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《黑龙江畜牧兽医》2016,(16)
为优化出可获得完整瘤胃细菌总DNA的方法,以满足分子生物学研究需要,试验采用3种DNA提取方法对瘤胃细菌DNA进行提取并对提取效果进行了比较。结果表明:细菌基因组试剂盒法提取的DNA其OD_(260)/OD_(280)值在1.8以上,电泳无杂带,DNA的提取效果最佳,PCR扩增效果较好;珠磨-CTAB法提取的DNA其OD_(260)/OD_(280)值在1.8以上,电泳结果存在少量杂带;水煮法提取的DNA其OD_(260)/OD_(280)值在2.0以上,无电泳条带,DNA严重降解。推荐采用细菌基因组DNA试剂盒法和珠磨-CTAB法对瘤胃细菌进行DNA提取。 相似文献
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辽东栎基因组DNA提取方法比较与优化 总被引:1,自引:0,他引:1
针对辽东栎叶片组织中多糖含量高严重影响基因组DNA的提取问题,比较了改良SDS法、改良CTAB法1和改良CTAB法2等3种方法的处理效果。结果表明:用改良SDS法提取DNA多糖杂质多,易降解、褐化严重;用改良CTAB法1提取DNA难以去除植物组织中的多糖类杂质;而改良CTAB法2提取的DNA,杂质少,纯度高。 相似文献
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本试验通过采集乌鲁木齐燕儿窝种牛场2003年5月份所有泌乳奶牛的牛奶样品,使用不同超声波功率(0、100、120、140、160 W)处理后,采用十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)、十二烷基磺酸钠(SDS)法提取牛奶中细菌DNA,并通过DNA浓度、纯度和细菌通用引物扩增16S rDNA的V6-V8区判定DNA的质量,筛选出提取牛奶中细菌DNA的最佳方法。结果表明,未使用超声波处理样品,直接采用CTAB、SDS法提取出的DNA无法扩增出细菌16S rDNA V6-V8区,而使用不同超声波功率(100、120、140、160 W)处理后能扩增出细菌16S rDNA V6-V8区,其中超声波功率140 W处理样品10 min并结合CTAB法提取牛奶中细菌DNA的浓度最高,为203.35 μg/mL。因此,超声波功率140 W处理样品并结合CTAB法提取牛奶中细菌DNA的方法最优,能满足从分子水平上进一步研究乳房炎相关细菌的要求。 相似文献
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奶牛血液保存条件和DNA提取方法的优化 总被引:2,自引:0,他引:2
本文研究中国荷斯坦牛血液在不同温度、时间保存的条件下(4℃保存0d为A组;-70℃保存30d为B组;4℃保存7d为C组)对DNA提取效果的影响和对比试剂盒法(E)、试剂盒改良法(F)、酚-氯仿法(G)提取中国荷斯坦牛血液基因组DNA的效果。试验结果表明:A组与B组差异不显著(P〉0.05);A组、B组与C组差异显著(P〈0.05)。4℃保存0d对DNA提取效果影响最小。在A组中,E与F差异不显著(P〉0.05);E、F与G差异显著(P〈0.05)。综合各方面因素。试剂盒改良法最好。 相似文献
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为筛选出一种从牛凝固血中高效获得基因组DNA的方法,本研究选择64个凝固血样,分别进行匀浆破碎和手动剪碎的预处理,结合酚-氯仿抽提和试剂盒提取方法,提取基因组DNA,并选择抗凝血作为参照,对试验耗时、DNA数量和质量进行比较。结果表明:通过对牛凝血块进行匀浆破碎预处理,不仅缩短了蛋白酶K的消化时间,而且获得了高质量基因组DNA,浓度和纯度均达到抗凝血提取效果(P0.05)。酚-氯仿提取法相比试剂盒法,虽然得到更多量的DNA,但是DNA质量下降,而且试验耗时增加。本研究证实,匀浆破碎预处理后的牛凝固血样可以作为高质量基因组DNA的样本来源,并可替代抗凝血,解决生产中抗凝血不易获得和采集的问题。 相似文献
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奶牛瘤胃微生物DNA提取法的研究与优化 总被引:1,自引:0,他引:1
试验通过对提取瘤胃微生物DNA常用的方法进行比较,优化出一种可以获得完整瘤胃微生物总DNA片段的方法,使其能进一步满足PCR的扩增要求以及后续的分子生物学研究。试验的瘤胃液样本取自3只装有瘘管的荷斯坦奶牛,将方法适当改进。结果表明:珠磨-CTAB法提取的总DNA片段长度大于20 kb,OD260/OD280在1.8以上,DNA的提取效果最稳定。同时对所提的DNA样本应用PCR方法进行了检测,成功扩增出长度分别为1 500 bp、1 000 bp左右的瘤胃细菌和古细菌的16S rDNA序列。结果证明了该方法所提取的瘤胃微生物DNA可以应用到后续的试验研究工作中。 相似文献
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快速提取桑树线粒体DNA的方法 总被引:1,自引:0,他引:1
线粒体是进行呼吸的细胞器,在绿色植物中占有重要地位.它具有相对独立的遗传物质线粒体DNA(mtDNA).研究表明,细胞质雄性不育、抗除草剂等性状与mtDNA有关,因此,mtDNA的研究越来越受重视.另外,mtDNA还被用来研究植物系统发育、分类等.然而mtDNA的快速、高效提取是限制深入研究的重要因素.传统的方法利用梯度离心提取mtDNA,其成本高,耗时长,产率低,对设备要求也较高.本文根据盖树鹏等提取mtDNA方法加以改进,简单、快速提取了桑树mtDNA,为从分子水平研究桑属种质资源的系统发育、分类提供了基础. 相似文献
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微孢子虫DNA提取方法的比较 总被引:1,自引:0,他引:1
本实验采用陈秀改进法、SDS法、CTAB法和TEK改进法对四种微孢子虫SD1、SD2、SD3、SD4基因组DNA进行抽提,并对抽提效果做了对比,结果表明,陈秀改进法对SD1、SD2、SD3基因组DNA抽提效果较好,TEK改进法对SD2、SD3、SD4基因组DNA抽提效果较好,SDS法和CTAB法对四种微孢子虫基因组DNA的抽提效果均不理想, 相似文献
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猪粪样DNA提取方法的比较 总被引:1,自引:0,他引:1
哺乳动物胃肠道中存在约30个属500多种不同的细菌,约1×1014个活细菌,其形成了复杂而动态平衡的微生态系统,对宿主营养物质的消化、吸收及免疫机制激活等起着十分重要的作用[1].这微生态平衡失调,机体正常的生理功能就会发生紊乱,导致疾病的发生、流行,对畜牧养殖业尤其是规模化养殖等带来极大的潜在威胁.因而,近年来对胃肠道微生物区系结构及其多样性研究成为热点,但由于胃肠道的特殊生存环境,目前有60%~80%的微生物是无法用传统的分离培养技术进行研究, 从而阻碍了人们对胃肠道微生物结构及其多样性的客观认识. 相似文献
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白色瘤胃球菌实为一种瘤胃内纤维分解菌,其利用所分泌的纤维素酶,来降解纤维素.本试验利用白色瘤胃球菌这一特性,首先基于DNA提取对其加以优化,为深入研究奠定基础. 相似文献
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为提高普氏原羚粪便DNA提取效果,在总结传统提取粪便DNA方法的基础上,设计了新的提取方法.该方法以NaCl替代TE溶解粪便样品.增加溶茵酶用量以减少蛋白酶K用量.经琼脂糖凝肢电泳和PCR扩增12SrRNA片段对改进方法与传统提取粪便DNA方法进行比较,发现用改进方法提取的DNA质和量均比传统方法好,且可满足一般分子生物学实验的需要.扩增的普氏原羚12SrRNA片段已经测序.并递交GenBank,登录号为EU247756.新方法不仅克服了传统提取法中DNA降解严重的问题.而且有效地解除了粪便DNA对Taq酶的抑制作用.为普氏原羚遗传多样性保护提供技术支持. 相似文献
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脱氧核糖核酸(DNA)作为大部分有机体和病毒的遗传物质,与生物的遗传与变异息息相关。很多研究都是基于核酸分析的基础开展的,对核酸的纯度要求很高。本研究采用4种常用方法提取小鼠基因组DNA,以探讨不同提取方法对DNA质量的影响。结果表明,酚/氯仿抽提法获得的DNA纯度较好,无RNA污染,但有少许蛋白质未剔除;试剂盒法提取到的DNA纯度高、核酸浓度大且无污染,但片段较小,可进行常规的PCR等核酸水平研究。 相似文献
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本试验比较了从山羊粪便中提取总DNA的四种方法的优缺点,旨在为后续实验提供合适的提取方法。笔者首先采用PBS缓冲液过夜处理粪便标本,继而通过酚-氯仿抽提法、CTAB抽提法、天根试剂盒法和OMEGA试剂盒法提取样品总DNA。结果显示:酚-氯仿抽提法提取的DNA完整性不好,且纯度低;CTAB法提取的DNA浓度和纯度都较高,但完整性不好;试剂盒法提取方便,操作简单,时间短,但提取的浓度较低,其中天根试剂盒法提取的DNA纯度高,完整性好。综合考虑,天根试剂盒法是提取山羊粪便总DNA的最佳方法。 相似文献