“功能基因组和生物芯片”在水稻基因组研究方面取得一批新进展

完成了水稻突变体库、水稻基因芯片构建的预定任务，全面开始重要农艺性状功能基因的筛查，其中，中国科学院遗传与发育生物学研究所与中国水稻研究所及其合作单位，采用图位克隆的方法分离克隆水稻分蘖控制基因BCl，这是我国近20年来，首次在世界上克隆具有自己知识产权和应用前景的主要农作物重要农艺性状的功能基因，这标志着我国水稻功能基因研究取得新突破。     

科技珍闻

2002年12月日,中科院、国家计委、科技部、国家自然基金委联合宣布,中国科学家独立完成了世界上第一个水稻基因组“精细图”——中国水稻(籼稻)基因组“精细图”,并预测出大约6万个水稻基因。由中科院基因组信息中心暨北京华大基因中心为主的科研团队完成了这一科研工程。据介绍,这张“精细图”覆盖了97％的基因序列,其中97％的基因被精确地定位在染色体上。籼稻基因组“精细图”是全世界第一张农作物的基因组精细图谱,也是一项令世界瞩目的科学研究成果。“精细图”的完成将为阐     

农村科技

<正>我国科学家主导完成50个水稻基因组重测序由中国科学院昆明动物研究所、深圳华大基因研究院、中国科学院研究生院和中国科学院植物研究所等单位主导完成的50个水稻基因组重测序及遗传变异数据库构建等研究成果,本月初在国际著名杂志《自然-生物技术》上在线发表。该研究首次对栽培稻和野生稻基因组进行了大     

水稻基因组研究的现状和展望

综述了水稻基因组学的现状及发展趋势 ,水稻是禾谷类的模式作物 ,水稻基因组研究主要集中在与QTL有关的定位。目前构建的遗传图谱已作为物理图谱、基因组测序、分离和鉴定重要基因的基础 ,水稻基因组学的下一步是功能基因组学 ,以确定基因的功能     

我国科学家绘制完成水稻全基因组“精细图”

我国科学家已绘制完成水稻全基因组“精细图”并进行了相关研究，有关成果发表在国际期刊《PLoS Biology(科学公共图书馆一生物学专辑)》2005年第3卷第2期上。专家认为，水稻基因组“精细图”的完成，为科学家研究各个水稻亚种的差异，在新层面上探讨杂交优势的机理，为禾本科植物的比较基因组学和进化研究奠定了基础。     

日本发现可使水稻产量提高23％的基因

日本本田负责研究开发的子公司与名古屋大学研究人员组成的联合研究小组．最近在世界上首次发现可使水稻产量提高23％的基因。这一基因名为Gnla．是一种与控制花芽发育分解细胞因子的生理活物质有关的基因，Gnla合成的酶有分解细胞因子的作用，研究人员发现这一基因活性低下，稻粒就会增加，从而提高水稻的产量。     

信息文摘

水稻分蘖调控分子机理研究取得突破 中国农科院水稻所年轻科学家钱前博士领导的课题组,与《水稻重要性状的功能基因组学研究》项目组其他科学家合作,在水稻分蘖分子遗传学机理研究和功能基因克隆等方面取得突破。该研究成果发表在最近一期的《Nature》上。这是我国近20年来,首次在世界上克隆     

科学家加大对水稻品种的测序力度

国际水稻研究所(IRRI)启动了一项雄心勃勃的合作计划,从而在两年时间里对1万种水稻品种的基因组进行测序,这可能有助于培育更健壮、生长更快速或者产量比以前更高的新品种。这个项目是在2004年国际水稻基因组测序项目的来自10个国家的科学家首次对日     

科技短波

<正>科学家破译两种棕榈藤基因组信息最近,国际竹藤中心在竹藤基因组学方面取得突破性成果,首次成功破解了两种棕榈藤全基因组数据信息,并同时发布了最新毛竹高精度基因组数据。据国际竹藤中心主任江泽慧介绍,历经5年攻关,该中心在世界上首次破译了黄藤和单叶省藤两种棕榈藤的全基因组信息,并持续维护、完善毛竹     

科技短波

最近,福建农林大学张亮生教授团队在世界上首次解析了睡莲基因组,并发现了调控睡莲花色花香合成的关键基因。研究成果发表在国际顶级学术刊物《自然》上。该研究在睡莲基因组及花色花香等重要观赏性状分子机制方面取得了新突破.     

禾谷类作物的比较基因组研究

水稻是基因组最小的禾谷类作物，饱和遗传连锁图谱的构建，以及在此基础上开展的标记辅助选择和抗病基因克隆，表明水稻基因组研究已经领先于其他禾谷类作物。     

水稻基因组序列研究进展

水稻是世界上最重要的粮食作物之一,是禾本科植物的模式植物。综述了基于图位克隆的水稻基因组序列,基因组大小为389 Mb,包括37 544个非转座因子相关蛋白的基因。95%的基因组序列被精确测定,包括全部的常染色质、2个完整的着丝点及6条完整的染色体。基因组中串联重复序列占14%,平均每Mb为51个SSR。SwaI光学限制性(酶切)图谱的构建使图距缩短了11%,使基因组大小变为382.17 Mb。     

水稻叶绿体表达体系的建立及抗PPT叶绿体转化植株的获得

 【目的】建立外源基因在水稻叶绿体中的表达体系。【方法】通过分析已公布的水稻叶绿体基因组全序列及其基因分布特点，选择ndhF与trnL的基因间序列作为除草剂PPT抗性基因bar定点整合的位点。以水稻叶绿体基因组DNA为模板，采用PCR方法克隆了两个适于水稻叶绿体基因组遗传转化的同源片段，构建了含水稻叶绿体16S高效表达启动子、外源基因bar、psbA基因的3′序列（终止子）以及两个同源片段的水稻叶绿体特异表达载体pRB。【结果】采用基因枪法转化水稻品种中花10号幼穗诱导的愈伤组织，并再生植株，获得转化体后代种子。对转化植株进行的分子检测结果表明，外源基因bar 可能被整合到水稻叶绿体基因组中。后代种子的遗传学分析显示，外源基因bar可正常表达并遗传。【结论】利用所建立的水稻叶绿体外源基因表达体系，外源基因bar既可在水稻叶绿体基因组中正常表达，还可作为转化体筛选时的除草剂抗性选择标记。     

科学家发现睡莲迷人香味的关键基因

正最近,福建农林大学张亮生教授团队在世界上首次解析了睡莲基因组,并发现了调控睡莲花色花香合成的关键基因。研究成果发表在国际顶级学术刊物《自然》上。该研究在睡莲基因组及花色花香等重要观赏性状分子机制方面取得了新突破,对我国观赏园艺领域的基础研究有重要的推动作用,为其他园艺作物复杂基因组解析提供了借鉴。     

禾谷类作物的比较基因组研究

 水稻是基因组最小的禾谷类作物,饱和遗传连锁图谱的构建,以及在此基础上开展的标记辅助选择和抗病基因克隆,表明水稻基因组研究已经领先于其他禾谷类作物。比较基因组研究表明：小麦、玉米、高粱、谷子和甘蔗的基因组均可由水稻染色体区段重新排列而成，这些区段上DNA标记的排列顺序在各个种之间保留。各种作物基因组大小的差异可能由于各个区段内基因间重复顺序扩增的程度不同所致。根据这些区段在各种作物染色体的排列顺序，有人提出根据水稻染色体区段排列单个原始禾谷类染色体的设想，为深入研究禾谷类作物的进化遗传提出了全新的思路。禾谷类作物基因组之间的共线性有利于在小基因组内克隆大基因组作物的同源基因，使生物技术在作物育种中发挥更大的作用。     

稻瘟病有望实现快速监测和预报

正最近,福建农林大学闽台作物有害生物生态防控国家重点实验室发现了水稻稻瘟病菌群体遗传新特征。研究组在国际上首次利用群体基因组测序的方法,对来自中国和其他国家、地区的稻瘟病菌近百个田间菌株,进行全基因组测序并结合分子生物学和遗传学手段进行验证,发现了稻瘟病菌群体结构主要受水稻类型和品种的选择影响,并且会快速进化的群体遗传学新特征及其传播和流行方式。这一研究成果有望对稻瘟病流     

水稻瘤矮病毒基因组第6片段（S6）序列测定与分析

 【目的】了解水稻瘤矮病毒（RGDV）基因组结构与功能。【方法】根据已报道的RGDV基因组各片段末端序列及其反向重复特性，采用4轮RT-PCR的方法扩增RGDV基因组第6片段（S6），用生物学软件进行序列分析。【结果】得到了该病毒S6的全序列。S6全长1 651 bp，G+C含量39.13%，包含一个长的ORF，起始于第25位，终止于第1 497位，编码490个氨基酸，分子量为53.3 kD。 【结论】该蛋白与伤瘤病毒（WTV）的P7的相似性为30.0%，与水稻矮缩病毒(RDV)的P7的相似性为31.7%。这是RGDV S6全序列的首次报道。     

中国水稻基因组计划标准实验材料的构建

中国水稻基因组计划标准实验材料的构建＊孙宗修朱旭东董凤高傅亚萍熊振民（中国水稻研究所农业部水稻生物学重点实验室，杭州３１０００６）ＥｓｔａｂｌｉｓｈｍｅｎｔｏｆａＳｔａｎｄａｒｄＥｘｐｅｒｉｍｅｎｔａｌＭａｔｅｒｉａｌｆｏｒＲｉｃｅＧｅｎｏｍｅＰｒｏ...     

RFLP揭示的籼粳基因组多态性

采用28个RFLP籼粳特异性探针和6个SSR籼粳特异性标记对水稻不同品种进行了籼粳基因组多态性分析，结果表明，这些标记分布在水稻12条染色体上，能对水稻品种进行籼粳稻分子分类。由于水稻基因组序列图的完成和释放，使得这些籼粳特异性标记揭示的基因组多态性可以在基因组序列水平上进行分析和验证。本研究以RZ906探针和RM405为例分析了籼粳特异性其及序列分子生物学基础。     

水稻突变体库构建方法的新发展——CRISPR/Cas9系统

水稻是世界上重要的粮食作物之一.随着水稻全基因组测序的完成,迫切需要开展基因组功能的研究,其中突变体的获得是至关重要的环节.构建水稻突变体库是挖掘优异种质资源、分离并鉴定基因功能最直接的办法.概括了几种早期常用的突变体库构建方法,重点介绍了利用CRISPR/Cas9基因编辑技术创制突变体库的研究进展.