| ‘麦缘锦楸’叶色表型qRT-PCR内参基因筛选及验证 |
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| 引用本文： | 杨英英,赵林姣,杨桂娟,张玉,付鹏跃,胡继文,刘莹,王楠.‘麦缘锦楸’叶色表型qRT-PCR内参基因筛选及验证[J].林业科学研究,2022,35(1):123-131. |
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| 作者姓名： | 杨英英 赵林姣 杨桂娟 张玉 付鹏跃 胡继文 刘莹 王楠 |
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| 作者单位： | 三峡大学生物技术研究中心, 湖北 宜昌 443002;林木遗传育种国家重点实验室, 中国林业科学研究院林业研究所, 国家林业和草原局林木培育重点实验室, 楸树国家创新联盟, 北京 100091;西南林业大学林学院, 云南 昆明 650224;林木遗传育种国家重点实验室, 中国林业科学研究院林业研究所, 国家林业和草原局林木培育重点实验室, 楸树国家创新联盟, 北京 100091;林木遗传育种国家重点实验室, 中国林业科学研究院林业研究所, 国家林业和草原局林木培育重点实验室, 楸树国家创新联盟, 北京 100091;林木遗传育种国家重点实验室, 中国林业科学研究院林业研究所, 国家林业和草原局林木培育重点实验室, 楸树国家创新联盟, 北京 100091;东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室, 黑龙江 哈尔滨 150040 |
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| 基金项目： | 中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金项目(CAFYBB2020SZ003)省部级。 |
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| 摘 要： | 目的]筛选不同叶色部位稳定表达的内参基因,为后期开展‘麦缘锦楸’叶色形成的分子机制奠定基础。方法]以‘麦缘锦楸’不同叶色部位及灰楸对应部位叶片为材料,利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术检测了7个候选基因(CfUBC、CfActin11、CfPP2A、CfMADH、CfGADPH、CfEF-1及CbuActin)的相对表达量,利用GeNorm、NormFinder和BestKeeper等分析软件对内参基因进行了稳定性评价。分析了‘麦缘锦楸’和灰楸不同叶色部位中萜类合成相关基因(CfGES)的表达模式,验证了上述稳定性评价结果的可靠性。结果]7个候选内参基因在‘麦缘锦楸’和灰楸叶片中均具有作为内参基因的性能,其中,CfMADH和CfEF-1在不同叶色部位的表达量最稳定,CfGADPH和CfActin11次之,CfUBC最差。以萜类合成相关基因CfGES验证内参稳定性发现,单独或组合使用CfEF-1及CfMADH为内参基因时,CfGES的表达差异与转录组数据趋势一致。结论]单独或组合使用CfMADH和CfEF-1来校准‘麦缘锦楸’不同叶色部位的基因表达量,可显著提高实验结果...
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| 关 键 词： | ‘麦缘锦楸’ 叶片 内参基因 qRT-PCR |
Selection and Validation of Reference Genes for Leaf Color Phenotype in 'Maiyuanjinqiu', a Catalpa fargesii Variety,by qRT-PCR |
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| YANG Ying-ying,ZHAO Lin-jiao,YANG Gui-juan,ZHANG Yu,FU Peng-yue,HU Ji-wen,LIU Ying,WANG Nan.Selection and Validation of Reference Genes for Leaf Color Phenotype in 'Maiyuanjinqiu', a Catalpa fargesii Variety,by qRT-PCR[J].Forest Research,2022,35(1):123-131. |
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| Authors: | YANG Ying-ying ZHAO Lin-jiao YANG Gui-juan ZHANG Yu FU Peng-yue HU Ji-wen LIU Ying WANG Nan |
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| Affiliation: | (Biotechnology Research Center of China Three Gorges University,Yichang 443002,Hubei,China;State Key Laboratory of Tree Genetics and Breeding,Research Institute of Forestry,Chinese Academy of Forestry,Key Laboratory of Tree Breeding and Cultivation of National Forestry and Grassland Administration,National Innovation Alliance of Catalpa bungei,Beijing 100091,China;Faculty of Forestry,Southwest Forestry University,Kunming 650224,Yunnan,China;State Key Laboratory of Tree Genetics and Breeding,Northeast Forestry University,Harbin 150040,Heilongjiang,China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Catalpa fargesii 'Maiyuanjinqiu' leaf reference gene qRT-PCR |
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