Fiber-FISH在植物基因组研究中的应用

Fiber-FISH技术最早在人类基因组研究中发展起来,现在广泛应用于人类、动物、植物基因组的研究.由于fiber FISH技术的高分辨率、高灵敏度和直观性,它能够解决基因组研究中的诸多问题,例如物理图谱构建、比较基因组研究、弥合物理图谱中的gap、基因位点长度及基因拷贝的确定等等.近年来,fiber-FISH技术在植物基因组研究中也取得了许多进展.     

专家访谈:基因伦理:近访邱仁宗

近日 ,全世界都因人类基因组工作框架图的公之于世而无比兴奋。从各种传媒上发送的信息都说 ,人类基因组研究有望揭示人类各种疾病的根源。于是 ,普通人期待着不久的将来基因疗法能够帮助他们治愈一切疾病。然而人们也心存疑虑 :人类基因组研究既然可以清楚地了解人体的一切 ,那么对于每个个体来说 ,便也无秘密可言。自己的身体没有属于自己的秘密 ,这难道不是件可怕的事情吗 ?它遭遇着来自社会、伦理和法律的种种挑战。日前 ,记者专门就上述问题拜访了中国人类基因组社会、伦理和法律问题委员会主任委员邱仁宗先生。谈到与人类基因组研究相…     

针叶树基因组研究进展

针叶树作为全球重要的用材及生态树种,因其基因组巨大,一直以来基因组相关研究进展较慢.近年来随着新技术新方法的出现及投入的增加,从ESTs数据库的构建及基因家族分析、非编码小RNAs、转录表达谱、遗传图谱构建、基因组关联分析及QTL定位等研究方向对几种重要模式针叶树开展了广泛而深入的研究,取得了一批重要成果,极大地推动了针叶树种基因组研究进展.本文总结了近年来的针叶树基因组研究概况,并探讨了以后的研究方向,可为该领域的研究提供参考和借鉴.     

生物技术在林木遗传育种中的应用

简要介绍了我国林木育种的发展历程及取得的主要成就, 综述了近年来林木遗传标记技术、林木基因组研究、林木抗虫、抗病、抗逆境、品质改良、遗传转化等基因工程技术在林木遗传育种中的应用进展, 并探讨了生物技术与林木常规育种的关系。     

RAPD技术及其在葡萄属植物研究上的应用

对ＲＡＰＤ技术、原理及其在基因组研究方面所具有的特点和优势进行讨论，综述了ＲＡＰＤ技术在葡萄上的研究进展，并展望了ＲＡＰＤ技术在葡萄属植物研究上的应用前景。     

林木分子标记研究进展

分子标记技术大大促进了林木有关研究的发展,林木分子标记研究主要包括林木遗传连锁图谱构建,比较基因组研究,数量性状位点定位,标记辅助选择,系统演化及群体遗传变异和多样性等内容。迄今,已有近２０个树种构建了基因组遗传连锁图谱,少数树种还进行了基因研究。     

表达序列标签(EST)分析及其在林木研究中的应用

简要叙述了表达序列标签EST技术的原理和流程,综述了EST在研究林木木材形成和其它生物学过程时新基因的发现、基因表达分析和基因芯片方面的应用进展以及在开发林木单核苷酸多态性和简单序列重复等分子标记和构建遗传图谱方面的应用进展,并对其在林木基因组研究中的应用前景进行了展望。     

微生物技术在环境保护领域的应用概况

指出了近年来,微生物及其相关技术在环境保护领域的应用越来越广泛,选育并开发了大批用于环境治理的微生物菌株及相关菌剂,展现出了广泛的应用和发展前景。基于微生物技术在环保领域的蓬勃发展,对环境保护领域的微生物技术及相关应用等进行了简要综述,重点阐述了污水的微生物处理、微生物降解土壤污染物、有机废弃物的堆肥等几个方面的技术应用。     

火干扰后对森林土壤微生物生物量的影响

土壤微生物生物量对环境因子的变化十分敏感,本文针对土壤微生物及影响因子,林火对土壤养分和土壤微生物生物量的影响等进行了综述,总结了国内外关于土壤微生物生物量的相关研究,同时评价了火干扰对土壤微生物生物量的影响,以及土壤养分元素变化与土壤微生物生物量的关系。研究结果对于进一步认识土壤微生物生物量的作用以及揭示干扰作用下土壤微生物生物量变化的机制研究具有重要意义。     

蛋白质组学及其在植物研究中的应用

蛋白质组研究将生命活动直接化和具体化,将基因功能整体化、动态化、定量化,是后基因组计划的一个重要组成部分.为全面准确了解和揭示植物生命活动规律,对其在分子水平上的研究工作应将基因组研究和蛋白质组研究并列开展,为植物各领域的研究提供更可靠的理论依据.综述了蛋白质组学的研究意义、重要研究体系及在植物研究中的应用,同时展望了未来的蛋白质组学.     

Response of soil microbial biomass and community composition to chronic nitrogen additions at Harvard forest

Soil microbial communities may respond to anthropogenic increases in ecosystem nitrogen (N) availability, and the microbial response may ultimately feed back on ecosystem carbon and N dynamics. We examined the long-term effects of chronic N additions on soil microbes by measuring soil microbial biomass, composition and substrate utilization patterns in pine and hardwood forests at the Harvard Forest Chronic N Amendment Study. Functional and structural genes for important N cycling processes were studied using DNA community profiles. In the O horizon soil of both stands, N additions decreased microbial biomass C as determined by chloroform fumigation-extraction. Utilization of N-containing substrates was lower in N-treated pine soils than in the controls, suggesting that N additions reduced potential microbial activity in the pine stand. Counts of fungi and bacteria as determined by direct microscopy and culture techniques did not show a clear response to N additions. Nitrogen additions, however, strongly influenced microbial community DNA profiles. The ammonia monooxygenase gene (amoA) generally was found in high N-treated soils, but not in control soils. The nifH gene for N₂-fixation was generally found in all soils, but was more difficult to amplify in the pine N-treated soil than the controls, suggesting that the population of N₂-fixers was altered by N additions. The 16S rDNA gene for Nitrobacter was found in all samples, but distinct differences among DNA profiles were observed in the pine B horizon in the control, low N, and high N-treated plots. Our findings indicate that chronic N additions decreased chloroform microbial carbon and altered microbial community profiles. These changes in microbial community structure may be an important component of the response of terrestrial ecosystems to human-accelerated N supply.     

石油-重金属复合污染土壤的微生物修复研究

以山东省黄河三角洲孤岛油区石油-重金属复合污染盐碱土为研究对象,通过测定土壤在不同时期的脱氢酶活性、微生物生物量碳、石油烃含量,研究了微生物在石油-重金属复合污染盐碱土修复过程中降解石油的作用。研究结果表明:微生物能促进石油烃的降解,60d后,添加降解菌的实验组和未添加降解菌的对照组石油烃平均降解率分别为45.60%和17.57%。加菌的实验组微生物活性高于对照组,15d时土壤脱氢酶活性实验组比对照组高出25.98%,微生物生物量碳实验组比对照组高出43.76%。     

Growth response of Pterocarpus santalinus seedlings to native microbial symbionts(arbuscular mycorrhizal fungi and Rhizobium aegyptiacum ) under nursery conditions

The objective of this research was to improve the growth and biomass of Pterocarpus santalinus L.f.(an endangered leguminous tree) using native microbial symbionts such as arbuscular mycorrhizal fungi and Rhizobium associated with native populations of P.santalinus.The native arbuscular mycorrhizal fungi isolated from P.santalinus soils were identified as(1) Glomus fasciculatum;(2)Glomus geosporum;and Glomus aggregatum.A nitrogenfixing microbial symbiont was isolated from the root nodules of P.santalinus and identified as Rhizobium aegyptiacum by16 s rRNA gene sequencing.These microbial symbionts were inoculated individually and in combination into P.santalinus seedling roots.After 90 days,growth and biomass had improved compared with uninoculated controls.Shoot and root lengths,number of leaves,stem circumference,number of root nodules,biomass,nutrient uptake and seedling quality index were significantly increased by a combined inoculation of arbuscular mycorrhizal fungi+Rhizobium aegyptiacum.It was concluded that native microbial symbionts positively influenced P.santalinus seedling growth which will be helpful for successful field establishment.     

分子生物学技术在水环境微生物研究中的应用

简述了核酸杂交技术、聚合酶链式反应（PCR）扩增技术、分子指纹技术和克隆基因文库技术4种分子生物学技术,综述了4种技术在海洋、湖泊、河流和其它水生态系统中微生物多样性的研究进展,研究内容大致可分为三个方向：一是人类活动对水环境微生物多样性的影响;二是种群结构和污染之间的规律;三是菌株的筛选和利用,使人们可以在水环境保护、治理过程中变得更加高效、有的放矢。     

攀枝花干热河谷区麻疯树土壤微生物种群数量分析

本文利用土壤微生物传统数量测定法,分析了攀枝花9个麻疯树主要分布区土壤微生物数量分布情况。分析结果表明,在三大微生物种群中,细菌占93.9%,丝状真菌和放线菌分别占3.1%和3.0%;不同林分年龄土壤微生物总数差异显著,成熟林分(1 237.6×104)>人工幼林(955.4×104);土壤类型不同,微生物种群数量差异明显,红壤(1 349.2×104)>黄沙壤(1 306.8×104)>山地黄壤(580.0×104)。通过土壤主要微生物生理类群分析结果,攀枝花麻疯树主要分布区土壤微生物生理类群数量比较贫乏,在氨化细菌数量中,红壤(37.0×103)>黄沙壤(0.8×103)>山地黄壤(0.3×103);在好气性纤维菌中,红壤(0.8×103)>黄沙壤(0.7×103)>山地黄壤(0.3×103);消化细菌,反消化细菌在山地黄壤和黄沙壤有少量分布;在3种土壤中均未分离到好气性固氮菌,说明攀枝花麻疯树主要分布区土壤不适宜好气性固氮菌生长繁殖。     

纤维素酶研究进展

笔者概述了纤维素酶的类型、作用机理;综述了产纤维素酶的菌种选育,包括产纤维素酶的微生物天然类群,诱变育种、工程菌的构建、发酵工艺等;并对纤维素酶的研究进行了展望。     

Canonical correlation analysis of soil nutrients, microorganisms and enzyme activities in vegetation restoration areas of degraded and eroded soils in northwestern Hunan Province, China

With the aid of canonical correlation analysis, the relations among soil nutrients, soil microorganisms, and soil enzyme activities were studied in vegetation restoration areas of degraded and eroded soils in the Nverzhai watershed in northwestern Hunan. The main results were as follows: the key factors in soil nutrients, microorganisms, and enzyme activities were N and P elements, number of bacteria, carbon and nitrogen in soil microbial biomass and the activities of urease, polyphenol oxidase, phosphatase, and invertase. The activities of urease and polyphenol oxidase are related to the inversion of N and P elements that had important impact on the accumulation of carbon and nitrogen in soil microbial biomass. Moreover, the activities of urease, polyphenol oxidase, and phosphatase could promote carbon accumulation in microbial biomass; however, invertase activities inhibited the accumulation of microbial biomass nitrogen. On the other hand, urease activities were beneficial to the N element content in soils but unfavorable for P elements. There is a negative relation between polyphenol oxidase activity and N element content. For every canonical variable group, the tendencies of soil nutrients, microorganisms, and enzyme activities to accumulate in different soil layers in different vegetation restoration communities could offer some scientific basis for the diagnosis of the health of the soil and the site type division in the process of vegetation restoration.     

土壤微生物量P研究综述

文章对土壤微生物量P的研究方法以及微生物量磷在土壤中的作用、施肥对土壤微生物量P的影响和土壤微生物量P与土壤中磷的相关性进行了简述．从而明确土壤微生物量P在土壤磷素转化和调节中的重要作用，并且对土壤肥力状况具有重要的指示意义。     

林火干扰对土壤氮组分及微生物氮循环影响研究进展

林火干扰作为森林生态系统中能量传递和养分循环的重要因子,对于研究火烧迹地植被更新与快速恢复可提供一定的数据理论支撑,而林火干扰对土壤微生境及微生物氮循环的影响机制一直是广大学者研究的热点。文中从火烧强度、恢复时间、火烧木管理方式等3个方面总结国内外林火干扰对土壤氮组分及氮循环的影响研究进展,揭示了林火干扰和全球气候变化对土壤氮循环的短期及长期影响机制,探讨不同生物技术在林火干扰下土壤微生物氮循环基因丰度变化中的应用;提出未来林火干扰对森林生态系统土壤氮循环影响的研究展望:1）全面比较研究不同林火干扰模式对土壤氮组分、微生物氮循环的影响;2）研究评价不同林火干扰模式下土壤氮库的稳定性;3）加强高通量测序、定量PCR技术、宏基因组学、稳定同位素探测等技术在林火干扰与气候变化对森林生态系统影响研究中的应用。研究结果对火烧迹地植被更新、土壤氮库的重建与功能发挥具有重要意义。