缺刻缘绿藻ω3脂肪酸去饱和酶基因的特性及在氮饥饿过程中相对转录量的分析 |
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引用本文: | 李春阳,杜道海,于水燕,李惠,刘凡,周志刚.缺刻缘绿藻ω3脂肪酸去饱和酶基因的特性及在氮饥饿过程中相对转录量的分析[J].水产学报,2010,34(9):1343-1353. |
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作者姓名: | 李春阳 杜道海 于水燕 李惠 刘凡 周志刚 |
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作者单位: | 1. 上海海洋大学农业部水产种质资源与利用重点开放实验室,上海,201306 2. 上海海洋大学农业部水产种质资源与利用重点开放实验室,上海,201306;上海市高校水产养殖学E-研究院,上海海洋大学水产与生命学院,上海,201306 |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目(30972243); 国家“八六三”高技术研究发展计划(2009AA064401); 教育部留学回国人员科研启动基金资助项目; 上海市教育委员会科研创新项目(09ZZ167); 海洋生物学重点学科资助项目(J50701) |
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摘 要: | 根据莱茵衣藻和普通小球藻ω3脂肪酸去饱和酶氨基酸序列(GenBank登录号分别为ABL09485和BAB78717)的保守区(TMFWALF和HHDIGTH)设计简并引物,以缺刻缘绿藻H4301总RNA为模板,通过反转录PCR和cDNA末端快速克隆技术(RACE),克隆了缺刻缘绿藻ω3脂肪酸去饱和酶基因的cDNA全长序列(GenBank登录号:EU658930),它与莱茵衣藻的这个基因具有69%相似性。该基因cDNA序列长2330bp,其中5'-非翻译区长107bp;3'-非翻译区912bp,且具有明显的poly(A)尾巴;开放阅读框1311bp,编码一个436个氨基酸的蛋白质,分子量为49.06ku,等电点7.85;该基因编码的蛋白为膜结合蛋白,含有2个疏水区域和3个保守的组氨酸簇基序。将该基因的cDNA序列与其DNA序列比对后,发现该基因在其编码区存在6个内含子,剪切位点均符合GT-AG规则。实时荧光定量PCR结果显示,在氮饥饿培养过程中,缺刻缘绿藻ω3脂肪酸去饱和酶基因的相对转录量在4h时可能因休克显著提高(P<0.05),然后开始下调,12h开始显著下降(P<0.05),并在20h降到最低(约为完全培...
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关 键 词: | 缺刻缘绿藻 ω3脂肪酸去饱和酶基因 氮饥饿 实时荧光定量PCR 脂肪酸 |
收稿时间: | 6/2/2010 12:00:00 AM |
修稿时间: | 2010/7/15 0:00:00 |
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