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OPAY02型2条多态性条带经克隆、测序和引物设计后,转换成SCAR标记,并对86个新扬州鸡随机交配后代基因组DNA进行了PCR扩增.2条带DNA序列与红色原鸡基因组序列比对结果表明,大分子量条带与位于红色原鸡第3号染色体上序列有98%的同源性,共检测到8个SNPS,其中195位的碱基T→G,316位的A→T,538位的G→A,731位的T→A,1 147位的G→A,1 329位的T→C,1 927位的C→T,2 081位的C→T,小分子量条带与红色原鸡没有同源序列,推测新扬州鸡野祖除红色原鸡外,还有其它来源.SCAR标记分析表明,经条件优化随机扩增的OPAY02型标记稳定、可靠,可用于遗传分析.2条带所在座位群体基因型平衡性测验结果表明,所测新扬州鸡群体处于平衡状态,选择可以打破平衡,有利于动物育种. 相似文献
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随机选择新扬州鸡大型系和小型系交后代48只,联合研究EAV/DNA指纹图谱带J与OPAY02型2种分子遗传标记与新扬州鸡体质量和生长的关系,结果表明,8、10、26周龄新扬州鸡体质量在2种分子标记的不同组合间比较均存在极显著的差异,尤其是J^-S1^-S2^+产条带组合遗传标记,8、10、26周龄新扬州鸡体质量均显著或极显著地高于其他JS1S2组合,根据数量性状多基因假说,可以推测J、S1和S2可能是影响鸡增重的多基因,2种分子遗传标记组合J^-S1^-S2^+遗传标记有望成为鸡体质量选择的遗传标记。 相似文献
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利用6对AFLP引物组合对我国12个地方鸡种和引进鸡种隐性白羽鸡进行了遗传检测,统计了每个引物组合在各个品种中检测到的多态性条带和特异性条带,计算了13个鸡种的遗传相似系数和遗传距离,并据此构建了UPGMA聚类关系图,分析了所研究鸡种的遗传关系.结果表明:6对AFLP引物组合在13个鸡种中共检测到290条多态性条带,平均每个引物组合产生48.3奈多态性标记,同时在每个品种群体中还检测到了数量不等的特异性条带,其中寿光鸡和东乡黑鸡最多,为9条,旧院黑鸡、兴义矮脚鸡和隐性白羽鸡最少,为1条.13个鸡种聚为4类,其中隐性白羽鸡单独聚为一类,鸡种间的遗传相似系数及聚类结果与各个鸡种的地理分布、现实状况相吻合,从而表明AFLP指纹用于我国地方鸡种的遗传多态性分析、品种鉴定及品种间亲缘关系分析是可行的. 相似文献
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鸭沙门菌的随机扩增多态性DNA分析 总被引:5,自引:0,他引:5
以5株同一血清型的鸭沙门茵为研究对象,分别提取基因组DNA后,用20条随机引物对其进行RAPD分析。结果,20条随机引物中不能扩出任何条带的引物有2条,能扩出条带但扩增图谱中没有特异性条带出现的引物有10条,能扩出条带且扩增图谱具有多态性的引物有8条。对筛选到的具有多态性的8条引物进行分析,共扩增出46个DNA片段,片段大小为0.2~3.2kb,其中5个菌株共有的片段有13条,显示多态性的片段有33条。 相似文献
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真龙柚是沙田柚的优变芽系选育而成。为了进一步确定芽变系性状的可遗传性,对沙田柚和真龙柚及其无性系子代6个样品进行了RAPD和SSR分析。结果显示:8个RAPD引物共扩增出43条稳定清晰条带,其中5条具有多态性,多态性比率为11.63%,平均每个引物扩增5.37条带;26对SSR引物共扩增出34条带,只有5条带具有多态性,多态性比率为14.71%。结果表明:真龙柚与沙田柚的遗传距离为0.063,它们之间在DNA水平上存在遗传差异,说明真龙柚是由遗传物质改变引起的,非环境因素控制,具有可遗传性,通过RAPD和SSR技术可以有效鉴定,RAPD引物A07、A05和SSR引物SS15、TAA27均能将真龙柚和沙田柚鉴别出来。 相似文献
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随机扩增多态DNA(RAPD)技术在鹅育种上的应用 总被引:10,自引:0,他引:10
本文用4种引物(OPH5、OPH13、OPH16和OPF4)对隆昌鹅、太湖鹅和新太湖鹅进行基因组DNA、RAPD分析。结果表明:三种鹅都有特异性的条带,扩增DNA条带都表现为多态性,条带数为3-12条,大小范围在0.36-0.38kb之间,多态频率为72.14%;RAPD标记可作为一种辅助手段来比较鹅群体的遗传变异性,太湖鹅遗传变异性大于隆昌鹅;OPF-04很可能用作区分隆昌鹅与太湖鹅的标记性引物。 相似文献
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鹌鹑高低应激品系的RAPD标记研究 总被引:10,自引:0,他引:10
本研究对美国路易斯安那州立大学家禽系选育的高应激和低应激两个品系鹌鹑进行RAPD分析,评定其遗传多态性。采用两个Kit共40个引物,至少能得到1个多态性片段的引物有35个。扩增片段大小范围为200~2600bp。9个引物测得高低应激系中共享条带为10~13。28个引物的品系内条带共享率为05~091,6个引物为035~049。28个引物的系间条带共享率在07以上。两个Kit测定品系间遗传距离的差异显著,KitAQ测得的遗传距离大于KitU。结果表明两个品系的鹌鹑间存在遗传变异。利用KitAQ和KitU的引物进行RAPD分析,可以评定鹌鹑高应激和低应激品系的个体间、品系间的遗传变异。 相似文献
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RAPD技术对地方鸡种群体遗传结构的分析 总被引:16,自引:1,他引:15
利用RAPD技术对4个地方鸡种和1个引进鸡种的群体遗传结构进行分析,通过筛选的5个随机引物OPH-02、OPH-05、OPH-13、OPH-16、OPG-07对5个鸡种的池DNA进行多态性研究,结果表明:5个引物共产生条带61个,扩增产物片段的长度一般从150bp-4kb。 相似文献
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应用PAPD方法对鸡败血霉形体DNA多态性的研究 总被引:2,自引:0,他引:2
用随机扩增多态性DNA(RAPD)方法,通过筛选的5个随机引物(OPH-02,OPH-05,OPH-07,OPH-13,OPG-16),对14株鸡败血霉形体(MG)国际标准株和国内分离株进行了DNA多态性研究。结果表明,5个引物共产生21种条带,其中有3个条带分别为2个菌株所特有,扩增产物片段的长度在150~4500bp之间,所有菌株均有1条共同条带,以OPH-05扩增产物的多态性最丰富。根据样品DNA所获得的菌株间相似性指数表明,D9603与D9607相似指数最高,S6,K3913和D9604三者相互间相似性指数最低。提示RAPD方法可用于霉形体遗传标记的分析。 相似文献
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试验旨在研究肌肉生长抑制素(myostatin,MSTN)基因在拜城油鸡中的多态性及其与生产性能的关系,探寻可用于拜城油鸡选育的分子遗传标记。选取96只6周龄的拜城油鸡公鸡,随机分为3组,每组32只,分别在12、18和24周龄时对其生产性能指标进行测定,同时采用PCR-RFLP方法检测MSTN基因的多态性,分析MSTN基因多态性与拜城油鸡生产性能的关系。结果显示,在拜城油鸡公鸡中MSTN基因存在多态性,检测到3种基因型:AA、GA、GG,GA为优势基因型,等位基因A为优势等位基因,不符合哈代-温伯格平衡定律(P<0.05)。在12周龄时,AA基因型个体的体重、屠体重、半净膛重、全净膛重、胸肌重和腿肌重均显著高于GA基因型个体(P<0.05);在18周龄时,GA基因型个体的体重、胸肌重和腿肌重均显著高于GG基因型个体(P<0.05);在24周龄时,AA基因型个体的体重、屠体重和半净膛重均极显著高于GG基因型个体(P<0.01),全净膛重和腿肌重显著高于GG基因型个体(P<0.05),GA基因型个体的体重、屠体重、半净膛重和腿肌重均显著高于GG基因型个体(P<0.05),其余指标在不同周龄不同基因型个体间差异不显著(P>0.05)。MSTN基因多态性与拜城油鸡部分生产性能指标密切相关,推测该基因可以作为拜城油鸡选育的分子遗传标记之一。 相似文献
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In this study, the single nucleotide polymorphism(SNP) of MSTN gene and its correlation with the production performance was tested, and explored the molecular genetic marker of breeding in Baicheng fatty chicken. 96 Baicheng fatty chicken roosters were selected randomly and divided into 3 groups, there were 32 chicken in each group. The indexes of production performance were measured in 12, 18 and 24 weeks old and the SNP of MSTN gene was detected by PCR-RFLP method, and analyzed the relationship between gene polymorphism and production performance indexes.The results showed that 3 genotypes of AA,GA and GG were found in Baicheng fatty chicken, GA was the dominant genotype, and allele A was the dominant allele, the allele frequency was not in the Hardy-Weinberg equilibrium (P<0.05). At 12 weeks old,AA genotype was significantly higher than GA genotype in body weight, carcass weight,semi-eviscerated weight, eviscerated weight, breast muscle weight and leg muscle weight (P<0.05). At 18 weeks old,GA genotype was significantly higher than GG genotype in body weight, breast muscle weight and leg muscle weight (P<0.05). At 24 weeks old,AA genotype was extremely significantly higher in body weight, carcass weight and semi-eviscerated weight than GG genotype (P<0.01),and AA genotype was significantly higher in eviscerated weight and leg muscle weight than GG genotype (P<0.05). GA genotype was significantly higher in body weight, carcass weight,semi-eviscerated weight and leg muscle weight than GG genotype (P<0.05), there were no significant difference in the other indexes among different genotypes at different ages (P>0.05). MSTN gene polymorphism was closely related to the production performance indexes of Baicheng fatty chicken, it was speculated this gene could be used as one of the molecular genetic markers for the breeding of Baicheng fatty chicken. 相似文献