太湖秀丽白虾遗传多样性的RAPD分析

用随机扩增多态DNA（RAPD）技术对取自4个湖区（东太湖、南太湖、西太湖、北太湖）的各20尾太湖秀丽白虾进行了遗传多样性分析。筛选的17个随机引物共检测到85个位点（200-1500bp）。各群体的多态位点比例为32.94%-38.82%,遗传多态度为0.2134-0.2518,群体间最大遗传距离为0.0545,最小遗传距离为0.0094。用UPGMA对4个群体进行聚类分析,构建聚类分析图。结果表明,太湖秀丽白虾的遗传多样性较丰富,不同湖区的群体没有明显的遗传分化。     

长江下游铜鱼线粒体DNA（mtDNA）遗传多样性的PCR-RFLP分析

对长江下游铜鱼线粒体DNA控制区（D-Loop区）和细胞色素b（Cytb）基因进行PCR扩增,扩增片段用10种限制性内切酶酶切。PCR-RFLP研究结果表明,D-Loop区和Cytb基因均未表现出个体之间的长度变异现象。10种核酸内切限制酶中,有2种对Cytb基因有酶切位点,有3种对D-Loop区有酶切位点。有酶切位点的5种限制性内切酶共检测到3种线粒体DNA单倍型。在Cytb基因检测到铜鱼个体间的变异,在D-Loop区没有检测到铜鱼个体间的变异。长江下游铜鱼线粒体DNA单倍型多样性指数（h）为0.6071,线粒体DNA遗传多样性较低。     

红叶李与安哥诺李及其杂交子代的RAPD分析

利用随机扩增多态性DNA分子标记（RAPD）技术对红叶李与安哥诺李及其杂交子代中的10株植株进行遗传多样性分析。从100个随机引物中筛选出15个引物,然后对所有子代进行分析。利用PopGene3.2软件分析所得图谱的多态位点数、多态位点百分率、Shannon信息指数(I)、Nei's基因多样性指数(H)、遗传距离和遗传一致度。用DPSv2.0软件依据所得到的遗传距离,按照非加权平均距离法（UPGMA）构建树状图。结果表明：15个随机引物共扩增出多态条带89个,总的多态位点百分率为93.54%,平均Shannon信息指数为0.4298,平均Nei's基因多样性指数为0.3574,说明杂交后代具有较丰富的遗传多样性。从树状图可以看出杂交子代的遗传变异较丰富,其中1号植株与母本亲缘关系最近,最有可能稳定遗传母本的红叶性状。     

基于DNA分子标记技术研究的10个特色茶花品种遗传差异分析

采用随机扩增多态性DNA (RAPD)技术对10个温州特色茶花品种的遗传多样性进行研究。15条十聚体随机引物共检测到105个清晰扩增位点,其中多态性位点79个,多态位点百分率为77.54%。遗传相似性分析表明：10个样品遗传距离在0.2236～0.4777之间,其中样品大朱砂与快乐王遗传距离最大（0.4905）,而金盘荔枝与快乐王最小（0.2236）;聚类结果显示：在遗传相似系数为 0.62时,10个茶花品种共分三组,其中样品弁天神乐、点雪分别自成一组,其余样品聚类一起。     

四种金鱼的遗传多样性研究

利用随机扩增多态DNA(RAPD)技术对红白龙睛蝶尾、狮头、黑龙睛、红白高头珍珠鳞四个品种金鱼进行基因组DNA的遗传多样性分析。在事先优化的条件下,试验从选用的40个随机引物中筛选出8个有效引物。共检测到72个清晰稳定的位点,大小为300bp～2500bp,其中48个位点具有多态性,各品种的多态位点比例分别为38.98%,40.29%,48.61%,30.56%,Shannon信息指数为0.1704～0.2954。遗传距离显示四个品种金鱼有一定遗传分化,其中狮头与红白高头珍珠鳞遗传距离最大(0.2303),红白龙睛蝶尾与黑龙睛遗传距离最小(0.0784)。利用UPGMA进行聚类分析表明,红白龙睛蝶尾和黑龙睛亲缘关系最密切,其次是狮头,最后为红白高头珍珠鳞。引物OPY17扩增获得的350bp片段为红白高头珍珠鳞的特异分子标记,可用于红白高头珍珠鳞的鉴别。     

濒危植物望天树的遗传多样性和居群遗传结构

龙脑香科(Dipterocarpaceae)濒危植物望天树(Parashorea chinensis)目前仅局限分布于热带亚洲北部边缘,目前已受到特别的保护,但有关其遗传特性的研究很少.在本研究中,使用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术对望天树7个天然居群进行了遗传多样性和群体遗传结构的研究.望天树7个天然居群(194个个体)用20个随机引物进行了扩增,48.22%的RAPD位点为多态位点,平均每个居群的多态位点百分比为20.84%.居群内的平均基因多样度为0.7870(用Shannon表型多样性指数来测量),整个物种的基因多样度为1.4100,居群内的基因多样度为55.82%,居群间的基因多样度为44.18%.GST平均值为0.4448.AMOVA 分析表明37.67%的遗传变异存在于地区间,11.40% 存在于地区内的居群间,而50.93% 则存在于居群内.结果揭示了望天树低水平的遗传多样性和很强的地区居群分化,这可能是由于望天树在其进化历史上,居群不断的减小及再扩张所引起的居群瓶颈所造成的.相关分析没有检测到居群大小和遗传多样性大小的正相关,而居群间的遗传距离和地理空间距离检测到了显著的正相关.所得结果对该物种保护策略的制定有指导作用.     

濒危植物望天树的遗传多样性和居群遗传结构

龙脑香科(Dipterocarpaceae)濒危植物望天树(Parashorea chinensis)目前仅局限分布于热带亚洲北部边缘，目前已受到特别的保护，但有关其遗传特性的研究很少。在本研究中，使用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术对望天树7个天然居群进行了遗传多样性和群体遗传结构的研究。望天树7个天然居群(194个个体)用20个随机引物进行了扩增，48．22％的RAPD位点为多态位点，平均每个居群的多态位点百分比为20．84％。居群内的平均基因多样度为0．7870(用Shannon表型多样性指数来测量)，整个物种的基因多样度为1．4100，居群内的基因多样度为55．82％，居群间的基因多样度为44．18％。GsT平均值为0．4448。AMOVA分析表明37．67％的遗传变异存在于地区间，11．40％存在于地区内的居群间，而50．93％则存在于居群内。结果揭示了望天树低水平的遗传多样性和很强的地区居群分化，这可能是由于望天树在其进化历史上，居群不断的减小及再扩张所引起的居群瓶颈所造成的。相关分析没有检测到居群大小和遗传多样性大小的正相关，而居群间的遗传距离和地理空间距离检测到了显著的正相关。所得结果对该物种保护策略的制定有指导作用。     

内蒙古中东部地区亚洲小车蝗3个种群的遗传多样性分析

为研究亚洲小车蝗不同地域自然种群的遗传变异及其分化,采用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术对内蒙古中东部地区3个种群的亚洲小车蝗(Oedaleus decorus asiaticus Bei-Bienko)进行了遗传多样性分析.用21个随机引物对亚洲小车蝗3个种群扩增出的总位点数为252,总多态位点百分率为91.67...     

利用微卫星标记分析建鲤种质资源的研究

为了评估和合理利用建鲤种质资源。从建鲤繁育群体中随机选取185尾鱼,用20个微卫星位点进行遗传多样性分析。结果表明：20个微卫星位点在该群体中所检测到的等位基因片段长度在114~316 bp,共检测出156个等位基因和402种基因型,各位点等位基因数为5~13个,平均7.8个,基因型数10~44种,平均20.1种;各位点观察杂合度(Ho)、期望杂合度(He)分别在0.346~0.978和0.619~0.880之间,平均分别为0.6434和0.757;所检测的20个位点多态信息含量(PIC)在0.552~0.868之间,平均为0.7253,都属于高度多态位点(PIC>0.5)。实验结果表明,该建鲤繁育群体多态信息含量丰富,遗传多样性水平较高,具有较大的选育潜力。群体内平均固定系数(FIS)为0.1479,说明该建鲤群体存在杂合子缺失现象。根据个体间的遗传距离构建的聚类图可以清楚地显示每个个体之间的遗传差异,这可为建鲤保种和繁殖配组提供依据,避免近交现象。     

克新系列马铃薯遗传多样性的RAPD分析

利用RAPD标记技术对19份克新系列马铃薯品种进行了遗传多样性分析,分别提取19份马铃薯品种的DNA,进行随机引物多态性扩增,从1000条随机引物中初步筛选出7条有多态性的引物进行详细研究,每条RAPD引物扩增出4~9条带,共获得52条带,其中多态性条带为43条;19份马铃薯品种的遗传距离介于0.17~0.72之间,平均值为0.39,平均遗传距离介于0.31~0.51之间;聚类分析结果在GS=0.53处可将克新系列马铃薯品种划分为三类,聚类结果与系谱分析基本相符,同时也说明克新系列马铃薯的遗传基础有所拓宽。研究表明：RAPD标记简便、快速、成本低,适用于分析马铃薯遗传多样性,指导马铃薯育种实践中的亲本组配。     

日本沼虾不同地理种群的遗传多样性研究

本文采用随机扩增多态DNA（RAPD）技术对6个地理种群（微山湖、洪泽湖、太湖、龙感湖、洪湖、珠江）的日本沼虾各30个个体进行了遗传多样性分析。在筛选出的18个引物中共检测到201个位点,大小在100～2000bp之间。多态位点141个,多态位点比例70.15％;各种群的多态位点数为30～99不等,多态位点比例为21.13%～55.93%。日本沼虾中国不同地理种群的平均遗传杂合度为0.2446,各种群内平均遗传杂合度为0.1132～0.2071。Shannon信息指数（I）为0.1695～0.2950。日本沼虾6个地理种群的两两地理种群间遗传分化指数Gst值在0.2116～0.4442之间,种群间总的遗传分化指数Gst0值为0.4858,Nm值在0.6257～1.8628之间,表明日本沼虾种群间已经发生显著或重要分化。同时发现OPX－830bp、OPI－360bp为珠江种群区别于其他种群的特征标记。聚类分析结果表明,洪湖种群与龙感湖种群,洪泽湖种群与微山湖种群分别先聚在一起,再与太湖种群聚类,最后与珠江种群聚合在一起。     

观赏向日葵种质资源遗传多样性RAPD分析

利用RAPD标记技术,从90条随机引物中筛选出16条对16个观赏向日葵种质资源进行DNA水平上的多态性检测,共获得242条DNA片段,大小分布在200～2800 bp之间,其中162条带具有遗传多态性,约占总数的66.9%,揭示了观赏向日葵较为丰富的遗传多样性.16个观赏向日葵的遗传相似性分析表明,各基因型间的Nei氏相似性系数分布在0.36～0.84之间,平均相似性系数为0.590 3;聚类分析结果在一定程度上可区分出不同的基因型,多数来源相同的种质资源表现出较为密切的亲缘关系.     

62株草菇遗传多样性分析

为了借助分子标记手段对草菇菌株进行鉴别，利用7个RAPD、ISSR，对62个草菇菌株基因组DNA进行PCR扩增，对草菇菌株的遗传差异进行分析。结果表明，7个引物共扩增出46条清晰的DNA片段，其大小介于250-2000bp，其中多态性片段43条，平均多态性位点百分率为93.5%。DNA指纹图谱分析结果表明，所有的供试菌株间的DNA指纹均存在差异性，各菌株间的遗传相似系数在0.63~0.97之间。聚类分析结果表明，62个草菇菌株在遗传相似系数为0.80处可以分成25个群组 草菇V0062、V0079和V0004与其它菌株之间的遗传距离最远。菌株V0084和V0085相似系数为0，需要借助其它方法进行进一步的鉴定。     

白菜种质遗传多样性与亲缘关系的ISSR标记分析

摘要：从分子水平用ISSR标记法对白菜遗传多样性进行分析,从100个ISSR引物中共筛选出11个多态性明显、条带清晰、反应稳定的引物,对65个样品DNA共扩增出107条谱带,平均每个引物扩增出9.72条带,其中多态性位点102个(93.5% )。种间遗传相似系数在遗传距离在0.40～0.65 之间,表明白菜栽培种内品种间的遗传基础相对较宽,存在较大的遗传变异性。利用UPGMA聚类分析表明：能将65个白菜地方品种划分为四大类。由ISSR标记聚类结果所表现出的大多种质之间的亲缘关系与其来源地有较大的相关性,但也有地理差别很大的白菜资源遗传关系较近的情况。本研究还表明,ISSR 标记比RAPD 标记具有更高的稳定性,在植物遗传多样性的分子标记或克隆研究中,可优先使用ISSR 标记。     

Genetic diversity and relationships among pea cultivars revealed by RAPDs and AFLPs

In order to obtain an overview of the genetic diversity present within the set of pea cultivars released in Germany, 21 cultivars were analysed at the DNA level by random amplified polymorphic DNAs (RAPDs) and amplified fragment length polymorphisms (AFLPs), as well as for agronomic traits. Yield of grain cultivars ranged from 2.95 to 3.87 t/ha. Based on the screening of 60 RAPD primers and 32 Eco RI + 3/Mse I+3 AFLP primer combinations, 20 RAPD primers and 11 Eco RI + 3/MseI+ 3 primer combinations generating polymorphic and distinct fragments were chosen for estimation of genetic diversity. Twenty RAPD primers amplified a total of 314 scorable bands ranging from about 262 bp to 1996 bp. Of these, 175 fragments (55.7%) were polymorphic. Based on these data, genetic similarity (GS) was estimated between 0.80 (‘Lisa’ vs.‘Grapis’) and 0.94 (‘Bohatyr’ vs. ‘Sponsor’; mean GS = 0.88). Eleven AFLP primer combinations led to the amplification of 949 scorable fragments ranging from 43 to 805 bp and of these, 462 (48.7%) were polymorphic. Genetic similarity based on AFLPs was calculated between 0.85 (‘Lisa’ vs.‘Laser’) and 0.94 (‘Bohatyr’ vs. ‘Sponsor’, mean GS = 0.90). Correlation of genetic similarity estimated on RAPDs and AFLPs was estimated at r = 0.79** using Spearman's rank correlation coefficient and at r = 0.84 by the Mantel test, respectively. UPGMA cluster analysis carried out on these data separately for RAPDs and AFLPs and on the combined data reflected, to some extent, pedigree relationships and cophenetic correlations (r = 0.89 for RAPDs, r = 0.88 for AFLPs, and r = 0.93 RAPDs + AFLPs) indicate a good fit of respective clusters to genetic similarity data. The correlation of cluster analyses to pedigree information and the impact on parental genotype selection is discussed.     

安徽野生香菇遗传多样性及杂种优势的RAPD分析

采用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术,利用17个引物对26个安徽野生香菇菌株和6个香菇栽培品种进行了遗传多样性分析,并构建了遗传相关聚类图。在128个RAPD标记中,多态性标记为104个,占81.3%。聚类分析显示,当以相异距离0.25为阈值,32个菌株被划为5个RAPD遗传组,多数菌株之间遗传相似性较低。表明供试菌株在DNA水平上存在比较显著的遗传变异,具有较丰富的遗传多样性。杂种优势的检测表明亲本间遗传距离较大的组合其杂种优势也较强。     

梨种质资源遗传多样性研究中的RAPD技术引物筛选

以梨属44个种和品种为试验材料,利用RAPD技术从50个随机引物中筛选出18个多态性引物,用于梨种质资源遗传多样性研究。结果表明：所选出的多态性引物每个引物扩增出的条带数在4—11之间,扩增出的DNA片段分子量大多在450bp—2000bp之间,共扩增出118个条带,其中样品间相同的条带数有11条,呈现多态性的条带107条,多态百分率达90.8%。     

利用RAPD分子标记分析玉米种质遗传多样性

以RAPD分子标记技术对玉米的10个品种的全基因组DNA进行PCR扩增,再用Popgene32软件和SPSS 13.0软件分析扩增结果,研究10个玉米的种质资源遗传关系。结果表明：（1）所选20个引物可扩增出214条RAPD条带;（2）所选引物扩增条带的多态性比率为86.4%,RAPD分子标记扩增10个玉米品种间的相似性系数分别在0.316-0.654之间;（3）用RAPD-PCR扩增条带的分析结果建立了遗传相关系数矩阵、构建了分子树状图、可将10个玉米品种分为3个类群;（4）RAPD分子标记适合于构建玉米的DNA指纹图谱,进行品种鉴定和遗传分析。     

不同黑麦草及其近缘种高羊茅的RAPD多态性分析

利用RAPD分子标记技术对黑麦草及其近缘种高羊茅的遗传关系进行了分析,结果发现,14个引物共扩增出62条带,其中52条带为多态性带,占总带数的83.9%,表明在这8个品种间具有较高的遗传多样性,存在一定的遗传分化。从UPGMA聚类分析的结果来看,特高黑麦草、蓝天堂黑麦草、多年生黑麦草、羊毛黑麦草、邦德黑麦草、美兰黑麦草和高羊茅黑麦草作为一个系谱群,它们之间有较为密切的亲缘关系;同时发现,高羊茅与其它7个草种间存在有较明显的遗传分化。