,三花鹅最晚到达生长拐点。四川白鹅生长性能优良,无论绝对生长还是相对生长始终都处于曲线上方;三花鹅的生长速度则比较均匀。