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西伯利亚鲟Sox9基因cDNA全长克隆、序列分析及其表达检测
引用本文:施志仪,程千千,宋佳坤,轩兴荣.西伯利亚鲟Sox9基因cDNA全长克隆、序列分析及其表达检测[J].水产学报,2010,34(5):664-672.
作者姓名:施志仪  程千千  宋佳坤  轩兴荣
作者单位:上海海洋大学水产与生命科学学院,上海,201306
基金项目:上海市科委基础重大项目(073205109); 上海市重点学科水生生物学建设项目(S30701)
摘    要:为了研究Sox9基因在西伯利亚鲟侧线神经发育过程当中所起的调控作用,本研究利用RT-PCR和RACE方法获得了西伯利亚鲟Sox9基因cDNA全长序列,经序列分析表明,所克隆Sox9cDNA全长为1409bp,包括开放阅读框(open reading frame,ORF)1083bp,5′端非翻译区(untranslate dregion,UTR)19bp和3′端非翻译区(untranslate dregion,UTR)307bp。1083bp的ORF共编码360个氨基酸,相对分子质量为41221.7U。序列分析表明,其与施氏鲟的亲缘关系较近,其次是斑马鱼。经实时荧光定量PCR技术对西伯利亚鲟Sox9基因在各组织以及在胚胎发育各时期中的相对表达量检测发现,Sox9在西伯利亚鲟中的表达具明显的组织差异性和时间差异性。其中,在肝,肾,肌肉,胰中的相对表达量较低。然而,大脑组织中的表达量与以上4个组织相比,处于极高水平,达到胰脏中相对表达量8.9倍,达到表达量最低点肾脏中的近21倍。在胚胎发育的不同阶段,Sox9均有表达。在原肠期、神经胚期及视泡形成期,Sox9基因的表达量均较高,特别是在原肠期其表达量达到西伯利亚鲟...

关 键 词:西伯利亚鲟  Sox9  cDNA全长  cDNA末端快速扩增  表达检测  
收稿时间:2009/9/26 0:00:00
修稿时间:2010/1/14 0:00:00

Cloning,analysis and expression detection of the full-length cDNA of Sox9 from the Siberian sturgeon (Acipenser baerii Brandt)
SHI Zhiyi,CHENG Qian-qian,SONG Jiakun and XUAN Xingrong.Cloning,analysis and expression detection of the full-length cDNA of Sox9 from the Siberian sturgeon (Acipenser baerii Brandt)[J].Journal of Fisheries of China,2010,34(5):664-672.
Authors:SHI Zhiyi  CHENG Qian-qian  SONG Jiakun and XUAN Xingrong
Affiliation:SHI Zhi-yi*,CHENG Qian-qian,SONG Jia-kun,XUAN Xing-rong (College of Fisheries , Life Science,Shanghai Ocean University,Shanghai 201306,China)
Abstract:
Keywords:Acipenser baerii Brandt  Sox9  full-length of cDNA  rapid amplification of cDNA ends(RACE)  detection of expression  
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