基于基因富集数据的中国金鱼品种谱系研究

金鱼起源于中国,是由野生鲫鱼驯化而来的一种观赏性鱼类。金鱼不同品种间存在巨大外形差异,长期的杂交与人工选择产生了众多的金鱼品种,但也导致其谱系关系混乱复杂,划分品种的难度加大。人们尝试了许多方法明确金鱼各品种间的谱系历史与杂交关系,但是至今未取得进展。本研究收集了11个中国金鱼品种,共计59个个体,利用跨物种靶基因富集和高通量测序获取了各品种目标基因序列。以斑马鱼4434个单拷贝基因位点为参考序列,将金鱼对应的基因按照异源四倍体亚基因组分组,富集的序列分别按照两个亚基因组进行比对分型,产生35298个单核苷酸多态性(SNPs)位点数据,用于金鱼品种谱系历史和杂交关系的研究。通过主成分分析,品种遗传结构以及系统发育网状图的构建,揭示了中国部分金鱼品种的遗传关系,解释了它们的遗传演化过程：1.龙睛、琉金两种文种金鱼与和金这种文种金鱼关系较近；珍珠鳞、狮头不是来自于和金,而是由草金类的金鱼独立演化而来。2.以兰寿为代表的蛋种金鱼虽然早于水泡眼出现,但水泡眼是文种金鱼先出现水泡眼特征,然后文种水泡背鳍消失,演化出现代金鱼中的主流水泡眼。这也解释了蛋种金鱼中,水泡眼出现文种的概率比较大的现象。3.龙睛鹤顶红与狮头关系密切,先产生了头瘤的性状,而不是从龙睛演化而来,龙睛的性状是在头瘤性状出现之后产生。4.珍珠鳞、皇冠珍珠、龙睛皇冠珍珠在遗传上关系相近,皇冠珍珠是由珍珠鳞直接演化而来,先出现珍珠鳞而后出现皇冠特征。龙睛皇冠珍珠是最晚演化而来,从龙睛中获得基因,并且可认为是由龙睛与皇冠珍珠杂交而来。研究结果将帮助了解中国金鱼的演化历史,对于金鱼品种的分类和品种培育起到一定的借鉴作用。     

八个品种金鱼及野生鲫线粒体控制区遗传差异和亲缘关系的研究

采用PCR技术扩增了红草金鱼(RC),红文鱼(RF),红顶白高头(WR),白珍珠(WP),红狮头(RT),红龙睛蝶尾(MB),墨龙睛(BM),红水泡(RB)八个品种金鱼和野生鲫(WC)线粒体DNA的D-Loop区部分序列,PCR产物经纯化、测序、同源序列比对后获得长度为699 bp的核苷酸序列,在129个样本中共检测到了17个单倍型,9个品种共享1种单倍型,5个品种的金鱼(BM,MB,WR,RF,RC)检测到各自独有的单倍型。遗传距离和聚类分析结果显示6个品种金鱼(WP,BM,MB,RT,WR,RB)首先聚在一起,然后依次与红文鱼(RF)、红草金鱼(RC)、野生鲫(WC)聚在一起。金鱼首先演化为草系金鱼,草系金鱼在演变为文系中较为古老的品种之后,经过进一步的变异,分化出金鱼其他各个品种。     

八个品种金鱼及野生鲫线粒体控制区遗传差异和亲缘关系的研究

采用PCR技术扩增了红草金鱼(RC),红文鱼(RF),红顶白高头(WR),白珍珠(WP),红狮头(RT),红龙睛蝶尾(MB),墨龙睛(BM),红水泡(RB)八个品种金鱼和野生鲫(WC)线粒体DNA的D-Loop区部分序列,PCR产物经纯化、测序、同源序列比对后获得长度为699 bp的核苷酸序列,在129个样本中共检测到了17个单倍型,9个品种共享1种单倍型,5个品种的金鱼(BM,MB,WR,RF,RC)检测到各自独有的单倍型。遗传距离和聚类分析结果显示6个品种金鱼(WP,BM,MB,RT,WR,RB)首先聚在一起,然后依次与红文鱼(RF)、红草金鱼(RC)、野生鲫(WC)聚在一起。金鱼首先演化为草系金鱼,草系金鱼在演变为文系中较为古老的品种之后,经过进一步的变异,分化出金鱼其他各个品种。     

名贵金鱼 贵在哪儿

<正>所谓的名贵金鱼,一要漂亮二是稀有。漂亮,就是要求色彩搭配协调美丽且有特色。稀有,即无法批量繁殖,只是偶然出现,其特色基因很难固定。所有品种中,特征与金鲫鱼相差越远为高级金鱼,品种难得为高级金鱼,二料或者三料(即一条金鱼同时拥有两个或三个品种特性)金鱼为高级金鱼,奇者为高级金鱼。同一品种中,品种特征明显者为高级金鱼。下面结合一些自己亲身感受,把国人对精品金鱼的理解归纳为以下几点。     

国外金鱼新品种赏析

<正>金鱼起源于中国,于1502年传到日本。金鱼在17世纪末传到英国,到1世纪中叶,双尾金鱼已传偏欧洲各国传到美国是1874年,之后传遍全世界故在世界的许多国家和地区都有金鱼养殖者在培育有特色的金鱼品种。1日本日本的金鱼品种数量不少于中国日本金鱼养殖者有着很强的耐心和细心培育了各种各样有特色的金鱼品种。1.1和金。和金的体型和草金鱼类似     

金鱼品系的遗传多样性分析及亲缘关系初探

采用RAPD技术对草金(Grassgoldfish)、红龙睛(Red dragoneye goldfish)、鹤顶红(Red-head wen goldfish)、水泡(Blisters-eye goldfish)、黑寿(White-head oval goldfish)等5个金鱼代表品种的遗传多样性及其亲缘关系进行研究。用14个引物在5个金鱼群体中共检测出116个位点,其中多态性位点27个。金鱼群体总的DNA多态位点百分率为23.3%。结果表明,5种金鱼群体间的遗传相似性指数均在0.8759￣0.818之间,存在一定的差异,但未达到显著水平,群体间遗传多样性差异不明显。群体间遗传相似性度最小的为草金和黑寿(0.8759),其遗传距离最大(0.1241),说明这2种群体亲缘关系最远;鹤顶红与黑寿的遗传相似性度最大(0.9182),其遗传距离最小(0.0818),可推断两者的亲缘关系较近。UPGMA法和NJ法的聚类分析显示,草金和红龙睛,鹤顶红和黑寿有较近的亲缘关系,这与传统金鱼品种演化关系的观点一致。研究金鱼遗传多样性对保护金鱼的种质资源有重要意义。     

观赏鱼之锦鲤品种介绍(五)

正在本期介绍蛋种金鱼的代表品种兰寿和龙种金鱼的代表品种龙睛。兰寿兰寿在日本18世纪出版的金鱼书中称为"卵虫",是中国金鱼传入日本后发展出的品种。20世纪80年代,兰寿从日本引入到中国大陆。兰寿有着短且没有背鳍的体形,背部圆滑的曲线是其欣赏的重点,其     

明清时期中国金鱼谱及其饲养技术研究

金鱼是由中国人最早培育成功的观赏用鱼。金鱼谱录是专门记录金鱼品种和饲养技术的专书,出现在明、清两代。这类书籍均由长期喂养金鱼的文人雅士或爱好者写出,是潜心养金鱼的人十几甚至几十年养鱼经验的结晶,极具科学性和实用性。书中所记的珍贵品种和饲养技术,对现在的金鱼选育、喂养和玩赏仍有参考价值。     

观赏鱼之锦鲤品种介绍(六)

正在本期介绍文种金鱼的代表品种狮头和蛋种金鱼的代表品种虎头。狮头狮头金鱼出现于19世纪末,其头顶肉瘤发达,可向下延伸至两颊,如同狮子头上卷起的毛发一般,故名"狮子头"。头顶肉瘤厚厚凸起,鳃盖上有肉瘤,正面看呈方形,草莓状。肉瘤向下能包裹两腮,如昂首的雄狮一般。狮头金鱼在鉴赏时要求头、身、尾比     

让鱼文化在孩子们中传承

<正>"同学们,知道这是什么品种的金鱼吗?这叫狮头金鱼,它们是通过遗传改良的品种。你们看,它们的身体很圆,是不是很可爱?"2015年5月28日下午,在北京市朝阳区黑庄户教育辅助中心,40多名小学生围绕在排成一行的金鱼品种展示水族箱前,充满好奇地认真听着教     

金鱼Dmrt2基因表达分析

采用荧光定量PCR技术检测了Dmrt2基因的两个亚型Dmrt2a和Dmrt2b在金鱼(Carassius auratus)不同发育时期以及不同组织中的表达情况,用RACE技术克隆得到金鱼Dmrt2a cDNA序列的全长为1 755 bp,5’和3’非编码区长分别为188 bp和67 bp,推测的开放阅读框可编码499个氨基酸的多肽。分子系统进化分析表明金鱼Dmrt2a与其它鱼类Dmrt2a基因聚成一支,与斑马鱼(Daniorerio)、红鳍东方鲀(Takifugu rubripes)、青鳉(Oryzias latipes)、罗非鱼(Oreochromis Niloticus)Dmrt2a的同源性分别为85%、61%、58%、58%。荧光定量PCR结果揭示,Dmrt2a在精巢中表达量最高,在卵巢中次之,而Dmrt2b在卵巢中表达量最高,在精巢中次之,二者在肾脏、消化道、肝脏、心脏和脑中都有表达,但表达量低;不同发育时期胚胎和仔鱼的Dmrt2a和Dmrt2b表达量变化很大,Dmrt2a在受精后24 h达到最高值,之后表达量降低,而Dmrt2b在孵化后仔鱼中表达量显著增加。     

氯氰菊酯对金鱼鱼种的急性毒性研究

[目的]研究氯氰菊酯对金鱼鱼种的急性毒性。[方法]采用常规生物急性毒性试验方法,研究氯氰菊酯对金鱼鱼种的急性毒性。[结果]结果表明,氯氰菊酯对金鱼鱼种24、48、72和96 h的半致死浓度MTL（Median tolerance limits）分别为17.10、13.50、10.74和10.53μg/L,安全浓度为1.05μg/L。[结论]该研究结果为金鱼及相关观赏鱼的鱼病防治工作提供参考依据。     

鸡血藤和甘草制剂对金鱼及泥鳅急性毒性的研究

为了探究不同浓度鸡血藤(Caulis spatholobi)和甘草(Radix glycyrrhizae)制剂对不同鱼类的急性毒性,参照预试验结果将鸡血藤和甘草制剂分别添加至养殖水中,5个浓度梯度分组放养金鱼和泥鳅,每隔12h观察死亡数并计数,96h结束试验,分析鸡血藤和甘草对金鱼和泥鳅半致死浓度和安全浓度。结果表明:两种药物对金鱼的急性毒性为甘草鸡血藤,对泥鳅的毒性为甘草鸡血藤;两种鱼类对鸡血藤和甘草的耐受性为金鱼泥鳅。鸡血藤对金鱼和泥鳅的半致死浓度和安全浓度分别为2.539 0、1.655 0g·L-1和0.253 9、0.165 5g·L-1;甘草对金鱼和泥鳅的半致死浓度和安全浓度分别为2.201 0、1.842 0g·L-1和0.220 1、0.184 2g·L-1。     

Actinomycin D blocks formation of memory of shock-avoidance in goldfish

When 2 micrograms of antinomycin D was injected intracranially into goldfish immediately after a training session, the formation of long-term memory of a shock-avoidance was blocked. The results are discussed in relation to similar findings with acetoxycycloheximide and puromycin in the goldfish and with apparently conflicting results in the mouse.     

借助mtDNA控制区序列分析金鱼与不同地域鲫的亲缘关系

用PCR法克隆测定了4个品种金鱼（草金、文种、龙种和蛋种）、6个不同水域鲫与银鲫的m tDNA控制区部分序列,并对之进行比较分析。结果表明：测得的金鱼与鲫的序列长度均为471 bp,银鲫为472bp;在所用样品中共检测到10种单倍型,金鱼4品种间序列无差异,共享1种单倍型;11尾鲫（来自6个不同水域）呈现8种单倍型,4尾银鲫（来自2个不同水域）共享1种单倍型。聚类分析结果表明,金鱼隶属于鲫的一支,银鲫呈独立的另一支。对金鱼与不同地域鲫的遗传距离测定结果表明：金鱼与嘉兴南湖的鲫亲缘关系最近（遗传距离D=0.00426）,其次为盐城射阳湖鲫（D=0.00534）、淮河鲫（D=0.00641）、鄱阳湖鲫（D=0.00749）,再次为黄河下游鲫（D=0.01073）,与闽江鲫亲缘关系较远（D=0.01291）。据此推测,金鱼起源于长江流域的鲫。     

饲料中添加叶黄素对金鱼体色的影响

为考察饲料中添加叶黄素对金鱼体色的影响,在基础饲料中分别添加0、50、100、150、200和300 mg·kg-1叶黄素,饲喂平均体质量(7.8±0.3)g文种金鱼10周,用色差计(WSC-S)对金鱼体表三刺激值进行测定.结果表明:饲料中添加叶黄素对金鱼增质量率无显著影响,但添加300 mg·kg-1叶黄素显著增大了饲料系数(P0.05);饲料中添加叶黄素0~150 mg·kg-1时,金鱼体表+a*值(红色)随叶黄素添加量的增加而增加,L*值(亮度)随叶黄素添加量的增加而降低;当叶黄素添加量大于150 mg·kg-1时,+a*和L*值基本保持稳定;与对照组相比,叶黄素添加量为200和300 mg·kg-1时,+b*值(黄色)显著增加(P0.05);随叶黄素添加量从0增加到150 mg·kg-1,金鱼鳞片、皮肤、肌肉和尾鳍中的叶黄素含量也增加,当添加量大于150 mg·kg-1时,上述各部位叶黄素含量达到最高并基本稳定;添加100、150、200和300 mg·kg-1叶黄素均可显著提高金鱼血清酪氨酸酶活力(P0.05).上述结果表明,在金鱼饲料中添加叶黄素150 mg·kg-1可有效改善金鱼体色.