| 北美栅锈菌和松杨栅锈菌可视化检测体系建立 |
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| 引用本文： | 蓝燕,农花萍,彭子嘉,陆颖,李坤蓬,徐勇,余仲东.北美栅锈菌和松杨栅锈菌可视化检测体系建立[J].林业科学研究,2023(5):140-148. |
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| 作者姓名： | 蓝燕 农花萍 彭子嘉 陆颖 李坤蓬 徐勇 余仲东 |
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| 作者单位： | 西北农林科技大学林学院 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金（31670650）； |
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| 摘 要： | 目的 ]为实现北美栅锈菌和松杨栅锈菌快速有效的鉴别及鉴定。方法 ]本研究根据两种锈菌的28SrDNA基因序列设计若干组LAMP引物。经筛选得到的引物以北美栅锈菌、松杨栅锈菌、图拉斯叉钩丝壳菌、芍药白粉菌、梨胶锈菌、羊肚菌、金针菇的基因组DNA为模板进行LAMP反应并完成特异性检测；首先建立初始LAMP反应体系，再进一步优化LAMP反应体系的组分和反应条件，加入羟基萘酚蓝实现可视化检测；最后确定检测体系灵敏度。结果 ]表明，筛选出的引物具有特异性；25μL北美栅锈菌LAMP检测体系最佳Mg2+浓度为6 mmol·L-1，最佳内外引物比例为8:1，最佳dNTPs浓度为1.2 mmol·L-1；同样地，25μL松杨栅锈菌LAMP检测体系最佳Mg2+浓度为4 mmol·L-1，最佳内外引物比例为6:1，最佳dNTPs浓度为1 mmol·L-1。加入160μM羟基萘酚蓝(HNB)可清晰地指示反应结果，两种检测体系在61℃条件下，分别反应30 min和40 min可实现目视判断结果，且灵敏度分别可达34 ...
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| 关 键 词： | 杨树 北美栅锈菌 松杨栅锈菌 环介导等温扩增技术 羟基萘酚蓝 |
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