泥东风螺4个群体遗传多样性的AFLP分析

利用AFLP分子标记方法对4个群体(福建连江野生、连江养殖、长乐养殖、广西野生)的泥东风螺进行遗传多样性分析。结果:用11对引物共扩增出908条有效片段,其中684条(75.33%)为多态性片段,224条片段(24.67%)为4个群体所共有;遗传多样性指数分析显示,4个群体的有效等位基因数、平均等位基因数、Shannon’s多样性指数和平均杂合度依次为1.500 6、1.974 0、0.464 7、0.303 4,Nei’s遗传距离为0.128 4~0.180 6,遗传相似系数为0.834 8~0.879 5,表明4个泥东风螺群体具有较为丰富的遗传多样性,且群体间具有较高的遗传相似性;分子方差分析(AMOVA)结果显示,4个群体中83.49%的变异来源于群体内,14.65%的变异来源于地区间,而群体间的遗传变异仅为1.86%,且4个群体间的遗传分化(GST)为0.195 4,基因流(NM)为2.058 6,说明群体间的基因交流水平较低;UPGMA聚类分析和主坐标(PCA)分析结果表明,长乐养殖群体和广西野生群体遗传距离最近,而连江野生群体与其他3个群体的遗传距离最远。     

药食昆虫九香虫AFLP遗传多样性研究

[目的]对广州鼎湖山和罗浮山药食昆虫九香虫（Aspongopus chinensis Dallas）种群进行遗传多样性分析。[方法]利用扩增片段长度多态性（AFLP）标记,建立九香虫AFLP指纹图谱,分析其种群遗传多样性参数。[结果]4个引物组合共揭示了362个位点,其中293个位点具有多态性,多态性位点所占比例为80.94%。种群Nei＇s基因多样性指数平均为0.2467,Shannon多态性信息指数为0.3687,种群间基因分化系数GST为0.1701,种群每代迁移数Nm为3.157。[结论]AFLP标记具有很高的多态性检测效率,适合用于分析九香虫种群遗传多样性;九香虫种群内的遗传变异程度较高,种群具有丰富的DNA遗传多样性水平。     

68份国外甘蔗种质资源遗传多样性的AFLP分析

采用10对扩增片段长度多态性标记(AFLP)引物，对近年来从澳大利亚、法国、美国和菲律宾引进，并保存于国家甘蔗种质资源圃的68份甘蔗种质资源进行遗传多样性研究。结果表明：68份种质间的遗传相似性系数较高， 为0.497 5～0.887 9，平均为0.761 2，表明大部分种质之间亲缘关系相近，遗传基础相似，遗传多样性并不丰富；各类种质间的平均遗传相似性系数以VMC型(菲律宾)最大，为0.825，Q型(澳大利亚)和CP型(美国)次之，分别为0.802和0.752，FR型(法国)最小，为0.685；在相似性系数0.676处可将68份种质分为5组，A组含CP67–412，B组含FR94–515，C组含FR96–626，D组含FR94–126，其余64份种质构成E组，占全部种质数的94.1%，A、B、C、D组4份种质与E组种质相比，亲缘关系较远，显示了独特的遗传组成；来自法国的种质资源具有较高的分散度，包含了较多的遗传信息。     

卵形鲳鲹养殖群体与野生群体遗传多样性的AFLP分析

利用AFLP技术对北部湾卵形鲳鲹野生群体和养殖群体进行遗传多样性分析和比较,可为卵形鲳鲹种质优化提供基础依据.研究采用10对引物组合在2个群体中共扩增出513个位点,其中多态位点数为133个,占总位点数的25.93％,两个群体平均多态位点比率为23.59％和18.32％,遗传多样性相对贫乏.养殖群体中低频位点明显减少而隐性纯合基因位点显著增加表明养殖群体丢失了低频基因.群体遗传结构分析表明,两群体间的遗传距离比较小,群体遗传结构相似.     

松江鲈群体遗传多样性的AFLP分析

利用AFLP分子标记技术对辽宁鸭绿江水域丹东段和河北秦皇岛渤海海域两个松江鲈Trachidemusfasciatus群体的遗传多样性进行分析研究.结果表明:用6对选择性引物,从两个群体的63个个体共扩增出360个位点,多态位点214个;松江鲈丹东和秦皇岛两群体的多态位点比率为50.28%、50.00%,平均杂合度和Shannon's指数分别为0.1690、0.1733和0.2534、0.2592,说明两个群体遗传多样性在同一水平上;Shannon's指数和AMOVA分析均显示松江鲈的遗传变异主要来自于群体内个体间,而群体间无明显的遗传分化;松江鲈UPGMA系统树没有依据群体分别聚类,未出现明显分支,无明显遗传差异;群体的显性基因型频率分布显示两个群体的遗传结构相似.     

松江鲈群体遗传多样性的AFLP分析

利用AFLP分子标记技术对辽宁鸭绿江水域丹东段和河北秦皇岛渤海海域两个松江鲈Trachidermus fasciatus群体的遗传多样性进行分析研究。结果表明:用6对选择性引物,从两个群体的63个个体共扩增出360个位点,多态位点214个;松江鲈丹东和秦皇岛两群体的多态位点比率为50.28%、50.00%,平均杂合度和Shannon s指数分别为0.1690、0.1733和0.2534、0.2592,说明两个群体遗传多样性在同一水平上;Shannon s指数和AMOVA分析均显示松江鲈的遗传变异主要来自于群体内个体间,而群体间无明显的遗传分化;松江鲈UPGMA系统树没有依据群体分别聚类,未出现明显分支,无明显遗传差异;群体的显性基因型频率分布显示两个群体的遗传结构相似。     

81个矮牵牛自交系遗传多样性的分析

[目的]对81个矮牵牛自交系的亲缘关系进行分析.[方法]采用十六烷基三甲基溴化铵法提取矮牵牛幼叶基因组DNA,利用扩增片段长度多态性对81个矮牵牛自交系的基因组DNA进行酶切、连接、预扩增、选择性扩增.[结果]采用8对引物组合共扩增出24 351条谱带,多态性条带比率为100％,平均每对引物扩增出3 044个多态性位点.81个矮牵牛自交系的相似性系数在0.2443～0.6233之间,平均值0.4338;每个位点的有效等位基因数1.2236,平均多样性指数0.2422;遗传相似性系数较高的是4号和5号,达到0.6233,较低的是9号和92号,为0.2443.[结论]根据遗传相似性系数进行聚类分析,可将81个矮牵牛自交系分为3个类群:91号、92号聚为Ⅰ类(小花型自交系);58号、73号和78号聚为第Ⅱ类(中花型自交系);其余76个聚为第Ⅲ类(大花型自交系).第Ⅲ类根据不同色系又可分为8个小类群,其中11个通过自然变异选育的自交系为D类,与其他类群的遗传关系较远.     

利用AFLP技术评价荔枝种质资源的遗传多样性

荔枝是中国、印度和东南亚地区重要的商业栽培果树。由于荔枝的广东本地品种名和汉语品种名译成的英译名各不相同,导致荔枝品种命名混乱,1个品种经常有许多品种名。为了更准确地评价荔枝品种间的亲缘关系,人们现已不从荔枝品种的表型性状进行分类,而是从其分子特征进行分类。美     

Genetic Diversity Analysis of Cultured Populations of Jade Perch （Scortum bacoo） in China Using AFLP Markers

Genetic diversity of three cultured populations of jade perch （Scortum bacoo） are studied using amplified fragment length polymorphism （AFLP） markers, which is Guangzhou（GZ） population, Foshan （FS） population and Qingdao（QD） population. Nine primer combinations were used and 385 fragments were detected. Among the 385 fragments, 80 bands （20.78%） were polymorphic. And it can be speculated that the genetic diversity of the three cultured populations of jade perch was very poor according to the gene genetic diversity among populations （Ht）, the gene genetic diversity within populations （Hs） and Shannon-Weiner index （I）. From gene differentiation （Gst）, genetic distance （D）, genetic similarity （5）, and UPGMA analysis, it is found that the relationship among the three populations is very closed, and the difference in genetic diversity among the three populations is not significant. Further clustering relationships of the jade perch cultured populations also are correlated to historical-breeding observations and genetic relationships. The GZ population clustered together with the QD population first, then with FS population.     

不同凡纳滨对虾养殖群体的微卫星遗传多样性分析

【目的】明确不同凡纳滨对虾（Litopenaeus vannamei）养殖群体间的遗传信息丰富度和遗传分化程度,为构建适应上海独特气候对虾品种繁育计划中的交配系谱分析提供参考依据。【方法】选用13对微卫星引物对来自厄瓜多尔恒兴对虾养殖公司2个养殖场（Pesquera和San Alfonso）共9个凡纳滨对虾养殖群体进行遗传多样性分析,探究不同群体间的遗传信息丰富度和遗传分化程度。【结果】13个微卫星位点在9个凡纳滨对虾养殖群体中检测到的等位基因数（Na）为2～6个,共有37个等位基因,多态信息含量（PIC）为0.1292～0.6799,平均为0.3326。在13个微卫星位点中,仅有1个微卫星位点（TUMXLV9.116）呈高度多态性,有4个微卫星位点（TUMXLV10.147、TUMXLV5.45c、TUMXLV10.191c和TUMXLV10.96）呈低度多态性,其余8个微卫星位点呈中度多态性。9个凡纳滨对虾养殖群体的观测杂合度（Ho）为0.2225～0.3662,平均为0. 2915;期望杂合度（He）为0.3317～0.4539,平均为0. 3974;Hardy-Weinberg平衡指数（D）为0.0214～0.4214,其中San Alfonso P23群体和Pesquera P23群体的D相对更接近于0,其基因型分布接近于Hardy-Weinberg平衡状态。9个凡纳滨对虾养殖群体的F_st平均值为0.1259,说明有12.59%的遗传分化来源于群体间,而87.41%的遗传分化来自群体内部;群体间的平均基因流（Nm）为1.7356,表明遗传漂变未能主导种群遗传结构的变化。在9个凡纳滨对虾养殖群体间,以Pesquera 29群体与Pesquera 15群体的遗传距离最大（0.2426）,San Alfonso 23群体与Pesquera 23群体的遗传距离最小（0.0215）;基于遗传距离的UPGMA聚类分析结果表明,9个凡纳滨对虾养殖群体可分为两大类,其中Pesquera 29群体和San Alfonso 12群体独立聚为一类。【结论】在9个凡纳滨对虾养殖群体中存在观测等位基因丢失现象,且遗传多样性较低,群体间分化程度为中等水平。因此,可通过引进不同地区拥有不同遗传背景且亲缘关系较远的群体作为亲本,以丰富子代群体的遗传多样性。     

青蟹野生与养殖群体遗传多样性的微卫星分析

利用微卫星分子标记对青蟹东海三门湾野生群体和浙江三门养殖群体的遗传多样性进行分析。6个微卫星位点在2个青蟹群体中共检测到66个等位基因,多态信息含量为0.746 ～ 0.895,均表现为高度多态性,可有效应用于青蟹遗传多样性的研究。青蟹野生群体与养殖群体的等位基因数分别为4 ～ 18,6 ～ 14,平均杂合度分别为0.577,0.561,平均多态信息含量分别为0.779,0.828;群体间遗传分化指数FST值为0.0317,遗传相似性指数为0.7930,遗传距离为0.2319。结果表明,青蟹野生与养殖群体的遗传多样性均较丰富,群体间存在一定的遗传分化。     

云南红豆杉天然群体的遗传多样性和群体分化

利用云南红豆杉Taxus yunnanensis种子的单倍体胚乳，采用水平淀粉凝胶电泳技术，对分布于金沙江流域的云南红豆杉天然群体的遗传多样性和群体分化进行了研究。对8个酶系统15个酶位点的分析结果表明：该地区的云南红豆杉天然群体遗传变异水平较高，多态位点比率P＝0．933，等位基因平均数A＝2．90，平均期望杂合度He=0.290；4个小群是遗传分化很小，基因分化系数GST＝0．071。云南红豆杉天然群体具有明显丰富的遗传变异和较小的群体间分化，其原因是云南红豆杉寿命长、风媒异花授粉、种子传播、基因交流频繁。     

梭鱼养殖群体与自然群体的遗传结构研究

[目的]掌握渤海地区梭鱼种群的种质资源状况。[方法]应用随机扩增多态DNA(RAPD)技术,对梭鱼养殖群体与自然群体的遗传多样性进行了分析。[结果]从45个随机引物中选出20个扩增效果稳定的引物进行群体分析。其中,梭鱼自然群体共检出了204个扩增位点,多态位点136个,多态位点比例为66.7%;养殖群体中共检出了217个扩增位点,多态位点130个,多态位点比例为59.9%。[结论]目前梭鱼群体的遗传多样性较为丰富,人工养殖还未对其造成明显的影响。     

基于AFLP标记的不同群体厚朴遗传多样性分析

[目的]探讨厚朴种源间、种源内家系及家系内个体间的遗传多样性,为厚朴良种选育提供理论依据。[方法]采用AFLP分子标记技术,分析来自湖北、广西和浙江的厚朴种源间、半同胞家系间及家系内单株间的遗传多样性。[结果]3个种源材料遗传距离为0.048 2~0.128 4,广西资源和浙江景宁2个群体相似性较高。种群遗传多样性平均水平、总种群基因多样度、基因流分别为0.203 5、0.254 1、3.421 7。观测等位基因数和有效等位基因数平均数分别为1.658 3和1.341 4;Nei’s基因多样性和Shannon多样性指数均值分别为0.203 5和0.308 7,其中湖北五峰的遗传多样性水平最高(为0.225 8),浙江景宁遗传多样性水平最低(为0.173 9)。湖北五峰、广西资源、浙江景宁家系内遗传多样性分别为0.264 4、0.181 9、0.173 8,Shannon多样性指数为0.415 4。[结论]湖北五峰种源遗传多样性水平最高,湖北五峰家系内的遗传多样性最丰富,存在较大的遗传分化。不同种源内家系之间的多样性指数及信息指数相差不多,说明在各自的生态环境中的变异水平相近。在厚朴良种选育过程中应充分重视优良种源、优良家系与优良单株的配合选择。     

红皮云杉等位酶群体遗传的多样性分析

在红皮去杉（Picea koraiensis）分布区内，选取了有代表性的12个群体（含170个单株种子的1042粒胚乳和300粒混合群体的胚乳）进行遗传分化分析。结果表明，11个酶系统21个位点中约有27.2％的基因位点是多态的，群体间的变异量只占总变异量的15.2％，84.8％的变异存在于群体内。红皮去杉群体等位酶多态位点的比率在去杉属中处于较低的水平，群体间的分化与去杉其它树种相比处于较高的水平。红皮去杉遗传改良工作在充分利用群体间（种源）变异的情况下，应加大红皮去杉群体内及个体选择的力度，以创造出更加优良的高产品种。     

基于AFLP分子标记的不同类型野生桂花种群遗传结构分析

桂花Osmanthus fragrans具有极高的经济价值和观赏价值。研究野生桂花种群的遗传多样性有利于为新品种的选育以及野生桂花资源的保护提供重要的依据。利用扩增片段长度多态性(AFLP)技术对江西全南(衰退型)和福建长汀(稳定型)这2个桂花自然种群96个个体进行了遗传多样性评估。7对引物组合共检测到330个清晰位点,其中多态位点276个,占83.64%。在物种水平,桂花的Shannon多态性信息指数(I)为0.428 3,Nei’s基因多样性(He)为0.285 6,表明桂花具有丰富的遗传多样性;在种群水平,福建长汀种群的多态性指数均高于江西全南种群,表明包含不同世代、具有较好自然更新能力的长汀种群携带更丰富的遗传信息;分子方差分析(AMOVA)表明:桂花的遗传变异主要存在于种群内(71%),种群间的遗传变异只占29%;2个种群间存在一定的遗传分化(Gst=0.161 6),种群间基因流较小(Nm=2.594 9)。     

我国稻瘟病菌的遗传多样性及其地理分布

用重复序列探讨ＭＧＲ５８６与限制性内切酶ＥｃｏＲ１组合，分析了我国１９８０－１９９６年期间的１７个省１４６个不同稻区４７５个稻瘟病菌株的限制性片段长度多态性，依其ＭＧＲ－ＤＮＡ指纹的相似率，结合病菌的致病性测定，将表现为４８个不同致病型的４７５个菌株区为５６个谱系，每个谱系的寄主范围有限，且与不同稻区稻瘟病的群     

湖南稻曲病菌群体遗传多样性分析

选用10个随机引物,利用RAPD技术,分析了来自湖南不同县（区）的53个稻曲病菌株的群体遗传结构．结果表明：以遗传相似系数0．78,将供试53个菌株划分为5个谱系,这5个谱系所含菌株数分别为42、7、2、1、1个,分别占总株数的79％、13％、4％、2％和2％,其谱系I为优势谱系．由此说明湖南稻曲病菌遗传群体有分化,但分化不明显;来自同一地区和不同地区同一品种的菌株大多数聚集在同一类．     

福建稻瘟菌群体遗传多样性RAPD分析

以ＯＰＧ、ＯＰＨ、ＯＰＫ等３个系列６０个引物对福建稻瘟菌进行了ＤＮＡ随机扩增多态性（ＲＡＰＤ）分析,６０个引物中有２１１个扩增出多态性条带,表明福建省曙菌群体有丰富的ＲＡＰＤ多态性,可为该菌的遗传分析提供大量的遗传标记,对ＲＡＰＤ条带多样性分析发现龙岩江山病圃稻瘟菌群体遗传多样性较简单,有明显优势种群可能影响其抗瘟评定的代表性较说明多点进行品种抗性理必要的。     

黄山松群体遗传多样性分析

利用RAPD分子标记分析了黄山松 1 0个家系的遗传多样性。从 2 0 6个随机引物 (组 )中筛选出 1 7个引物 ,获得 38个多态位点。Shannon多样性指数平均为 4 5 2 5 1 ,Shannon多样性值范围在 0 0 1 0 2～ 0 0 5 0 4。家系 (余姚×文石 )遗传多样性水平最高 ,其Shannon多样性指数为7 965 8。根据这 38个多态位点计算遗传距离 ,进行聚类分析。在遗传距离 0 42处可将 1 0个家系聚类分成 3组。图 2表 3参 1 3