| 基于线粒体全基因组结构的鲳属鱼类分子分类研究 |
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| 引用本文： | 闫永斌,程起群.基于线粒体全基因组结构的鲳属鱼类分子分类研究[J].海洋渔业,2022,44(1):31-44. |
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| 作者姓名： | 闫永斌 程起群 |
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| 作者单位： | 中国水产科学研究院东海水产研究所,上海 200090;上海海洋大学海洋科学学院,上海 201306;中国水产科学研究院东海水产研究所,上海 200090 |
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| 基金项目： | 上海市自然科学基金项目(编号:19ZR1470100)。 |
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| 摘 要： | 为明确鲳属鱼类的线粒体全基因组序列结构、寻找有效的种间鉴别分子标记,并剖析其系统发育信息,从而为鲳属鱼类的分类学、进化遗传学和种质鉴定提供参考依据,测定了鲳属5种鱼类(中国鲳Pampus chinensis、灰鲳P.cinereus、银鲳P.argenteus、珍鲳P.minor、翎鲳P.punctatissimus)的线粒体全基因组序列,并结合NCBI数据库中已有的鲳属鱼类线粒体全基因组序列进行分析。结果显示:1)鲳属线粒体基因组全序列长度在16551 bp到18062 bp之间,其基因组结构与大多数硬骨鱼类一致;比较特别的是,银鲳和镰鲳具有两个tRNA;结构,珍鲳出现ND1基因重排以及两个重复的D-loop结构。2)银鲳与镰鲳的D-loop区出现重复CSB3结构,灰鲳与翎鲳D-loop区出现重复TAS结构。3)ND2基因条形码及其微型条形码均可将鲳属鱼类区分开,可作为有效的鲳属鉴别分子标记。4)东海区的银鲳与镰鲳应为同一物种,灰鲳可能为翎鲳的同物异名。
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| 关 键 词： | 鲳属鱼类 线粒体全基因组 分子鉴定 DNA条形码 系统发育 |
Study on molecular taxonomy of genus Pampus based on complete mitochondrial genome structure |
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| YAN Yongbin,CHENG Qiqun.Study on molecular taxonomy of genus Pampus based on complete mitochondrial genome structure[J].Marine Fisheries,2022,44(1):31-44. |
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| Authors: | YAN Yongbin CHENG Qiqun |
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| Affiliation: | (East China SeaF isheries Research Institute,Chinese Academy of Fishery Sciences,Shanghai200090,China;College of Marine Sciences,Shanghai Ocean University,Shanghai 201306,China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Pampus complete mitochondrial genome molecular identification DNA barcode phylogeny |
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