基于LFY2int2和SSR的浙江云和梨种质鉴定

【目的】明确浙江云和梨地方品种的遗传背景,为优良品种选育提供科学依据。【方法】基于低拷贝核基因LFY2int2的DNA序列和SSR对16份云和梨种质进行了分子鉴定。【结果】供试样本中共有4种LFY2int2拷贝(a,b1,b2和c),除了‘真香梨1’(c/b2)和‘云和红梨’(b1/b2)外,其余样本均为a/b1。基于LFY2int2的系统发育树表明‘真香梨1’与所有中国砂梨(Pyrus pyrifolia)样本分开独立成支;12对SSR引物在供试样本中分别扩增出了2~6个等位基因,UPGMA聚类结果显示‘真香梨1’和‘云和红梨’分别以0.45和0.70的相似系数与其他云和梨样本分开,而其余样本可分为2组,其中‘老雪梨4’和‘薄皮雪梨2’一致,‘老雪梨3’和‘老雪梨10’一致。【结论】基于LFY2int2和SSR的分析结果表明‘真香梨1’与中国砂梨亲缘关系远,它可能是砂梨和西洋梨(P.communis)的杂交后代;‘云和红梨’与典型云和雪梨起源不同;此外鉴定出了2组可能为同物异名的种质。     

梨栽培品种SSR鉴定及遗传多样性

应用SSR技术对梨41个栽培品种进行遗传多样性分析, 12对SSR引物扩增出114个等位基因, 平均每个位点915个。位点杂合度在0.1517～0.7079之间, 遗传多样性指数为0.4630。用两对引物(BGT23b和CHO2D11) 即可区分除芽变品种之外的全部供试品种。系统聚类分析将41个梨品种分为2大类, 即西洋梨和东方梨。原产中国的秋子梨、白梨和部分砂梨品种归类相互交错; 库尔勒香梨和其他新疆梨聚在一起; 我国砂梨品种宝珠梨、德胜香, 日本砂梨品种新世纪、丰水以及韩国砂梨品种黄金梨聚在一起。秋白与蜜梨, 南果梨与满园香、秋子、八里香相似系数高, 分别属于同一品种群。金花梨与金川雪、苍溪雪起源演化相关。     

甘肃中部梨资源遗传变异和亲缘关系的SSR分析

用6对SSR特异性引物对甘肃中部46个梨品种或类型的遗传变异和亲缘关系进行了分析,结果表明,SSR位点的期望杂合度为0.446～0.738,平均为0.639,显示了良好的品种鉴定能力。采用UPGMA聚类分析法构建的系统树将供试梨品种或类型分为7个大组:木梨组、白梨组、秋子梨组、褐梨组、西洋梨组和2个可能以秋子梨为基本种而形成的复杂的种间杂种组。唯一的砂梨品种黄花梨包含在白梨组中。新疆梨的5个品种没有独立成组,而是分别包含在木梨、白梨及秋子梨组中。一些原来根据形态学无法归类的品种和类型分别和木梨、白梨和西洋梨聚合在一起,显示出和这些梨系统的亲缘关系;木梨虽然采集地相对集中,但也显示出丰富的遗传多样性。     

秋子梨基于SSR荧光标记的分子身份证构建及亲缘关系分析

以国家果树种质兴城梨、苹果圃保存的53份秋子梨种质为试材,利用位于梨基因组17条染色体上多态性好的17对SSR荧光引物构建秋子梨分子身份证,建立每份种质的条形码标识,并探讨种质之间的亲缘关系。结果表明,17对SSR引物在53份秋子梨种质中共检测到267个等位基因,平均每对引物检测到15.7个等位基因。引物NAUpy45b检测到的等位基因数最多,为23个;NAUpy54b检测到的等位基因数最少,为10个。所有引物的香农信息指数平均为2.311,其中,NAUpy45b的香农信息指数最高,为2.673;NAUpy86c的香农信息指数最低,为1.493。聚类分析将53份秋子梨划分成2个组,与地理相关:长白山及小兴安岭的秋子梨野生资源单独聚类,与栽培品种亲缘关系较远。"热梨"和"白八里香"可能为同物异名品种。所选SSR标记可以区分芽变品种,可用于梨种质资源鉴别和保护。     

部分中国砂梨和日本梨的RAPD分析

 采用RAPD分子标记技术, 对来自福建和浙江的6份中国砂梨和36份日本梨的亲缘关系进行了分析。27个引物产生了可记录的多态性条带261条。聚类分析将这些梨品种和类型分为4个中国砂梨群和5个日本梨群。其中4个日本梨群中都包含有日本高知县的品种或类型。尽管由于取样的偏差, 中国砂梨和日本梨在聚类分析中没有混合聚为大群, 但中国砂梨品种与部分日本梨, 特别是来自高知县的日本梨的相似系数高于与中国梨之间的相似系数。     

利用SSR荧光标记构建92个梨品种指纹图谱

 利用SSR荧光标记技术筛选出的10对SSR荧光标记引物,构建中国建国以后选育的92个梨品种的SSR指纹图谱。10对SSR引物共扩增出132个等位基因,位点的杂合度在0.2421 ~ 0.8632之间。10对引物的扩增带型为8 ~ 44个,平均为29.7个。利用其中5对引物KA16、NH009b、NH013a、CH02b121和CH05d04可区分所有供试品种。92个梨品种10个SSR位点的遗传多样性和多态性信息含量的变化范围分别为0.4886 ~ 0.8810和0.4537 ~ 0.8707,平均值分别为0.7920和0.7732。92个梨品种的SSR指纹图谱互不相同,可以作为各品种特定的图谱,为品种鉴别提供依据。     

应用RAPD技术研究柿品种间的亲缘关系

采用随机扩增多态性DNA（RAPD）技术对原产中国、日本和韩国的部分柿品种间的亲缘关系进行了初步探讨。结果表明：（1）15个供试品种经OPA－06、OPA－08、OPA－19三个引物扩增后,品种间和引物间的谱带类型各不相同;（2）经6个随机引物扩增出的15个供试品种的谱带类型和相似指数的分析结果显示,‘富有’和‘次郎’,‘平核无’和‘仓光’,‘磨盘柿’和‘杵头柿’间可能具有较近的亲缘关系。     

80个梨品种SSR特征指纹数据表的构建

【目的】通过鉴定80份梨种质资源SSR指纹数据,构建梨品种指纹图谱数库表,为实现梨种质资源鉴定及新品种DUS测试的可视化和简便化奠定数据基础。【方法】利用荧光标记技术检测SSR位点,并对SSR位点基因数目进行统计,SSR位点排序,并对供试品种进行排序区分和数据标示,构建了80个梨品种的特征指纹数据表。【结果】12对引物中,可利用NH039A、NH007b、NAUpy97a、NB105a、NB141b、NAUpy82r 6对引物区分所有供试品种,可作为区分这80个梨品种的核心引物。【结论】筛选出了区分供试80个梨品种的核心引物,为梨指纹图谱数据库的共建和共享提供了数据基础。     

越橘叶片转录组SSR发掘及其多态性研究

对高丛越橘品种‘布里吉塔’叶片转录组序列进行了简单重复序列（SSR）位点搜索和分析,发现了22 058个SSR位点,总发生频率为21.32%。SSR重复类型以二核苷酸发生频率最高（77.70%）,三核苷酸次之（21.45%）。选用53对SSR引物在8个越橘属植物中进行PCR扩增,筛选出15对条带清晰且能稳定扩增的SSR核心引物。使用核心引物对39份越橘属种质进行分析,有效等位基因数最大值为7.11（VcSSR19）,最小值为1.41（VcSSR41）,平均值为3.90。香农多样性指数变化范围是0.64 ~ 2.31,平均值为1.55。观察杂合度和期望杂合度的变化范围分别是0.050 ~ 0.900和0.293 ~ 0.870,平均值分别为0.457和0.677。使用5对引物可以完全区分39份种质中的38份。南高丛越橘品种‘莱格西’和‘蓝雨’与蔓越橘品种、越橘属野生种具有更近的亲缘关系,是与野生种进行杂交育种的合适种质。     

基于SSR标记技术的南丰柑橘种质资源亲缘关系研究

【目的】从分子水平探究南丰柑橘种质间的亲缘关系。【方法】应用SSR技术对28份南丰柑橘种质进行基因组的多态性分析。【结果】从91对引物中筛选得到13对SSR引物,可区分全部供试材料。共扩增得到64个等位基因,平均每个位点4.92个等位基因。以遗传相似系数0.18为界,金柑属金柑单独聚为1类,柑橘属27份供试样品聚为1类。以相似系数0.59为阈值,27份柑橘属供试种质分为5个类群,其中南丰蜜橘品种群(包含小果系、大果系、桂花蒂系、早熟系)所有20份供试种质与‘蜜广’聚为一类,‘小叶广’‘火广’‘火橘’聚为一类,‘红广’‘红橘’‘本地早橘’各为一类。【结论】南丰广橘品种群中‘蜜广’与南丰蜜橘品种群有较近的亲缘关系,而‘红广’与亲本南丰蜜橘和‘红橘’的亲缘关系均较远。‘小叶广’‘火广’和‘火橘’亲缘关系较近。     

An assessment of genetic variability and relationships within Asian pears based on AFLP (amplified fragment length polymorphism) markers

A total of 100 Pyrus L. accessions native mainly to East Asia were subjected to amplified fragment length polymorphism (AFLP) analysis to evaluate genetic variability and relationships among the accessions. Six AFLP primer combinations produced a total of 459 fragments, of which 410 were polymorphic with a polymorphism percentage of 89%. The Dice's similarity coefficient among pear accessions ranged from 0.671 (P. betulaefolia Bge and P. elaeagrifolia Pall.) to 0.947 (‘Umajirou’ and ‘Immuraaki’). Occidental pears generally had low similarities to Asian pears. The dendrogram generated from all the accessions by unweighted pair-group method of arithmetic analysis (UPGMA) cluster analysis clearly distinguished Occidental pears from accessions of East Asia. P. ussuriensis Maxim., P. betulaefolia and P. communis L. clustered separately into independent groups in accordance with their morphological classification. Japanese pear cultivars formed two groups with some Chinese white pears and Chinese sand pears. Chinese white pears and Chinese sand pears independently formed their own groups and also mingled into mixed groups in the dendrogram. Therefore, Chinese white pears were treated as a cultivated group or an ecotype of P. pyrifolia: P. pyrifolia White Pear Group. The information obtained from this study will be of great help for understanding the origin and evolution of Asian pear cultivars.     

红色砂梨2个品种着色过程中的外观变化及其解剖学结构观察

以红色砂梨(Pyrus pyrifolia Nakai)品种美人酥和云红梨1号为试材,以套袋处理(果袋类型、去袋方式和去袋时间组合成10个不同的套袋处理)为手段研究了果实着色过程中外观和解剖结构的变化。结果表明,红色砂梨的着色需要有高强度的光照。生长过程中套有不透光袋的果实临近成熟时,只有完全曝光才能大量合成花青苷,而且在很短的时间内(大约2周)果实着色面积、着色程度即可优于对照(不套袋处理)。红色砂梨着色是从果实向阳的一侧先开始,且以果点为中心呈放射状向四周扩展,至采收时果实阳面红色能够均匀分布,但整个果面色泽很难一致。解剖结构分析表明果面呈红色是因为果皮中紧邻表皮层的3～4层细胞存在红色细胞(含有花青苷),在果实着色过程中这些红色细胞数目不断增多,同时细胞内色素浓度不断增大。云红梨1号合成花青苷的能力明显优于美人酥,果实着色更鲜艳。解剖学观察发现云红梨1号的表皮细胞层也含有红色细胞。     

梨属植物分类的历史回顾及新进展

一般相信梨属植物的原种起源于第三纪的我国西部和西南部的山区。根据其原生分布,分为东方梨和西方梨。由于梨属植物分布范围广,加上梨属种间很容易发生自然杂交,梨属植物的分类至今仍存在很多问题。被大多数植物分类学家所认可的种大约在30个左右。我国是东方梨种的主要起源地,我国分类学家相信有13个种起源于我国。不仅如此,我国也是世界上梨品种类型最多的国家。主栽系统有砂梨、白梨、秋子梨和新疆梨等。最新的分子生物学证据表明,白梨、砂梨和日本梨系统可能起源于共同的祖先:分布于我国长江流域的野生砂梨。考虑到白梨在我国梨栽培中的重要地位,建议用Pyruspyrifoliavar.sinensis(Lindley)TengetTanabe来表示白梨系统。     

Genetic relationships of pear cultivars in Xinjiang,China, as measured by RAPD markers

Summary

Thirteen native pear species have been identified in China, of which P. armeniacaefolia Yu and P. sinkiangensis Yu are specific to Xinjiang. P. armeniacaefolia grows wild and a few cultivars have been assigned to this species. Cultivars of P. sinkiangensis have been suspected to be of hybrid origin involving P. communis L. and P. bretschneideri Rehd. In this study, traditional pear cultivars in Xinjiang were evaluated using RAPD markers and compared with representatives of Occidental pear species, cultivars of P. communis and East Asian pear accessions. The combination of 72 pear accessions and 20 selected primers produced 231 scorable polymorphic RAPD bands, of which some were specific to certain species. Five main groups of pear accessions could be distinguished from UPGMA analysis: 1) P. xerophila Yu, its relatives and one cultivar of P. ussuriensis Max., 2) cultivars of P. sinkiangensis, 3) cultivars of P. pyrifolia Nakai and P. bretschneideri, 4) wild Occidental species, cultivars of P. communis and P. armeniacaefolia, and 5) hybrids between P. communis and Chinese or Japanese pear cultivars. The result of PCA generally agrees with that based on UPGMA. Based on RAPD data, some cultivars traditionally classified as P. bretschneideri should be assigned to P. sinkiangensis. Some heirloom cultivars assigned to P. communis were found to be of hybrid origin involving the Chinese white pear (P. bretschneideri) or sand pear (P. pyrifolia). Our results confirmed that P. sinkiangensis is of hybrid origin and at least P. communis, P. armeniacaefolia and Chinese white pears or sand pears have been involved. A further study is needed to understand how pear species and cultivars in Xinjiang are related to those originated from countries in Central Asia.     

甘肃中部梨种质资源的AFLP分析

采用AFLP分子标记技术对甘肃中部梨种质资源的遗传多样性进行分析。结果表明,6对AFLP引物在40份甘肃梨种质中共扩增出472条带,其中多态性带为404条,多态率高达86%,显示了甘肃中部梨资源丰富的遗传多样性。任何一对引物可以鉴别所有40份资源,显示了很高的鉴别能力。采用UPGMA聚类分析法构建的系统树在相似系数为0.72时将40份种质分为7个组:西洋梨、新疆梨、白梨(砂梨)、木梨、褐梨组和2个秋子梨组。所有白梨品种与唯一的砂梨品种黄花梨聚为一个大组。形态学上归属不明的品种分别聚类到西洋梨、白梨、木梨和秋子梨组中。研究表明基于AFLP标记的梨资源分类体系可以反映甘肃地方梨品种和类型间的遗传多样性和亲缘关系。     

甜樱桃品种SSR指纹检索系统的开发及遗传多样性分析

用SSR技术开发了甜樱桃( Prunus avium ) 指纹检索系统并进行遗传多样性分析。18对樱桃、桃和杏的引物在19份甜樱桃及2份草原樱桃( P. fruticosa) 品种中共扩增出83个等位位点, 每个 SSR位点的等位位点数2 ～8 个, 平均416 个, 多态性信息量( PIC) 变化范围为0.38 ～0.80, 平均为 0.64。7个甜樱桃品种具有特殊位点或特殊带型。利用UDP98-414、UDP98-406、UDP96-001及PMS40等4 对引物开发的指纹检索系统, 可以区分18个甜樱桃品种。根据遗传距离进行聚类分析, 19个甜樱桃品种 分成2组, 甜樱桃品种间的聚类结果基本反映了供试材料之间的亲缘关系。