全基因组关联分析在水禽主要数量性状基因座定位的应用现状

水禽的经济性状多为数量性状,数量性状基因座(quantitative trait loci, QTL)是调控数量性状表达的遗传基础,因此QTL的定位是分子育种的基础。全基因组关联分析(genome wide association studies, GWAS)作为鉴定表型与基因型关系的一种分析策略,是挖掘畜禽QTL的重要手段,并已经成功应用于猪、牛、鸡等畜禽的遗传育种工作中。利用GWAS可以定位与水禽经济性状相关的QTL,确定影响水禽性状的功能基因或主效基因,从而实现对水禽重要性状的改良。文章综述了GWAS在水禽重要性状研究上的应用效果,并分析了不足之处,以期为完善水禽遗传育种与遗传改良方法提供参考。     

利用连锁不平衡进行畜禽QTL定位的研究进展

一般家养畜禽群体规模小、选择强度高，连锁不平衡（linkage disequilibrium , LD）现象普遍存在，尤其在杂种或新培育品种群体中更为突出。随着分子遗传学的发展，我们可以直接选择影响性状的基因或包含基因的染色体区域（QTL），可分型的遗传标记和QTL之间是否存在连锁不平衡是畜禽群体中QTL定位和应用的关键。目前，畜禽群体中用基因组范围内SNPs的连锁不平衡精细定位影响畜禽重要经济性状的QTL正受到广泛关注。作者从LD定位QTL的原理、畜禽群体中LD程度、利用LD进行QTL定位的试验设计及统计分析方法、LD在畜禽QTL精细定位中的应用等几个方面进行了综述。并进一步阐述了畜禽群体中利用LD进行标记辅助选择（MAS）的策略，对LD在畜禽QTL定位及标记辅助选择方面的应用进行了新的探讨。     

畜禽数量性状位点的研究进展

畜禽数量性状位点的研究进展杨宁（中国农业大学动物科技学院北京１０００９４）１数量性状位点传统数量遗传学理论认为，数量性状的遗传基础是遵守孟德尔遗传规律的微效多基因。近年来随着分子生物学技术的进步，遗传学家开始直接研究数量性状的分子遗传基础，即数量性状...     

数量性状基因座定位与家蚕育种

传统的育种方法一般根据数量遗传学的原理和方法,对育种亲本及后代进行适当的选种选配,以提高育种群的优良基因频率,降低不良基因频率,从而达到改良经济性状的目的.数量性状基因座(Quantity Trait Locus QTL)一改传统数量遗传学将控制某个数量性状的多个基因作为一个整体来研究的方法,直接将研究目标指向各个基因座,借助各种遗传标记,通过统计学处理,将影响数量性状的多个基因剖分开来,使其定位于特定的染色体上,确定它们与其它基因的关系,最终还将分析出其DNA序列.这样,就可以充分利用先进的分子生物学技术对数量性状进行遗传操纵.QTL一经提出即受到育种家们的高度重视并成为研究热点,目前在植物和畜禽中的研究较为广泛并取得可喜的进展,但在蚕的研究中尚处于萌芽阶段.本文就QTL有关的原理、定位方法及在家蚕中的研究情况作一概述.     

猪分子育种技术及其发展趋势

动物分子育种是以分子遗传学和分子数量遗传学为理论,利用分子生物学技术来改良畜禽品种的一门新型学科,主要包括两大研究领域:一是以转基因技术为基础的转基因育种,二是以基因组分析为基础的基因组育种。随着现代生物技术和信息技术的发展,国际上的动物育种已逐渐进入分子水平。根据英、美等西方发达国家和联合国粮农组织的预测,21世纪全球畜牧业的90%畜禽品种都将通过分子育种提供,分子育种技术正在对未来猪的育种和生产产生巨大的影响。1转基因动物技术与猪的育种转基因动物技术是在20世纪80年代初发展起来的,该技术在改良畜禽生产性状、…     

遗传标记是动物分子育种的基础

正迄今为止,畜禽育种工作已经取得了巨大的进展,畜牧生产水平也得到了极大的提高。然而在20世纪90年代,由于畜禽选种理论和技术发展缓慢,导致了遗传改良的速度也呈现了变慢的趋势。正是在这一时期,随着分子生物学和基因组学的飞速发展,不断提出了新的动物育种方法。以分子数量遗传学为理论基础的动物分子育种也应运而生。以基因组分析和转基因动物技术为依托的分子育种技术是建立在对各种遗传标记不断研究的基础之上,本文就动物分子育种的遗传标记发展情况作一概述。     

芯片技术在畜禽育种中的应用研究进展

中国畜禽品种资源丰富,且有许多优良性状基因,但这些优良性状基因并没有被充分利用,因此,在基因水平上开展遗传资源的开发和利用是畜禽经济性状改良的重要方向。目前,虽然传统系谱选择方法在育种工作中发挥了重要作用,但存在准确率低、育种周期长等缺点。随着分子生物学技术的快速发展,近年来先进的基因组测序和基因分型技术大大促进了畜禽育种方法的革新。从低通量、耗时的限制性片段多态标记（RFLP）到如今高通量、高密度的单核苷酸多态性（SNP）标记,基因检测效率有了大幅度提高。基因芯片技术在分子标记辅助选择和全基因组选择育种研究中逐渐得到广泛应用,成为畜禽育种的新技术手段和新热点。主要介绍了高、低密度SNP芯片技术在畜禽育种中的研究及应用,并简述了其技术优势、存在问题及挑战、应用展望,旨在表明基因芯片技术必将会成为畜禽分子育种工作中一项重要的基础技术,在畜禽种业快速发展过程中起到重要的推动作用,以期为基因芯片技术在畜禽育种中得到进一步应用提供理论参考,推进中国畜禽育种遗传进展,提升中国畜禽种业的科技竞争力。     

鸡QTL定位的研究进展

鸡的大多数重要经济性状均属于数量性状,研究鸡数量性状遗传对鸡育种具有十分重要意义。数量遗传性状变异位于染色体特定位点的连锁编码基因被称为数量性状位点(quantitative trait locus,QTL)。近年来,大量研究揭示了鸡QTL的基本特征,剖析了重要经济性状的遗传基础,已经精细定位和克隆了鸡特定数量性状基因,给鸡资源保护遗传改良提供了新策略。文章综述了QTL定位的理论基础及鸡QTL定位的研究进展,并对鸡QTL研究的趋势进行了展望。     

建议开展农业动物遗传育种与克隆的分子生物学基础研究攻关

农业是我国12亿人口赖以生存的基础。发展动物农业对提高人民生活水平、保持社会安定团结具有重要的战略意义。根据美英等西方发达国家政府和世界粮农组织（FAO）的预测，2l世纪全球动物农业90％的品种都将通过分子育种提供，而品种对整个动物生产的贡献率亦将达到50％以上，显然品种是动物农业发展的首要关键。优良品种的扩繁是农业动物育种的核心内容之一，直接影响到动物农业生产的效率。有了良种和高速扩繁技术就能够在同样投入的条件下有更大的产出。90年代以来，国际上的动物育种已进入分子水平，朝着快速改变动物基因型的方向发展，扩繁也愈来愈多地以动物克隆为核心技术。我国要跟上这一科技形势，就要开展动物分子育种，也就是要研究动物遗传育种与克隆的分子生物学基础，为我国进入2l世纪的动物农业提供高产、优质、高效发展的遗传理论和高新技术。本项研究拟解决的重大科学问题有： 1．农业动物功能性基因组及重要经济性状的基因定位研究     

畜禽表观遗传学主要研究领域及研究进展

表观遗传学（epigenetics）是指DNA序列未发生变化,而基因表达却发生了可遗传的变化。近年来,表观遗传学在家养动物研究领域发展极为迅速,主要畜种涉及鸡、猪、牛、羊等,并形成一门新兴学科--畜禽表观遗传学（livestock epigenetics）。畜禽表观遗传学主要针对各种表观遗传修饰,包括DNA甲基化、组蛋白修饰及非编码RNA等,研究家养动物的生长发育、疾病抗性、繁殖、经济等性状的表达调控基础。作者综述和分析了畜禽表观遗传学的主要研究领域及现状,进一步对其发展趋势进行了展望,有助于全面了解畜禽复杂性状形成的分子基础,这也极大开拓了研究和改善畜禽各类经济性状的思路与策略。     

基因图谱的构建及其在动物遗传育种中的应用

基因图谱的构建是遗传学研究中的一个很重要的领域，是对基因组进行系统性研究的基础，也是遗传育种的依据。生物体基因功能的表达及其调控均受基因组本身的结构，即基因组中ＤＮＡ碱基顺序和组成的操纵，而构建基因图谱是了解基因组的组织、结构以及性状控制的分子基础的最基本方法。对于动物育种来说，构建基因图谱的意义在于了解控制动物生产性能、抗病力、抗应激反应力等诸多性状的基因的结构与功能；采用标记辅助选择或基因型选择法改良畜群；通过反义遗传学分离或处理某些重要基因；研究不同动物种间基因组型及进化关系等。１　基因图…     

试论动物育种方法

动物育种从理论上讲,包括选种、选配、品系繁育和杂交改良;在实际应用中,则根据动物的不同特点及所选性状的不同,侧重于不同的育种策略和育种方法,以达到最佳的改良效果。1动物育种方法的历史回顾1.1遗传学理论基础动物育种方法的发展离不开遗传学理论的发展,遗传学理论决定着动物育种方法的变迁。遗传学的发展经历了4个时期:孟德尔遗传学,群体遗传学,数量遗传学和分子数量遗传学[8]。期间,数学、统计学和遗传学进行了充分的结合,发展到数量遗传学时,已成为一门研究群体数量性状遗传与变异规律的学科。数量遗传学以微效多基因假说为前提,认…     

畜禽经济性状的分子遗传标记研究进展

畜禽的经济性状大多数是与动物的生长发育、生产性能、生理代谢关系密切的多基因性状,对人类的生产和生活具有重要的经济价值.发现与研究畜禽重要经济性状位点(QTLs)的遗传标记及其相关性,是基因定位的基础,也是目前畜禽遗传育种工作的研究重点之一.数量性状主效基因相关性的研究在动物遗传育种领域所取得的进展远不及在植物方面.畜禽分子遗传标记的研究,不仅需要试验技术和手段的创新,更期待在基础理论方面有新的突破.文章对相关研究工作进行了简要的综述.     

单核苷酸多态性的研究情况及应用

单核苷酸多态性（SNPs）作为新的遗传标记已广泛应用于基因定位、克隆和遗传多样性的研究。在畜禽的遗传育种过程中,人们一直在致力于寻找些可靠的遗传标记（Genetic Marker）来提高选择效率与效能。而遗传标记的内涵随着遗传学,特别是基因概念的发展而发展。遗传标记已逐渐从形态、细胞扩展到生化和分子水平上的标记。     

动物遗传育种研究进展

随着遗传学理论的不断发展,动物遗传育种技术经历了表型和表型值选种技术育种、DNA重组技术育种、分子技术育种3个阶段。其中,在20世纪80年代国际上动物育种已进入分子水平,朝着快速改变动物基因型的方向发展,即开始分子育种技术阶段。国内也紧跟国际步伐,主要研究畜禽遗传育种的分子生物学基础,为我国21世纪畜牧业的发展提供理论基础和先进技术。现在,动物分子育种仍占据着动物育种大部分的领地,并将主导21世纪动物遗传育种的发展趋势。     

鸭基因组研究现状和未来展望

作为禽流感病毒、乙肝病毒的自然贮存库和重要的农业经济动物,鸭在分子生物学(如宿主与病原物互作机制)和分子遗传学(如生长和屠体性状主效基因的克隆)领域的重要地位逐渐为人们所认可.近年来,鸭的基因组学研究取得了一些进展:①构建了鸭的遗传和细胞遗传图谱,并在此基础上定位了鸭生长、屠体和肉质性状的QTLs;②开展了鸡和鸭的比较基因定位研究;③建立了鸭的全基因组BAC文库;④克隆了约3 000条鸭的ESTs序列;⑤利用微卫星标记估计了鸭的遗传多样性.但与其它模式生物(如鸡、猪)相比较,鸭的基因组学研究仍处于起始阶段.随着分子生物学技术,特别是全基因组序列测定技术的发展,高密度的鸭遗传图谱、高分辨率的鸭和鸡以及其它脊椎动物的比较遗传图谱将会被构建,甚至是鸭全基因组序列的测定.这些基因组信息的获得将为大规模的鸭品种资源评定、重要经济性状分子机理的剖析进而改良其生产性能(如提高产蛋量和内质性能、增加对禽流感等疾病的抗性)奠定基础.     

家蚕基因组中的分子标记遗传图谱

遗传标记既是基因组研究的重要内容，又是构建遗传图谱、研究生物多样性、育种、基因定位与克隆等的基因。目前，已有多项分子标记技术用于家蚕基因组的研究，并构建了多种分子标记遗传图谱，包括限制性酶切片段长度多态性（简称RFLP）、DNA随机扩增多态性（简称RAPD）、扩增片段长度多态性（简称AFLP）、简单重复序列PCR（简称SSR－PCR）等。本文就分子标记技术构建的家蚕基因组分子标记遗传图谱进行了讨论。     

畜禽主要经济性状（肉,蛋,奶）的遗传改进与育种新技术

本文主要阐述了改进肉蛋奶等畜禽主要经济性状的数量遗传学,细胞遗传学和分子遗传学基础,在育种新技术方面,重点介绍了近年来发展的分子生物学技术,计算机技术和系统工程技术,以及它们在动物育种中的应用。     

猪育种的经济性状选择与生产性能测定

1育种技术的发展随着数量遗传学理论的发展,育种学家可以借助一定的统计学方法将性状的表型值进行剖分,并从中估计出可以真实遗传的部分,即育种值,使畜禽育种由表型值选择发展为育种值选择,从而提高了选种的准确性和效率。随着分子生物学技术突飞猛进的发展,对分子遗传标记、QTL图谱分析的研究正不断深入。目前,畜禽遗传图谱的构建已取得了较大的进展,使得利用1个或1群标记以区分不同个体QTL的有利基因型正在逐步成为现实。标记辅助选择就     

芯片技术在畜禽育种中的应用研究进展

中国畜禽品种资源丰富,且有许多优良性状基因,但这些优良性状基因并没有被充分利用,因此,在基因水平上开展遗传资源的开发和利用是畜禽经济性状改良的重要方向。目前,虽然传统系谱选择方法在育种工作中发挥了重要作用,但存在准确率低、育种周期长等缺点。随着分子生物学技术的快速发展,近年来先进的基因组测序和基因分型技术大大促进了畜禽育种方法的革新。从低通量、耗时的限制性片段多态标记(RFLP)到如今高通量、高密度的单核苷酸多态性(SNP)标记,基因检测效率有了大幅度提高。基因芯片技术在分子标记辅助选择和全基因组选择育种研究中逐渐得到广泛应用,成为畜禽育种的新技术手段和新热点。主要介绍了高、低密度SNP芯片技术在畜禽育种中的研究及应用,并简述了其技术优势、存在问题及挑战、应用展望,旨在表明基因芯片技术必将会成为畜禽分子育种工作中一项重要的基础技术,在畜禽种业快速发展过程中起到重要的推动作用,以期为基因芯片技术在畜禽育种中得到进一步应用提供理论参考,推进中国畜禽育种遗传进展,提升中国畜禽种业的科技竞争力。