我国近海中国对虾种群遗传差异的RAPD分析

应用随机扩增多态DNA（RAPD）技术对取自我国近海烟台、长岛、青岛、宁波等4个地方的20只中国对虾进行了种群内和种群间遗传差异分析。在使用的50个随机引物中,有9引物扩增出条带清晰的多态性片段。烟台、长岛、青岛、宁波等4个地理种群内的遗传距离分别为0．0154、0．0370、0．0462、0．0550,种群之间的遗传距离分别为0．0793、0．1139、0．0988、0．1485、0．0880、0．1260。UPGMA和NJ法构建的种群间分子系统树基本一致,结果表明不同地理种群这间存在一定程度的遗传差异。     

平胸龟2个地理种群遗传差异的比较

利用25个随机引物对平胸龟2个种群共49个个体分别进行PCR扩增,结果显示:平均每个个体扩增出209条DNA带,平均每个引物可产生8条带,扩增谱带分子质量大小在100～2000 bp之间,多态性比例为72.13%.其中12条引物扩增出16个特异于不同种群的DNA片段,可作为鉴别广东或福建种群的分子标记.用RAPD1.04和Genepop3.2软件分析所得谱带,得出广东、福建2个地理种群的平胸龟具有较高的遗传多样性,且广东种群的遗传多样性高于福建种群.2个种群间的平均遗传距离为0.278 6±0.025 9,遗传分化指数Gst为0.285 7.NJTREE聚类分析显示广东和福建2个地区的平胸龟各自聚成2个类群,有较明显的种群分化.     

中国水稻二化螟5个地理种群遗传差异的RAPD分析

以中国水稻二化螟5个地理种群的基因组DNA为材料,对其进行随机扩增多态性DNA(RAPD)分析.从50个引物中筛选出29个稳定性好、多态性高的引物,单个引物扩增出的DNA条带数从2～15条不等,其片段大小为200～3 000 bp,5个地理种群共扩增出条带220条,其中为多态片段的97条,平均每条引物扩增出条带7.59条.通过公式计算多态性位点、遗传相似性指数和遗传距离,结果表明:(1)5个地理种群遗传变异较高,其中以广西省全州市多态位点百分率最高(52.73%),吉林省柳河县多态位点百分率最低(34.55%);(2)5个二化螟地理种群间的遗传相似性指数的变异范围为0.551 88～0.849 00,遗传距离指数为0.121 42～0.448 12,平均遗传距离指数为0.312 28;安徽省庐江县与湖北省武汉市地理种群间的遗传距离最小,而吉林省柳河县与广西省全州市地理种群间的遗传距离最大.     

青岛百合复合种群遗传多样性的RAPD分析

对青岛百合(Lilium tsingtauense Gilg)复合种群6个局部种群的遗传多样性进行了RAPD分析。通过11个引物扩增到117个显性位点,其中多态性位点平均为62.86%,各百合群体多态性位点多少顺序为Y5、Y1、Y4、Y6、Y2、Y3。把RAPD多样性指标与样地的基本状况进行相关分析,发现海拔高度、样地坡度和植被类型与各个多样性指标呈正相关,样地坡向与各个多样性指标呈负相关。Nei’s基因多样度指数(h)和Shannon信息指数(I)的统计结果表明,种群内h和I的平均值分别为0.203 4和0.309 0,这两个指数均为Y5最高,其次为Y1,Y3最低。不同位点在种群间的分化程度差别很大,基因分化度的波动范围为0.016 5~0.942 7,平均为0.378 3。种群间平均基因流为0.821 6,说明有遗传漂变的存在。6个百合种群间遗传一致度与遗传距离的无偏估计表明,最小的遗传距离在Y4和Y6之间,最大的遗传距离在Y3和Y5之间,遗传一致度则相反。种群聚类分析表明,Y1和Y2比较近;Y4和Y6比较近又和Y5联系在一起。Y3比较特殊,单独为一类。     

RAPD分析中遗传距离计算方法的比较

为了更有效地应用ＲＡＰＤ分析这一手段研究种群遗传变异,以广州市力康鸡场７个蛋鸡品系为材料,根据ＲＡＰＤ测定的结果,采用Ｎｅｉ、Ｒｏｇｅｒｓｔ和Ｈｅｄｒｉｃｋ的遗传距离公式计算上述７个品系彼此间的亲缘关系,同时提出新的遗传距离计算公式。结论认为Ｒｏｇｅｒｓ的公式较适用于ＲＡＰＤ数据的分析,文中提出的公式跟其他距离公式存在显著相关,但有待进一步验证。     

上海宝山香柚种群遗传多样性的RAPD分析

采用随机引物扩增多态性DNA(RAPD)技术,对上海市宝山区长兴岛、横沙岛、宝山区生物技术中心以及复旦大学校内的香柚共计60个样本亲缘关系进行鉴定和遗传多样性分析,运用NTSYS-pc软件计算各品种间的Jaccad遗传相似系数,按非加权配对算术平均法(UPGMA)建立各品种间的聚类图,13个经过筛选的随机引物,获得多态性为52%的扩增条带,所有样本间的遗传距离在0.07-0.95之间,聚类图表明样本间的遗传多样性很复杂,其中只有长兴岛样品遗传距离在0.25以内,其他3地无论种群间还是种群内遗传距离都比较大,多数具有其自身的独特性,为香柚种质资源的保护提供了重要参考.     

锥栗不同品种遗传距离的RAPD分析

运用RAPD法对不同锥栗品种间基于DNA基础上的遗传距离进行了研究，建立了锥栗PCR反应的标准程序，得到的扩增片段大小在500－2000bp之间，确定了10个品种基于DNA分子水平上的相似系数。当相似系数等于0．74时，可把这10个品种分为4类，即“油栗仔，蔓榛，中尖嘴，猴嘴榛”“红紫榛，大尖嘴”“仁嘴栗，乌棒”和“嫁接毛榛”。图2表2参6     

大白菜地方种质遗传关系的RAPD分析

对11个大白菜地方种质材料，用改进的CTAB法提取总DNA后进行RAPD(Random Amplified Polymorphic DNA)分析。聚类结果表明，当遗传距离为0．18时，11份材料可分为二个生态类群，第一类群属于直简类型(交叉性气候生态型)，另一类群在0．15时，又分为二个类群，矮桩类型(海洋性气候生态型)和直简与矮桩的过渡类型。同时表明，应用RAPD选择特定引物在同一亚种内不同品种间进行遗传多样性、亲缘关系及品种鉴定等研究是可行的。     

中籼杂交稻遗传多样性的RAPD分析

选用20个随机引物对15个在生产和育种上广泛使用的中籼杂交稻亲本进行遗传多样性分析。20个引物共扩增出205条带纹,其中多态性带为165条。不同引物的多态性频率有较大差异,但普遍较高,平均达95．33％。亲本间的遗传距离小,在0．1210－0．3913之间,平均0．2455。15个亲本按UPGMA法可明显地分为不育系（I类）和恢复系（Ⅱ类）两类,其中Ⅱ类又分为两个亚类（Ⅱ－1和Ⅱ－2）。类群内和类群间的遗传距离分析表明,不育系与恢复系内的遗传差异都较小,而且不育系的遗传变异较恢复系小;不育系和恢复系间的遗传距离只有0．2906,而且与恢复系两个亚类间遗传差异不显著,这说明杂交水稻亲本的遗传资源匮乏。亲本间的遗传差异小,这可能是限制当前杂交水稻产量的重要因素。增加亲本遗传多样性和扩大亲本间遗传差异是当前中籼杂交稻育种的重要任务之一。     

中国芸芥遗传多样性RAPD标记分析

 选择我国不同生态地区有代表性的芸芥材料 ,利用RAPD标记技术进行分子标记差异分析 ,根据遗传相似系数计算不同材料RAPD数据的遗传距离矩阵 ,按UPGMA方法对研究材料进行了聚类。研究结果表明 ,我国芸芥具有比较大的遗传多样性 ,12个引物共扩增出 131条DNA带 ,其中 10 5条表现出多态性 ,占总带数的 80 .15 % ,不同生态类型地区来源的材料有各自的特征带。 2 0个材料的遗传距离在 0 .1178～ 0 .4 994之间 ,其中以和田芸芥与其它材料的遗传距离最大 ,而神池芸芥与朔州芸芥遗传距离最小。聚类分析表明 ,2 0个材料可分为 4组 ,其中和田芸芥和四川芸芥各自列为一组 ,和田芸芥可能是我国芸芥的一种新类型。组别划分与材料的地理亲缘关系及植物学形态特征相似性有关     

广西和广东地区施氏獭蛤3个自然群体的形态差异和遗传多样性分析

采用形态特征分析和RAPD技术对采自广西北海、防城和广东湛江的施氏獭蛤Lutraria siebaldii 3个自然群体和越南大獭蛤Lutraria maxima 1个群体的遗传多样性进行分析。结果表明：用20条引物从施氏獭蛤3个群体和越南大獭蛤1个群体的145个样品中共扩增出428条带,大小为125～5 000 bp,每条引物扩增出6～17条带;多态位点比例为76.1%～91.9%,平均多态位点比例为84.5%,遗传距离为0.1321～0.2441;对施氏獭蛤3个群体和大獭蛤1个群体进行UPGMA聚类分析,施氏獭蛤北海群体和防城群体先聚为一体,再与湛江群体聚类,最后与越南的大獭蛤群体聚为一个整体;用8条引物可以区分施氏獭蛤3个自然群体和大獭蛤群体,可作为群体特征标记;形态差异分析结果显示,湛江、北海和防城施氏獭蛤3个群体的形态较接近,而越南大獭蛤群体的外部形态和遗传距离均与施氏獭蛤3个群体差异较大,已分化成为同属不同种;主成分分析表明,主成分1、主成分2和主成分3的贡献率分别为49.13%、17.18%和14.02%,累计贡献率为80.33%;施氏獭蛤3个群体判别函数的判别准确率P1为88.9%～100.0%,P2为86.7%～100.0%,综合判别率为95.9%。这说明施氏獭蛤3个群体的遗传多样性均处于较高水平,种质状况良好,且具有很好的养殖前景。     

Analysis on Genetic Relationship of Oxya chinensis and Oxya japonica from Xuzhou and Pingshan, China

Genetic relationship among Oxya chinensis populations and Oxya japonica populations collected from Xuzhou City, Jiangsu Province and Pingshan County, Hebei Province, China were analyzed by random amplified polymorphic DNA （RAPD） markers. A total of 125 DNA bands ranging from 200 to 2 200 bp were amplified by 10 random primers in DNA samples from 43 grasshopper individuals. One hundred and twenty-three （99%） of these bands were polymorphic. Shannon＇s index showed that the genetic, diversity within O. chinensis （0.3432） was higher than that of O. japonica （0.2781）. Nei＇s genetic distance between O. chinensis population and O. japonica population from the same area was less than that between populations from two different areas. The dendrogram based on Nei＇s genetic distance of RAPD markers was constructed using the unweighted pair group method with the arithmetic average （UPGMA） and Neighbor-Joining （NJ） methods. Cluster analysis indicated that all the individuals were grouped into two main clusters. O. chinensis populations from Xuzhou and Pingshan formed one cluster, and O. japonica populations from the two regions belonged to another cluster. The results demonstrated that RAPD can detect within species, and among closely related species. polymorphisms to distinguish minor difference among individuals     

一种适于杉科植物遗传多样性分析的RAPD体系的建立初探

以墨西哥落羽杉、中国柳杉及日本柳杉为代表样品,摸索出一套适于杉科植物遗传分析的RAPD方法,通过大量的引物筛选和扩大所用引物数量,将能从理论上筛选出特定的引物对,用于杉科植物的真假杂种鉴定、亲本确认以及分类学的研究。     

枝角类RAPD条件优化和遗传多样性分析

以蒙古裸腹(MoinamongolicaDaday)和多刺裸腹(M.macrocopaStraus)为材料,对枝角类RAPD扩增条件进行了摸索和优化,结果表明,枝角类PCR扩增反应的最佳体系为:在25μL体积中,模板DNA25ng/μL,dNTPs0.1mmol/L,TaqDNA聚合酶1U,引物0.1μmol/L,Mg2+1.5mmol/L,10×PCR缓冲液2.5μL。按照优化的RAPD条件进行实验,重现性良好。2种裸腹在盐胁迫条件下的种群遗传多样性分析表明,同种裸腹不同生存盐度之间的种群遗传相似度较高,分别为0.9134和0.9038;而多刺裸腹和蒙古裸腹两个种间的遗传相似度相对较低,约为0.5～0.6。     

汉江上游鲫鱼RAPD遗传多样性研究

采用RAPD技术从26个随机引物中筛选出8个引物对汉江上游汉中段野生鲫鱼群体的遗传多样性进行研究,结果共检测出512个位点,其中多态位点347个,其多态位点比例(P)为67.77%;利用POPGEN软件获得汉江上游汉中段野生鲫鱼群体11个个体间的遗传距离,个体间遗传距离(D)在0.008 6~0.535 0,个体间遗传相似系数(S)在0.585 6~0.991 5,Shannon遗传多样性指数(H0)为0.652 5。试验表明,汉江上游汉中段野生鲫鱼群体仍保持着较丰富的遗传多样性,应加以保护。     

槟榔江水牛群体遗传结构的RAPD分析

 为探讨RAPD标记在水牛遗传多样性方面检测的应用价值，以及了解槟榔江水牛的群体遗传结构状况，研究采用随机扩增多态性DNA标记技术对槟榔江水牛20个个体进行了遗传变异分析，从70个随机引物中筛选出15个多态性丰富的引物对其所有个体的总基因组DNA进行了PCR扩增，结果15条引物共产生105种扩增片段，多态片段95条，平均每条引物的扩增带数为7，各引物多态性片段范围在2～12之间，多态频率在40%～100%之间，多态座位平均为90.48%。表明槟榔江水牛的遗传多样性较丰富。     

枝角类RAPD条件优化和遗传多样性分析

以蒙古裸腹(MoinamongolicaDaday)和多刺裸腹(M.macrocopaStraus)为材料,对枝角类RAPD扩增条件进行了摸索和优化,结果表明,枝角类PCR扩增反应的最佳体系为:在25μL体积中,模板DNA25ng/μL,dNTPs0.1mmol/L,TaqDNA聚合酶1U,引物0.1μmol/L,Mg2+1.5mmol/L,10×PCR缓冲液2.5μL。按照优化的RAPD条件进行实验,重现性良好。2种裸腹在盐胁迫条件下的种群遗传多样性分析表明,同种裸腹不同生存盐度之间的种群遗传相似度较高,分别为0.9134和0.9038;而多刺裸腹和蒙古裸腹两个种间的遗传相似度相对较低,约为0.5～0.6。     

切割潜蝇茧蜂2个地理种群的RAPD比较分析

切割潜蝇茧蜂[Psyttalia incisi(Silvestri)]是寄生橘小实蝇幼虫—蛹期的重要寄生蜂。应用经筛选的8个10 bp随机引物,运用随机扩增多态DNA(random amplified polymorphic DNA,RAPD)技术比较其漳州种群和引进种群(美国夏威夷)的分子多态性。结果表明,2个地理种群A、B分离物之间相异系数均大于0.7,地理种群内部分离物相异系数分别为0.3和0.12,差异较小。不加权算术平均组对法(unweighted pair group mothed with arithmetic mean,UPGMA)聚类结果表明,4个分离物在0.76的相异水平上可以聚为2个群体,而在0.12的相异水平上才能聚为4个群体。表明A、B地理种群之间相异性较高,差异较大。