人工合成六倍体小麦的ISSR位点遗传多样性分析

为了解人工合成六倍体小麦品种的遗传多样性,选用了100条ISSR引物对11份人工合成小麦和3个普通小麦材料(TP、HTS-1、CS)进行了遗传多样性分析。筛选出了42条引物可用于遗传多样性分析,其中有24条引物对供试材料具有较强的鉴别能力。42条引物共扩增出了273个条带,每条引物扩增出的条带数是3~12,平均每条为6.5,同时检测到在14份小麦试材中有170(占62.3%)个等位变异位点,引物等位变异数为1~11,平均每个位点出现4.5个等位变异。42条引物扩增产物的多态性信息量(PIC)为0.499~0.879,平均为0.767,多数引物扩增的多态性信息量在0.800左右。14份材料间的遗传相似系数为0.663~0.934,平均为0.790。根据材料间的遗传相似系数聚类,14个材料被聚为3类,其中聚为第2类的试材最多。本研究表明,14份小麦材料遗传相似性较大,亲缘关系较近,但参试材料总体遗传多样性水平较高。聚类分析结果与试材系谱及亲本来源相吻合。结果表明ISSR标记技术可应用于物种的鉴别、遗传多样性研究和遗传图谱构建。     

湖南省饭豆地方种质资源遗传多样性的RAPD和ISSR分析

为揭示湖南省饭豆地方品种的遗传多样性,促进种质资源的有效保护和利用。本研究利用RAPD和ISSR标记分析了源于湖南省各地36份古老饭豆地方品种的遗传多样性,并采用UPGMA方法进行了遗传聚类分析。结果表明：12个RAPD引物和4个ISSR引物在供试材料中共扩增产生81条带型清晰的条带,平均每个引物扩增产生5.06个条带;其中59个为多态性条带,占总扩增条带的72.84%,具有多态性引物的PIC值在0.397~0.968之间;通过UPGMA法进行聚类分析表明供试材料的遗传相似系数在0.605~0.877之间,供试材料被分为4大类,且聚类结果表现明显的地域特征。本研究结果可为本省饭豆种质资源保护和育种研究提供理论依据。     

引进国外马铃薯种质资源的遗传多样性分析

应用RAPD标记技术研究国外马铃薯品种的遗传多样性,以期明确这些品种的亲缘关系,为马铃薯优良品种的选育提供理论依据。利用筛选的29条RAPD引物,对24份国外马铃薯品种进行遗传多样性分析。结果显示,29条RAPD引物共扩增出165个条带,其中116条为多态性条带,多态性比例为70.3%;试供的24个国外马铃薯品种间的遗传相似系数在0.514~0.816之间,平均为0.677;相似系数小于0.6的品种对仅为7.25%;24个马铃薯品种可聚为2大类6亚类。结果表明,试供的24个国外马铃薯品种间的遗传相似性高,遗传基础比较狭窄。     

8份剑麻种质亲缘关系的ISSR和RAPD分析

为了揭示剑麻栽培品种的遗传多样性,利用ISSR和RAPD分子标记技术对8份剑麻种质的亲缘关系进行分析。结果表明,筛选后选用的8条ISSR引物和8条RAPD引物,分别产生了53条和66条扩增条带,其中多态性条带分别为44条和61条,多态性条带百分率分别为83.02%和92.42%。根据2种标记的扩增结果,用UPGMA法对8份剑麻种质进行聚类分析,供试材料之间具有较高的遗传多样性,其品种间遗传相似系数分别为0.59～0.80和0.52～0.76。2个标记的聚类结果基本一致,但有点差异,可将供试的8份剑麻种质划分为2类群,而且2个标记聚类结果呈显著相关性,相关系数为0.70。可见,剑麻种质资源的遗传多样性丰富。     

25个猕猴桃材料遗传多样性分析及DNA指纹图谱的建立

利用ISSR分子标记对25个猕猴桃品种和种质资源材料进行遗传多样性分析,并构建其ISSR指纹图谱,旨在阐明其亲缘关系,为遗传、育种和利用提供理论依据。结果显示,从100条引物中筛选出10条引物,在25个供试材料中共扩增出172条带,每条引物平均扩增条带数为17.2条,多态性条带169条,每条引物平均扩增多态性条带数为16.9条,多态性比例为98.26%;遗传相似系数值在0.51~0.87之间;在相似系数水平为0.604时,可将所有供试材料聚为三类。本研究构建的指纹图谱可用于猕猴桃种质的分类与鉴定,为种质资源的鉴定、分类、利用和杂交育种亲本的选配等方面提供理论依据。     

扶芳藤遗传多样性RAPD鉴定及类型划分研究

利用RAPD标记技术对56份扶芳藤、3份大叶黄杨和1份胶东卫矛材料进行遗传多样性分析，筛选出35个引物扩增出205条稳定、清晰、可重复的DNA片段，其中32个引物扩增出100条带具有多态性，其多态性频率48.78%；不同引物及不同位点谱带所揭示的扶芳藤遗传差异较大，其遗传多样性指数分布范围为0.0331~0.8904；根据引物L04和U12扩增的RAPD带型和以遗传距离进行聚类分析结果可明显地区分扶芳藤与大叶黄杨、冬季全部落叶的与冬季不落或部分落叶的扶芳藤类型、从我国收集的扶芳藤资源与从捷克和美国引入的3个品种；同时聚类分析还可区分我国东南沿海地区与其他地区收集扶芳藤资源。     

应用RAPD分析四川马铃薯地方品种与部分栽培品种间遗传关系

为探讨四川省马铃薯地方品种与栽培品种间遗传关系，评价其在遗传研究与育种利用价值，指导杂交亲本选配，对21份地方品种和10个栽培品种进行了RAPD分析。选取8份差异较大的材料对170条RAPD引物进行筛选，获得20条多态性高、条带清晰、稳定的RAPD引物。20条RAPD引物共扩增出191个位点，其中多态性位点172个；平均多态性位点比率90.1%，平均多态性信息量(PIC)为0.822；栽培品种、地方品种平均PIC分别为0.823和0.814。遗传距离与聚类分析表明：31份材料间平均遗传距离0.4274，变幅为0.1481~0.5852，地方品种间平均遗传距离和变幅均高于栽培品种间，地方品种与栽培品种间平均遗传距离为0.4496；表明地方品种中可能存在更广泛的遗传变异，具有较高的育种利用价值。大部分地方品种出乎意料与栽培品种聚在不同的类中，与供试栽培品种间亲缘关系较远，可能具有较高的杂交组配潜力；而N5-33、N5-38和N6-22可能分别源自于大西洋、疫不加与南湖塔(或米拉)，值得深入对比研究。     

利用RAPD技术研究弱秋眠性紫花苜蓿遗传多样性

在42个供试品种中选出生长势良好的半秋眠、不秋眠紫花苜蓿（Medicago sativa L.）品种13份，用RAPD技术对其遗传多样性进行分析。结果表明，30个随机引物均能扩增出清晰的条带，数目在1～14条之间。其中12条引物占所用引物的40%，在13份材料中共产生分子量不同的126个RAPD标记，其中多态性条带116条，占92.06%。说明半秋眠、     

西南横断山区野生狗牙根遗传多样性的RAMP分析

采用RAMP标记技术,分析了西南横断山区25份野生狗牙根材料的遗传多样性。结果表明,被测材料间RAMP标记多态性较高。10个引物组合扩增出的56条带中,39条具多态性,PPB为69.64%。每个引物组合可扩增出2~6条多态性带,平均3.9条。RAMP标记遗传相似性系数(GS)变化范围为0.6667~0.9474,平均值为0.8129。RAMP标记可将所有25份狗牙根材料区分开,供试材料可以明显的划分为4大类。聚类结果与材料的地理分布有一定关系。据此认为,西南横断山区野生狗牙根种质资源在分子水平确实存在较大的遗传差异,RAMP是评价狗牙根遗传多样性的有效方法。     

浙江省10个晚粳稻品种SSR指纹图谱的构建及遗传差异分析

本研究利用均匀分布于水稻12条染色体上的48对SSR引物,采用荧光标记毛细管电泳检测方法,以浙江省主要推广种植的10个常规晚粳稻品种为材料,进行遗传多样性分析并构建其指纹图谱。结果表明,共有27对引物在品种间存在57个多态性片段,每对引物可以扩增出2~3个态性片段,平均每个引物2.1个。10个品种间的遗传相似系数为0.439~0.877,平均为0.642,10个供试材料间遗传基础相对狭窄。选用7对多态性较高的引物构建的核心指纹图谱能区分10个晚粳稻品种。聚类分析结果显示,在遗传相似系数0.580处可将10个品种划分为两类:越光衍生品种如浙粳27和其他类型。研究结果为浙江省常规晚粳稻品种的保护和纯度鉴定,选育和推广提供理论和技术支持。     

六倍体小黑麦基于农艺性状和品质性状的多样性分析

为明确从国际玉米小麦改良中心(CIMMYT)引进的111份六倍体小黑麦的遗传多样性特点,为其有效利用提供参考依据,对其农艺性状和品质性状特点进行了多样性分析。结果表明:6个农艺性状的平均变异系数为16.94%,平均多样性指数是1.96,小穗数/穗、穗长和千粒重的多样性指数均高于2.00;10个品质性状的平均变异系数为8.60%,平均多样性指数是1.94,吸水率、面团稳定时间的多样性指数均高于2.00。结论:111份六倍体小黑麦的农艺性状和品质性状表现出较大的差异,具有较丰富的多样性。     

栽培荞麦种子醇溶蛋白遗传多样性分析

利用A-PAGE（Acid-polyacrylamide gel electrophoresis）对来源于7个国家的76份栽培荞麦（苦荞54份，甜荞22份）醇溶蛋白遗传多样性进行评价。结果表明，荞麦醇溶蛋白位点存在丰富的等位变异，共分离出18条迁移率不同的谱带，每份材料具有6~12条不等，平均9.5条，多态性带占88.89%。材料间平均遗传相似系数（GS）为0.777，变幅为0.389~1.000。在GS为0.63的水平上供试材料可聚为苦荞和甜荞两大类，绝大部分来自于相同或相似生态地理环境的材料聚成一类，表明荞麦醇溶蛋白所揭示的遗传关系与地理来源有较高的相关性。     

AFLP分析小豆种(Vigna angularis)内遗传多样性

利用12对AFLP引物,对来自于世界6个国家的146份小豆(Vigna angularis)栽培变种(var. angularis)和野生变种(var. nipponensis)种质的基因组DNA进行扩增,得到580条清晰的显带,其中313(53.93%)条呈多态性,平均每对AFLP引物得到26.08条多态性带;平均遗传距离0.35,变异幅度为0.00～0.87.利用AFLP多态性数据进行的Jaccard''s遗传距     

甘蓝品种的AFLP指纹鉴别图谱分析

本试验采用AFLP技术分析了来自全国9个栽培地区的44个甘蓝主栽品种,共筛选了40对E 3/M 3引物组合,多态性条带的数量从0条到15条不等。其中引物组合E-AAC/M-CTA是甘蓝品种中多态性最高的引物,有15条多态性条带,多态性条带的百分率为30%,但该引物不足以区分44个供试的甘蓝品种。同时筛选了11组E 2/M 3对引物组合,其中引物组合E-AG/M-CTC产生了13条清晰的多态性条带。以E-AAC/M-CTA和E-AG/M-CTC这两对引物组合的多态性条带构建了44份甘蓝品种材料的指纹图谱,此指纹图谱可以将供试的44份材料一一区分。     

AFLP in Triticum aestivum L.: patterns of genetic diversity and genome distribution

The amplified fragment length polymorphism (AFLP) procedure was applied to a diverse panel of wheat (Triticum aestivum L. em. Thell.) accessions and sixty-nine of the recombinant inbred lines (RILs) from the widely used genetic mapping population derived from the cross of Opata 85 and W7984. Most (76.8%) bands were monomorphic among T. aestivum accessions. The majority of bands monomorphic in T. aestivum also were present in the synthetic wheat parent (W7984). Ten primer pairs generated 153 polymorphic AFLP bands, 140 of which could be assigned to a chromosome location and were relatively evenly distributed on the genetic linkage map. AFLP loci in T. aestivum were distributed throughout the genome; they generally have only one detectable sequence variant; and they exhibit monogenic dominant mendelian inheritance. Frequencies of polymorphic bands in the germplasm sampled are in the range that enables informative cluster analyses as well as map-based diversity and association analysis studies. AFLP bands mapped to individual loci in the Opata 85/W7984 RIL population will frequently be polymorphic in other crosses or germplasm, irrespective of whether the band arises from the T. aestivum parent or the synthetic wheat parent. This revised version was published online in July 2006 with corrections to the Cover Date.     

Genetic instability of bermudagrass (Cynodon) cultivars 'Tifgreen' and 'Tifdwarf' detected by DAF and ASAP analysis of accessions and off-types

DNA amplification fingerprinting (DAF) and arbitrary signatures from amplification profiles (ASAP) were used to evaluate the genetic stability of two important bermudagrass (Cynodon) cultivars, the interspecific cross Tifgreen and its somatic mutant Tifdwarf, and study genetic diversity and origin of derived bermudagrass off-types that exhibit patches of contrasting morphology and performance. Mini-hairpin primers produced complex and reproducible DAF and ASAP profiles with high levels of polymorphic DNA, and established genetic relationships between 11 Tifgreen and 8 Tifdwarf turf plot accessions and 16 off-types. DAF analysis revealed an average 14.1 ± 5.6 (SE) polymorphic bands/primer within cultivar accessions. In contrast, the higher resolving power of ASAP detected 24.5 ± 2.1 polymorphic bands/primer. Similarly, DAF and ASAP produced 13.0 ± 5.5 (SE) and 20 ± 2.8 polymorphic bands/primer within off-types, respectively. Phenetic analysis using cluster (UPGMA) and ordination (PCO) techniques showed that both Tifdwarf and Tifgreen were genetically unstable. The analysis showed that almost all cultivar accessions and one-half of the off-types studied were genetically distinct, but very close to each other. In this case, genetic variation was probably the result of somatic mutations. The other off-types and some Tifgreen accessions represented a genetically distant and diverse bermudagrass group of interspecific hybrid (n=27) origin. Off-types were probably the result of sod contamination. Results complement a previous study that established that the interspecific Tifway bermudagrass was genetically stable whereas derived off-types were contaminants rather than somatic mutants. Tifgreen and Tifdwarf showed genetic instabilities that were readily detected by DNA amplification with mini-hairpin primers. The present study offers a direct molecular alternative capable of evaluating the genetic stability of selected cultivars. This revised version was published online in July 2006 with corrections to the Cover Date.     

ISSR标记对34份樱桃种质资源的遗传分析

利用ISSR标记对34份樱桃种质资源进行遗传多样性检测。结果发现，ISSR标记能够揭示材料间较高的遗传多样性。每个引物可获得6～12条DNA片段，平均为8.76条；17个ISSR引物共扩增出149条DNA片段，其中143条具有多态性，多态性比率（PPB）为95.97%；平均多态信息量（PIC）为0.90；每个位点有效等位基因数（Ne）为1.914；材料间遗传相似系数GS变幅为0.44～0.91，平均达0.73。通过聚类，从分子水平对樱桃种质资源的遗传关系进行分析，并对34份资源进行分类，ISSR标记能将34份樱桃种质完全区分开，为樱桃种质资源的研究利用提供参考。     

不同来源棉花种质资源遗传多样性的ISSR分析

 采取ISSR分子标记对48份棉花种质资源的遗传多样性进行分析，从60条ISSR引物中筛选出11条引物，这11条引物共扩增出92个条带，平均每条引物扩增出8.36个条带；其中多态性带77个条带，多态率达83.70％。UPGMA聚类分析显示，48份材料的相似性系数（GS）变化范围在0.27～0.93之间。聚类将48个种质资源划分为 4个大类(GS=0.55)，湛江野生棉、廉江野生棉与其它品种在遗传上有很大差别，属于较原始类型，归为一类；长绒棉与陆地棉品种存在明显的遗传差异也单独归为一类；其它不同省份的陆地棉品种在遗传上有较高的相似性，归为其它类型。分析结果表明，ISSR具有丰富遗传多样性和稳定性, 是一种较好的遗传分子标记，适宜于棉花品种遗传多样性分析     

瓠瓜种质资源遗传多样性的RAPD分析

采用RAPD分子标记对源自中国7个省份的38份瓠瓜种质资源进行遗传多样性分析.20个随机引物共扩增出104条多态性带,平均每个引物扩增的多态性带数为5.2条,多态性位点百分率为51.2%.利用NTSYS-pc软件计算种质问的遗传距离,用15PGMA法进行聚类分析,将供试的38份种质可分为3个类群8组,用EIGEN方法进行主坐标分析,将其分为3个类群13组.两种分类方法所获结果基本一致.RAPD分子标记表现出与瓠瓜的农艺性状分类和地区分布有一定的相关性.