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基于SSR标记的广东省甘蔗黑穗病菌遗传多样性研究
引用本文:陈健文,冯淑杰,钟玫,刘睿,沈万宽,陈仲华,杨湛端,徐苑娴,邓海华.基于SSR标记的广东省甘蔗黑穗病菌遗传多样性研究[J].广东农业科学,2012,39(24):154-157.
作者姓名:陈健文  冯淑杰  钟玫  刘睿  沈万宽  陈仲华  杨湛端  徐苑娴  邓海华
作者单位:广州甘蔗糖业研究所/广东省甘蔗改良与生物炼制重点实验室;华南农业大学园艺学院
基金项目:广东省科技计划项目(粤科规划字[2009]198号);国家现代农业产业体系建设(CARS-20)
摘    要:利用SSR标记分析了30个来自广东省甘蔗主产区的甘蔗黑穗病菌菌株的遗传多样性。用19对带型较稳定且条带清晰的引物从供试菌株群体中检测到了39个多态性位点,平均每个引物得到2.05条多态性带。UPGMA聚类分析表明,在约0.74的相似系数水平,SSR标记把30个菌株划分为5个类群,类群1有22个菌株,包含了绝大部分来自粤西和粤北的菌株及全部的广州市郊菌株;在约0.8的相似系数水平,类群1可以进一步分为2个亚群体,亚群体1包含了90%的粤北菌株,亚群体2则包含了50%的粤西菌株。研究结果表明:该菌的遗传多样性与菌株的地理来源呈显著相关,而与品种间的相关性不大。

关 键 词:甘蔗黑粉菌  遗传多样性  SSR标记

Genetic diversity analysis of sugarcane smut fungus in Guangdong providence revealed by SSR markers
CHEN Jian-wen,FENG Shu-jie,ZHONG Mei,LIU Rui,SHEN Wan-kuan,CHEN Zhong-hua,YANG Zhan-duan,XU Yuan-xian,DENG Hai-hua.Genetic diversity analysis of sugarcane smut fungus in Guangdong providence revealed by SSR markers[J].Guangdong Agricultural Sciences,2012,39(24):154-157.
Authors:CHEN Jian-wen  FENG Shu-jie  ZHONG Mei  LIU Rui  SHEN Wan-kuan  CHEN Zhong-hua  YANG Zhan-duan  XU Yuan-xian  DENG Hai-hua
Affiliation:1(1.Guangzhou Sugarcane Industry Research Institute/Guangdong Key Lab of Sugarcane Improvement & Biorefinery,Guangzhou 510316, China;2.College of Horticultural Science,South China Agricultural University,Guangzhou 510642,China)
Abstract:
Keywords:
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