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玉米早期发育阶段粒位效应的蛋白质组学分析
引用本文:于涛,李耕,刘鹏,董树亭,张吉旺,赵斌,柏晗.玉米早期发育阶段粒位效应的蛋白质组学分析[J].中国农业科学,2016,49(1):54-68.
作者姓名:于涛  李耕  刘鹏  董树亭  张吉旺  赵斌  柏晗
基金项目:国家自然科学基金(31371576,31401339)、国家“十二五”科技支撑计划(2011BAD16B14,2013BAD07B06-2)、国家公益性行业(农业)科研专项经费项目(201203100,201203096)、山东省高等学校科技计划项目(J14LF10)、山东省农业重大应用技术创新课题
摘    要:【目的】从蛋白质组学的角度研究早期发育阶段玉米上、中部籽粒差异表达的蛋白质,分析其功能,探明玉米粒位发育差异的分子机理。【方法】在大田条件下,以粒位效应显著的玉米品种登海661(DH661)为供试材料,90 000株/hm~2密度下种植,在开花期人工饱和授粉后0、3、6、12 d取果穗上部与中部籽粒。采用TCA-丙酮沉淀法提取籽粒总蛋白,双向电泳分离后获得蛋白质图谱。分别以0、3、6、12 d中部籽粒的凝胶作为参考胶,将上部籽粒凝胶与其进行比对,利用Image master 2D 7.0软件分析籽粒早期发育不同阶段上、中粒位蛋白质表达的差异。通过MALDI-TOF/TOF MS质谱分析及NCBI数据库搜索,对差异表达蛋白质进行鉴定并分析其涉及的生物学功能。【结果】较高密度种植后,果穗籽粒早期发育阶段共检测到超过1000个清晰蛋白质点。通过图像处理软件成对匹配分析,果穗上、中部籽粒早期发育阶段差异蛋白质点为66个,其中52个蛋白质点与NCBI数据库匹配,鉴定率为78.8%。差异蛋白质涉及籽粒呼吸与能量代谢(10个蛋白质点,19%)、胁迫与防御(9个蛋白质点,17%)、蛋白质代谢(9个蛋白质点,17%)、氮代谢(6个蛋白质点,11%)、细胞分化与增殖(5个蛋白质点,10%)、转录与翻译(5个蛋白质点,10%)、次生物质代谢(3个蛋白质点,6%)等功能范畴。对相关的差异蛋白质表达丰度分析,与中部籽粒相比,上部籽粒涉及细胞分化与增殖、呼吸与能量代谢的大部分蛋白质在一个或多个时间段内均显著下调,说明上部籽粒胚乳细胞增殖及呼吸能量代谢能力显著降低。同时,上部籽粒涉及胁迫与防御的多种抗氧化酶系、乙二醛酶1以及涉及蛋白质代谢的4个分子伴侣蛋白质在发育早期也处于低水平表达,说明上部籽粒应对逆境条件防御能力较弱且蛋白质结构不稳定。另外,与中部籽粒相比,上部籽粒氮代谢中丙氨酸转氨酶以及S-腺苷甲硫氨酸合成酶1在授粉后6—12 d内均下调表达,说明上部籽粒氮同化能力较弱,影响后续的氨基酸合成与蛋白质代谢过程。【结论】与果穗中部籽粒相比,上部籽粒细胞分化与增殖相关蛋白质的表达水平较低,呼吸与能量代谢能力较弱,导致上部籽粒库容与库活性降低。另外,面对氧化应激等逆境时,上部籽粒相关的抗氧化酶以及分子伴侣蛋白表达水平较低,致使其防御能力低于中部籽粒。丙氨酸转氨酶、S-腺苷甲硫氨酸合成酶1(SAMS)的差异表达也可能是导致粒位效应的重要原因。

关 键 词:玉米  粒位效应  早期发育  差异表达蛋白质  蛋白质功能
收稿时间:2015-05-22

Proteomics Analysis of Grain Position Effects During Early Developmental Stages of Maize
YU Tao,LI Geng,LIU Peng,DONG Shu-ting,ZHANG Ji-wang,ZHAO Bin,BAI Han.Proteomics Analysis of Grain Position Effects During Early Developmental Stages of Maize[J].Scientia Agricultura Sinica,2016,49(1):54-68.
Authors:YU Tao  LI Geng  LIU Peng  DONG Shu-ting  ZHANG Ji-wang  ZHAO Bin  BAI Han
Affiliation:College of Agronomy, Shandong Agricultural University/Key Laboratory of Crop Biology of China, Taian 271018, Shandong
Abstract:
Keywords:maize  grain position effects  early developmental stages  differential expression proteins  protein function
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